XLOC_030275 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030275
Unique NameXLOC_030275
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_131:33709..45608-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_030275 ID=XLOC_030275|Name=XLOC_030275|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11900bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_131:33709..45608- (Clytia hemisphaerica)
CAGTACATTTATCGTTTACCGTACAATTAGGAATTAAAAAGGTGACGTAA
TCCTCACAATCAACGCGCTGTGATTGGCTGATCTACCAATACATACAGAC
GAAGAAAATGGCGAACTGAAAGTTTCTGTTCTGTCAAGGAACAACAAAAA
AAGAAATCACACGGTATATACTTGTAGAGACGAATCCTTACACCACTCGA
ATCTACCAAAGGTAAAAGATGTACTTCATACATGTGCTTTGAATATATTT
ACCCCCTCTTATTTTTTCCAAAAACTAGCGTTAATCACCTTGAACCACCA
CCAAAAAAGTCAAAAAAGTACTAAACAAATAGACCTTTTTTTAAAGAGGC
AGCCATGTTGAATCATTATATACTCCAGCATAAAAACAATGATACAGCCA
TGCATAATTACTGTATCATGCATATTTTAAAAATTATGCATGGCTGTATC
ATTTTTTTATGCTGGAGTACATTTCTATTTCTATTTGGTTGAGTTGCATG
AGACTTTAGAGGCCTATTATTGCAACTTTAGAGGCTTACTAATTAATGAG
CGCCCCGTCAGCACCTTGAACTGACTACCCAATTCCCTTCACATGGCATG
GGTTGACCCGGGCGAAGGAACGTTCACTTGCCAAGTGAACTGCCATGACT
CATGAGTGGGAATCGAACCCCGCTGGCCTCCTGCACTGAAGCCAAGGTTG
ACTACCACGATGACACCACAACATAATTATTCAACATGGCTGCCTCTTTA
AAAAAGGAGATTTTTCTGATTCCTCAGAGCGCGACGAGCAATTTTTTTCC
CTGATAATTTTTCCTATCCGTCATTCCGTGATTCAGGGGCTATTGGGGAG
GTAGGGTCAGGGTTGCTTGCTAGTAACAGCTTGTCACTGTGCCGGGTGCA
TACTCGGCCCCTTGGGCCCCGCAGGGTTGCTAGTAACGGCTCGAATTTCA
GTCAGGTTTAAAAAGGGTTAATTTTACCCATATTATAATAACATTACCCC
CCTCTTTTGCCAGTTCGGTATAATGTGTTATGAATTGCGTGATTTTGCTG
TGCGGCGATGGCTCAACGGATAGAACGCTGGCTTCCAAATCTGAAGGTCT
TTCTTTGGTGGTGGTTCGAATCCCACTCGGTTCGAAAATTAGACTGGTCG
AAATTGATGGACAAATGATTGACAGGTATGAAAACTCAGTCAGAAATGAG
AAAGTAAGTCTCAGAAAGTAGAATAAACAGGTAAGGTGAAAGATAGGAAA
GGGAAAATGGGCCGTCACGCTCTGTGCATTTAGCGAAATGTAAAAAAAGG
TCTATTCATTCAAAAATTTGTTGTCAGTTATAGATTAGAACGATTAGAAG
AACACAGGGCTTTCGTGGTTTGGGTGTTTGATCCTTTCAGGGAAAGTTTG
AGCTCAGGGATAAAAGGTGCTTCTCATCACCATTGATGCCACACAGCCTT
TCTTTATCCAGGCGGTGTCGGGCTCGATAGGATTGATAATTGGAACGGAT
CAATGAAGGATCAATAAAGGATCGATAAATTACTTATTGATTCCGATAAA
GGATCAAGTAGGGATGGATACCAGATCAATACTCAAGAATTTTTTGGTCA
GGATCATTTATCGATTACTTATCGATCTTACATTGATCCAATCAAATTAT
