TCONS_00000143 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00000143
Unique Name	TCONS_00000143
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2762

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000001:183813..196914-
coding sequence from alignment at sc0000001:183813..196914-

transcript sequence

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CTTATTTGCTACCTACCTACCCTGTTCATTCAACTTCTACTTGACACTTC
AAAGACTACAAACATCTTCTCTTCGTCATTCTGTTCTAGccctcaaaaat
aaaaatgcctAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATG
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TTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAacATTCTATG
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AAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCC
AAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGT
CGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATC
CCAGCCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGT
AACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACAC
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GTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAAAAGAACAAATTACACACA
AGCATACATCAACAAATCATCACAACACCTCGAAATGAAAATGtgtaaaa
aacaataaaaatgaaatttgaaataagaacaaaacgaaatttaattttga
taacataaaagttattacAATGATAGTTAGTCATTTTCCTCCAATATCCT
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GATCGCGTCGCTTTTTATAATCGAGTACATTATTATAACTTAGTTCGAAA
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aatgttcttattttctccatttttcatgtatttttgtccattttcgtaag
aaattaggtgtttgagagtccgcgaagccttaaaatgttcttaacttgtt
cttagcatttttgccaccgaagccttatgttcttctaATAGTTTGTTCCT
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ATTCTAGGCCTCATCTCGCGATTTGTTATTCGTCTATTTGAGTAAATCTG
GTGCGTAATTCAACATATATACCATTTTTGGGTttttagcttgttttttt
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aaagtcggtttttaatttttcaactgGCAAACTTGATGGAAACTTATTCC
TGAAATTTATATGGGTTTTATTTTAGCCATAAAAAACActctttgttaat
ttttgtgCATATTTAACTATGATgatatacattttttttttaagaatttt
tataCTACTACCATTATTAAATAAATACATTACGTCATATCGTAAAAAAG
ATAGTAAGCAAC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00000143-protein

>TCONS_00000143-protein ID=TCONS_00000143-protein|Name=TCONS_00000143-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=408bp
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YRSLNRTR

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000001:183813..196914-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00000143 ID=TCONS_00000143|Name=TCONS_00000143|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13102bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:183813..196914- (Clytia hemisphaerica)
TTTTCGATTTAACGTGTGACCGCGTAACTCGTTTTCCTTTTGAAATGAGG
CCAGACCAATAAGCCGGATATGTTTACAAAATAGAACTCAGCTGAGATCG
TGTGGTGTGGATTTATTTTTGGGAAATCTGAACACAAGCTACAACATCTG
CTTATTTGCTACCTACCTACCCTGTTCATTCAACTTCTACTTGACACTTC
AAAGACTACAAACATCTTCTCTTCGTCATTCTGTTCTAGCCCTCAAAAAT
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TTCAAGCATAAGTCAATTTAAGTCTATAAGTCCAATCCCACAAGACGGCA
ATCACAATGTAGAATGGCTAAACTTTCTACTTTCTCTCTGGTTGTTATTC
CCGGGGAAACTTTCTTATTAGTCAGTCAGGGATATGTTCAGATTTGCTGT
TTGTCAATTGGTTAGTCAGATCGGTTAAATAGACGATAGGTAATCGGTTA
AATAAAGGGTCATTGTTGTTATGCCTAGATACAGTACCTCAGAGGTAAAT
AATCGTACCAATAGAATTGTATTTTTAATCTAACTTGATCAAGTTTTGTT
GCCCTAATGTTTGATAGTTGGGTTATCAAACTTAAATCAAATACTAGCTA
ATTCTCAAAGAGACCTTAAAAATAGTTCAATTAGTTTGTTTATTGATAAA
CTTCATCAAATATCGAACATATATAATCTGCAACTGACGCAATGCAAAAA
ATCAGCAATCTTAGTATTGATTGATCTTTCAAAAAGATTACATCATTGAC
GCAAAATAGTCAGCCTACTTTTTTTAGCACTGTTGGTGGCAGACTTACCC
CCTCCATTCCGCTTACAGATTGTATAGAAGCTTTTTTGGTGGCCATCAAA
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GGGGCGGGTGGTGACGCGAACAAAACATTTTTTGATGGTCGTCAGAGCAA
TTAAGGAAAAAGCTATACTTTAAAAGAACATTGATTTTCCTGGATTTTTT
TCCGCTTCTCTCATGCACCGGAAAATCACCGAAAAATATGATGCGGGCGG
TTGACGCGAATAGAACAATTTTTCGATGGCCGCCTTTGTCATCCAGGGTT
TTGTCAAATTTGTCAAACATTTCTTCTTGTCAAACTTTGTCAAACTTGAT
GTTTTTAGCCAAACTTAATAACTCGCATCTTAGCAATTTTTGAGAATTTT
GATTAATGAATTTAAATTAATTTTTGTTGTTCAGTTAAGTTCAAGAAAGT
TCTTTTAGTTCTGTAATCAAATTGTTTGATTGTATTATCAAAATAGAAAG
TGCAATTTGAAGGAAAACTACAATAAAGGTCATAATATTGAGAAAGTCGA
TTTTGGGCTATCTCTTTAATTTAATCGAATATTTCAATTCGGAAGGGGTT
GGCAGACTTACAGGCTATATTTTGAGCATTATTTGACTATTTTTGAACTT
