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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_91:397367..403754- Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045559 ID=XLOC_045559|Name=XLOC_045559|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6388bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_91:397367..403754- (Clytia hemisphaerica)
ATAGAATTCCAAAAAAAAAACACAAATAATTTATAACTGTTTGTCCAAAA
CTAGTTCAAAATGGTGAAATTAACAGCAGATTTAATTGAGATTGCTCCAC
AGTATACCAACCCTTTGAGAGATCGTGAAATTGATTTACGTGGGAACAAA
ATATCTGTCATTGAAAATCTTGGCGCAACTCTTGTAAGTTTTATCTTATC
TTGATGGTTCTTTCAATTGTATTTACTGTAAATATATGAATGATGGCCTA
AATTCTGACAGCTCAAAATAATATCAATCAGATAATTTAGCTCCAAGGAC
ATAATCAGTTTTTGGTCCACCGTATTAATGACTGGATTACATATCAAATT
TCTCGGGTTTTTGCTTTTTAGGCTTTCTCATGCCAAAAATGTTATTAATC
TCTCAGTTCCATCTATCTGTTATGATGTATTTAATCTATTTTTCAGGATC
AATTTGATTGCATAGATATATCAGACAATGATGTCAAGAAGTTGGAGTCT
TTTCCACTCTTAAAACGTCTCAAAATGCTCATCTGTAACAATAATAGAAT
CTGGTGAGTGACTGGCTTGAGTTTTGATTTATTTTACTTAGACTTAGATG
CGTTATCTCTTATATGAAAAAATGCTTTTGAGGTCTTTTTAAGTTTGTAC
TGCTCTAGGTTTGTTTGCTTATTTCTGCAAACTTTAGGGAACGTTTCGAA
GATCTTTTATGTAGGCTTCATTCTACCCTTATTGTTGTAATTATTATCGT
TTCCTCTCAAGCAAGTTTGAGACTCGACTGATACAATATTCATTTAAAAA
ACCACCAACCCTTATGTATTTTTTAAGGTTAGATATATATTGACGGTGGG
TAAAGGTAAGAGTTTCAATTTTCCTGAAAACATTCGCGAAAGCGAATACA
TCTGGCGTCACCCAAATTTTCCTTAACAAACAATTTAAACGCTGCGCTGG
TTATTTTGTCAGAATGTGTTTACATAGATCATGGGTTGAATAAAATGAGT
TCTACCAACTGGTTGGAAAGGAATCGGACTGGATATTTTAACACATTTTC
CTTGAATTCTGATTCTTTTACAGTATTTAGTGGCATATTTTACACTATGC
TTTGGCATGGGTAGTATTCGAGCTTTTGTTTTGAACTATTTCCATCATTT
GATTTTTACCATTGATTTTGTTGGTTATGTTAGCTACTGTTTGGGTTCAG
TTGTCAAACATTTTCTACTGGAAAGGTGGATTTCAGTTTTCATCACAGAT
CTATTTTGCTTCTTAGAGTATAACGTATATTTCCTTGAAATTTGTTTCTT
TTCAGGGATATTTTGTTACTTTTAGGTTACCTCACCAAGCAGGAACTCCC
ACAGTGAAAACAAAGAAACTATTGAGCCGTCTAAAACAAGTCCTAAGAAG
AAACTTGCCTTGATCTCATCTCATGCTGGCATATCTTTTCAAATCTATGT
TGCCCTTATCAGTTTTCTTTATTTTTTTTTCTTCTTTCAAACGGCAGTCG
TTTTGAAGAGAACTTGGAGGAATCATTACCAGCTCTGGAAGATTTGGTGT
TGTCAAATAACAATGTGCAAGAATTGGTATGAATTGATTATTTGGTTACA
TCCAGTCAACCCTCCTTAATCTACGAGGGGTTCGGGTTCAAACGGCGTTA
AATGTGTGTTTGTCTGTGTGTTTGTTTGCCATGATTTCAGACTTCTTTCC
TTGTAAACAGGAGTGCAAACTCCTTTTGGTGCATTTGTTTTTTTTTGCAA
CGGATTGATAGTTGTATTTCATTCACCAAACATTTTAGCTGAATTTAATG
ATCTCACCTTTGAATGATTTCTGTTTTTCACATAACTTGGCGAAGTTTTT
ATCCCAATTGCAGGATTATTTTAGACATCTCTGTTCAAACAATATCGTAA
AAATGAAAATTTATTCTGTGTGTTTTATTTCTTGCTAAACAATAATCTTT
CAGCTCCTCTCAGTTACATACTTTTTTTGTTTTTAGATCGATTTAGACCC