CGATTGTAAAATTATATCTATTACTTATTGATCTTATCGATCCAATCAAA
CAATCGATTCTAAAATATATCGATCCAATTGATATCGATCTCTTATCGAT
CTGAAAAATATATTGGTAGCGACAAAAGAGCATGAGTCTGCTAATGTCAC
CCATTTTCGGTTTTGTTAACTTTTCAACTTTAAGGCTCCAGTGAAAAATC
TAGGTGCATGCAATAATGATACCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CAGTTTGATTAAGCCCTGATACTTATGTTTTCTGAAAATTGAAGTCATTA
ATAAAAGAATTATCTAGGAATAAAAGTGAAATTCAAAACTTTTATTTTTT
CCAAATTTTTTCACCTATTTGGGTGACATTACCAGACTCATGCTCAAAAG
CAGAATTTTCCGGGTACTTTAGCGGATAATAAGGACTTTCCAAATTTCCA
TTGGGTGAGAATACACCTTTCCCGTAATTCAAAGTTCTCAGAAATGGTCC
GGGAAAATGTGCGCTCCACTGTTGTGTATAAAATTGTTTGGGAGGTAAAA
AACGTGTTTTTGCCTGCGAGGGGTTAGGGAAAGTGGGATTTCAGCCTCTA
ACATACCTCTTTTGTACCTCTTTTTGGCTTTTGCTTGAACAGCTCATCCA
ACTCGTTGAGTCCGATGCTTCGACATTTCCTTGAGACTGTTGGAGTCAGC
TTGCCTAAGGTTAAAATAGTGGGCGAGCAGAGGTTCGTCCGGAACAGTTG
TGTGGAAGGTGTCTAAGTGTTTTTTGAATACTTCTTTGGGGCAGTTTGTC
AAATCTCTTATTGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNACGTTGCTGTGTCGGTAAAATAGCGAGAACTTTGCTTCAGA
GCGTCGTTTTTCCCATAGGCAAGGTGCTCAAATTTAAGACCATTCAGCTG
CATGTTGACATTTGACATTTGACAGCGATCTTCTTTTGACAAAATATTTT
CAGGGTGGTATAATATCATGAATAGATTGAACATACTTAAATTTGATGGA
ATTTTGTTCGACAGAACTTAAGAAAAGCTAAAAAAAACAACTTTCCCTAA
GGGAACGCAGGCAAAAAGGGGTTTGTTTACCTCCAGAGACCAAAGGGTGG
AGAGCATCAAAATAATGCGCGCGCATTAGTTTTACGAATTACTGGAAAGG
TGTATTTCGTTATCTGATATTTCGATGGTGGATTGGTGGCGGCCCACGCT
ACAGCTCTAAAAGAAAGGAGCGGGCCAATTTCCCATTGGAGAGGAATGAT
AATCTGCCTTTGATGTGCCGCATCCCCAGTCAGGTTTAACTAGACTATTT
AACTAGTCGACTAATTCACGCTCAACCCCATAGTTTCTCGTTGGGATACG
ATATTTCTTAATATTCTTTAGCCGTCCCGCCTGAGAAAGTAACTTTTTTG
ACTTCAAACTTAATAAGAATACACCAATCGATAAAAATAATCCAAGCGAT
GCCCCTAATCTGGACAGATTCTCTTACGGGGTCCCATATGGTCTTTACTT
TAGAGAGAATACGTGTCATGTGCGGAAAATTAGAATCTGATCAGAGATTA
CTCTCGATCGGGCTATCGTTAACTGCAATAGACGGACAAATAGTCATTGT
TCTAATTGGATANTTAACTGCAATAGACGGACAAATGGTCATTGTAACGA
GTATTCGATAAATTCTAATTGGATGTATACAGATTTATTTTGCGTCAGCA
AAAATTTCCCAGTTTGCAGAGTACAGTATGGCAAGGCTGCACTCAAGGAA
AAATTTCGGAAAACCAAGTTCTGTGCACCGGAATAACACACCTGATAAAT
TTTGGTCCAGACAAGGTGCACCTATATTTCGAAAATTCGCCCAAAAAGGC
AAAAAAAGAATTGTTAAAATTATATACGCCTGCACTTGAGCTTGAGGAAA
AAATAGCTGAAACTCTGCTGCAAGTCTGAACTTGCACCTGAAAACCTGAA