TTGAACCCTCAGATACTAAGGTCCTAAGTCTTAAGTCTCATGATAAAACT
CAGAGTTAAAACTCTACCCTTCCAACCTACTTTAGAGCACTTGCAAATCG
CTTGTGGTTCAAAAACTTCCCGGTGTATTTCTCTTTTTTCTCAAATATTA
TATGACCTTGATTGTAGTTGTGTCGCTATTTTTGCTTCAAGGTGATTTCT
ATAACTCAAAGAATAAGTTAAATTATTTTTATTTCTAGTTCTATAAATTT
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TATTTCAATCCTTATTCTAGCAGTAGGCTTTTCTATCTTCATATTTCCGA
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GCTTGCAAGCTAAACTAAAATGAGTAATTATAAACTCCAACCAACTTCAT
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GTTATAGTTTTAATGCTGGAGTTTAAAATTATTCAATTCGTAATACATCA
TGATTAAGAAAATATCTTTAGTAGTATGTCAGTTTATTTATTATCACAAA
TAAGTGCCAACAATTGTTTCACTGTATTTAATGATATATAATCATGTACT
GTATTCCATTGCTTGTTACTTTTCAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTA
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TCGCACTANTATAGAAGCTTTTTTGGTGGCCATCAAAAAAATGCTCTGTT
CGTGTCGCAATGGGTGTTAAAAATGCATGCGGGCGGACAGGCGGTCGAAA
AAATTCCTGTTTTTTTTTTAATTAAACCAGTAATTCGGGGGCGGGTGGTG
ACGCGAACAAAACATTTTTTGATGGTCGTCAGAGCAATTAAGGAAAAAGC
TATACTTTAAAAGAACATTGATTTTCCTGGATTTTTTTCCGCTTCTCTCA
TGCACCGGAAAATCACCGAAAAATATGATGCGGGCGGTTGACGCGAATAG
AACAATTTTTCGATGGCCGCCTTTGTCATCCAGGGTTTTGTCAAATTTGT
CAAACATTTCTTCTTGTCAAACTTTGTCAAACTTGATGTTTTTAGCCAAA
CTTAATAACTCGCATCTTAGCAATTTTTGAGAATTTTGATTAATGAATTT
AAATTAATTTTTGTTGTTCAGTTAAGTTCAAGAAAGTTCTTTTAGTTCTG
TAATCAAATTGTTTGATTGTATTATCAAAATAGAAAGTGCAATTTGAAGG
AAAACTACAATAAAGGTCATAATATTGAGAAAGTCGATTTTGGGCTATCT
CTTTAATTTAATCGAATATTTCAATTCGGAAGGGGTTGGCAGACTTACAG
GCTATATTTTGAGCATTATTTGACTATTTTTGAACTTTTGAACCCTCAGA
TACTAAGGTCCTAAGTCTTAAGTCTCATGATAAAACTCAGAGTTAAAACT
CTACCCTTCCAACCTACTTTAGAGCACTTGCAAATCGCTTGTGGTTCAAA
AACTTCCCGGTGTATTTCTCTTTTTTCTCAAATATTATATGACCTTGATT
GTAGTTGTGTCGCTATTTTTGCTTCAAGGTGATTTCTATATCACAAAGAA
TAAGTTAAATTATTTTTATTTCTAGTTCTATAAATTTTAGTCACATAATA
CACTAAGGTACATTATCATGATATTGACATTTTATTTTATTTCAATCCTT
ATTCTAGCAGTAGGCTTTTCTATCTTCATATTTCCAATGAAAACAGAATT
TGCCGCAAAAATTCCTTAAATAGAAGAGGAATTTACATTTTAAATATTTT
CATTTAAGATTTGGTGCAAAAAAGGGAAACTAGAAAAGCTTGCAAGCTAA
ACTAAAATGAGTAATTATAAACTCCAACCAACTTCATTATCTAAAAATAT
AGCACATGCATATTTTACTAATCGTATGCATCAATCTGTTATAGTTGTAA
TGCTGGAGTTTAAAATTATTCAATTCGTAATACATCATGATTAAGAAAAT
ATCTTTAGTAGTATGTCAGTTTATTTATTATCACAAATCAGTGCCAACAA
TTGTTTCACTGTATTTAATGATATATAATCATGTACTGTATTCCATTGCT
TGTTACTTTTCAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAAT
ATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCT
GTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAG
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TAATTGCTAATAAAACTGATCACAACAAGGGTAAACTTTAAGATTTCTAA
CATTTGCAGAAATTGACATTCAAAATAAATACAAAAAATCTACTGTTATG
TTATTAAACTTGAATTCACCCAGGTCGTGTTAATTATAGCTGTTAAACAA
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AATCGTTGCACTCCTTTTACCTGCATATGGACTTGAATAGGGGCAGAATG
ATAAACTTTTTAGTGTAGTTCCCAGAACTCTCCATTTCCATTGACAGAAT
CTCTTGGTCAATCTGAGTGAATTGATTACAAAAGTTTAAGTTGAAAAATT
TTTTCCCAATAAGGTAATAAGAATTTTTCTGAATATACTTCACTTCTTGA
TTGATTATGTTTTTCTTTTCTAGACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCC
CTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGGTAATCTAAAGATCCTCTCATAAGTCAT
AAAGATTGAAATATTTTACTCAGTCCAAAACACATTTCTTTAAAAGGAAA
AATATTTTTTTATTCTTTCTTTTCTTTTGAATTTCTTTTAGCATTACTTC
TGGATATTTTTTCAATCTTAGAAAAGCTTTTAAACTTATTCCCGTGTCTA
GACATTTTCATCTTAAACATAATAGTTTCCTAACTTTAAGATTTTAATTC
ACATTAGATTATCATTTTCAAAAAAATTCAGTATGTATGACAAAATATGG
CAACATTTTTATTTTTTTCTTTATTTCTTTAGGAGAAGATTTAATCATTG
AATTACGTCAACACACAGATTACATATCAGGTATGGGAAAGTTTTTATTT
TAATTGAAGATTGCTATCCAAGAATGGCAGATAACTGCCCATAGCTGAAA
TTGAATAGTGTCTTTTCTTTTAATGGTAAAACTCTTCATCTGTCGCCAAA
AACATCTCCAGTTCAGCCACAAAGACACAATTTCTGGCCTGCAAATATGG
AAGAAGAGTTCATGATAATCGCATCCGAAATAGCTTGGGTCATTTCCACA
AGTTTTATTACTTTAATTCAAAAGTAGTGGCAAACACCTGGTCTTTTTTG
GGTGNCCACAAGTTTTATTACTTTAATTTAAAAGTAGTGGCAAACACCTG
GTCTTTTTTGGGTGCCTCTGTATAAAAAAATTCCGTCATGAATATCGTTA
ATTTGTTCCATAACACTGATGACCTAAGACCTACCGCTACAGGACCCAAA
AATATGCCCAGCTGGCACACAACGTCAAAACAACGTCCATTTGACATTCA
TAACGTCCAAATTACGTTATTTGAACGTTAAAACAACGTTGTGTGCCAGC
TTGTTGGGCAATCTCACATGATGCCAGTGGTACTTTTAAAGCCTTTCAAA
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TAGCCGCATTCTTTTTCACCGTTCAACAAATTGCAGGTTAGCTCAATACA
TTACAGATGATTTAGATCAAATAATTGATTTTTTTACTTTTTAGATGGAA
AAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTCTTATATCCAGCA
ATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGC
TAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGTAAGCATTTTTTTCTTGAAAGTGT
TTTCTAACAAATACAGTTGTCCTCGTTAACATGCCAAAAGGTTTAATCTC
AAAAGAAATATCTCGGAAAAATTACAATCTTGCACTTCTGTGTGTGAGAT
TGGTCTTTTGTCGTATCAAAACTTTGTTTTTTCCTCTTTATGAAAAGTGC
CTAATCTCAGTATCAAAAATAAACGTTTGCAGCGTAACTATTGATTTTGT
AACGTAATTTTAAGATTGAGCTATTAGTCATGTGAACGACGTTGTGTAAA
TTTCTTCTGTCATAGGCAGATTTCCGTCTCAGTGAAATATATAAAGAGTG
CTTTTCCATCTCAAAATTATACATAATTTACCAACATTTCAAGAATATGT
GCTAATTTTCTGTGTAAAATTCATTTCCTGTCTCAGACCCTCTACAAATA
GTTCTTGGAAATCCAGGTCGAAAATAATATGTAGTAATTTTTTGAAATCA
AATTGAACGTAGAAATCACCTTAAATATTGTATGGTTTTATTTTTTTTGT
ATTTTCTTTCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACT
GTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGGTAAGTCTTTAATTGAT
TTTTAATTCCTTTTTTTTCATTACTAAAGCTTGATAATTATTGGCAAAGA
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TATCTTTTTGATAAGTTTGATGGAAGTAGTAGTGCCATTCAGGCTGAGTT
GAGTGGACCCCAGCCTATTCAAAGCTAAGCTCTAGTATTCAGCACAGAAG
GGATGTTATACGTGTGTGAAGTTAGACAGCTAGGAGCCCGCTGGTACCCC
TTAATTACCTAAGTACCCCCCTCCCAGAAGTTAGACAGCGTCACATTATT
CTAATACACGGGTTGCAAAACTATATCAATGTAGTCAAAACATGTGTTAA
TCGAAAAAGTTCTCTTGATTTTATTCCCATATTACTTACTTTATTTACAA
CTTAAAGCTGATAACTTTTTTTTAGTGTCAATCAGAAATAAATTTCATGT
GACAAACACTAAGAATTTCAAGTAAAAGCATGATTTGGCTTCAGACTTTA
ATTTTGCAACCTGTGTATTGTCTAAAAGCTTGGACATTGAATGGGATTTC
TATAGTGAAGTTTACATAGTATAGAGTATATCATTTGGGTAGAGACTGCG
TCCAACCTAGAACAACGACTATACAGCTATATTAAACAAAGTTATTTAGT
AAATTAACAGTTCTAAGGTGTGAATTTTAACTAAAGAGACTACCGTTCGT
CTCCTCTGAGACAGGGATCTGTAATTAATGATATAATTGTTTATAATTTA
TAATTAATTGAAGTACTTATTAATAACATGCTAAACTATTTATTTAAACT
ATTTATTAAACATATAACTCATAACTCAACATGTTACTTAATGTTAAAAT
TTGTTTTCAATATTAAACTATTTAAGAGCATTAGGCTTCGATAACTGAAA
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CAGAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAGCGTGTACACGG
CTGATGAATTAATTATTTCGATTGAGTAAAATGCCTAAATTTTCTTCTTT
TTTTAAGAATTTAAAAAGTTATTTTGATTCTATTTTATAGATTGCCCTTT
TTATTTATAAGAACATTCAAAACTTTTGAAGCTTTAATATAAATTTTTTC
TCATAAAAACTAATACATTCATTTACTAAAATTTGGCGACTGCAATGAAA
GCTATTTTTCCGGATATTTAATTTCGCGGATACAAAGATTTAAAACACTA
CTTGTTAAAGAAAAACTAATTGATATTCGACTTAAACGATGACTATTTTG
CATAATTTTTTTTTCATTTTTGAAGAACGTGTTTTTTTTGCGCGCATTTA
ATTTGGCAGATTTAGTCTAAAACTGCCAAATTCGCAAAATTTATATAAGT
TAATTAAACAAGATAGCTGAAGTATTAGAAGAGATTTTTAGAAAGTTAAA
ATGTTAGATAATTTAGTGTAGTGAATTTCTGTCAAATCTTCTGTTACTAG
ATTCCAAAAAACATATAGGGCGATTACGTTTTCACGAGAAAAACTAGAAC
GATTTACAATCTTTACCATGACCCCTGCAAAGCATCATTGCCACTGCTAA
TTTTATAACTTTTCTATTTTTCATATTGCTTTTAAAAGTGAATGGATAAT
TTGACGAATTCAAAAGTATCAGCTTCTTACGGTTCCTAACATATTACGAT
TATAATCATTACGCAATCAAACTCAATATTCTTGGAGTATTTCTTAATTT
TTCTTAATTTAATCGCCGAATAGACGATATCGGCTTAACGAAATTCTCCC
CGAATGATTACCCATGATGCATTGCGCAAAAAAAATCAGTAAGTCAATAT
TGTCCGTGAATTTTTTTGCACAATGCATCATGGGTAATGATTCGGGGAGA
ATTCGGTAGGCCGATATCGTCTATATGTATAATTTTTCAAATAACTATAT
AATAATAAAAAACTAATACCTCGCCTTTGTTAATTTCTATTAATTTAGGG
CGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTA
AACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCT
AAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAG
TTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTT
TGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCC
TTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAG
ACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTG
TAGAATCGATCCCAGGTAAGCTATGTATTTTATTCTTAACAACTCAAAAA
AAAAAAAGCAATTAAACCCATCTTTAGGAGATCACCCTAAAAAGCCGGGA
AAATCCTGGGGTCCCTGAAAATAAGATGTCTCTCTAAAATTTAGACGAAT
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AGTTTCATTTTTTAAGGGGTATGGTTTTATAAACTTCCGAAAAGAGAAGG
ATCTAGACAAAAATAATTTTCAGTGTCTTTTTTTCCTTGTACCAAATTTG
ACCGACCCTTCCCCTCAGGTTTATCTAGTATCTTAATTATCCTAGATATC
TCATTTCACTGAAGATTGGTGCACACGAAAGTATGAAATAAGAACTTAGT
TAATTTTTATTATAATACTTTACGCGTACATTCTTTTGCGAGCATAAGCT
TTCGCGAATTGCCCTGTTTAAAATTTTCAAAGACATATTTACTTTCGCGA
AAAAGGCCAAAATTCGCAAAAATCGCGAACGTTTCTACTCGCGAAAGTTT
GTACACCTAAAGTACCTTGTATCTTATTCATTTATTATCTTATTTTTAAA
TTATCTTTTAGCCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATA
GATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTA
ACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAG
GTATTTAAAAAATTATAGCTCATCTCAAATATCGTTTTTCTTTACAAATT
