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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00068617 ID=TCONS_00068617|Name=TCONS_00068617|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=833bp
TAAGTGCAAAAGTAAGAAACTAAACAAAAAAGGGATaaaagaaaattgtt
gaaatggATTTGCCAAATGAGCTCTGGAAATTAGTGATTTCTTACTTAGA
TCTCAAAAGTGCTCAGAATATTGCTCTTACTTCAAAGAAGATGCACCAGT
TGTCAATGATGAGGCTTTGGTCAAAACCAAGATATACCAAGAATACAAAG
GACATTGCATTTCTAcacaagatttcaaatttttctattCGTGAGTTGCA
CACCTCTGATTTCAGTTGTAAATGGCTTGAGATTTTAGGGTTGGTTCCAC
AACTTAGACTTTTACATGTTGACAATGCATTCAATTATCATTTTAAACCA
GACAAAGCTTATTTGCGTTTCTTAAAGATTTCTGTTATTGTTCATACAAA
AGCCTTAGAAATCTGGGAGAACTTTGAAGAATTGTTGGATATTTTGTGTT
CCATCAAAATTCAATCATTGGTTATTGATCACGATTCGAGGTATTATCAA
AGAGAAAATCTTCAACGTTATCTGACTTTCGAAGAATTTAAACTGCTTTC
TTCAAAAGTTTGTATTTCCGAGGTGCATACAGATTGTATCGAATGGGATA
GTGGAAATATCCTTGATTTTATTGAGTTGTTGTCAACCATGAGGGATTGC
AGTGTCTATTTATATAACCACAACCATTTATCTACGTCTTTATATACTGT
TAAACATTTGGAATTGATGGTAGCCCTTGAtatcaaaattgtttacattg
aAAGTGAAgGCTTGAATTTGGAAAGTTGCTCAATTCTATTAGAAATGGTC
AAAGTTATGATGAAGATGAGACATCTTAAAGAA Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00068617-protein >TCONS_00068617-protein ID=TCONS_00068617-protein|Name=TCONS_00068617-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=260bp
MDLPNELWKLVISYLDLKSAQNIALTSKKMHQLSMMRLWSKPRYTKNTKD
IAFLHKISNFSIRELHTSDFSCKWLEILGLVPQLRLLHVDNAFNYHFKPD
KAYLRFLKISVIVHTKALEIWENFEELLDILCSIKIQSLVIDHDSRYYQR
ENLQRYLTFEEFKLLSSKVCISEVHTDCIEWDSGNILDFIELLSTMRDCS
VYLYNHNHLSTSLYTVKHLELMVALDIKIVYIESEGLNLESCSILLEMVK
VMMKMRHLKE Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_486:20766..32397- Legend: exonfive_prime_UTRCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00068617 ID=TCONS_00068617|Name=TCONS_00068617|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11632bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_486:20766..32397- (Clytia hemisphaerica)
TAAGTGCAAAAGTAAGAAACTAAACAAAAAAGGGATAAAAGAAAATTGTT
GAAATGGATTTGCCAAATGAGCTCTGGAAATTAGTGATTTCTTACTTAGA
TCTCAAAAGTGCTCAGAATATTGCTCTTACTTCAAAGAAGATGCACCAGT
TGTCAATGATGAGGCTTTGGTCAAAACCAAGATATACCAAGAATACAAAG