AACCTCAAAATTTTGCACCTACACAACAACTTTCATAATCAACCATCCTT
TTTCAGAGATTTATGGAACATTTTACACGGATGATTAATCATCTTAATCA
TCCGTGTAAAATGTTCCATAAATCTCTGAAAAAGGATGGTTGATTATGAA
AGTTGCTGTTTTAAATAAATCATATCATGTTTTTAATCAAGGAAATCTTT
CAAGGAAGCTCTTAGATATTTGGGGAAATTTATTCTGCTTTTTTCCCAGC
TTTTTCAAAAAAAGGGAACGTTCTTATCTATTTTAGGTTTTTGGGCCAGT
TCTTGACGTCTTACCCTTCCGAACAGCCAAGGAAGCTATCAACTTAGCCA
ACAACACAACACTCGGTGGTAGTGTTTGGTCGGAACACATCGGTCTAGCA
ATGGAGGTAGCATCCAACATCCAGGCTGGATCCGTATGGATCAATAACCA
TAATGTGTTTGATGCGGCTGCCGGTTTCGGTGGTTACAAAGAAAGTGGTT
ATGCCGTGATGGTGGAAAAGAGGTACATGTTAAGCTCGTTTGTTGTTTTG
CTCACTTGTTTATCTTGTTTATCAAATCTCGAAATCGTTCCTCAACAACA
CAAATTTTTTACGGTGCTTCAGTGACACTTGTTAATATGGTGAACCCAGT
CGGACATACCAGGAAAACATTAATCAAGCTTCGTCTCTATAGGTGCTCTA
CTTGTACTAAGCAGCATGACGTAAAACATTCTCTTAACTTTTATATGGAA
TTTGGTCCGCTTATTTTATTTTATCTTTGACAGGGTTTATATGAATAAGT
GAAACCAAAATGGTCGGTTTTTGGAAAATTTTCTGAAAAATTCCTCCTGA
GCAGAAAAATATCAAAATGAATATCAAAACAATCAAATTTATTTGGAATG
ATCAAAATTAATCATTTTGACAAACTGAAAACATTCAACCACCAAATTAA
TGATTTATTTAATGAAATACTTCAAAGTGTAAATAACCTTACTCAAAATA
AACAATAACTTGTAATTGAAATAATGATGTGACAATGAATGAATATTAAT
GTTAGATTTAACAAGAGTAGTCTTATTGCGAGGCTAGAAAATAGTGTTTA
CAGACTCATGCACTCAGAGTCAGTTCTAAAAGGTTAAAAATATTTATCAA
CCAAAATGCTTTAGTATAAACACCAATTTTTACGATCCCTTCGAGATGAA
ACCACATTTCAAGCCTTTGCATTTTTGTCGTCTTACTTCAATCACGTAAA
CTTATTTGAAAAATAAAATAGTACACATTTTTAATTATATCCAGCTACAG
CAATAGATGCCCTCTTTTCAAAAGATATTTTTCTAGCAACATTCCATTGG
TGTATGAAGAATTCAACATAAAACGTAAAATGTTCCTGGGTCATTAGTTT
GCCAGACGTCTTGACACATTGTAGAAAGCTATTAAACTGCTCACAGATTG
AAGTGTTCACTCCTTTGAATCCCAACAAACGGCGTGATTTGTATGTGAGT
GAACATTTATGCGTGTAGCCATGAAAAATGTCATGGAAAAATCTTGTGTC
AGCAAAAAATCCATTCTCTCTGTTTCTACAGTACTCCTCCAAGGAGCAAG
AGAAGTCATAAAAAATATTTTCTGGTGCTTTTTCTAGATACGAGTAAAGC
GAGTTGGCAGCATCCTTGCGACCCTCAGACGATGTAATGATGTGGTATCC
CCAGCAATGGCCGTGACTCGGACAGAACCAAAGGAAAAGGTAAGTCGTAC
CTTTGTGGGATACATTAGGGAAAATCTTTGAGCATGGTACATCAGGTGTA
TCATCAAAGTTACCTTTCTTTTTCTCATTATCACGGTCAATGGAGAACAC
ACGTGGCTTCCTGATCTGATTACCGTGATCAGTGAAATAGTAGGCTCTCC
CTGTTTTTGCTGGGTTGTAAACGTCGAACATGGATGATGCCTGAGGTGGA
ATGTTATTTTCCTCTAGTTTTTCTCTCATCGATACGAGCTTGGTGATAAA
ATCTTTCACGTAGGGATCAATGATACCATTTGAGAGATTGGTTGTAATAA