ATTGTCAACGATAAAAAGTTTACGTTCAGTATGGTATGTATTTTCTTTCC
TTTCTCTTTCTCCTACTAAAGGTTTTACAAAGCTTTCTCTAATAAAGAAA
CATTGATGAGTTTAAAGGTTCATGCAAAATATAGTGTACCCGCCATTAGT
CGAACGTTATTTCATCGTTTTCTCAGCTCACAAACCTTTATAACCGACGA
ACTCTTCAAAAATTAAGCTTTCCATAACAAAGAAGCTTAGCTTTCCTAAT
GATTGCTTTAGTTACCAAGATAGGACTGTAAGGTTGTCTGCTAAACGGAA
AGAGTTGTACTGCAATAGAAATTAGTCCCAGAAGACTTTGTGTGTGTGTG
GATTTGATGTGATTAACAGAGTTACTACGCATAAGCATACCAGGATAATC
ACGACTACGGACGAAAAATGTAATAAGCTAGTGAAAATACGAAATTTGAT
TGGTTGAAACTCACTAGCCTGTTAAATTTTCGTTCGTCGTCGTGATTTTA
CTGATTTAACTTTACTACTTACAATATTATGTAGTATGAACTATGCTTGA
CTTTTATACTTTGAACTTTTTTGTTCTAGCTTCCTTCGGAATCCAGTTGC
AAATAAACAAAACTACCGGCTATATTTGATCTTCAAAATCCCTCAACTTC
GCGTTGTCGACTTCAAAAGAATAAAAGATAAAGTATGTTCTGTTGCTTTT
GTAACTGTGAATTTTTCACTCCAACCAAATGAGAGAAAATTATGGAAAGT
ACTGCAAAATATAGTGTATCCGCCATTAGTCGGACGTTATTTCATTGTCT
TCCCAGCTCACAAACCATTATAATCGACAAATCTCCAATAATTAAACTTT
GATTGGAAAAGAATACTTATTCACGCCGAGTAAACATTACGTTTGCATTC
TTTTCAATTTAAGATATTTTAGTACATAACTAAAAAGCTGAACGAAGATC
TGAAATCTTTTACACTATTTTACAAACGTCGAATTTTAATTTCTGTCAAA
AGGTAGAAAGAATAAGCAAACTGTCTTATTGTGTCTCCCTTTTATTTCCC
TCCTTCTTTTATTCATTTTTGTTGATTTTACTGGATATGTCTTTTAAAAT
GTTTTCATTCTTTATTTTATGTCCTTTTGTGTTATCATTTTTTCTCGAAA
TAGGTATTGACGCTAGCTAGTAAAGTTCAATGACATTGAATTTCTTATAT
TTCTGTCTCTAAAGTGATGAATAATGATTTTACCAATATCTTACTTTTTT
TCAGGAGAGGTCGGCAGCTAACAGACTCTTCAAGAGCAAGAAAGGGGAGA
TTTTACAAAAAGATATCGCTGCTAAGCGTAGTAAAACGTAAGAAACAGTT
TGGGTGTTTCCAACAGTCAGTGGAGTCTGTTTTAAGTGGAAACTTTTTTT
CATTCAAATGTCTGCTTAATTCGAACAAGTTTTATGGTCCCTTCAGTTAA
CAATACCATCTCACTCCATTACTCGAAATTTCCCTAACTCAAACATACAT
TTGCTCCCAGTGCGTGTTTGAGTTACGGATACTTCACTGTACCGACAAAA
TGAATTACAGTTTATGATTCTTCTTGTGATCATTCTATGAAAGCCTCAGT
ACGTTTGCTGAACATACCTCCTCCCCCCTTCGAATATGGCCGCATTAGAA
CGTTAGTGAAACATCATTAACTACGAAAGTCATGCCAATCTCTCTATCTC
TTAACTTATTTTATCCGTTTTCATCATTATCAGATTTGAAGTCAAAGATA
TCCAACCAACGCAAGAAGACGTTGAATTTCTGGCCCAAAAATATAAAGAC
CAAGAAGCTATCAAGGTTTTTCATTCTATATTCAATGTTATAATAATTAA
AGTACTCTGTAGGGTCCTATCTAGGTGTAAAATGAGGAGAAACCTTTCAA
AAAAATTTTAAAGGAATCGGAAACGCTATGAGGCCATCTCTTTGCTGGCT
AAATGGAACACCCAATGTACAGCGAGACACTACACGTCTTTTTTTATAAG
GAACACGTTTATAAGGAACTTGAGGCTGAGAATAAGAAAACAAGTTAATG
AACACCAAGAGTTAAAATTGAACTTCACACGTTTACAAATTCCTAGACAA
AAAATGATAAATATTGATAAAATAACGTTCAATTGTTCGTCTTTTGTCAA
TTGTTCAACAAATCATCAAATCAGTCCAACCTTACCAGCTAAGTAAATAA
GGAACTTGATAAGGAATTTCGAGGCTGGAATTCTCTGGAAAAATATGGAA
CTCCAGGCTTGGAGCCAACTTAAGGTTCCTTATAAAAAAAACGTGTAGTC
TTTTCGTTGATAATTTTAACATTTTCTTGATTTCTTTCGTAGGAAGCCAT