GACATTGCATTTCTACACAAGATTTCAAATTTTTCTATTCGTGAGTTGCA
CACCTCTGATTTCAGTTGTAAATGGCTTGAGATTTTAGGGTTGGTTCCAC
AACTTAGACTTTTACATGTTGACAATGCATTCAATTATCATTTTAAACCA
GACAAAGCTTATTTGCGTTTCTTAAAGATTTCTGTTATTGTTCATACAAA
AGCCTTAGAAATCTGGGAGAACTTTGAAGAATTGTTGGATATTTTGTGTT
CCATCAAAATTCAATCATTGGTTATTGATCACGATTCGAGGTATTATCAA
AGAGAAAATCTTCAACGTTATCTGACTTTCGAAGAATTTAAACTGCTTTC
TTCAAAAGTTTGTATTTCCGAGGTGCATACAGATTGTATCGAATGGGATA
GTGGAAATATCCTTGATTTTATTGAGTTGTTGTCAACCATGAGGGATTGC
AGTGTCTATTTATATAACCACAACCATTTATCTACGTCTTTATATACTGT
TAAACATTTGGAATTGATGGTAGCCCTTGATATCAAAATTGTTTACATTG
AAAGTGAAGGCTTGAATTTTGAAAGTTGCCCAATTCTATTAGAAATGGTC
AAAGTTATGAAAAAGATGAGACATCTTAAAGAATTCAGGTTTTATGATTG
CGATTTTAAAACTGAATTCAGATCAGAAGTTGGATCACTTGTCGATTTAC
CTATCAAGAGTATGTCCACTAGTTTCTTTGTGAGAGAAGAAGGAAAGATT
GGAGACATCGTAGATACTCTATTACGTATGAAATCATTAAATCAAGTTAC
CATCAGTGAGGCGTATGAGACAGATCACATGCTGTCACCTGAAGAATTGA
TTTTGTTTAAAGAACTTCCTGTTAAGGAAGTTTTCTTAGAAGCCTTGAAT
CTGACGCCCCAAAATATTCCTGAATTTCGTCAAGTCTTGAAACAAATGAA
GATTGCTAAGATTCACTGGATCACTGGTTACTTTGAAACTCTGGGGTTTG
AAGTTTCTGTTGAGGAATTTATTGACGAATCAAATGGTTTGATCTATAAA
ACAATCGGGTAAATTCGAAACGAAGGACAAAGAAGCAAAAAAGAAAGGTT
GCTCTTTTCCAGGAAGAATTTGAATATGGGGGTGGAGGATTTAACACTTT
TTGGAAATTTACAGCAGGTTTCTACCCCACAATACCCCCGTCCCCGATCA
AGCATTAGTTGACCCCCTGGATATTCAAAATTCAAAGCTAAATTACCCCT
AAACAGAGCAAGTTTACCCCGAGGACACTCTATCCTCCACCTCCAATTCC
GACTACAGTCGTACAATAATCATGGTTGAATCTAAACCAAACGCGTCACG
AGATTGTAAAATGACCAATGGCAAAAGAATACAAAATTGTCAGCTTCACA
GTAAAAGTACTGGCCTTACTTTTTTTACTTCAATTTAAGCACTGTTTATT
CCTCTTAAATCTGTGGTATTTGATGGTTCTTCATAAATATCAACCCCTAG
AGATGTTATTTCCGCTTTTTAGTATATATTGATATATTGATTTTTAGATC
GCTCAAAGGAGGTTAAAAAGCATTCATATGGGCTTTTCTAGAAAAAATTG
AATATGGGGGGTTGAGGATATAACGATTTTCAGTGATTTACCTCCCGGAC
AAAGTGACTTTCGGCCCCCCAGACAACGAGCTTTACCCCCCGGACAAGCA
TCATTATCCCCAAAATTTAATTTTTCGCTACCCCACGGACAATATATCCA
CCACCCCCCATGTACGGACATTTTCTGGAAGAGCCCAATTGTCAAGTTTT
GTCTGTTTGTTCGGTGTTTTGTTGTTTTTTCATTTTCATTATTTATGTTC
TCTTTAGGCCTGGGAACGAAACTTTCACAATACTTGTTAAGTGCTAATGA
GAATCGAATTCTATTCTTTTTAGATAAATTTTATTAGATCAGATTTATTT
AAAAATTGAAAGAATGTTTTCATCAAATAAGTCAATGTCTGTACGATCTG
ACCTCTCCAATGTTATTTTATCACCAGCCACACTTCTTGATGGATTTGAC
AGATATGCTCTTGGAGGATTTGATGCTAGCGATAAATATTATTTGATTTT
