XLOC_038057 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038057
Unique NameXLOC_038057
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_343:58211..68998-

Legend: gene
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>XLOC_038057 ID=XLOC_038057|Name=XLOC_038057|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10788bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_343:58211..68998- (Clytia hemisphaerica)
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CCTGTACCTGTTGACTTTTGGTTTTACATTAAATCCATATAGTCACTCAG TGCTCTTCAAATTAGTTCCCCATCAAAGTTACAATATGCAAGATTTAGTA TCAAACAACACTTCATTGTTTCACCAAGCTGTTACGTTACAGACAAACCT AAGCACACGGTTAAAGAAAACAGAAACTAATGGTCTACATAATGGGAAAG CAGGTAAAGGGAATACAACAAATGGTCATATCAGTAACGGTGGCATTATG GAGATTTTGGAAAATCCACAAAGTTATGGAAAAGAAGCTTGCACAATGAG TCCAGATACAGTACGCTATGAAGCACAATGTTTACGAACTGATTTTTATC TACGAATCAAACAGATCTTATTCAATTCTCTGATAAGTGCATATTATGTA GGGTTCATACCGCTCAAGTTTACACAGGTTAGTTCACTTCACCTCTTCAT TACATTCGATTTAGATATATTACCTTTGAGCCTTTCTAATCTGAATAATT TATAGATCGTTTCAAAGGGTTGTGTTAAAAACTTTAAATGATGGGCGTCG TTGGAAGATTTTTTTTTTAAGTTTGGAATACTTGGTAGGTGTAGGGGATT TTAGAGGGAAGGACATTATTATTAAACCACCTAAAATCGTAGGAGAACTA CTTTATTGTTGCTGCAAAACAAGGCTCTTCAACTTTCTACCCAATCCTAC CCGAAGTTTCAACTCCTCAAGCTCAAAGTTTTCATACTTTTCAATAAAAA TGTTACGGGCTGAAATCTTGTGTTTTCTGCTCTTTCAGAATGGTTGGTTA TACTATGACGTGTGGTGGTCAATGCAACATATCTTCTTTGTATGGATCAA CACGTTCATGTTGCTTATCACTTTCTTGGTTCCACATCATTACATAAATG GCCTTCACAAATGCGCTATACATCTTGGTGGATGGAAAAAGTATACTGGT CAAAGAGACACTACCCCGCACATGTAAGTTTCCTGAAGCCTAAAATTATC CATGAATCAGATTTGTTTCACCTTCTTCTAGAGGCTCTCAAAGCCTTGAC GGGCAGGAATAGTAAATTAAAACGACGAACACATCTAGTGTAAATGATCA CTCTCAAGTGCCTAATAGATTTGGGTTAAAAAAGTTTGGGGAGCTGATAA TTATTGTACCTCTAAATACGGTTTATTAAATCAGGCTATTTAGATCACAA TAAGGGACTCTCCTTTTGACAGCTGAAAATATTTACAAAAATTGGTAAAC GGGGGAAGGCCTAATTAAGGGCTACTACTACCGTTGACACTGATCTGTGA TTACTAATTACCTATTGGTCTTAAGCGAGGAGGGGTCGAACCTGTCAGAA AAAGTCCGCAATCTGAGAAAGCATTTTAACATAATCGCTTGGCTACCTTA ACCTAAACCCAAATCTTATTTCTTAAATAGTTGGTCACCATTAACGACTT GGCCACGTGATGCGTTAGTACGTCATAATAAAGGATTGTTTAGAGCCATA GAGAATCAAAATACTGCAACGCCAGGAGATGTTCACCATTCTAGGTTCTA TGTAAGTTATTAATTTCTTCACTATCTTCCAATCCTCGAAATTGTAATAA CATTTTTATAGATTATCTCATGGACAGTGAAAGCAAGTTGTAAATATGTT CAAGGAAAAGCGAGTTTGTCCTTCTAACAATCGAAAAGTTACCTTGTTGG TAAATAATATGAACAAGATTTTGAGTATATACTCTCGGGTACCTAATAGC CGCCCCCCCCCCCGCTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCC CCCCCCCGCTTATTCCAAACCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTATGT ATCTATGATAATAATCCAATCGTTTTCTTCTATTTCAGTGCATATTCAAT TCACCATTACGTTTATTGAATTGGTTAACCATTATCCAATTAGCATCTGT GATTGGTCAATTTTATGTTTTGTTATGGTCAAGATTGTGGTACCAATGCC TATCTGTTGTCTTGATGTCCCCGATCAGTTATTACCTGCTCTTCCGCATC CTACGTGGTCGTTGGGCAGTCGAGGCAACTTTGAAGGAACACCAAACTAT AAACACTGGACCTGCTGGATAACGGATACCCCCTTTCGGAATCGATTCGG ATCTTTGAACGCATTTAGACGATTTTTTTAGAAAAGCAAAGAAAAAACAG GAATGCATTGTGACAATAAAAGTCTTGAAAAAAAGTTAGAAGATAGGTTT TTCATTAACCTTTGTATTTATTTTTCCTAACATTTTTTTCTTATTATTTT GTGTTACTCGAAACTACGCGGAGTTATTTGTTATAGTTTTTTCTAGAAGA TTTTCATGCTCTGAACATGCTGCAAACCATTTTTTTTTCTGTTATTTTCC CTTATTTTCCCTTATGTTGTCCATAAGGTCAGTAATTTGAAACTTTTTGA TTTACTTGAAAAGTGAGTATATTGTTTATTCTTCTCTTTTAATTTACATA GATTTTTTTGTAAAAGAATTTAGGACCCTCCCTGCGCTCCGGAAACTTCC GGAGTTTTCCGGAGCAGCTAAACAAACACTATTTTTCTCTCTGGAAAGTT CTGGAGCTCTTCCGGTGCTTCCGGAGCAAGTGATTTTTATCAGTTTCTAA AAAACCGTTTAAACATGGTTACAAAAAATATTTGTCCCCAGGTTATGGAC ACTTTGGTCAAATAAAATACTTTGAGGATGATGGTTCAGCCAATGAAATT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060496TCONS_00060496Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060496-proteinTCONS_00060496-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_343supercontigscaffold_343:58211..68998 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TMEM39Atransmembrane protein 39A Homo Sapiens
TMEM39Btransmembrane protein 39B Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
245.51 238.67 125.49 100.73 48.81 36.54 46.09 49.38 39.67 41.04 54.54 49.06 50.16 54.29 44.77 43.6 33.02 43.56 43.74 39.49 37.06 37.37 112.06 99.31 38.62 46.29 30.81 35.04 77.64 78.82