XLOC_041995 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041995
Unique NameXLOC_041995
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_466:285459..296385-

Legend: gene
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>XLOC_041995 ID=XLOC_041995|Name=XLOC_041995|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10927bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_466:285459..296385- (Clytia hemisphaerica)
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TTCACAATCACAGATTCTGCTCGCAGAATTTCAAACTCTCAAGGTTATCT AAGATAACCTTTCGCGATCGCAGATAACCTTTCGCGATCGCGAGCCTCGC ACGCACCGTATTGTTGCGCGAAGGAGCGAAAAACAAAGTTTTGTGCGAAT TGCACGTGTAATCTCGTTAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACGTTTGTAGAATACCATGC ATTCTTTTCCCATTGCTCCATTCGTGGAGAAGACTAGGGGAGTGAATGTT CCATTTTCAACTTGAAGTACTCTTTCGTTGTATTGTCTTTTCTTCTCTTT CTCGTTTGTTTCGTAGCACTTTTTAAAGAACTTGCGTCAAAAATTACAAG AAGTCTCTATTGACTTTGAAATATTAATGAAATTAGTCATTGAATATTGA ATATTATTTTCTACAGAATAGCAGTGATGAGAGTTCGTCTATCAAATCAT TCAACCGTCAAAACTCATCATCCAGTGGTATACGGAGACCTCAGATGCAA AACAACATTTTATATCAACAACCAGACTCGCCGCAGTCTTCGATGACGTC ATCAGGACTATCAGGTTTCACCTCAGTTAGCAATTATAATGGAAGAGGTT CAATGCCAAACTCTGGTTTCAAAAGGTAGGGTTTAGGTTCAAGGACTATA TTCTTTTGATTCTTTAGAGAGCATTATTTTCATAATGTATAAAGAAGTCT TCAAGAAATGTTTTGGTGACGATACCATCTTGCCCTGTATAAATTTATTC CCTTGATACCTTGAGGTATCTTATTCCGCTTGTTTAGCTGTGATACCTTA 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AATGAGATCGTCCTAAAATTTCTTTCAAAACCTAGAGTTCTTGTCTTTGT ACCACGGTTTTTACCTCATGCTTTTCGTTCCTCCGTTCTTTAATAGCAGT CTGTTTTTGCCTATTTTTGCCTAGAGTCCAGCTTATAAAAAACTTATTGT AAAGCGAACTTAAGGTCAAAGCAAGCTCCTTCAGAAAATAAGATCTCCTT GTTAGTTTATCTATAATGGTGATTGGTTAGTACTAAAAGTATTTTTCAAA ATAGTTGTTTTCTTTTCTTTAGCAAATATCAGTGACTTTCTACAACGTCT CGAGTTGGAAAAATATGGTGCTCAATTCTCCGAGCAAGAGGTAACATTTC TCATATCATCATTCCGTAATTCTAAAATGTCTTTATTCCAATTCATTCAG TATTCACTCATACTGTGTTATATATGCTATGGGATATGACATTCCAGAAA CCTGTATTTACCAACTATTTATTACACTATTGAGCCTTATATTAAAGAGA CCGGGTCTACTTTACCAGGGAGGAATGGCACTGAAATGTCTGTATCTGTG AGCAAATCAATACATCAGACATTCGATGTCTACTCTTCCACTGACATTCG CTTTTCAGAATTTTTAATTTTAGGCGAGAATCGCAATTATAGTACTTTCA ATTTATTTCATGGAATATTTTGATTTTTGAGGGTTTCAGTGGCTTCTAGG ATATATTCCCAGCCTTATTGGAACTATTTTGAGCTTTAAGTCTCGTATAC AAACTCTACAGTTAAAATGTAGAGTTAAAAAGTTAAAATTCTACATTCCA TAAGTAACTTAGAGGGGATTAGCTTAGCAGGGAATTCCCCTTTTTCTTAT ATATCTTATCCATGATTGTATCATTAGGGTGCCATCTCCAGGGTTTAAAG CTCAGTGATTATTCCTGGTAAGACTTTGAGATTAATGTATTTTGTTATGT ACAGGTTGACATGATAGCACTCCGTGAAATGGATGATAACGATTTGAAAG ACATCGGAGTGGATCAAACCATTTATCGTAAACGTATTATTGACGCTGTT ACTCCTAATGTAAGAGAAATTCATTTTTTTATTTTTTTTAAATGATTTTG AATTTGATCAAATTTAGCCCAAAACCCTTGGGGGATAAAGGTTTGGGGGA TGCCAAGAAGGGGGGTCAGACCCCCTTTCCGCACTATGTCATGTTTTTAT GATAAAATATAAATAAGAAGCAATTTTAGCGTGATCTAAAACAACTCTCA AGTTTTCATTGTACATTCACTAAAGGTTTTATTTTTACATAAGTGTTCCC GTTTCATATCAGACACATATTTCATATCAAGACGTGTCTGTCTATTGTTA