CGAAAATATTGGGATTAAGATTCAGACACACATTATTTAAGTTCGTTGTT
CATTATGACAAAGTTTCAGAAAAATTCGTTACAAATCTTTTGGAAATTGG
TCACCCTGTTCTTGGTGGTATAGTGATGGCAAAATTTTACCTTGTTAGAT
TTTGAAGGAGTTAGAATAATTGACTGCGTTGAAAAAGAAAGCAAATTGAA
TGAGGCATTGGTAAGAAAAATTGATCTGTATTATTTTAATCTGTACGAAT
TTCTTATCCTTGAGAATCATGATATTGATCCAGATGATAAAGAGCATCAG
CCAGATATTACCTTGAGCTATCACGCACTGGATCAAATAATGAAAAATAA
TTTCAACTCTGTTACCAAGAAAATGATAACTACTCTCGTGGCAGTTGCCT
AATTTCTGGCTCCTCGCAAATAATGTTGAATGCTTCTACTTTGACAACGA
TTGACGAAAGAAATTAATTAATTATTCAATTCAGTTTCATGTTTCCACAT
TTATCAAATGTAAAATTCACGTTAAAAAGCTAGAAAAAAATGAGTAAAAA
GTGGGTGCATGGTGTCAGCCCCCCCCCTTAGAAATCTGAAGGGCACCTAG
GCCAGGTTAGTAGAGGGGGGCTAATGCCTTGCAATTCTTTGGGGTTACCT
ATTCATTAAGGGTACCTAGCTGTCTTGATGGAGGCTCTGGGGGGCGGTTA
TATTTTCCAAATCGAAAATTTCAAAATATTTCAAATTATTGAATTTTTTT
ACTAAACCACCCCAAAAATCATTAAGATTTTACCAATGACAAAACAACAA
AAAGTGTCAATTCAAAAAAGATTTTTTTGGCTGAATTGGGGTACCTAACT
CAAAGCAATTTCTCAAGGGGACCTAAATTGCTGGGGGCACCATGCTCAAT
GGGGGCACCTGAAAAGTGTGCTGAAACCATGGGGTGATTGGCGTGATAAA
ATTTATAATAGGTGTGTTAAAAAATTGTCATATAAACGCGTTTAAAAACA
ATGAAGTGAATACTGAGGCTATTAAAATATATTTATTTATTTATCTATTT
ATTATGCTTTGTCCGGTGGGAGACATTTAAATTTTTTTAGAACAAATTTG
TTGCTATGGCGACATTTCGAAATCAATTCGGACCGTTATTTAACAAGGTC
AAGTTCTGAGGTTATAACATGAAACTTCTATGTAAGACAAATGTTTCATC
GCTTTGACCCATTAACATATGGCGGGCCGTGGTCAATTACCGACCAAGTT
AGAGACGGCTTGATGTCTTTGAGTTGTAAATCCCATATATGGTTTGACAG
TTCGATTGATTTTTTCATTTCTTCGTATTTGAAGTATGAGTGTAAAAGAT
TAGATCGCTAAGTATTTGCTACAATATCAAATCAATGAGAGTCATGAATA
CGCGCGTTTAATCTTTGTTGATTTTGAATTTCAACAAATGGTGCTGTGAT
ACGAATGGGAAAAGCATTTTATTTATCTTGAAAGCCTGAGACTGTGCCAA
AATTACTGTATATGCTAGTTTGCAGCAACCACAAAAGCTTTTTCTTGGAT
TGGTGCATGATGCAGTTTGTACTACATACTGTAGTCTGTGACCATTGAAT
CTTTAAAAATCAAATCTTGTCCGAGGTTCTTCTCCAGGAAGCTTATCTTA
ATTGCTTCACCAAAACAGTGCTATTATTTTGATATGTGATTTTTAATTTC
TTTTAGAATTAATATAATTAAAAAATCATCTTGTAGCAATGAAAACTGCA
CTGCTTGGTTTTAATGATGATTCATTACCAAGAGTTCGATTAATACCAGA
AAATACTGTTAACGTTACCCCAAACCATTTTGTTATCGAAGAAAAGAATA
ATAACACTAATAATAACACTTTTACAGTATCTGAATGGACCAGTCAAAGT
CATTTCATCAGAAACATTGTTTGGGTTTACAATGGAATCGATAATAGCAA
TAAACTGACTTTAAAGTGTCGCAAAGGTTTTTACTATTCACCAGTAAATT
CATTGAGTAGTGCCATCAACGCAAGTCATGATTTTGTTATTTTTCCAGTT