CATACCAATCTCCCAGCTCGGGAAAAAAGTGCTTCGTAATGCAGTGAAAG
GTATCTTTGAATGTAGCATCTTTCGTTACTTCAGAGTCGACTGTCTTTTT
GAGCATTTCAATATATTTTTTAGGTATTGTGTTGGTGATGCTGGCATCTG
TGGTCAATACGTGAAGAACTTTCGCCAATGAACCGCGTTCAAGTGGATGC
ACTGATTGGACAAACAATTTGTTGACTACATCAACGATCACTTTGTCTTT
GCAATCATGTTTGACCATTTCAAGATGTTCATCGATCTTTTCTTGATCAA
GCTTGTTCTTCCCCATCACATGGTTTGCCAACTCTGAGACTGCCTTGTTG
ACATCAGCTCGTTTACCGGTCGTGTTGTTGTTATTGATGAAGGTGCGTCC
GTACCTTCGTGTGAGCGTTTTGATTGGTTCACCTTCTGCCGTCTCGATCG
GAACCACGTCAGACTGTTTCAATGTGATTCCTATTTTGGTACCGTCTGCA
GCCAAGCATTTTAGTTTGTCGCCGCAACCGAAACATTTTTTCCTGAAGTT
GATTTTCATAGATGATGCCCAGGAAAACCACCACTTGATGAACGTGTTTC
TCGACATGAAAGTCTTTTTTGATTTTGCACGTTTGTATTTTCGTTTGTAG
AACTTTACAAAACCGGAAAATGTTTGGCGACTGGTCATAACCAAATCCAC
GAATTCCCACCCCATTTCCCAACTGCAGGCTACACTCGGGGATGAGCGAT
AAATACAATCTTCGAAACCATATTTTCGAATGCACGATCCTTTGATGCAC
CTTCGCTTGAATATTTTGGCATCAACAGCACCAGCTGAGGTATAAAGCGT
GGTTTCGCCATCAGGAATCAAATGACCATCGGGAATATCTTCAGTGAACC
ATACACCCTGAACGAAAGGAAAACAAACTTTATGGTAGTACTAAATTACA
GTATAATTGCAAATGACTTTGGAGTTGCATGAATTTATTCCGGTTCTTCT
GCTCAAACAAGATGTCATTGTGTCATTATGTCATTAAACTTCGATATACC
GAATTACGAACAAACTATGGTCAGAAGTTGAACTTTCTGTTCTTCTATTT
TTGTCATTATTTTTAAAATTTCAAATCATTAAATTTTTTGAATTTGAATT
TTCTCAAATAATAAAACATTATTATCCAGTTTTAAAAGTGGTGGTCATAC
CTCACATTCACACGAGCCTGTCTTGTCAGGTATTAATTGTATATCTTCCC
GTTTGAAAATTTTCAGTGAAAATTCCTCAACCTTTGACATCAACGTTTCG
TAAAAGGGATCTTGATCGACTGATTGTTTGCTTGTAGCGCAATTGTGAAA
CTGCCACTGCTTGAGCTCCTCGTCAAACACCTTTTCATTTGGTTTCTATG
AGACAATTGTTATTTAAGAGCATTAAATTATTCACTATTTTTTTATATAT
CGATACCAGGGGGGGTCCACTTTCAAAAATGGTAGTGTGTATTTGTATAT
GATTCCTAGGATATAAACTTGTTTGTAAATCTCATTTTTGCTAAAATAGG
CGTTAGAAATTAAATTTGTTGTTCTATGGCCAGATCGTAATATGGGTCGG
TCGGTATAATAAAAATAAATATTTCGAAATTTAGGGTCGACAAAGTGCAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047530TCONS_00047530Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_131supercontigscaffold_131:33709..45608 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
17.59	18.04	6.71	4.95	35.83	31.13	25.1	34.46	22.76	27.52	30.79	21.18	27.67	23.55	8.18	11.49	9.41	13.34	13.06	15.83	11.96	10.98	20.41	17.36	18.38	36.93	23.47	19.88	18.37	20.21