XLOC_044838 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044838
Unique NameXLOC_044838
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_71:1182457..1191330-

Legend: gene
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>XLOC_044838 ID=XLOC_044838|Name=XLOC_044838|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8874bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:1182457..1191330- (Clytia hemisphaerica)
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AAATAAACCGTTCATTAAGTCAAATCAAATGACTTTGGAGGTTTGGTGAA ATGTTGGCCGAATTGCCGTCCCATGTTTTGTCAGATGGTACCAAGTTAGA GCAGTTGATGGTAAGGTACTTGCAGCCTTTCAGTGCCTTGCATGACGGGC AGCTAAAATGTTGGCTTGAAATCTAAAATGAAACTACTGAAAACAAAAGT AAAATCAGCCCACACCAAATCCCGTAATCTTGATATAGGAGTTTTAGTCT TAACTGTTAGATATTATTACTTTTATTCCTATCTAGCAATTTAATTTCAA TATTTCACAGGTCAAATGTTGTGGCTCCACCGGACCTAACTCATGGAAAA ATACTACTTGGACTAACACCAACAGGGACAAGGCAGTTAACGGGTCAGAT TACCAACTCTTCCCAAAATCATGCTGCAAATCTGGTGATTGTAACATGGG AAATGGCTTCCCTGTTACTTCAAATGACAACATCTTCATGGATGTAAGTC TAACAAATGATCTAAGATAAATGGAATATTATTTGGCATTCCATTTCATA TCCATACAGGGAGATAGACTATCATTTCCAAGGGTAATTTTAGCAGAATT TCCAGGGGTCTAAATGTGTTTTTCCCATTTTTCCAGGGGATAAATATTTT TAAATTTCCATGGGGTAAAAGACTAATTTTAGTTTTTCCACCTCACTTTA AGGTATGAAAAGAATATTTTTGCAAATTTTGCCACTTCCCGAGGTATTCA CACATATCCAAGAAATATTTTTGAATTTAAGAGGTTCGTACAGGGGGTGG CTGTATGGAAATTTAGTGGTTTGACCCATTGCTGGATGAATCCTTGAGCT CTATGAGAGACGGGTAACTTTTTAATAATAACTAATTGTTTACATGTGGA CTTGTTTTTAGACTCCTTGTTTAAAAATTGAAATGAGATGGATTGCTTAA TTCGAAATCAGAATTTGGATATTAAAAAAAATCTATGATTCTCAAGGCAT TTAAAACTGAAAAGCTTGAAATTCTTAAAAGTACATTTAAATGAAGAGGA TCTTTAAATTCTTTTCCACTTTTTATAAAAAAATTGTTTTCATGACTATT TATTTATCTTGTTTGGTGGTTTTGGATATTAGAAACTTTCCGTCAGATAT TTCCGTTAAAACTGCATATGCATGCCTTTCCATAAGCTAATCATTTAGAG AACTTATATAGGAACCCTAACAAGAGAATACTTAATATTTAATGAAAAAA ATCTTTCTCCGTCCTATTTCTTTTGGATAATCCTTAATCATTTCCTTTCC ACTTTCAAACATTGAAAATCGAGTGTCCGGACTGTATACTAATTTATTAA AGGTTTTATTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGGACAGTGTCTT CCTATTGTTATTTGCTGATATAAGCAAAAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTT CTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCACTCCAATGTGAAAAAGCTTGT AAATTAAAATTGAGTAAGCAAACGATAGATATCACTCTTATTTCACGTAA AATAGTAGTAAGATGTGAATCAAAAACAGCACTTCTTATACCACTAATCA TAACTTGAGATTCTCTTCTTTCTTTTCAGGGTTGCGTGANTATGATTCTC AAGGCATTTAAAACTGAAAAGCTTGAAATTCTTAAAAGTACATTTAAATG AAGAGGATCTTTAAATTCTTTTCCACTTTTTATAAAAAAACTGTTTTCAT GACTATTTATTTATCTTGTTTGGTGGTTTTGGATATTAGAAACTTTCCGT CAGATATTTCCGTTAAAACTGCATATGCATGCCTTTCCATAAGCTAATCA TTTAGAGAACTTATATAGGAACCCTAACAAGAGAATACTTAATATTTAAT GAAAAAAATCTTTCTCCGTCCTATTTCTTTTGGATAATCCTTAATCATTT CCTTTCCACTTTCAAACATTGAAAATCGAGTGTCCGGACTGTATACTAAT TTATTAAAGGTTTTATTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGGACA GTGTCTTCCTATTGTTATTTGCTGATATAAGCAAAAAATGTTTTTCTTTT CCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCACTCCAATGTGAAAA AGCTTGTAAATTAAAATTGAGTAAGCAAACGATAGATATCACTCTTATTT CACGTAAAATAGTAGTAAGATGTGAATCAAAAACAGCACTTCTTATACCA CTAATCATAACTTGAGATTCTCTTCTTTCTTTTCAGGGTTGCGTGACAGA AAGTGAACAGTTCTTGAACGATCACATGAAAGAATTGGTCGGTGTCGGTG TCGGTATCGCTTTTATTCAAATCATCGGTATCGTGTTCGCCATCTTATTG TGCAAAAAAATCGGAGTAGAATCTGTCTAAAGATTTCGACCACCAAGAAC ACATACACATTAAACTTCTTGATCATAAATCAAAATTTTTGTCTTAAGTA TTTTTTTTTGTTAAGTATTTATTTTATCAACCACAGTCAGGTGTATTAAA CTGAATTTTGTATCGATTTCTTGTCAGTCTTTTTTATTTTAGGGTTAGCT CTTCCTTTTTTGGGTGATTTCTTTGTCACATTTTGTTTAATATTTTTACT TTTTTATATTAATCGATGTTGTTTTAACACTTTGTATATTCAAATTGACA GGAACTAACTGTGCGTGAAAGAATGTAATTAATCTTACTTAGCTGATGTA AAATCACTTTGTGTTTAGGCTGCACACATCCCTTCTGGTATGTTTGATAT AGGGGATGCGTATCGTGTGTCTGATTCCCGTCGTAGAACTTTCTTTAAAA GCTTTAGAAATTCAATGATTGTGGTTACTAATCATGTCTCTAAAACTTAA AAACACACAGACGGGTCAACTCTCGGACGGGAATTAGATACACGGTACGT AAATCCCATATATTAAAACATATCAGGAAATGTGTGCAACCTCTTGTGTT AGACGTTCCATGACCACGAAGGATATCCAAGTTATCCCAGCTAGCGAACG TGAACGTTGTTTCAAAATATTAATGAAATTAAGACCTTGCTGTTTTCAAA TCTGTGTTCTGACCTCTCATATTTCTTAGATAAAAGTTAGGTTGTTTTAG GCTGTGACTTTTATAGGGAATACC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072219TCONS_00072219Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072218TCONS_00072218Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072219-proteinTCONS_00072219-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_71supercontigscaffold_71:1182457..1191330 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1436.11 1420.68 1892.86 1912.92 1333.32 989.22 1010.49 1050.48 1163.36 1189.13 1039.41 853.26 497.96 465.17 267.83 287.3 393.58 534.49 427.33 460.75 383.6 378.65 585.04 529.92 225.55 218.59 332.27 287.63 374.22 402.7