GAGCATAAAAACAGGCGAGCTATATCTTTGACTTTATGTCAGTTAGTTGA
TGATTTTAAATTTAACCCCGACATGGATAGAACAGGAAGAGACCTGGGAA
CTATTTTTGAGTTAGAAGAGGAGCACTGTTACCTGAAAGACTTTGATATA
AAACTATCAACGGATGAAAAGACTTTAAGTCTTATGGTCGAAACCTTCAA
CGAAGAAAATAAGGAACACAAACGCGATGTTCATATATTCAGATCTCTTT
TCTCTTCAGATAATTGTTTATCCTTGAAAAGAGTGCTGACCATCGACACA
ATGTCAATGGGAGTTTGCCAGAATGATGTTGTTTTTAACATCAATGCTGA
TAAAATACTCATGTTCTTAGTAGATGGTGTAGTCGTTTATTCCTTGCACA
CGCAAAGTGTTATTGCAAAACATTATATCAAAGAAATGTACCTCCCTTTC
GAATGGGCTCATGATTTGAAGCATGGTGAAATTTTGATTCATTTTGCTGA
GGAACGGACCAAAATAAACGTTCATACAATTAATTACCTGGAGAAAACAT
TGTCCTTGATAACTAAAGTTAATGTTTCAGATTTCATACCAAAACATCTC
AGCTTCGATTTCCGTTGCCAGCAGCCATATTATCATCAAGTGACTTCTGG
TACATCTTTATTGATACTGGCAAGGCGAGATGTTTATTTGATCGACCCTT
TCACAGGTCATCTTTTACAAAAGATAATGTGTAATGTCAGTAGACCAAAT
ATCTCTGTTATAAATGTCCAGTTGAATTGGTGTTCAAATGAAGTAGTGGT
GTTTTATAGCGGGGTTGACAATAAATTCTTTTGGCAAGTTTTCAAATTGA
AAACAAGGTTTGTGGAACCACTGTTACATTCTCCACTTAAAGTTGTATTG
TTGAATTATTCCATCAATGATTTGGTACAATTGAACTTACCAAAGTCGAT
TAAGGATAACTTTTTTAAATGATCACCTAAAATTTCGTGTATACTACAGT
ACAAGGTGAGCAAAAAAGGTATGACCAGACAAAACTTCTATACCTTTCAT
TTTTTTCTTATTTTACTTTTTTCTATAATTACTTGACCAATTTTATTTGT
TTTGAATATTTTTGATGCACTGATCTATTTTGAATGTTTACTTGATTTTT
TGTTGATCTAAATTTAGTACTATAGTGATTATTTAGGTTAATTTTATACA
GATTATGTATGGTAGTTTGAAATATGAATTTATTATATACTGTTGGAAAG
ATAAGTTTATTTCTATTTCTGTTTTTAATTTAGATGTTGAACTTTTTGAA
GTTTGTGGGTTTATAAAAGTCGTTCATAATCAATTCTTATATTTCTTATA
GCTTTTTATCTTTATAAATGATTTACTTACAGAAACTATAGATTATAACT
GGACTAATGGTCACAACATCAATCCTTTAATCTTGTTCAGGGTAAAAATA
TTTTGGTTTCATGATGGATTTTTCTTTAGTTTTTGAGCCGTTTTGCCCAA
TTCCGAAATTTTAGAGTGAAGCTTTCTTATTACGGAGATTTTTGTGTGAA
AAGAGATCTATTTTCGATGAATTATCAGGATTCCAAACTACTGAAAAGAT
TTAGGACGAAAAATAATCGAAATTAAAGCGGCTGAATTTTTCTGGTACAT
CCCTTCCTGTACACAAAATATAGGTATTTTAACATCAAAATTTAAGATCC
ATTTTTTAGAATATCGTATTAACTTGCTTTTTTTTGTACATTTTACTTTT
ATTTTTCTCGATATTTTCTCGAAATTTATCTATAATTTTAAAGAACGTTC
AACGTTCACACAATTTCATAATTTTTTTGTCATTATTAGAAAACTCTTGC
TTATACAATATTTTCTTTATGAAATCTGATCACGTTTTAATTATTATATC
TTCAAAATACTTTGATAAAAAAAAGAAACTTCTCTTAATCAATCATGTAG
AATTCATGATGTTGATGGAGATTTTTTTCTATAATTTAAACTTATTTTTA
AAGGTTTTCAAAATGTCTAAACTAACTAAACAGGGAGATTCCTCTCAATG
