XLOC_039239 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039239
Unique NameXLOC_039239
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_370:47651..79667+

Legend: gene
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>XLOC_039239 ID=XLOC_039239|Name=XLOC_039239|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=32017bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_370:47651..79667+ (Clytia hemisphaerica)
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AGAGGCTATGAACCCTCACCACAACGATTTCCGCCCCGTTATCCACCCGA GCAGGAACCAGACGATGGACGTTATCTTCCACAACCGCCCTCATCTAGTG AGCCGCCCCACTCGCCTTACGCTTCGTCTTCAGATCACCAGTTTGCACCG CAAGGACGTTTTTCGCCTCCTCAGAACGCTTATATTGAGGAGGATGAAAC AGGTGATTACCCTGATGGAGATATGACGCTAGTTTAGAGTGATGACGTAA AGATTTCTATGACTGAAGTCATTTTAACGCAAGGCTACGTAATCTGATAA GTGGTGCTGTCTTTCTTTATGGTTTTATACCATGAATCGAATCGATGGCT TATCAAATATAAGGAGCAATTCACTTCAATGATTGTTTACAAAAAGATGT ATGGCTTTGATGATAAAATGATAATAATagggaaagtgaaagtgaacGAA TGATTATGGTCGAGATGATAATAAATTGATAAAGTCATATTTACAGGTCA TTgatattatggagataatttTGAAAAGGTAGTGACTCGAAAAAGATATG CTGCTAATATACATACATATAGGTTGggttaataattaatttttttggaa gTAATGAATGTGATTCTAAATCAAATATTAAGgagaaatgattttttatg gagATAACTTTGGGTAATGTATAGAACATGAAAATTTTggtctttcattt tattttgttactGGTGGTAtttatttagaaactttttatatttttcgttt aaatgtttttatttttctcacatTGCACTTCGAAAGTTTTCAGCTTTATC CAAGAACAATCAAAATGGATAAACTCCGTAGTATTTTTCTACCAGCTAAA TCTCTTCATTGCCTCAAAGGTCTAATGTATTAAATTATGTTCCACTCTGG CTTCTGGCTCGTTGTAATAACAAAGAAATTctctattttgtgagtatttt tgtcgaCTTTCCcaagaaattgggtattttagggtccgcaaagccttaaa atgttcttaacttgttcttaatattttggccaaaatattaaaaaaaatta ttttcttatatagtttgttcttgtttGCACTGGGTCTAATTTGCCTAatt tctgactttttttaagaatttaatcCGCATATTTTTATATGTAAATAaca taaaataattaatttttcccttattttctgtttttgaaattaactttttt tgttcttttttctaattttttgataaatgttttttgattctgtttttttt ttttgtttttttttttcaatgtatgAAAATAAgagtgtttttatattttt ttataaatattcaATTATCATCCTTTTTCTTTCGCTTAGTGTATCTATTG TCAAACATAAAAGTAGTGTGTCAACATCATTtgactatttaaaaaaaatt acagtatTATACTTCAGTGAAGGCCTCGATGTGTTTCTTTTCCAAGTTTT CATCCCAAAGGtatattttaatgattttaaagcTTGCAAGCACATAACGG TTCCACATAGGCGAGTTTAGGTATCTTCCCTTTTCGAGGACGGCGGAGCG GTTGAAACGATTAGGAACAAGCCAAAGTTCTGGaagtcaggatctagaca aatctgAAGCCAACCGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062614TCONS_00062614Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062615TCONS_00062615Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062616TCONS_00062616Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062617TCONS_00062617Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062616-proteinTCONS_00062616-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_370supercontigscaffold_370:47651..79667 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SDK2PREDICTED: protein sidekick-2 isoform X2 Homo Sapiens
SDK1protein sidekick-1 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.23 5.25 11.02 12.14 105.75 77.87 39.33 46.74 19.71 25.92 18.04 19.41 17.61 18.71 12.5 16.93 21.38 18.96 18.61 24.51 20.68 21.77 10.47 14.07 25.72 24.63 22.72 17.83 19.77 19.64