XLOC_031662 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031662
Unique NameXLOC_031662
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_167:1399339..1444126+

Legend: gene
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>XLOC_031662 ID=XLOC_031662|Name=XLOC_031662|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=44788bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:1399339..1444126+ (Clytia hemisphaerica)
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AATTTTAGAAAAGCTTTCGTAGgaatgtttttaaactttttggatTTGGA GGTTCATTATTTTAGAAGAAAAGTGAGAATTATATGGAAAAAAGCTGACC ATCTTTCCTTCCTTGAGCTTAGCTATTGTGAATTTCGTGTACTCCTTCGT CTTGTATTTTTACGTTTGGGCCTGTACTCTTAGCTCGGTAACACTCTATG GAGGAGAGGCTTGGGaaaaattattatcaatttagggtttttaatttctt ttcattttcttcccTTTTTAAATCTACTGGTGCATgattaatttatgaaa aaaagaagttttatcTGATGgagaaataaatgaaaacatttttttgaagc cGAAAAAAGGAACTCTACTTGACTTCCACGAAGGCGACTGCGCAAACTTT GTTTGAAGTTTAGAAATTTGCAATCAATTTATATTAAAgtatgaaattga aaaagttcTAAGGAGAGAAGTTTTGTATGATAAACTTGAATTTCGTGGGA GATAAAACAAACTAATATTTTTAGAAGCGTGAACTAAGGAGCCCTCGTTC TGTGCTCCAAGAGTTTTATTGCTTCAAAATCTGAAAgtgtttttgggaaa atgtctTATGGTAGGCGTAAAATTTGCAATTAAAAAAGCAACAGCAGTAG AAACAGTTTAAGAATTCCTAGAGTCTGGTTTTATTATGTTgtgaataaat tatttttgcttttaaggatttttaattGATGTAGTTTTCaatctattttt tcaatttcttttagcACCGGTTATGCCACCTACCACGTCACCAAAATCGG GCGGCGGTGATGGTGGAACCAAAGGGGAACCAGCTGAAGAAGGAGGATTT GCCAAATTTGGTCCTATCTTGTTGGGCGGTATTTTGGGCGGCTTTGTTAT CTTGTTGGCGGTGACAATCTATTGCTTATGTCGCAAACGAAAGAACAGAA AATATGCTGGTAAGTAAAATTTTCTGACAACTTGATCCATTTTTTAAGTA GAGCTACTGAGTTAAAGAatccgattttttttttcaatttcaaatataaa caaagaaGCTTTAAAATCGTAACTGAAGCATGAAAATGGCCTCTATACAT AGCCGTATTATTGCTATGACCCAAAACCATTTCTCATCAACAAGACTAAC TGaccaattatttttcatttcattatttagCTTCACGACAACAACAAATC GCCTTCACTAAAGAAAAGTAAGTTCTTTCATCATATCTCCATCTTCCGAT GATTGATCCTGCCTTGTAATCCTACCTCCTCTTCATTCAAGATTATCATT ATCCTAATCTTTCCATTCACACACGGCAAAAATCGCTCATTACTGGTACA AGAAATTTCTATgggtttgaaaaccaaactgtGTCCGCCTTACTGATTTC TCATTTAAAAATCACCGTTTTTGAAATCGTCTTTTTACATTTTCCTCGCC TTTTCTTCCCCTTTCATGTTACCTGAAAACAAACTTTCTTTTCCTTCTTA CCTTAGCGGTGTCAACATGGAGCATGGTATTGAAGCAGGTTACAGTGATG AAGAAGAAGTTGACGAAACAGATGAAGTTAAACTCCTACATGACGAACAA GATTCTCCAAGACGTTTCCATCTCAAAACATGCCCTGCTTTGAAACTCGG TGAATATACCAACAACGGTGGAGATATAAAAGGAAAGAGTAAAGATCCAG TCTATTTCTTGTTACAACGATATGAAGAGGAAAAAGAGATGTGCACGTGT AGTACAATGCGATACATGACGCTTAACTCACACGAACAGAAAGTCAAACG CGATAAGAAGAGACATCAGAAAAAGGCTGGATCGAATGGTGGCATGCATC GAGCAAATTCGTCACCGTCACTTTTGTTAACGTCAGAAAACGGTTCATCT ATCGATCCGTCAGAATTATTAGACGAAGAAGACTATGATTTGAGCGATAA CGAGAAAGACGCCGTCGGCGATTTAAATACCGAAAAGTATCCGACGCTGA AACgacaaaagtttaaagattcgTATGATCAATTCTGTCGGGATGGAACC