AATAGCTAAAGAAAATGGGGTCACTTTTGACATTCGCACCCCGGGTAGTT
ATGCAATTCTATCTGATTAAATTCAACTTACTATTACTCTGTCTTTCATT
GTTTGCAATTACACGAAATTTCTTCTACCATAGTTAAGATTGTGGGTGAA
GAATAATATTAACAATGAACGACGTAAGAAAATCAATGTTTCTGCCACCA
ACAGCAACTACAGAATACAAAAATAAAGAATTGAGCATTTCCTTGGATAT
AATGATCTTCAAGCTATCAATTCCTTTCAAAGGGGATTTGACCACACTAG
CAAACACTTTTACATTCTCGAAGATATGGATGGTGGAGATCGTCTTCGTG
TATTTATGGTGTATTTCAATGAACAACAAAATGCTCTCGAGAAGAGAAAT
CTAACCATTGATTTCCAAGATATGGATGGTTCGGAATCGGTCTGGCAGGA
ACTTGATGCGTATACTGGGAATGTTGTTGTCATTGTGAAGCATGATATCC
TCGATAGTGATAATGCAGAGAACTTTATAATAAATGTTTATCATTATTAT
CTCCCTGATGTTTTAGTTGATCATCCGTATAAGGTATTGGATTTAACTAT
CGAGCCAAGTGAAGCAGATATTGTTTTAAGATTCGATGATAAAGACTACG
AAAGATGCCAAATTTGGTATGGATTAAGAGAAAATGACGTAACTGCACTT
TTGGTGTTAACCTTTTTCAAAAAATATAACGAGGAAGGAGAAGCAACTCG
TCTCCGTGAATGTTGTTTGGATGTTATAAAGACGCAGCAAACTGAAATCT
GTCATTCAAAGAGAGTTGTCGTCGATCTCAGTCAATCTTCAGTTTTTGAC
GATTTTTTCTTTTTTCTCAATGCAACAAAAGAGAGAATCTATTTTTATTT
CAAAAGAGACAGTGTCTTAAGAATTGACGAATATGACTACACTGGCAATT
TTTGTTATGTTTATTCGATTGCAATAGATGATGGATACCATGATTATCAT
TTTGACGACCGTTATATTGTTTTATCACACAAAAGAATTACTCACAAGGA
TAATGCTATACGAGTTTGGGAATTGAATCAAGATAGGACATGTATTGTTC
AAGAGTTTAATGATGAAATAATTGATTACGAAACATCAGATGTAAAGTCA
TTTTCGTTTCAATATTCGATCAAAAGGTTTGTTGATTTCCTTTTGGTTGC
CAATGCTTCTGACTTTAATAAAGGCAGACAACTTGTCTCTTGGATTCAAA
TTTGCAATGGAGAGAAATTAAGAGGGTATGGGATTTTTAGAGGATTGCCT
TTACCGAATTTTTTTTTAAATTGGAATCTGCACGAAGTTGGGATCACTTA
TTTTGACGAGATGACGATGGAGAGGCAGAAAATGTTTTTCAAAATCGCTC
ATGTAAATATGAATGAATATTCAATTCAAAAAATCACTCTGAAACATTTG
GCACGAGTGGTAGTACTTCAATTATTTAGCAGTAACGAATTACTAAAGCT
CAATCTACCATCAACTCTTTTTGGATATTTAGGAATTGAAAAGTGAAAAT
TTGATCTCTTTTATTATTTCATCTGTTCTTTTATTTGAGTCGTGTTTTCT
TTTTAAGCTGGCTTAGAATTTTTGAAAATGTTTTTATACAAGTTTTTATG
TAATTGTCTCTCCAGAGTGATCTTTGTTAAAAATTACCATTGATCATATC
TGATAAATAATATGTTTATCCTAGACTGCCACTTTTTTTTTCCATTTTTC
CATTTTTATCTTGTTTTCTAAGATAGACCATTTGATATTTTGATCACTTT
AAATAAAGAAACTTTCGAAAATACCTTAAGTGGATTAATTTTGAGGTGGA
TATATAAATTGGCGATTGGGAAAAATTAAATCTTTGGCGGGGATTTAACT
TGGCGAATAATCAATTTTGTAAATTTTAGCGGGGATTTAATTTGGCGAAT
GGGAAGGTTTTAGTCTCTGGTAAACTAAGAAATGCATGGTATTTTACTAA
AAATGCATTATTCTCCATAGAACTTCTATCTTGAAAAATTTCGTTAAATT
TTGCAGGGATTTAATTTGGCGAATGATCGTTTTTGAAATTTCGGCAGGGA
