XLOC_032476 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_032476
Unique NameXLOC_032476
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_20:118552..163761-

Legend: gene
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TCTCGGGATTGGCTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATTTTT GGCGCAATGATGCAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTT TCGAAAAAAATTCATTTACGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAA CCGGTTTTTTGGCATTTTCTGGAGATTTCATCATTAGTTTTTTCTGTTTT TTTGCACAAAGATGCGTATTAGCAATGCCTAAAACATGGATTAGTCCGAT TTTTGAGAAAAATTCTATTCCGGCTGAAAATGCCGGANNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCCTCTCCCCCCATCAACAATCAATGATGAA TTTATTGCGTTATGCATTTTCGCTAAACGATATATTTTCTGACTGATTTT TTTCTCCTCGCATTGCTACCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAG CATCTAGCTTGTTAAGTTTAAAATGTATTTTAATTTGGGACATATGGACT AGCATACAATTCTTACTGTCGATTTCAATTGTTAAAAATTCTGGAATAGT ATTATTGCAAAATGAGAAATGTTCTATTGAACATTTTAGTTTCGGACGTT GATGAAGCCACCTTTTTCGAATCATCATCAAAAGCTGCTTACTTTGCTAA AATCAATGTCCAAAAGCTTTTTTACATGTCGAAATTTTTTCTTTTCTTTA AATTTTTTAAAACTTAGATTACGTATGATTCAATACCATTAAGAAAAAGA TTTCTCAATTAAAAATAGTATCAACGATAAATCATTGACAATGCATTGAT TTGTCAATATTCTGGCCCTAAGTTTCATTTGAAGCAGTGACGTCATCTAA TCCTTATATCAAAGTACGTCTTTTTTTGAGTGTCTGAATGGAGTCTTATC ATTCTATGACATCTTCAGTAACCCTTAGCAACGAACCTTATGATATAAAA AGGTATCTATAACACTATACAAGAAGAAATTTCATATTAATTTGGTATAG ACATTTGTACAGATAGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGGAAAATTGTTGAAAG AAAAATAGCACACATTCCTTAAGTGGTATTGGGATAATTACACTTCATTC TGATTAATTGTGATTGCTGAGAGCTGGGATCGTCCAGTTTACATTCATTT TGGATTTGAGAGCCCACAGAGACTGTTTTACTTTACGTACAGGACTTTAT AAATTTTAAATACAAAATGTCAAGTTATCGTAATCGGAATAGTAAAAGAC CCAAAACGTATTATTTAGGGTAAGTAAATACTTTACTTTCTCAAGAACTT TCGTTTTTAAATCTCAAATCAATATAAAGTGTGTATTACATACCGTTCGA AATGGAGTTCCGGTGAGTTTTCCGGATGCCGGTTTTAAAATACAGAATTT TACGTCCCTTTTTAAAAAATTAACTAACGGTACTTGAAAGCTTAGAACTA AGATTGAAGAGAGTAAGTGGATAGTGATATTAAAGGGTGTTTCAATGATA AGTATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTCTACGGAAAGACCCCGGTT TATGCCAGTAGTGGCTAACTTTATACAACTTTTGTCTAGTTTGAAGTTGC CACTACTGGCTAAAACCGCTGAAAACCGGGGTATTTCCGTAGAAAACATT ACGTCATGAATATCATGAATAGTTGGTCCAATTGGATCAGTGATACAGGG TTTCTTTCAGGGCCAAAAAATTTGGCGGTTCGTCGGTTGATCACCTTTTA ATAATTTGAGTACTTTCTTAAAAAATGCTTCTGTCATCTTCTGTTTTAAA AGTGCATAAATAAATTTAAAAATAAATGATCGTAAATTTACGATTTTAGG CCGTTAAGTAGGTGAATCTACGACAGCAGTCAAAAGACGACACGAAGGCT CCTTTTTCGATCGATATCTACCCGAAAAAAGGGGAGGGTGCCACCATTTT