TTCTTTGTATTTATTTACAAGGACATTGCATGGAATTTAGCATAACAAAT
TTGTAGCTTTTACGTTTTAGGCTGCTGAACAATTATACTAGGTCCAACCC
CTTTTGAATTCCGAATCGTTTCATTTTCAAAAATGAACTCAAAATCATCT
TTTTAACCTGGTTTTGTACAACGAAAGAAGAAATGTTTTACTTCTTTNCA
TCTTTTTAACCTGGTTTTGTACAACGAAAGAAGAAATGTTTTACTTCTTT
TATGAGAATATACTTCTTGTCTTTGCATTAATCTACAACTAGTTTTTTTT
TTCGATGTTTCGTACTTTATTTGGGATTTTTTGGAAAATTCACTTCACTA
AGAAAAACCTTTAAAAGCCATTTGACTATAGAACTATATGTATTAAACAT
TTTTTCTCTTTTGATAGGGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAACCACGC
CTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCC
GTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTG
GATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGACGC
CATCAAAGAGGCGGATCGAGAGTAAGGAAATTTTATTTGTCTATGCAACT
GTATAGTTGACGGTAAAGATGCTCTCTAATTTGATTTTCAAGAGAAATTG
AATTTTCATTTAATTGTTGACGGAGACTTTCATTATTTTCGAATAATGGA
GCGTATCGAATAATAGAACGTTGAACTGGAGAGCGTGTCCCGGGTGGAAA
TTCCTCGAAAAATAGGAAGGTGTTTATTACAGTTTGTGGTGATTAATCTA
TCATTCATATCATAATGGTGGGTGTTTTGGGCTTTATTCAGATGTGGCTC
CCTATATACAGAGATTGTTGATTTGCAAAGCTCATGAGTCCTGGGAAGGA
CGAAACACGTGTCTGCGGATAGCTATACACATTTTTTCTATAAGAATATC
CAAAAATTTTAAAGCATTCCGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCT
AAAAATGTACTTAAAATGTTCTTATTTGGACCATTTTGTGAGCATTTTCG
ACCATTTTCCTAAGAAAATGGGTGTTTTTGAGTCCTCAAAGCCTTAAAAT
GTTCTAAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTAT
ATAGTTTGTTCTTATATTACAAAACGTGTATATGGATNAAATGTTCTAAA
CTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTG
TTCTTATATTACAAAACGTGTATATGGATAAATAATGACTTATAATTTCT
TATTTTTCTTCCAGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAAA
AGAACAAATTACACACAAGGTGAGATACCCTTCAAAGAGGACTTTGAATC
TTATAAAATAATTTAATGCTACAATCATGGTCGAAATATATTGAGAATTT
TATGTATTTTAACGTTTTGCAAAATTTAAAGTTCGGGCGAGAATTTCGAT
TTTATTACTACCACTTTTAATTCCATTGGATTTTTCGATTGTACCTTGAA
ACTTTTAGTTAACCAAAAAACTAAAACAACTTTGCCTGGTAAACATAAGG
TACCTCGATTTGTGAGGTCCTCTTGATTTGTGATATTCATGACGTAATTT
TTTCTACGGAAAGACCCTGGTTTTTGTCAGTAGTGGCAAATTTTATACAA
CTTTTGTCTAGTTTAAATCTGCCACTACTGGCAAAAACCGGGGTTTTTCC
GTAGAAAACATTACGTCATGAATATCATGAATCGAATCCTTCTTGTCTAC
AAGATCCTCAATTTTAATCTTAACTTTTCCTGTTTTCTCTTTTCAGCATA
CATCAACAAATCATCACAACACCTCGAAATGAAAATGTGTAAAAAACAAT
AAAAATGAAATTTGAAATAAGAACAAAACGAAATTTAATTTTGATAACAT
AAAAGTTATTACAATGATAGTTAGTCATTTTCCTCCAATATCCTCCCTTC
TTAGAATTTTATCAAAGATTTTTTTATCACTATCTAGAAAGCTAGATCGC
GTCGCTTTTTATAATCGAGTACATTATTATAACTTAGTTCGAAACTGGAT
CATATATATGGACGTATTATATTTAATTTTGAAAGTGACAATTTATTACA
GATTAATTGACTGAAACTCCGTAAAACATTTTCCGTATCTGAAACTCCTA
AGAATCGTTCGATGATCATTGGAACTGTAATTCTCTCACAAAACAATTTC
TCTCGCAATTTATGTCATGAGACATTACTATTTTGCCATTTTCACTTAGC
GTGGTTTGGTGGAGTAATTAATTGAATCCTCTTAAGCGGCTGGATGGCTA
TCTCAGTTCTTTTGAGTAATACGTTTTTTTATTAGAACATCTAAAAAATT
TTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACGTTTTGAGTATTAAGCCTAAAAATGTT
CTTATTTTCTCCATTTTTCATGTATTTTTGTCCATTTTCGTAAGAAATTA
GGTGTTTGAGAGTCCGCGAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAGC
ATTTTTGCCACCGAAGCCTTATGTTCTTCTAATAGTTTGTTCCTACAAAA
AAGATGTGTACTCTATATAATAACTCTTTGGAATTAATCAGCAAATTCTA
GGCCTCATCTCGCGATTTGTTATTCGTCTATTTGAGTAAATCTGGTGCGT
AATTCAACATATATACCATTTTTGGGTTTTTAGCTTGTTTTTTTTATTTG
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ATGTATTTTTTCAGACTTTGTAAAAAATCGAATGATCAAGATTTTTATGT
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CCATTATTAAATAAATACATTACGTCATATCGTAAAAAAGATAGTAAGCA
AC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001:183813..196914-

>TCONS_00000143 ID=TCONS_00000143|Name=TCONS_00000143|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=12270bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:183813..196914- (Clytia hemisphaerica)
GGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACG
CCCAACATGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGT
TGACGAACTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTG
AGAGCGACTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGA
AACGCCCTTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACA
GATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAACCCACATAC
CTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGA
TCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCG
TACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCTGATA
GTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGAT
GGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAAC
TTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACC
AATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGA
CGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACG
TCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAA
CCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGA
TTTTGAAACATCGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACA
CGATTTCTTATATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAA
TTCTTTTATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAG
ATTTAATCATTGAATTACGTCAACACACAGATTACATATCAGACATTCTA
TGACTGCACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGT
CCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAATATGTATATCTTCATATGGAAAT
GCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTAT
TCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAA
TGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATGTGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATC
GCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAACCACGCCTTACG
TTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCCGTAGAG
ATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTGGATTTG
CTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGACGCCATCAA
AGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCAC
TATAGATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAA
TTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGA
GAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAA
GTACTAAACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGC
CGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATC
CAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATG
AATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTT
AATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTC
CATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATA
CGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGAC
TAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGATGGAAAAGT
CATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTCTTATATCCAGCAATAC
CACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGCTAAA
TTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAGATTTAATCATTGAATTACGTCAA
CACACAGATTACATATCAGACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCCCTGG
TAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTA
TGAATATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTA
AATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTC
GAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCA
TGTGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGT
CACGCCCAACATGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCC
GCGTTGACGAACTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGAC
GCTGAGAGCGACTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGA
ACGAAACGCCCTTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTG
TACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAACCCAC
ATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGACGATC
TCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCA
GTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCT
GATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGG
TGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATT
TAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGAT
GACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCC
ACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCAT
CACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGG
TGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTC
CCGATTTTGAAACATCGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACA
CACACGATTTCTTATATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGT
GAAATTCTTTTATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGA
GAAGATTTAATCATTGAATTACGTCAACACACAGATTACATATCAGACAT
TCTATGACTGCACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAAC
CTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAATATGTATATCTTCATATGG
AAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCA
TTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCAT
GAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATGTGGGCGTTCTATCGATCGTTG
AATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAACCACGCCT
TACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCCGT
AGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTGGA
TTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGACGCCA
TCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCG
TCACTATAGATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCA
GAAATTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACT
AAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATT
AAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACC
CGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTA
AATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAG
AATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGA
TTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGC
GCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGA
AATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCT
CGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGATGGAA
AAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTCTTATATCCAGCA
ATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGC
TAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAGATTTAATCATTGAATTACG
TCAACACACAGATTACATATCAGACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCC
CTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAG
ACTATGAATATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGC
ACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAA
ATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATC
TTCATGTGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATA
CAGTCACGCCCAACATGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAA
CGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTC
AGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTG
ATGAACGAAACGCCCTTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCAC
GGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAAC
CCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGAC
GATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAA
AGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAACAATT
AGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCG
CGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCC
GATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAA
GGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAA
AGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCG
CCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCC
AGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAA
GTTCCCGATTTTGAAACATCGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGC
AACACACACGATTTCTTATATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGG
CCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTA
CTGAGAAGATTTAATCATTGAATTACGTCAACACACAGATTACATATCAG
ACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGA
CAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAATATGTATATCTTCAT
ATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTT
CCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAG
CCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATGTGGGCGTTCTATCGATC
GTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAACCAC
GCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACG
CCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTT
TGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGAC
GCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTG
CTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACG
CCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTC
TACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCC
TATTAAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAAC
CACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGC
AGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTC
TAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATC
GTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCA
TCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAA
CGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAA
TTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGAT
GGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTCTTATATCC
AGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAA
CTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAGATTTAATCATTGAAT
TACGTCAACACACAGATTACATATCAGACATTCTATGACTGCACAGATCC
TGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTA
CGAGACTATGAATATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGC
TCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGAT
TAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTT
GATCTTCATGTGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTT
CATACAGTCACGCCCAACATGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTAT
TCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAG
ATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTG
CGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGA
CCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACC
GAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTT
GGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGA
TAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAAC
AATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCG
GGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCAC
GCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGAC
GTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGT
CCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGT
GTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGA
TCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAA
AGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAG
TAGCAACACACACGATTTCTTATATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAA
GTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGC
GTTACTGAGAAGATTTAATCATTGAATTACGTCAACACACAGATTACATA
TCAGACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAA
AAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAATATGTATATCT
TCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAA
CTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGA
AAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATGTGGGCGTTCTATC
GATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAA
CCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTG
TACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTAC
TCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAA
TGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACAGATCGAGCTCA
CCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCATCGAC
CACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTG
CTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCAT
CGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCA
AAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAG
GCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGG
ATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCG
AATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTC
CCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCT
TCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCT
AGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACAT
CGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTCTTAT
ATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATAC
AAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAGATTTAATCATT
GAATTACGTCAACACACAGATTACATATCAGACATTCTATGACTGCACAG
ATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGTCCAGGAACATT
TCTACGAGACTATGAATATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTG
AAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAA
AGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGA
AGTTGATCTTCATGTGGGCGTTCTATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGA
GGTTCATACAGTCACGCCCAACATGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAAC
GTATTCAACGCCGCGTTGACGAACTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTAT
GTAGATTCAGACGCTGAGAGCGACTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATC
TTTGCGTGATGAACGAAACGCCCTTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATC
GAGACCACGGTGTACAGATCGAGCTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGT
AACCGAACCCACATACCTTTCATCGACCACGCCCAGAAATTTAACCACAC
GGTTGGACGATCTCGATCTCTCGCTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCC
TGGATAAAAGCAGTCGTACCATTGCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACAT
AAACAATTAGCTGATAGTCGTGTTCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAAC
TTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGTTGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAA
GCACGCCCGATTTAACTTTGGTGGGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTT
CGACGTAAGGATGACCAATTGATTTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTAC
TCGTCCAAAGCCACGACGTTCCGTGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTT
CCGTGTCGCCATCACGTCCACGTACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAA
TCGATCCCAGGGTGAACCAGTAAAGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCA
TCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAAACATCGATGGAAAAGTCATATCACATT
GCAGTAGCAACACACACGATTTCTTATATCCAGCAATACCACCTTATTAT
GGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTTATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTAT
CCGCGTTACTGAGAAGATTTAATCATTGAATTACGTCAACACACAGATTA
CATATCAGACATTCTATGACTGCACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTA
TTAAAAGACAACCTGTCCAGGAACATTTCTACGAGACTATGAATATGTAT
ATCTTCATATGGAAATGCTTGGGCTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCA
CCAACTTTCCCATTATTCTTCCATGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCC
TAGAAAAGCCATGAAATGCATTGTTGAAGTTGATCTTCATGTGGGCGTTC
TATCGATCGTTGAATCGCACCCGATGAGGTTCATACAGTCACGCCCAACA
TGAACCACGCCTTACGTTCTTCCCAACGTATTCAACGCCGCGTTGACGAA
CTTGTACGCCGTAGAGATTTCAACTATGTAGATTCAGACGCTGAGAGCGA
CTACTCTTTGGATTTGCTACGCGAATCTTTGCGTGATGAACGAAACGCCC
TTAATGACGCCATCAAAGAGGCGGATCGAGACCACGGTGTACAGATCGAG
CTCACCTGCTCGTCACTATAGATCAGTAACCGAACCCACATACCTTTCAT
CGACCACGCCCAGAAATTTAACCACACGGTTGGACGATCTCGATCTCTCG
CTTGCTTCTACTAAGAGAAGGGCGCCCTGGATAAAAGCAGTCGTACCATT
GCATCGCCTATTAAAAGTACTAAACATAAACAATTAGCTGATAGTCGTGT
TCCAAAACCACCCGGCCGCCCTAAAACTTCGGGCGCGGGTGATGGTGGGT
TGAGGCGCAGTAAATCCAAAAGTTCAAGCACGCCCGATTTAACTTTGGTG
GGGGATTCTAAGAATGAATTTTTGGTTCGACGTAAGGATGACCAATTGAT
TTCGAATCGTGATTTTAATTCCTTTACTCGTCCAAAGCCACGACGTTCCG
TGTCCCCATCGCGCTCCATGAGACGTTCCGTGTCGCCATCACGTCCACGT
ACCTTCAACGGAAATACGACTGTAGAATCGATCCCAGGGTGAACCAGTAA
AGCTAGAATTCTCGACTAAAACTGTCATCAAAGAAGTTCCCGATTTTGAA
ACATCGATGGAAAAGTCATATCACATTGCAGTAGCAACACACACGATTTC
TTATATCCAGCAATACCACCTTATTATGGAAGTGGCCGTGAAATTCTTTT
ATACAAAACTGCTAAATTTAAACCTATCCGCGTTACTGAGAAGATTTAAT
CATTGAATTACGTCAACACACAGATTACATATCAGACATTCTATGACTGC
ACAGATCCTGCCCTGGTAGCTGCTGTATTAAAAGACAACCTGTCCAGGAA
CATTTCTACGAGACTATGAATATGTATATCTTCATATGGAAATGCTTGGG
CTTGAAGCTCGCACTAAATCTGTCCCACCAACTTTCCCATTATTCTTCCA
TGAAAGATTAAAATTCGAAAGAATGCCTAGAAAAGCCATGAAATGCATTG
TTGAAGTTGATCTTCATGTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000082	XLOC_000082	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00000143-protein	TCONS_00000143-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000001	supercontig	sc0000001:183813..196914 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.82639	7.10232	7.62537	10.2854	112.489	79.274	28.979	31.6758	14.616	19.155	11.8036	15.7834	14.6425	12.9869	6.11344	6.41092	4.82897	6.7059	14.0419	19.853	8.1647	8.35889	7.19137	7.67273	9.31692	9.19248	4.17137	5.52285	2.55202	3.82303

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR032732	SPATA6_N

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00000143 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SPAT6 (Spermatogenesis-associated protein 6 OS=Homo sapiens GN=SPATA6 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 93.9745 bits (232), Expect = 8.094e-20
Identity = 53/159 (33.33%), Postives = 88/159 (55.35%), Query Frame = 3

Query:  255 MPR-KAMKCIVEVDLHVTTCPGTFLRDYEYVYLHMEMLGLEARTKSVPPTFPLFFHERLKFERTFYDCTDPALVAAVLKGEDLIIELRQHTDYISDGKVISHCSSNTHDFLYPA---IPPYYGSGREILLYKTAKFKPIRVTGEPVKLEFSTKTVIKEV 719
            MP+ KA++C + +++   TCPG  L+D E +YL + + G   +T+ VP TFPL F+ R+ FE+ F D  DP  V   L+ +  + EL Q    +  G+ +S    NT DF++P    +  ++ S R++ + + +  +     G   +LEFST +VI E 
Sbjct:    1 MPKVKALQCALALEISSVTCPGVVLKDKEDIYLSICVFGQYKKTQCVPATFPLVFNARMVFEKVFPDAVDPGDVVTQLEYDTAVFELIQLVPPV--GETLSTYDENTRDFMFPGPNQMSGHHDSNRQVTMRRISGLR-----GNAPRLEFSTTSVITEC 152

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00000143 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00000143 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SPAT6	8.094e-20	33.33	Spermatogenesis-associated protein 6 OS=Homo sapie...	[more]

You are here

TCONS_00000143 (transcript) - C. hemisphaerica