TTTAATTTGGCGTTTTTTAACAAAATTCGTTAAATTCGCCAAATTTAATC
CCCGCCAAAATCTATCCACTTAAGGTATTGTCCAAAAAATCAAAGTTTGG
ATTTTTACTTGACGTCTAGCCCAGTTTTTGATGAAATTCTTTGAGGGAGT
GGCTTAAAGATTACTCAATTCACATTGAGAAAGCTAAGAAGTCGCCCACA
ATGGTTTCTGATCTGAGACGAATACCTTAAGGGAAGAAATTTTAGCGGAA
ATTTAACTATGCGGGTGGTCGAAAAAGTTTTTTTTACAGATGGGAATTTG
ATTTTTTAGATGGCTTGAAAAATTAACCTTTGACGGGAATTTAATTTGGC
GGGAACTTTAAATTTGGTTGATCCAGGCTATAATGTAATTTGCATGCTCC
TTTTTTTAACATTTTGTCTGTTTGTTGTGTTGTGTATAGTTTGAATTTTT
ATATCGAAAAGTTTTCATGGATTGAAATACCAGTTGCTCTTCTTAGTTTC
TAACCCTTTGGCCGGTTACTCCTGTCTCTTGAATAGACGCCCCCCCCCGC
TAATTGTTAAGAGGAAAAAATCTATCCCCCGCTCTTATTAAGACCCCCTC
CCGCTAATACACCCTTTAAAAGTTTCGCCATCTCCACCGTAAAGGCGATA
GGTAAAATTGCTCACTTTAGTACTGTGGAAGGTTAGAGAAATGTAAAAAT
TGCCATTTTTCTTCTTTCCTTTAAAGAGAATTTTTTGGATGTTTGAACAT
GATATTAATGACAATTTTATGTATCTCTCCTGAAAATTTCACAAATTTCA
AAAATTACCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCACCCGTCTATTCGGGAGACAAGAGTACG
TTAATTTCATTGATTGTCGAGCAAATCATTTATTTGCGCCAAATTACATG
AAATTATGCGAGACTCGTAATCTAGCAAGGCTTGCTTCTTAAAGCTTATA
CTTTCAAACTTTATTTTTCATTTTTCAGATTAAGGATAACAAATTGAAAA
ATAAAAAAAATGACCAATATTGCAAAATCAATGTTTGTACCTCCAAATAT
GCTTGGCAAAGATGAATTATCAATCTCACTTGGCGTAGATTTCTACAGAG
ATATTTACGACCAAGGCTTTGATGGTTCTGGTAAATATTACATTATTGCA
ATAGATGAGTATGGAGAATTTGATATGGCTATTTTTGTTATCGATTTTGA
TGCAGTAACTGAATCAATTGGAAAGAAGATATTGAAGATCTCAATACCTA
TCGAATGTGAATGCGACAGACAGTCTTTCTTGTTTCCATACCATGGCAAA
GTTGTCCATAGTGTTCAATATAAAGCATCAGAAGATGAAAATATTGCTGT
GGACCTTTATTATCTCGATATCTTTGACCTTTTGAAAAAATCGAATGACA
CAATTGTGATTGATAAAACACCTGATATTACTTTGAATTATGACAAGGAA
CGATTTAACAAGATTTATTTTGAACGTTGTGGTGTTGATAAAAAATCATC
AACTCTGCTTCTTCAAGGGTATTGTAGATATAGAGAAGATAGATGGTATT
ATCGATATCGACCTGAGATTTGCATCGATGTTTTGCACGTTAGTAAGATG
CATATGGTTCATTTGAAAAGGGTGGAATGCGATTTGGAGATTTTTTCTTC
CGGTATTTACCATCCAATGAAGATCTTATATTCCAAACAAAGGCTGTATT
TTTCTGCAAAATCTGTTAAAACGTACGAAATCTTTGAAGTTGATCTTAAT
GGGAAAATTGTATTTTCATACATACTGTCATGGGATTCTGATTTGTTCAA
TTATCAGTCTTTATTGCAATCTGGAGAAGGTGATACAGTGATTGTCATTT
TCTACGGTATATCAGGAATCTTTTGCATGCAAAGACTTCTAGAGGGTCAT
ATTGGATCCAGTCAAGAATTCAAACTTCCTGTAAACCTCGAAATCACTAA
AGTCGATTTTCCTGGTTGTCCAATATTAAAATTTGGACATCTTTTGATTC
