XLOC_044350 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044350
Unique NameXLOC_044350
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_60:767236..774743-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044350 ID=XLOC_044350|Name=XLOC_044350|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7508bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:767236..774743- (Clytia hemisphaerica)
CTTCTAATTCTTATATAAATTAATTTGTAATCCAGGTCTTGGTTTTAATC TTTTAAAACAAATCGAGAAGATTTCACTTTCGATTTCTAAATCACATGTC AAAACAACCAGAGGCGGAGCGAGAGACAAGGTAGGTAGAAATTTTAAGAC AAAACCTTCTTTTCTTTGTCTTTTTTCTTTTTTGAACTTTAGCCATTGAT TTTATGATTAGGATAACAAGATCAAGTTCCAAATTTTCTATAATATTTTC CCTTCTGCCTTGTTGTCTTCGGCATCTTCATTGAGACATTGCAAGAGCTT CTCCTCAGATAATTTCTTCAGCGCGTGTGACCTCTACTTTTCTTTCTCTT AACTAGGAGACTTTTCTTTCTTCGTTAATTTTTGGCCTTCCCATCATTTT GCGCAAGTTTTGAACTTCATAGATCGACTCAGCACGTTTTTTTCTCCCTT CTAGCAAAATTTCGTAGAGTTCTGCTTATGTTTCGTGGACCTAGACTAGG ACGGTTTAGGGTCAATCAATCTAAAGGCCGATCTACATCATGAGAATTTT GTGAAAAGTAATAATATAGATCGGGCCATATTCTAGCTGGGAGACCCGAC TTCTCTGTCTGTGTGTGTGGTTGTTTCAAAAAAATATCAAAGTATAGACA CAGTATAGTAGCCGGGAATTATACAAGATACAAGAATCAATCGCAGAATT TGATTGGCTAATATTTTATTGTTATGATTTGATAAACAAAAGTATGACGT CAAACAGTTCTATTGTTTCAAGAAGTGGCGCAAGCTTTTGAATTGTTTTG AAAAGATAACGGTTTTTTTCTTTTGTGATTTGAAGTGATTTGAATAGGCC CGTTTCATGTGACGTCAATTTTCTCAGGATCTAGAAGGAATTTTGAATGT AAATTTTAGTATGTTACCGTAGAATCGTCTAATATCGACATGCGTCTTCT 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AAAAACTTTTGGCTAGTTCTTGTACCCGGCTGCAATAAAAAAAATCAAAT TAACCTTTCGTCCTCATTTATAGAATTGTAACCAAAGGTTTTTCTAAGTA GTTTTGTTTGATTCTCATGCTACAGACAAAAAAGCAAAAAGGAGCAAATG GAAAAAAAAGAATAGGCTAAGAGACAGGCATGTAAAAGATTTGTTCTCAA AATAAGTCAATGGTTTTATTCATCTTTTCATTTGGATATCATAAGCAGAA AAAAATATTGCCAGTTGGTCAAATGGCCTTTTCAGTTAGACACTTTGTGT CAGGGCTTATTTGCCCTGAATATTTTTTCAAGGAATTTAATGGGTTGATT CTTTGTGTTTTAAATTTGACATGGTCAAATTTTAGTTTATCTTTCCTCTC TCTAATGAAAGAGGTCTGATTCCTTAAAAAGTTGCAGAACTCAATAGATT TCACTTCAAAGAGGGACTTCAAAGTTATTTCTGACACTTTCACCAGCCCA CTACAAGGGTTTGGGATCTCTTGAGTTTAATATTTCAAAATATCTGAATT ATCACGTGCCTTTGATTCAGATTATAGAGTTGATAAAATTGCAAAAAATA TGAATGAAGTAGCAATATGTCCAAAAGAAGAGGCTTCAGTTGTCCAGTGT GTGATTCCCTTTATGAAGAAAATGAACTAGAAGAACATGTTCAAAGTCAC TTCAATGATAACCACAGATGGAATGAAGTTGGTAATTGTCCTATACATTT TGTTTTGTTATTTACAAAATTTACAAGTTTTACATTTCTAGGACGAAAGA TTTGAATGATGAATAATCCTCTTTAATGTAACTTTTATCTTTGCCCATTA