XLOC_033862 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033862
Unique NameXLOC_033862
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:1025926..1036348-

Legend: gene
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>XLOC_033862 ID=XLOC_033862|Name=XLOC_033862|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10423bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:1025926..1036348- (Clytia hemisphaerica)
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GGTATAACTAAAGTCCTTCCTAGATTAGTTATCCATAAATGTTCATACGA TTATAACTTATGAATTTCAACAGGGTATTTTTGGATGAATTAAATCTGTT TGCAGTGAAATTAAAAATTATCCTAAATAGAAGACCGTTTTAACTGATAC TGAGAAAAAGAAATTCTATTCTATTCTATAATGGTGACATTTCAACTTGA CCAATATTTTAAATGTCTTAATATTTAAGTCTTCAATCTTTAATAAATCC TTCTCTTTTCTTCAGGAAAAGCGGGCTTGAAAACACCATTTGTCATTTGC GCTGACATGAATTCCTTGGTGGACTCTGGCGCCATCGAATATGTTGAAAA AGGGAAAATCCCAATCAATCATCCAGATTTCAAGACCATGAAATATGGGG GTTTCCTCTCAAAGCACACAGATAAGGAGAAGAAAAATGGGGAGATGGTG ACGCACCCTTTCAAGTTGAGTAGAGTTGCAAAAGAGAATGAACTGCCATT CACTAATTATACATATGACTTTGAAGGAGTGTTAGATTATATCTTCTATA CTAAAGATGAGTTGACAATCCTAGGTGAACTTGGTCCTGTTAACTTGGAA TATCTGAAGAAAAATAAAGTCATTGGGTTTCCACATCCTCATTTCCCGTC AGATCATATTTGTTTGGTTGTCGAGTTTGATTTCAAATTGCCTTCCAGGT AGTTTGGACTCTCTTCAACCATCAATTATCTAAAACGGTGAATTGTTATG TGAATTTTTTTAACGTGGAATACTTCTTCCAGATTTTACATCTTGTCGGA TTTGAGCACATTTCTTCCAACCTACATTTCCCACAACCCTGCATTTTTCT TTATGGATGACATGGCTGGCAAAACTGAGATCAAAGTGTACTGGTTGCAT CAAATTTTTCTTTTGCTTGACTCGTGGAAATCGGTTTTAACAATTATTTG 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ATTGTGGAAAAACTCACTTTTAAGCATTTCAAATCTTGACTATTCACCTT TTGTCAAAATACGACTGGATAAGAAAAGATAATTCCAAACACCTGTGAAT AAGATTGGCTTTTATTATGTAAAATACTACTGCAAAGATTTTTTTTATCA AACTCTAATGTTTTTGGTCATTTATAATATTTTTTGTGCACATGTGTATT AAAGCGAAACCATAATTGTATTTGTGTAATATTGAACACCTATCACGCAA GAAGCAATCTATTTTATTGACATTATAGTCAATGTACTGATAATACCACA GATCGTAATTTACTTTAACTAAGGATTTTTTAAAGGTAATCTAAAATAAT GTTTGTCATTTCTTGAGATTTTTGTTGTGGTTTTTTTTTTTGGCGTGAGA TCTAGAACTTTGAATTATGCGATTTTTTTAAAACGAGATCTTCTAAAGGA TGAAAACCCAGGTTTTTCTTAAATTTACTTTACATTTTATTTTAAAACTA ATTCTTATTTATGTATAGCAAGTTAGAAGCAGTAGTCGTCAATTTTCACC TTAGCCTAGCACTTTTATTTGTTGACAACCTTTTTAATCAATCTTATCAA TGACGTTCAGAACGAAATGTCATTTTGAAATGAATAAGTAAATAATAGTG ATCATTGAACTACCTTTGTTTGTGGAAATTGATATAAAAATAACTTCGAA CCATCAGAACTAGTAACTCAAAGAGTCGAGAGCACTAGGTGAAATTGACA AACTGCTATGATTTTATCCCAGCTTTTTTTAAAAAAAATAAAGAGACAGG TTGATGTATTTGTTTACTTCTGGTCATTGCAGAAGATGATATGAAAACAG TTGAAAAAGAAAACCACATAAAGATTTTAAACTTAAAATTCTTTTATTCT ATCATATTGTAGTTCTTTATTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053692TCONS_00053692Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053691TCONS_00053691Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053692-proteinTCONS_00053692-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:1025926..1036348 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CNOT6CCR4-NOT transcription complex subunit 6 Homo Sapiens
CNOT6LPREDICTED: CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.22 7.06 13.59 16.09 60.29 46.49 48.33 49.06 31.54 29.9 21.31 21.06 17.62 18.2 17.32 19.37 27.23 23.36 12.12 13.24 22.25 22.86 25.01 25.95 24.05 26.78 13.05 9.49 20.41 21.04