CCTTGCTTTACGAGCCGGACAAGTCATCGACGAAATTTTTTCTGTTCGAC
TTAAATAGCAAACAGATTTCAAGTGAGATTAATGTAAATCCAAATGATGA
AATGCAGACATTTTCATTAAATTGGAATTTAAAGGAATTGGTTTATACTG
GGTTCTATGTAAGCAATCACGAGGAGGGTGGCCATGATGAGATGTTGTTC
AAAGCTCATAAGATTGTTTTCCCAAATATTGGCTTAACTTTGAAATGTTT
AGCGCGTCTTGCTGTTTTGACCTCGTTCAGTGAGGAAGAAATAATCAAGC
AAAATCTTCCAGAATCTTTATTCCGGTTTCTTGGAATTGAAAAATAAATG
TATAATAAAATAAAGTTTTACGGCGAAGTATTTTTAAGCAACATTTCGTT
GGTATAGAAAAATAAATAAAATGTATGAAAATGTTTCTACCCTTAAATTT
CCCTGTTTTAAATTGTTCGAATTTTGTGCTTAATGCGTAAATGAGTTCAA
GTATCTAAGGATTGCAAAATGTTATTGAACTAAAATTTGGACCAGTGTTA
AATCTTAGTCAAGAGGTTTTTTTTTCATAAAAATATTCAATATTTTTGAA
GCCTTCGGATATTTTTAAATTTTTGAGTTTTGAACCTAATGTTCTTAACA
TGTCCTCATTTTTACCTCGAAGCGTAATGTTATATAACGGTTTGTTTTAA
TATGTATGCTTTCATTTAAGTTCAAAAGTCAGAAAACAAAGACCGATAAA
AAAATTTTTAAAAAATATGGATTTGCCAAATGAGCTATGGAAATTGGTGA
TTTCTTACTTAGATCACAAAAGTGCTCAGAATATTGCTCTTACTTCAAAG
AAGATGCAGCAGTTGTCAATGATGAGGCTTTGGTCAAAACCAAGATATAC
CAAGAATACAAAGGAAGAATTCAATTTTATTAGAAAGTTGTTTACATTGA
AAGCGAAGGCTTGAATTTGGAAAGTTGCTCAATTCTATTAGAAATGGTCA
AAGTTATGATGAAGATGAGACATCTTAAAGAA Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_486:20766..32397- >TCONS_00068617 ID=TCONS_00068617|Name=TCONS_00068617|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1560bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_486:20766..32397- (Clytia hemisphaerica)
GCTTGAATTTGGAAAGTTGCTCAATTCTATTAGAAATGGTCAAAGTTATG
ATGAAGATGAGACATCTTAAAGAAATGGATTTGCCAAATGAGCTCTGGAA
ATTAGTGATTTCTTACTTAGATCTCAAAAGTGCTCAGAATATTGCTCTTA
CTTCAAAGAAGATGCACCAGTTGTCAATGATGAGGCTTTGGTCAAAACCA
AGATATACCAAGAATACAAAGGACATTGCATTTCTACACAAGATTTCAAA
TTTTTCTATTCGTGAGTTGCACACCTCTGATTTCAGTTGTAAATGGCTTG
AGATTTTAGGGTTGGTTCCACAACTTAGACTTTTACATGTTGACAATGCA
TTCAATTATCATTTTAAACCAGACAAAGCTTATTTGCGTTTCTTAAAGAT
TTCTGTTATTGTTCATACAAAAGCCTTAGAAATCTGGGAGAACTTTGAAG
AATTGTTGGATATTTTGTGTTCCATCAAAATTCAATCATTGGTTATTGAT
CACGATTCGAGGTATTATCAAAGAGAAAATCTTCAACGTTATCTGACTTT
CGAAGAATTTAAACTGCTTTCTTCAAAAGTTTGTATTTCCGAGGTGCATA
CAGATTGTATCGAATGGGATAGTGGAAATATCCTTGATTTTATTGAGTTG
TTGTCAACCATGAGGGATTGCAGTGTCTATTTATATAACCACAACCATTT
ATCTACGTCTTTATATACTGTTAAACATTTGGAATTGATGGTAGCCCTTG