ATACCCATTAATTACCCATCATTACCCATTAATTTTGGTTACTATTTATA AAATTTTGATTTGCACAACCTTTATTAATTCTTGCATACACAGAGATTAA ATTAGACAAAAATAAGTTAAAAATTGCGCTTTAGGTCCACCTCCATGTGT ATTACAGCCAAATTGTACATTTTAGAGGTTTTCTTTTAAAACAGTAAAAT AATTCACTTGTGTTTTTAATCATAGAATATGAAGAAGTACAATGTCAGTT TGATGGGTGTGGTTTGTTGGGTACAGTATTCATGTTTTTATTAAAGATCT TACTGTATTTGAGATTGATTAGATGATTTTGTTTAGGAATATAAATTGAA ATGCTAACCTTTCTTTGCTGATCTTATAGCCAATTTTACTTTGTGATAAA TTATTGATGAACTGCTGGATAAAGTTACTATATAAGATATAACCTGCAAT GTTTTTCAATGGTTTCAATTTTACTTGTTTTATTTTTAGTTGATGTGAAA TGTCTTGAAGATCACTTACTTGCACATGAGTTTGGAGAGAAAGCTGACTC AAGCCCCATTAATGATGGTAAATTTTCATTACTATAAGACTTGAAGACAT TTTAAAGTTAAATACATACTGTTTGAAAGATATTCCAAGGTAGATTATTT GAAAGATTGAAAATTTTTATAAGAATGAAAGTTGAAGGAGGTTGATGAAA AAAAATTAGGATTTACTATCTCAATAAGCTCTTTTCAACCATTTAATTCT TTTAGATTCTTTGCTGGCAGCTGCATTGCAGGAAGAAGAAACTAATGACT TGACAAGAAAAAATGATAGATGCGCAGAAAATGACATTCAGCTTGCAAAA GACTTACAAAAACAAGCAGAGAAAGAGCTCGAGGAAAAAGAATTCAAAAA ATTACAGGTTTAGAAAAGTTATCCAGTGTTGTAACCTGTTGCTACACAAC CTGTTGTAACCTGATAACAACTGGTCATAATTCTCTTACTGACAAAAAAA ATTAACCATCTGAGGAAAATAGTCTTCCCGTGTAAAATTCTACAGTAAGA ATCTTGTTGTATGTTGGAAAATCAAAAACTAAATTTTCCTAATTGCCCTA TTTCAACTTTGTTTCACTACTACCCAGCCCACTCTTTTGGCAATGCATGG ACCTTAAGAAAATGAGGTTGCATCTAAAAAAGTATGAACTTTCAATACAT CCTTATCCTTGGAATTCTTATCCAGTTTGTCTTCTTTTTTCATTTTGCAG GAAAAATATGGAATGACTAGTAATGGTGGTTACACTGAGCAATTCAATGA AAAGATGGGTAAACAAGTTGGAAGGAATGTTTCAATTGGAGATTACTTTC AGAAGAAAGCAAACATGATGTGTTCAATGATGACTGGAGAAGATACTAAT GAAACAAGAACTACTGGTATTTTAATGATACCCCACAAAATTTTGTGGTT TTGTCAAAAAACAGCAAAGTTGAAATCCTTGAAAATTTGTTTTGCAAAAA TTTCTTCTCGCAAAAATTCTTCCCTTGGGTACTTTTTATTTACTACTGAC TTTTTTCATTCAATATTTGGTTTGTTTAAAATCGAACAAAATTCTATCAA TTTGAATCACTGGAAGACAACCTTTTGGTTTGACCATAGCATAACAAGTG CAGTTATTTTTTTGTCTTATGTATCCTCTCTTACAGGAACAATTACAGTA TTAACCAATTACTATCAATCAGGAAGNCTCTCTTACAGGAACAATTACAG TATTAACAAATTACTATCAATCAGGAAGTATAAAGGGTATTTCACAAGTC CATTTAAGCTCTGACACAAATCATTATGCAGCTGATGTATCAGATAATGG TTGGGGCTGTGGTTATCGAAACACTCAGATGCTTCTTTCCTCTCTCCTGT TAAATCCTTTATATAAAGATCACATAGAACAAAAACTGGGCATGTTGACA GTACCTTCGGTCCCAAAAATTCAATCGTGTATAGAGGAAGCTTGGAAAGA AGGTAAATATGAATATATTATGTTCCCCCAAACCTTTAACCTTGTTAGAA ATTGGTTTTCAATCTTCGTGTTAATGTTTGGGTTTTTCAAATAATAAAGG TTGTAGTTAATTAAAATGGTTGATTTAATTTTTAATCTGTCCATTGAAAT ATTTGAATGCACACACAGCATGGCTTCAGATATAACACAACATTATGTCA TTCACTTGAAATTGCATTTTTCAAACATTACACTATGAAATTGTATTCTA