XLOC_042800 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042800
Unique NameXLOC_042800
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_486:20766..32397-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042800 ID=XLOC_042800|Name=XLOC_042800|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11632bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_486:20766..32397- (Clytia hemisphaerica)
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CCCGCCAAAATCTATCCACTTAAGGTATTGTCCAAAAAATCAAAGTTTGG ATTTTTACTTGACGTCTAGCCCAGTTTTTGATGAAATTCTTTGAGGGAGT GGCTTAAAGATTACTCAATTCACATTGAGAAAGCTAAGAAGTCGCCCACA ATGGTTTCTGATCTGAGACGAATACCTTAAGGGAAGAAATTTTAGCGGAA ATTTAACTATGCGGGTGGTCGAAAAAGTTTTTTTTACAGATGGGAATTTG ATTTTTTAGATGGCTTGAAAAATTAACCTTTGACGGGAATTTAATTTGGC GGGAACTTTAAATTTGGTTGATCCAGGCTATAATGTAATTTGCATGCTCC TTTTTTTAACATTTTGTCTGTTTGTTGTGTTGTGTATAGTTTGAATTTTT ATATCGAAAAGTTTTCATGGATTGAAATACCAGTTGCTCTTCTTAGTTTC TAACCCTTTGGCCGGTTACTCCTGTCTCTTGAATAGACGCCCCCCCCCGC TAATTGTTAAGAGGAAAAAATCTATCCCCCGCTCTTATTAAGACCCCCTC CCGCTAATACACCCTTTAAAAGTTTCGCCATCTCCACCGTAAAGGCGATA GGTAAAATTGCTCACTTTAGTACTGTGGAAGGTTAGAGAAATGTAAAAAT TGCCATTTTTCTTCTTTCCTTTAAAGAGAATTTTTTGGATGTTTGAACAT GATATTAATGACAATTTTATGTATCTCTCCTGAAAATTTCACAAATTTCA AAAATTACCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCACCCGTCTATTCGGGAGACAAGAGTACG TTAATTTCATTGATTGTCGAGCAAATCATTTATTTGCGCCAAATTACATG 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TCTACGGTATATCAGGAATCTTTTGCATGCAAAGACTTCTAGAGGGTCAT ATTGGATCCAGTCAAGAATTCAAACTTCCTGTAAACCTCGAAATCACTAA AGTCGATTTTCCTGGTTGTCCAATATTAAAATTTGGACATCTTTTGATTC CCTTGCTTTACGAGCCGGACAAGTCATCGACGAAATTTTTTCTGTTCGAC TTAAATAGCAAACAGATTTCAAGTGAGATTAATGTAAATCCAAATGATGA AATGCAGACATTTTCATTAAATTGGAATTTAAAGGAATTGGTTTATACTG GGTTCTATGTAAGCAATCACGAGGAGGGTGGCCATGATGAGATGTTGTTC AAAGCTCATAAGATTGTTTTCCCAAATATTGGCTTAACTTTGAAATGTTT AGCGCGTCTTGCTGTTTTGACCTCGTTCAGTGAGGAAGAAATAATCAAGC AAAATCTTCCAGAATCTTTATTCCGGTTTCTTGGAATTGAAAAATAAATG TATAATAAAATAAAGTTTTACGGCGAAGTATTTTTAAGCAACATTTCGTT GGTATAGAAAAATAAATAAAATGTATGAAAATGTTTCTACCCTTAAATTT CCCTGTTTTAAATTGTTCGAATTTTGTGCTTAATGCGTAAATGAGTTCAA GTATCTAAGGATTGCAAAATGTTATTGAACTAAAATTTGGACCAGTGTTA AATCTTAGTCAAGAGGTTTTTTTTTCATAAAAATATTCAATATTTTTGAA GCCTTCGGATATTTTTAAATTTTTGAGTTTTGAACCTAATGTTCTTAACA TGTCCTCATTTTTACCTCGAAGCGTAATGTTATATAACGGTTTGTTTTAA TATGTATGCTTTCATTTAAGTTCAAAAGTCAGAAAACAAAGACCGATAAA AAAATTTTTAAAAAATATGGATTTGCCAAATGAGCTATGGAAATTGGTGA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068617TCONS_00068617Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068617-proteinTCONS_00068617-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_486supercontigscaffold_486:20766..32397 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.88 7.59 3.68 2.38 0.2 0 0.06 0.09 0 0 0 0 0 0.14 0 0.22 0 0.35 0.07 0 0.38 0.05 5.02 3.11 0 0.83 0.06 0.24 1.17 2.87