XLOC_034259 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034259
Unique NameXLOC_034259
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_242:361201..385208-

Legend: gene
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>XLOC_034259 ID=XLOC_034259|Name=XLOC_034259|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24008bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:361201..385208- (Clytia hemisphaerica)
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TATTCCAATATACCAGGATATTGTTCATATATTGTAGACTTTGAGGGGAG TTATGCAGTATTATAGGTGCAGGTCACTTATTCCAGACTTTGAGTGGAGT TCAGGTTGGAATTATGCCGTATTATAGGTGTTATAATATGATAATGTACC TTAAGGGAAGAAATTTTTGCAGGAATTTAATTTCGCGGCTGATCAATTTT TTTTTTTTTCGCGGGAATTTAATTTCGCGGTTCAGCGATTTTCGAAAAAT TCGCGGGAATTTAATTTCGCGGTTGCAGGATATTTTAGGCCAAAAGCGTT ATTAAATAAGCAAAAAACCTGTTTTAAGGCTTGAAATAGTACGAATTTGG GGGAATGCGTGAAATAAATTAAATTTCGCGGATTGACGATTTTGTAAAAT TTCGCGGGAACTTAATTTCGCGGTTTTAGGCAAAATCCGCGTAAACCGCG AAATTTTGTTCCCGCGAAAATTTCTTCCCTTAAGGTAATTACTTCTACAG GATAAAGTTAATGTTAGTTTGTACAATTAATTCCTTCAGTCCTCTCACTC CATACTCCATTCAAATTTAGTCGTCTAGCAAGCGACTAAGCTTTAAAACA AAATCTTCTCTTCACATCCTAGGTGTTTTATACGCGTTGATTTTTGGACA AGTCACAAACATTATTTCACAACTACAAAAAAGTTCCAACGAGTTTACTG ACCAAATTGCATCGATCCATAACTTTAATAAAATCTACAAGATGCCACCA AAGGTTGCTAAGCGATTGGAAGATTTCTTCATAGCAACGTGGGCGGTTAC CAAGGGAACGGATGAACAAGAGGTGTATAATCAATTCAAATTCTTTACAA GCCTCGCCCATTTGGGGATGGGTCATACTCATACTTAATAAGCAAAAGAG AAGATCAAACTTTTCAAGTTTTAATAGCCTTCCTTGTCCAGAAACTGATA GTTCTAGATAAAAAGATATAGCTGTACGAACGAAACCATAGTCATCTTGG AAGTCTTAATCTGAATAAAATATGATTGCTTGAGATACGGGGTTCTCCAA ACAAAGGGGGCAACTTTCCACACAAACAAACATCTTCAATAATGAATTTT TTCTACCTCCAGATTTTAAAACCATGTCCTCGCGATTTACAATCTGACCT TTGCATCAATATCCATAAAACCGTATTCGAGAATAACTCAGCTTTCCGGC ATCTATCAGATCCCGCATTACGGGCGTTATCTCGTTATTTCTGGACAATT CGGACAGCTCCTGGAGATAAATTGATTACGACAGGAGAAGAAGTGAACAC TGTATATTTTGTGGCCAATGGATCATTGGAAGTTTACAGTGGTAATGATT TGACTGGCTTGATAGGTTAGTTCGGTTTTTTCAATAGTTCACGCCAATGG AAAAGTTAGAAGGCTTGATCTTACACAAACTATTTCTTGAGCAAAAGAAA TGATTTCTTTTCAGTTGAGTTGAGATATTACAGTGTTAAATTTTGTTAAA TACCGGGTGTCCCACAAATAAATTACCCTTGTTTTAGCCTTTTTTGACAT TTTTTTAAATTGATATTTTAGGATTTTGAACATAACTTTTGAACCAATGA AGCAAAATTAAAAAGTATTACACCTAATTTTAAATTAGGCTTTCCTCTGA ATGATTCCGAAATCTTTGAGAAATCTTTCTGCTACTGCCTACAATATCAA ATCAAAGAGGGTAACTTATTTATGGGACACCCGGTAGCTCTACCAAAAAA CCTTAAGGTTTTGCGCAATATAGCAGAAAGTTTGCTATCCGAGATCACAG ACCAATTATCTATCCCATATATGACAATTTCCAGCACATTTGAAATATAC CTGGAAGCTAAAATCTGGATACGTGTAGACATGTATGAAATGTCATTTAT 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TCACATTATATCTTTTACTTGCTGATAATGTTACAGTAACGTCAAAATAT CTCTTTTGTAAGAAAAAATATGTATTTCTGTTTAGTTGGAGACCGTCACC AAGTCCGGGGAGGTGATATCCACAGAACTTTCTTTCAAAGATAAAGACAA AGAAATGCAGCAACGAGGTGGTATAAACAAAGGTCAAAGTTTCTCAGAGT CCATGTTCATTAATGAGGGTGGAGCGGTCGATTATTCTGAAAGTGGTCGC