AATCTTTATCATTTTAGGATTTGATCAAAGTGGCAAAGAACAGTTGGGTG GTAAGTTATCCAAAACAAAGAAATGGATCGGCACAACTGAAGTTGCTTCA TTGCTTCGGTGGATGAATATAAGGTAAGATGATAAAAGGTTGTTGTGAAC AATCTTTGTTTACTGCTGAGAATAAACCGATACTAAGTGAATGAATCTAG TGCTCTCGGGAAATTTTCATGAAACATTCCTTTAGCTGTTTGACAAAAGT GTCATTGATAATCAAATCGGTAATATTTCCTTCCTTCTCTTTAAGAGCGC GGATTGTGGACTTTCACAAGTCTCAAAACAACTTACATCCTCTGATGTTT CAATGGGTTAAAGATTACTTTACACAAAACTCTGATGAACAAATACCACC ATTGTACATCCAACATGAAGGTTAATGTTTCTTACAGGAAAAGATTTTCA ATGTGTTATAGTAACTCTATAATAAGAGGGGGGTTTATCTAAAGAATCCT GCATTTACTAGAAATAGAGAAAAAGAACGACAAATTTCATAAAAAACAAC AAATGTTGCCATCCACAACCCCCACCGTGACTGTACCACCCCTACGTATT CATTCCTCCTTGATTATCACGGGAATTAACTAAATATGGTTTGAAAAACG ACAAATTACGCATGCGTGTTACAATGCAGGATTCTTTAGAGAAACAGACT GTAAGGCTCAAGGCTCAATTCCTTGTATTTTAGAGCGCCATAATTTAGTC TCAGACTCAAGAATATTTAAATATTTTGGATTGGCTTTAAAACTCGTTTA ACAGCAGTGCCTTTAACCATGAAGGTTAGGGTTATAACAATTTTATCAAA ATAAAGTCTTTATTTATTGCGTGTAGTTTATCTTATATCTTCAACTATGT AATGTAACTGCTTGACGTTAGTTAATTTTTTACCTTTAGGCCACAGTAGA ACAATTATCGGTCTAGAGGAATACTCTGGATCAGCAGAAAACCAACTCTT AATATTCGATCCGTCTAACCATAAAATGCAATCAATAAAAAGCATTAAAC CACCTTACACCAAAATACAAACAAAAGCTTTGAGGAAATCCTTACACCAA ATGAAGTATAAACAATTTCAACTTGTCTTCATTGATGGTGTTTATAAATC AGAATGTGATCGAAATGTAAGCAGAATTGTTCAGTTTTTCATAAGCTTGA GTATGAATTGCAAACAGCCTATTTCACTTGCTTCTTGATTTACCAGCTTA TCAACAATCCAGTGTTGCAGATTGTTAAGAAATTTCGCCTCAATAATAAT AATAATCCCTGAAAGAACAAACTTAAATGAAAACCTAATTTTAGATGTTT CGTATAGATTCAACAAAGCTGTGTTTTAGCACTGTTAATTTAATCTCTTC ATATTTCAGGCAGGCAAGATTCTGTCTTCAATCAGGATCCCGCCGGATTA AAAAGATCATTGAGAATTTGTTTGTTATTATTTAGCACCTTTTGTATATT TTTTTCAAAAAAATATTTTATGGCAGTATTTTATTTATATTTTTACCAAA AACAGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071371TCONS_00071371Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071370TCONS_00071370Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071369TCONS_00071369Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071368TCONS_00071368Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071369-proteinTCONS_00071369-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_60supercontigscaffold_60:767236..774743 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
85.16 83.58 110.65 100.54 41.14 28.98 23.83 24.44 19.62 21.59 16.09 13.92 9.85 11 11.16 10.95 17.53 17.42 7.06 12.1 13.58 12.3 45.85 42.33 20.99 26.93 16.49 11.1 26.63 28.48