ATATCAAAATTGTTTACATTGAAAGTGAAGGCTTGAATTTGGAAAGTTGC
TCAATTCTATTAGAAATGGTCAAAGTTATGATGAAGATGAGACATCTTAA
AGAAATGGATTTGCCAAATGAGCTCTGGAAATTAGTGATTTCTTACTTAG
ATCTCAAAAGTGCTCAGAATATTGCTCTTACTTCAAAGAAGATGCACCAG
TTGTCAATGATGAGGCTTTGGTCAAAACCAAGATATACCAAGAATACAAA
GGACATTGCATTTCTACACAAGATTTCAAATTTTTCTATTCGTGAGTTGC
ACACCTCTGATTTCAGTTGTAAATGGCTTGAGATTTTAGGGTTGGTTCCA
CAACTTAGACTTTTACATGTTGACAATGCATTCAATTATCATTTTAAACC
AGACAAAGCTTATTTGCGTTTCTTAAAGATTTCTGTTATTGTTCATACAA
AAGCCTTAGAAATCTGGGAGAACTTTGAAGAATTGTTGGATATTTTGTGT
TCCATCAAAATTCAATCATTGGTTATTGATCACGATTCGAGGTATTATCA
AAGAGAAAATCTTCAACGTTATCTGACTTTCGAAGAATTTAAACTGCTTT
CTTCAAAAGTTTGTATTTCCGAGGTGCATACAGATTGTATCGAATGGGAT
AGTGGAAATATCCTTGATTTTATTGAGTTGTTGTCAACCATGAGGGATTG
CAGTGTCTATTTATATAACCACAACCATTTATCTACGTCTTTATATACTG
TTAAACATTTGGAATTGATGGTAGCCCTTGATATCAAAATTGTTTACATT
GAAAGTGAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1575043694:31639..32397 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1575043694:31639..32397 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1575043694:20766..20839 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1575043694:20766..20839 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1510915933:31639..32397 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1510915933:31639..32397 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1510915933:20766..20839 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1510915933:20766..20839 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1491911889:31639..32397 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1491911889:31639..32397 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1491911889:20766..20839 | TCONS_00068617-exon-scaffold_486-1491911889:20766..20839 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_486 | supercontig | scaffold_486:20766..32397 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005515 | protein binding |
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
| Category |
Term Accession |
Term Name |
| molecular_function |
GO:0005515 |
protein binding |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
