XLOC_040252 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040252
Unique NameXLOC_040252
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_41:161151..171770-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040252 ID=XLOC_040252|Name=XLOC_040252|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10620bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_41:161151..171770- (Clytia hemisphaerica)
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TACCATGTTGTATTGTATGCTGTATTTCTCTAAAGTGCAGTTACAACTTA TGACCCGTTGGTTGAAGTTTAATAAACCTCTCTAATTTTTCAGCAAAATC AGAAAGAGCTAATTTATACTTGAAATTATTCAAGCTGGTGTTTGGTTCTG TGTCTCTTTTTGCTCAAGAAAATGAACAGATGCTAAAGGTGAGTACCCTT AACGTCCTTTGACCAGTTTTTATGAAGATATCTTTTTTTTTTGCGCACCC GGTAAACTAGGTGGAAATCGACCTCCTTCTCCTAACACAACTATAAATTG CTAATCTTACTCGTAGCTATTCATTCGAAATTATACCCGAACTCTTGTTT ATTCTAGCCTCACCTCCACGACATTGTCAACAACTCGATGGAATTAGCCT TGACAGCAAAAGAGCCATACAATTACTTCTTACTGTTGAGAGCCTTATTC AGATCCATTGGAGGAGGTACGTTGTCCAAACCTTTGATGGATTTTTTTTA AATCCCAATCGAGGCTAGAAATTTGAAGGAAAATTGCTATCTGAATATTT TTCTTTACTCGTTCTTATCAATCGGTCTGTATACATTTTCTTAAGAAATT GACTGCTTGATCTATTTGCATTCGAAACTTTCTGTAAATTTCAAGGATAT TTTTATTCAAATTTAAGTACTGCAAAGATCACTTTGTTTTTATCCAGGAA ATCATGACTTATTATATCAAGAGTTTCTCCCCTTGCTGCCAACACTTCTA CAAGGACTCAACAATCTGCAAAGTGGTATACATAAACAATACATGAAAGA TTTATTTGTGGAGCTCTGTCTCACTGTTCCTGTCCGATTGAGGTAAAGAT TTCAGATGGCAATTGATAGGTTCTACAATATAAAGTTTGAGAGATATCGA TCTTTTCCNTTGTCTCACTGTGCCTGTCCGATTGAGGTAAAGATTTTAGA 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TTTTTCAAGAAACTTGTGCGTGATCAAAGCTATAAAGAAAATGAAGTCAC CAAAAACGGTAAGATAAAGTTTCTTCAAAGACTGCTCGGAGTGGTTTGCC GCTAAGAAAACAAGAACATAAAACTCAGTAATGACCGTAAGCCGCTGCTT TATTTATAGCATATCGTGGCAAATCTAAAAATAGACATAGATTTTTTTGT TTGACCGAAATTCAATCCCATCACCCTTTGCGTTAATTACGCTTGCACGC AAATTACACTCAATTACAACGGAAAAGTAATAACTTTCACGACTTTTGAA TTAAGACGAAAAGGATTATGGGATTGAATTTCGGTCAAATGAGAGAAGTA ATAATTATGACGTTTGCATAACGAAGTGCTAGTCTCATAACAATTTATTG GCATTAAATCCACTTCATAACACTCTCTACAAATTCCATATGGTGCACTC TCTCAAATCGAACTTTATTATTTGACTCTCGCCATCTCTGATACTTTCAT AGTACTTACAGTTGACTTTCTCTCTAATTCGATCTTTAAGGAACCAAAAA TTTTATTCGAATTACAGAGAGTATTTTAAACCGCTTTCTAGATGAGGGGA CCAATATTTTAATTCGAATTATAGAAAGATTCGAATTATAGAGATTTGAA TTATTTAAAGTTGACCGTATGTTTTAACTTGCGGCCCTTGCACCATCCCA TGAATACAAAAAATAAAATACTACTACTACTACTACTACTACTATTATAT CAGCTTTGTCATTGCAGTTTATTTCCTTTTCAGGTAAAGCATGCGTGCCA CCTTGTGTCGATGAACAGAGTAAAAAGAATTTTCAACAAGGTTTGACTAG TATGTTATTCGCTGCGACCATCAAAGAACTTCAGAATGATTCCATACCTT TCATGCTTGGTGTGCTCCGTCAAATTGCTTTGTTGATTGTCACTCAACAA GCTGGCAAATTCTCCAAACCTCCACAAACCAGGTATAGAACAATTATACA AATTATTATATACCAGTAGGCAGAAACAGCCATTGAATAATTCCTGATAT ACCATGTCCATTATACCACGGTAGAATTTTTTTTCAAATTTTGCTTTCAA AGTTTGATTTTTTTGTCGCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064199TCONS_00064199Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064198TCONS_00064198Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064197TCONS_00064197Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064199-proteinTCONS_00064199-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_41supercontigscaffold_41:161151..171770 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.9 0.92 0.9 0.87 13.52 9.91 7.95 11.57 3.12 3.37 3.18 3.17 3.13 3.78 1.86 2.69 2.62 2.93 1.07 1.96 5.14 4.27 1.22 2.88 8.84 8.03 1.31 1.22 1.03 1.16