TCCCTGGATTACCCTTACCCTTTATCCTTTTCTTAATGTCTTCAGCATTG CACCAATCACCAAATGTCTTTTACTGGGATTACTTCATAGTTAAACTTCT ATGGAATTTTTTAATATTCCATCTGGTAAACCATTTTATTTCTCTTTAAA ATGATTGCGGTCAAATCGGTGAGCTTTTATCATAAAATGACCAGTCGATT AAAAATTCCATACAATACCTTCTAATAGCTTTTAATTCCATATTTTTCTT TCCTTTTTTGTGTTTGTTTTGGTTTGGTTTGTAATAATTTCCAATACTTA AAAAGTTAATGGTATCAAAATGTCGTCAAGTCTACCTCTTTGATTTGAAC CGCTTCTTTAGTAAAAAATATTTGATGAGTTTGATACATAATAATGCCAC AACAAAATTGTCTCTACCTGGATTGACAGTTCCAGTCTACAAGAACTTTG ATGTTACATTTTAAACTAATAAAGACTAGTATTTTGAAGTCCTGCTGTCC TTTTTGGTATTTTAACATGTCGCTGCCCATTGTGCTGTATGTCCGTTTTT GATGAAGTAGCGCTTTGTCGATTCAAGTTTATTTTAGAAGAAATGGCGCC TTGCTCACTTTTGAGTCGCTTGGCATTCACGCCCTACGGGCTTCTTGTTT TACTTAGGTCCAAATTCAACTTTTAGGACTAGGATATTTTTCATACTTTA AACGACTAGACCAATTAGCAATTCTCGATAACAAATATTTTAGCTCATCG TTCTTATTTCGCAAAACAATAAGGTTATTCATCACCAGTTCAAAACAAAC TTTCTGATAATGTGACTCATTTGTCAATGACTTGCTGATTGTGTCATCAT TATACGTTTGTTTGTTATACACACTCTTATTAGCCTGTAGCTAACCTGAT AACAGATGTTCATAATTTTCTTACGCGCACGGTAAACCTCTAAAGGCACT TGAAAATTATACATCTGAGGAAAATAGTCCTCCCGCGGAAAATTCTACAA CAAGAATTTTGTTGTGCGCCGGAAAAAATAAAAACTAATACGGCGCCCTA TTCATAAACACAATCGCGCAACTTTGTTGTCATTCCCAGTCCTTTTAGAC GAACGCGGTCCTTACGATTTCGAGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTCGAGATTGCATATTCGTCAGAT TGTTTGTTTTCACACATCCCTTTAGAGCTTCAGCGTGGTGTGCAGAAAAC ATTCACAATCTGATCTCAGGTTACCTGTAGCTCGATGATGGACATATTCG ATAAGAACGACGAGATACAAAGTATTCCACATTGTAATCAACAAGATTAG TTGTTATTCGTATACAAGTTTAAGTTGTATTGGAAGTTTATTGTGTGATT TACGTTTCACTTAAAATCAAACTTGGTTGAAAGCCAAACGTAAATCGTGT GATCCAAGCCACAAAAGACTTCTAATATGAATATTACTGGGTCGATAAAC TCAAACTTAAGTTTAAGTTGTATTTACTAGAAAGCTTAGGATGGTATGGT TAACTGTGGTATTGTCCGGTAAAAAATTTATACATAGCGGCCAGCAAAGT GATTTGGTGAATGGATGATTTCTTAATAAAATTGGTCGATCGGAATGTTT TCAAAGAATTTTACAGATTGTTAATCTCCAATGTTTATGTTTAACTCATT TCCAATCCCTCAAGAATACATTTAGATCAGGAAATTTCTTCTTTTCAGCC TATATTTTCCTTTATATACGTTTTTTTTTTTAATTGGAAATTCAAATTTT TGAAGCCTTCGGATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTGACCAATTTGCGAA CTATTTTTGACCATTTTCCTAAGAAATAGGGTGTTTTTGAGTCCACTAAG CCTTAAAATGTTCTTAACTTGATCTTAACATTTCGGCCATTGAAGCCTTG TGTTCTTATAGTTTGTTCTTATGAGAAAAAAAACGTGTAGCCGAACATTC TGAAGTTTTTGATTTCCCTTCTACGACGTTAAATCAAAAGTTGATAATTT CCTTTTCTCTGGATTGGATATCTAATCGTAGACATATTAAAAGCTCGGAA GGAAAATAAAAAGATAGAAATCAAAATATTTGAATTGTAAACCGTTTTGA TGATCCGGAGGCATCATTCAGGTTTTTGATTTCTGGTCGGGGAAGGAAGA TCATTTTATTTTGTATGTTTTGACAAAATGTTCATCAAAATACAGACCGA TAGCTGCAATTTTATCTAGTTCCTTAACCATTGAGTATTTGACTGTATGG TTCTTAGGAAAACATGAGAAATGGTAAATCTTTAACTGGGGAAACTTTAG