ACGACGAAAGATGGTCGTCGCCGATTGTCCTCGGAAGAGAAAACCGAAGC CGACAAAAATTTGGTTATTCTCGGAAACGGTGAAGTCGTCAACCTGAAAG ACGTCAATGATGTATCATCTGAAAACTCGGCTACCGAAAGTGAACGAGTT TTAACACCGAAAATGATGATGGAAGTTAACGATAATCGTCGTTCCAAATC GAGTGGATTCGGTGATGGAAGTAACTCGACCTCCGATTCGGAATCGATCC AAGAACTGAAAAACCCGATGTCTGGACGATTACCGCCATACACAAACGGA TACCTAACTGATACCGGTATTTTGAAACGCCCCGATCATGGGTATGCTTC TGATTTCTCAACACGCAGCTCACCACTTGATTACAAGAAACGAGGCGGGC GTTATCAACCACCCGCCCCACAACAACACTCTCGTATAAATGGTTACGAG CCACCAAATCATTATTATTCTGAAGATGAATCCGTTCGAAGCGGCCATTC AGGTTTACGCCCTATCCAACCGCCCCCTTACACCCAAGCATTACACGATA TCGAACGTTTATCAGAGAAAAATGATGTGACCGACAGTGAGGATTTGTAT GATCACCTACTGGATATGGGTCGAAAATTAGGTGTCACTTTAGATGATTC TATTGAGAGCGATTTGAACACTAAAGGCATGACTTTGCCTCCACCTCGCT CCTATTCCAACCCGAGGGCGTACCCACCTCCAACGGGTGTTGAGTCGGGC TACATGACAGACACTAGTGTCGGGAAAGACCGATATACCGATCGAGAAAA ATCGGAACGTTGTGCTCAACTTCTGAAtgaatttaaaagttcaaaatcaa GGAACACTATTAATAATAACACAGACTCTGAAAATAACTATGAAGATGAA CTCCCCGTTGATCCGCCTACGTTACGTAGTCGTTCCGTGATGGGTAACGT AACGGAATTTGAAGAGCCACGTGTTCCTCCCGTCTTACGGCGTAGTAACA GTGCCGGATCGAGCGGTGTTTACAAAGAATGGCTTGTGTGAACTGGTCCT TGATATAGATAGATGGGGTTTTGTTATAATTGGAGGATTACATCATCGTG TAGATGGTGCCTTATGTAGTTGGCAATGTCTCATTCAAGGTGTTTTCTAA CCAAgagacaaaaatgaaaaaaagaccttttgcattttgaaaaatgGCCG AAATGACATTTTCTAGGTAATTAAAGATAGATAGTTCTTTGAGCATTATT TCATCCTAAAAATTCCTAAAGCCAATTTTACAAAAGTTTGGGCCAACGAA AACTACAGTTAATAAACGCAACATGGAACATGAAATGCAAAGTATTTGTA AATAAAtgctaaatttttttataacaaaatatttatatagtatgataatg aaagtttttttttcaaagtcaagTAGAGAAATACAAAATGAAGTAAGTAG TTAGCGCCCCTGTCAAAATGAGTTTCAATTCCACTTCAtgccaaaataaa aatatatttaaacgtGTAACGCTGGTTCCTTTAGGATTGTTAAAATGGCG AATTTGATTCCGAAATTCATGACAGGGGCTCTTTAGTTTTTTATTCGTTT AATTTATTAATTCTCCTTAAAAGTGTTATAATTCAAGAATGGATTGAATT CTGGTCCGTAGAATACACTCAAGTTTGATATTTTGTCGCGTTTCTATTCA AGATAATTTCTTTACGAtatttctgtattttttttttaaagaataggGCT TTAGTCATGAATAGTTACAACATTTTGTatacgttttttgttttattttc ctttcaaaaaaatatgtaattttGCTAACAGCAAGAAGGAATTGTACATT TTCCATCCGATGATGAATTAACACTTTAACATGATGAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049962TCONS_00049962Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049963TCONS_00049963Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049964TCONS_00049964Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049962-proteinTCONS_00049962-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_167supercontigscaffold_167:1399339..1444126 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.82 9.59 2.56 1.47 147.5 113.49 114.67 118.02 52.53 79.08 40.39 39.82 45.21 37.68 31.26 35.32 72.09 59.64 47.94 55.5 42.57 43.77 35.95 42.23 106.15 77.52 56.63 43.87 143.15 163.8