TATTATGCTGATATAAGCAAAAAATGCTTTTTCTTTTCGTCTTTCTGACC AATATTGCTCCACATCCATGTCAATTCAATGTAAAAAAGCTTGTGAATTA AAATTGAAGAGTAAGCGAACGATGTCACTCTTATTTAGAAACAAAACCTT TAAGGGACAACTGTATATTTATGCTATCAGCTGAGGATTTATATAACAGA CTTTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGCAAAAACACAGAGGAGCGTCAAACAAT CGCATTCCATCACATGCAAGATTTTCACCAACACCACCCGGTCAACGTAA GAATTAACTTTTGTTTTCTTTCCTTTTCAGCAAAAACACAGAGGAGCGTC AAACAATCGCATTCCATCACATGCAAGATTTTCACCAACACCACCCGGTC AACGTAAGAATTAACTTTTGTTTTCTTTCCATCGCTAGTATTGCTGAAGT AAAGGATGTTCAAATGAGTCTAAAATTAGTTCTTTCTAATTTCGAAAAGA TTTTTGCTTATAATTTTTATGTAATTTATTTCAACGCTTTAGTTTGCTAT AGAAAACTAAACTTGAAAAAGTTTATGAAAGCACCTTAGATGTGCGCAGG TTTTCAAAGCTTTGAAAAATTTGCGAATTACCGAGGTTGGGCGAGGTGTT CCGGAATCATCCGTAAATCCGTAACACCCGAATGGTTTCCGGACACCGTC CTACACGCATCTGAGCTGATTAGCGATTAAAAATGTTAAGTTAGATTCCT TACGATACTAATACCTTTTCAACAAATTTTTATTACTTCTTTCCAGCGAA TGCACTGATTCCAACAGCTGGTTTTCCAAAGAATCAAACATCATTTGCAA GTGGTATGAGAGGAGCCAATGGTTATCCATTAATACGGTAACGCACAGCA ATCCGTCTAGTCCTCTGTAAGCTAAAGTTTATTTTTTTGACGTCATTTAC TAGATTTATGCGGGCTTGTTTTTGCACACCTAACATTATAAAGAGTCCCC CATCCCTCAAGCCAAACTACGTTTAATAGCCTTAAAACAGACACGATTTA GTGTTCTAAAAGGGCTGAAATTCTAATATATATTTTTTTCTGTCCGCACC AACCAAGTTGGCACTCCTTAAACATGGTCCTATCAAAGTTGAGCCGCCGG CTGTGCCATAACTCGAACAACTATGGCAAGATTCTAACATAAGTCTGCAT TTATCTGAAACTCATATTTAGAAAATATTGCGTCAGGAGGAACTTGACTA AATCTGTAATTGTTTTAATTATTTTAATGTAATTTTTAATACATATATTA CGAAATTGAAATTTTTGATACAGAAAACTCATACTTCGATGTGGATTTAA ATTTTTACGAATTATCATGTTTTAATGTTGTTGTTTTACAAGTTCACACA TGCTTCATTCACAATATTATCTTACTGTCTTATCAGCACTTTATCTTTTA TGATAAGTTTTTATTTTCTTTCGTGATGCACAATTTTATGAAGATAATTT TTTTTAGAATTTTTTAAAACGAAAAAAAATCATATTATTAGGTTGGTTAT TTTATTTATGTAATTATTTGTGGTTAGCCTACTTTTGATTTTTAACAATC CTTTTAATTATTTTGTTTTTTTGTGAATATTTCATTTCAGGTATTCTCTA CTACTTTCTAAGCTCATTTATTTTTGTTTGGTCAACATTTGCAATAATCT TTGGATTTCTAGTTGAGGTAGACGTAATAATTATCATAATTTTTTCATNG TTTCACTTCAGGTATTCTCTGCTACTTTCTAAGCTCATTTATTTTTGTTT GGTCAACATTGGCAATAATCTTTGGATTTCTAGTTGAGGTAGACGTAATA ATTATCATAATTTTTTCATTTAAGCTTTTTTATAATCGTTGGATTACTGT ATTTCATTTTTTTCTGTACATTATATCTCGGAATATCTAATTTTTTTTAT AGCATTGGATTTCAAAAGAAATTTATG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067222TCONS_00067222Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067221TCONS_00067221Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067222-proteinTCONS_00067222-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_466supercontigscaffold_466:285459..296385 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ANKS6PREDICTED: ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 6 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (1.13 tpm) - - (43.58 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.12 3.98 1.55 1.13 17.17 14.54 22.49 23.08 23.19 31.85 24.3 18.73 22.39 19.14 19.05 23.19 15.43 15.9 18.27 23.33 12.11 13 11.43 13.47 12.65 14.73 43.58 35.43 31.52 30.44