TATTCGCTTTTAATATTATTATGATAATTCGGATGACTTCAAAAAACTTT TATATTGTCCTTAAACTCTATGATGCATTTTAAAATGTCTTTTTTTTTTT TCAAATTTACATTTTCTGTGCAATTAATGAAATCTTTGCCACCTGATGAT TTGACATCAATTAAAAGAAACAGGGGGGAGATCATAATATTCGTTAATGA GATTATATGATCAACACACCATTTTATAATACCATGATGCCAATTAAGAG GGTTGTGTTATATCATTGAGAGACATCGTCAGCATTTGCTTGTATAGAAG CCGTATATTTTGCTAGCAGGGTTAAAACTCAGCTTTGAAGGTTTTGTTTT GAAAACCTTTATGGCTGTGTATGCTTAAAATTTCTGTCTTCAATGTTTTA TGAAATTGAATATTATGGTACCTATTTTTCATTTGACTTTTCAAAAGTAT TTTTGGATGAATTTGAATTTTTTGATGAGGTTTTGGTCTAGAACACGACT TTTCAAAACAAAGCAGCAACTAGGCTTTTCTAAATGTTTTATTGTTGATG TGTTTTATATTGTTGATTGGCTTTGGATTTGGGAAATTCCTTTCCTTTTT AGTTAGAGTCCTACTATATACATTTTCAACTAGTCTTTACAACCTACAAG ATTAGTCCTAGGAACTAACACCTTTTTTAAACATAAGCTTTCCTCTGTTG TTGAGTTTGAATCTTTTTTTGCCAATCCTAGGACTTTAAACTTTTTGTAC AAAGTATTAAACTATATAAAAGAAGATTTCTGGTTTTCATAGATGAGCTA AAGTCAAAAAATGGTGGTTTTCTTCACCAGCTTATCCTGGTGGATTTTCA GATCAAAATTTAGTTCCTTACATTGCTAATCTGTTCCTTAGTAGATGAAA AGAATAACTGTTGTTGAAAAATGTTTTTTTCCGAAGTTTTTATCTTTGCT ATAGTCTAAAGATGGTCTTTCTCTAAAGGATTAGATTGTTAGTTTCAGCT TTTGGCTTAGTTCGTTTTGAATCTTTCTGCCAACGTTGATGGGCTCTCGT TTATGTCGTGAGTATCCTGTAGCGGATAGAATTGGTTTGATTCAATATTC TTCTTTTTCTTGATACAGGCTATTTTATGTTCTTTGGATCCTTAATTATT GGAAGATTGCCAATAAAACTCTATTTTGGATTTTTTTTTGTTTTAAACGA AAGCCTCATTAACTACTCAACAGTTTCGTTGAAATTACCTGAGCTTCTCT CATGATATAAATTTTTTTTGATGAACTAATCGCTTTTTATGTGTATAGTA TGTGAGGTGTGAGAGAGTTTGATGGAAAATGACTGTGTCCAAAAATACTG ATATGTTTGACCTCAGTATGTTATGTTAGTGAGTGAAGGTGAAAAAACCT CTAGTTTTTGAAAATTAAATCTTTACCATATATAAGTCAGTCTTGAGCAG CTTTTAAAACTAACGTAGTTAGTTTTTAGGATTTTTTTGGTTAATATAAA GAATTGACCGGATTTTAAATGATATATTTTTGTTCGGGGTTTTATTGTCG 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ACTGTATTCTCTTTCAGTATTTTTTTGGTGAAAAGTCAATTGGAGTAGTA AATTCGTTATAATATGTTAAAAATCTTTGTGGAGTTTGTCTTGGGTCATC ATTTTTAAATTAGCGACTCTGATTTTTGGCAAAGTTCTCTAAAATGATAT TAAAAGAATTTTATTTGACATAAATTCTTTCCAAAATAAAAACGATGATT TCTCAACGTTCGTATTGTGAAACAAGATGCTTGCTAGCGGAAATCTAGCC CCTTGAAACACGCACAATGCAACGGAAAAGAACAGTCAATGTACTCAAAA GCATAGCATAAAAGAAAAATAAGACGATCTTTGACAATCTGTCATTAAAA TGTTGTCATACTCCCTTAACACTTGATGCTTATGACATAATGTTTACTTG CTGCCATTACAGAAAGAACTGTGGAGCTTCTAAGTGGACCCTTCTCAATC TTACTTCAAGTATTTTCACTTGAATCTTTTATGAAACAAAAGCATTTTTT CTGAAATTCTTTCTTTTGAGTACCCTCTTCTAAAAAAAAGGAAAATTTTT GAACCGTTACCATGAGCTTGCATTCTTTTAAAGCAAAATACTCCAATAAT TACTAAAATGTATTGCCTGTAACTACCTTTGCTTTAAGACTACGAAAAAG AAATCACTAAAAATTCCAAACTCCAAATTATTCATTCTATAAAGCAAAGT TCACGAAATCATAGATTTCGTCCATTTTTGACTGTCACCTTATAGCTCTG CATATAATGACCTTCTAATCTCTCTTTTTTTCTCTATTTTAAAGTTGATA