TTCTAAAGCCACCACACTGGAAGAAGTTCGGAAATTGGAATTACTTTTAC
AGCAGGGCCACGTCCCCGGTAAAACAGGTGATGGAGATAACCAAAATGAA
GACGAGGAAGAAATGGAAACAGCATGATTATTATCTTCATAATGCAAATT
TTTTCATACCTGATGATCTTAGGTCATGATAACCTAACCCTCGAACGTTG
CTCCTTGTACATTTTCCAGAACTGTCTTTTTTGAAATTAAAATCTCCTTC
AAAAGGGGCATTTTTTATGCAAAATGTCGTGTTCATTCTGTGCAGGAGGC
TTTTATATTTNTTGAAATTAAAATCTCCTTCAAAAGGGGCATTTTTTATG
CAAAATGTCGTGTTCATTCTGTTCAGGAGGCTTTTATATTTCTATAAACT
TTAATTAATAGATTTATAACATTAAAGCTTTTTACCTGTGTCTTTCGGAG
AAAACTGATAGATCAGATGCTCTTTCTTGGCACTCACGCCTATGGCAACA
TTTTTATCGTTTTTTAACAATAGGAATAAAATACAGCCTTTTTACAGAGC
ATTGTTTCTTTTTTCTCCCTGCAGATAGACAGTCAACACAATTAGTATTT
CCATTCAGGAAGGCTTAGACTTCGGGATTTCTTTTGCCGAAGGTCAATGT
TATTATGATTATAATTACCTCATTAATATTAATACTGGTTGTTTTTGTAT
TTGAGAATTTAATTACTCGTATAGCCTTTGTGTAAGATATATACATAATA
TTAGAGTTCTAGTGTTGCTTCATATTTTGAACTCTTTTCTGTCACTATAC
TCATCTATTTTACTTTTTTTCGTTTAAGTGAACCTAGAAAAAACAACAAG
TAATAAGAAAAAAAGAAGTCTTAAATAGATATCCTAAGAATGAAGGAATT
CGACACCACCAAATACCGAATGATTGAAACGATCACAGCGAGCGCAAAAC
ACCGACCTCCGCTACATAGCGATCCGAAAATATTTGAACCTTTAATTCTA
CCCAAACACGACCGTAAAATTGGTATCGGAGTTCAAGTTTTTACGGGACT
TTTCGCCATTTACGGTGTTCTTTTCATGGACTTTGGTAACAGAGAACATT
GCTTTTCGGCAATCCGACGAGCCTTTTTCGGCAAATTGAATTCGTGGATG
ACGATACGACCTGAAGATGAACCTTACATTGCGAGACGGGTGGAAGAGAT
GAAACTTAGAGTTAAACAAGTTGATGAAACCAAAGCAATTTATGGTGGAA
ATAATTGAATGNAGAGTTAAACAAGTTGATGAAACCAAAGCAATCTATGG
TGGAAATAATTGAATGCAGTCTCCAAATATAGTTGGGGTAAATAAAGACT
TTCGAGTGTCGTATATGCCTAGAAAAATTTAGTATAATTTGCTCGAAATG
TTCTCTGCGTGTATGACCTTTGGCAAAAGTTTTTCTTCCTAAATTAAAGG
ATTGTGATCGGCTTACGTGATCAATAAGCTTTCAAACGTACGATTTTGTG
CTACAAGAATATGGACATCATTGAACCGCTTGCAATCAAGTTGTAAGCAA
GTTGAAGAATCAATCCCTAATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCT
GACATTACATCACGGATCCAATAGCTGATTGGTTGTAAGTGACTTAAAAT
CAGTCAATACGTCACTTTCAACCAATCAGCTGTTGGGTCCGTGGAGGATA
TTGCAATGGTGCATATCATGAATATGTCTCTGTCATCTTAATCTGTTGAA
AGATTGTCAACTATTTGATATGGATTTGAGGCAAATGAAATGCATTAGTG
TTGATTACTGTTGGTAGTAACGGAACATGTTGCTCATAAACTTGACATAA
AAATAAGAAAGTTCGGTAAATCTCTGGTCATCTTGGTTTGAATGTTGTGT
GTGAGTGTGATCTAATTATGTACAGAAATGATGATTTTATTGCAATTAAG
TATTGTATTTAGATGACTGAAAACTTTTATTTTTATCTAAAATTTTAAAT
ATTAAAATCATTCTAAATGGAAAAAGATTAGCAGTGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_91 | supercontig | scaffold_91:397367..403754 - |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| SNRPA1 | U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | Homo Sapiens |
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