XLOC_031628 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031628
Unique NameXLOC_031628
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_167:338059..359997+

Legend: gene
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>XLOC_031628 ID=XLOC_031628|Name=XLOC_031628|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21939bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_167:338059..359997+ (Clytia hemisphaerica)
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ACATACGAAATACTAATGTATATTCTTTTGAAATCAACGAGGAAGGGATT AAATAAGCTCTAAGATAGTAAGTGCGGAGCTGTCATTATAAGCTGTCATA GGCACACAAGTTTCCGACTGCATTCAAGGGCGATACGAAGactccctttt ctctagctgtctactCGAAGATAGGGCAATGAGCAACTCCTTTCCcagga tttctccacttacccttgatctgtctctttaattgctgagcatcaagtaa AGAGGCattaagtaccattttgggaatcttccAGTATGACCTTGGATGGG GGTCGAACCACCCACAACTTGCGCACCGAAACTGGAAGCTCTATCTTCAA TCTGGCAGTCAAAGCTGGCATACAGAGTTATAATAGTATATATAATAAAT GTaaattgtaataaaatatttcttatctAGGATCCCGGTATGTGGAAAGT TCTCTGATGACATTGATCGAAGATGAAGACGATAATAAGTGGCATGAACA GCAATTAAGTCGTAAAATGGTCATTAAAACGAAAACAGAAGAATACATTA ACACTTTCACCTTCCATGGTCTTACCAGAGTGTTCAAAGGTGAACGGATC GAATCTGTATTTTGGTTATTTATGATATTAGGTGGTGTGTCATTATCGGG AGTTGTCGTTAATCGCCTAGTTACCAGAtatcaaaaacatgaaatttaca CGGAGATTCAAACTAAAATCACAGATGAAAACTTCTTCCCAAGTGTGACA TTTTGTGAGAATCAGCTATTAATTGATAGCTATTTTTCATATTGTGGCGT TGCACCGAGACATGGACATGAAAATCATCACAAAGTTTGTGACTACATAA TGAAAGAACCGGAAGAATCCATCGAGGAATCTCGAAATAAATTCTGGTAT AACGGTCTATTTAACATTACAAAATGCGAAACATGGGGAGGCAAGAAATG CGCCAGTAGTGATTATTTCAAGACTCTAAACCATTTCAACCATTCATGTA TCACTTGGAATTATGCAGGTAATTTGAGTGATGTCTATAGCCATGTTGAT ATTGAGTTTGATGTTAAGCCACTATCTTGGCTTGGTAAAAACGAAGGTAT ACGAGAACATTTACGAGAAGGTATATTTGCACTGCCACATGACCATAGAA TATACGAAATTGACATAGTGAACAAATTAGACATTGAACCGTATAAAACA TATGAAATCAAATTAGACACAACCGTTATAAAAAGACTACCACACCCTTT CCCCTCTAAGTGCGCAAGTAGTAAGGGTGATGAcatttttcctggaaaat aCACGCGAAGATCATGCATTGAATCACACAACTATATCGAAATGTACAAA AAATGTGGGGACACTTTGGATTACGTACGCCAATTTATTCCACCTGATAT TAAGAAACAATACAAAGGGAATAAAACTATTAGAGAAGCAGAAAAGTGTG TTTGGTTATTTGGGAAAGGAGAAacacaaaaaactaaaaactgtAATCTT CCTTGCCAAGAACTGCAATTGGCGATAACGACTTCATCTAGCGAACGCAA AAAGGACAAATCACGAACCAAGTACCGTATAAGTTTGCAACATCAACTGA TTGATGCTTATAAGGTTATGGAAGAGAAAGAGCTATATCCTTGGGACCAA ATGGCATGTGAAATTGGAGGTCTTATCGGGTTGGCTATTGGTGCATCCAT AATTTCTTTGGTAGAGGTTATAGTGTACGCATTTTTGGTGATTGTTAATA AAGTGATCTGAGGAAAATTAGCCGCTAACAAAGGCATTTAACTAATATGA ACAAAACGATATAGCAAAAACGACCTTTTGGAAGGAAAATAGGAGCTgaa gaaatttccaaattctTTTGGAAAAGTCCTGCGTCATAAATTGatactag ccgtcccggcgtcgtccgagacgacttcttactccttttaatacgctcgc ttcgctcgcttttctatttttcagaaacttgtagggaTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049877TCONS_00049877Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049878TCONS_00049878Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049879TCONS_00049879Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049880TCONS_00049880Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049881TCONS_00049881Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049882TCONS_00049882Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049883TCONS_00049883Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049884TCONS_00049884Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049883-proteinTCONS_00049883-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_167supercontigscaffold_167:338059..359997 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.37 0.63 0.52 0.54 0.45 0.33 1.11 1.41 2.51 1.73 2.57 3.01 9.44 6.65 0.47 0.71 2.37 3.21 13.96 16.62 4.14 4.14 4.09 6 6.47 8.24 2.72 1.36 0.4 0.3