TTTAGTGCTGAATCAAAGGCTAACCAACGCAACCATTTGGATGTATTGAG CGGTATGAGTGAGTTGAAAGGCGAGCTACGTCGCGAGACCGAACGAATGA ATGCTAAAATGGGAATCGTAGAAGCTCAGATGCGGTTGGTCTTGAAATTA TTACGACGTAAGAACAAGATAAATGATATTGATCCGGAAATCGGGATGCA GTTGGATGAATTAATGCAGTATGATGAACAAGAAGGCGGTGAGGAGGAAG ATACTGAATGGTTCGTGGCTGATGCCCATGGCTGGAAGGAGGAACCATCC CGGGGAGGGTCTAGCAGCGGAAGTAGGGGATCAAGTAAGCGCAGTGTTGC GACAACATCTTCTCATCGTAAAGTGATGGCGGTTTCAAGCTCACCTCCCA AACTACATCATATGAAAAATGTCGCTAAAGTTATCAGCTCCGTTGCTAAG AAACCACAACCGACTGGCTCAACTGCGACTCCGGTAAAACCAAAAACAAT TATCAGTACACCTAAACCACCACCGAAATCGGAAATGAAAAAATCTGAGG AGACAGTTCCTGAGACAGGCGTAGTACCTCCGAAGAAACCGCCGGTACCG AGTAAGCCAGCTTTGAAAAAGAAAGAAAGTGTGAAAGGACAATTGAATGA AACTTTTGAAGAAGATATGGAGACCATTCTGTTGTAACTGGACGACGTCT TCTGAATGACTTTTGAACGTGTTATGACTGCACTTGGAACACTATCTTAA CTAATTAGTCATAGGAAAGTGTGATAAAGTTCTTTTGCGCCGTATTCATC TAGCATCGCTTATCGAAAGTTAATTCAATAGAAACTTTAAAGAAAATTCA ATCCCCAAAATAAGCTTTGTAAATGGAAGCGCTGTCTAGAATAACACTAC CTGTGCTTTAAACTAACCGTGGGAGACAGTAAACGTCAGAAAACAGAAAA CTTTAATCAAGAAAGAAATGTTAAAAATCAACAATGGAAAGGCCATTTCT CGTGCCATATGAAATCAAGTGAATTAAGAAATTAAGAAAAGTTTTAAGTA ACTTATTATTATTATTATATACCGCTTAAGAAGAAATTCAAACTTACCAG ATAAATGATATTTAGGCGGATAACCAACTTCGCTGAACAGGCTAATAAAA ATGAAAAAGTAAAATTTGAATGTGTAATCTTAGGTTCCAAATAAAGCCCA AAAATATAAGGTAAATATAGGCTAAAATCTGGCTATTTAGAGTAAAACAA GGGGCCTTCTCTTGGCCGTTTATTTGGAACCCAAGAGTAGTTTTAAAGGA TGTCAAAATATATTGGTATGAAGGACTGATACGATGTGTTACGGTTTGTA TATTGGTTTGTTTACAAAGAGACATTTTTTTAGCTTTTTACCTCTTCAAT AATGGCCAGTGTGTTGCCACCAGAAATATTCTTCTCATCAATTTGTTGAT TTTAAATCCATTCATGAGTAGTTTTTGAATTTTTATATTTATTCTGAAAG AAGAATAATATAATGAATGCTAAAGAAACAAATAAAAAGGTAGTTTCTTC AGTAAAACTGTCAGATCTTGATTTGTGTTAAGGGCTACTTTAGACTATAC ACATAATAATATTGACGAACGATATTCAACAATATGATTCGCGGACCGTA ATGCAACTGGTACTCTATTATAAAAAAGAATTTTCTTTGGAATATTGCAA ATCGAGCTGACAATATATTCAGCATTATTTCGTCGATATATTGTGTAATG TATGTAGCCTTTTAAAGATATTATGCATGTACATGATTTTTCTCCTCCCT CCCTTGTAAATAAAAACATTTTGTCATTTATTATAAAGTTGTATATAAGA CGACATAATATTTTCAAGAAATCATTCATCACATCACATTACGACGCAAA GAAAGTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054333TCONS_00054333Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054332TCONS_00054332Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054331TCONS_00054331Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054330TCONS_00054330Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054333-proteinTCONS_00054333-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_242supercontigscaffold_242:361201..385208 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
KCNH4potassium voltage-gated channel subfamily H member 4 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.05 0.04 0.19 0.14 0.08 0.08 1.08 1.1 1.76 1.37 2.77 1.55 17.01 13.88 0.95 1.09 1.43 1.8 30.09 34.17 6.21 5.14 2.74 4.53 7.03 13.85 0.73 0.47 0.25 0.13