TAGACGTGATACCAGTAGGTGCAGATTTGGTCAAAGTATGGGGTGTGGAA TCAGAGCTATTTCTTATGATTGACGATCAAGGACAAATGAGAGGCACTGT AAGTATTTTTGTTTTTTTTTGCATTTTAGTGCCCTTCTTTATCCAATGAT ATACAAAAATCGATGGAATTAATTAAGAAAGTACAGTGATACAATCCTAA TGCTGCACACTGGTGGATTTAAGATAATAGAGGAAGTGCGTCGGAAACAT GCGAAGGAGTCCAACGCTCGTTAAAAGACAATGTTAAATTACAATCAAAA ATCTCTTCCTCTGATAAGGTCGACTTAGTCCAAAACCACCTATGACTTCA AACGGTTTTGTGGTACCCTCAGCCTTGTGGTGTGGGATGGTGTTTTGTGA AAACTGATTTTTCCCACAAATCTCTTTACATTTTATCTCTATAATAACAA GATTTTTAAATTAAGAATTTTGGTGTTACATAATTCCTTGATCGTATCAA AAATCAAAATGAATTGCCTCCTTCAATTAATTACATTAAGTTACAAAGAC TGCACTCATCGTGGAAATTTTGTTCCCTTTTTTTAATAGGCTTTCTTTTC AAAGTTGTAAACTTGCTAATGCGTAATGGGTTTATTCCATGAGGTGTTTA TCGGTTTAAAAATATGAAAAAAAACCTAAGAAAATGACCGGCGATGACTT TATTCATTGAACATAATAGGCTGCAAGACCTCACCAAAACACTCGGGACT TTACATGAACAGACCGTGCTGATTTTGACTTTTTAAAATGTAATTTCCAT TCTCTGTAAATAACCGAAATCTCAATACAGGGTCGAAAGTTCTCCCGAAA TGCGATTACCATTTTAAATGAGCGACACCAAAAAGTTAAAATCAGTATGA GATTGCCATGTAAACCAGCCCTTAGATGGGGCCCCCTTAGATATGCGTTA TTTTAAGACTCTTGTTAGATTGCAAAGAGCTCATTTTAAAGAACTTTTTT TGAGATTTTCAATTTTTCATTTTTCAGGATGTTGATAGCGCGGAATGTAT CTTCGAAGAAACGTTAACAGAAAACTTTTTCAATGTCTACTACTCAGCTA TGTATTTGAATAAAAGATGGTGCATAGGATTACGTAATAAACAACAAACC AGGAGTTTTTATCGGAAACCGAAACCTGCAAAAGACACTTCTTTTATGAT TGAGATTGTACAGCGAAGAGCTTCAACCTCATCCGCATGCGATAGTGATG ATAGTCGCGTCAGCTCTATTTGATGAGCGCGGAAAAGTGAGAATTGAGAG CAGGGGATTTCATTGAAACCTTCTTGATGGAGAGAAGTGTTTATGGGTTT AAAATGAAAGGAATGGAGCTTTGATTTGGTGCGATTTGTTTGGAATCGTT ACCGTTGGAAACCATCTAGACACACCTGGTGAAGATGGTACCATTTTGAA TTTTTGATCCATTGCCGCGCCGTTTGGCAAAAAACTATTTTAAACATTTG TCACTTTGGGGACACAAACACAAGATTAATATTACAAATAAAGATTTAAA GAAATGAACATTTTTAAAATCTCATTTTATTTGGAATTGTGGTAATCAGT AACAGGATTTTATGTTATTTTTTGCATTGTTAACGTCAGGATACGAGACC GAATTTCCAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00051237TCONS_00051237Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051236TCONS_00051236Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051235TCONS_00051235Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00051234TCONS_00051234Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00051237-proteinTCONS_00051237-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_20supercontigscaffold_20:118552..163761 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.97 10.9 19.5 21.43 67.73 50.24 72.31 67.61 34.18 47.03 25.7 31.28 44.98 30.21 64.04 76.89 59.11 70.18 49.88 61.06 27.55 24.17 48.85 48.96 33.21 37.69 192.61 154.81 115 125.92