XLOC_030249 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030249
Unique NameXLOC_030249
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_13:171387..178572-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_030249 ID=XLOC_030249|Name=XLOC_030249|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7186bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_13:171387..178572- (Clytia hemisphaerica)
CCCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCACCCCCGTCGGTCG ACAAGGGTAGTACCCCCCCCGGGGAATCATTTGCGTTCTTTCAGCGTGTT AAAAAAAGGTGAGGGAGTGGTCGTCAGATTTTCTTTGGAGGTAGATTGTG GTGTGTAAATGCTGGATTTGGTATTGGTCTGACTGGGGGTTGCCATAGTA TCTATTTCTGGTGTTCGCTGGTCAATGGTGGTTCGGACTGTCATTTTCTA GGATTGTTGCAATTTGAGATTGTGGGTTCTTGTATAGTGTTTTGGATTTC GTCTTTTGCGTGTTGGTTGTTGAGTGGTGGCTGCAATGCCGGACAAAAGG TTGTAGACAAATGAAATTTCAGTGAAAAATGATGAGAAATAGAGCATAAT GACTCTTCAATGTGTCTGAAAGGGATGGAAGTTAAGAAAAACACTTTTGA AGTCGTTGCATTGCTTTTGAATTGCTTTTGAGGGAACCACAAGCAAAAAA CCAGCGTTTTGATACTGGTGTAAACCAGTTAATCAAGCCCTTGTGGTTTG CCCTTGAGGTTAGACTTTCAAAGACTTTGAACAGCTTTGGATAGGTTTGG AAAGCACCCAGAGCCTCTTGGGAACTTGTCTTTGATCGATATTGAAGTAT TTAGCAAATATTGCAGAAGTCTACAAACCTTTTGTCCAGCATTGTGAGGG TTGCTATATTGAGCCATGTATTGTCGATTTTTGTTTTTTTCTGAGGATTG TGTGGTATGGATCTTCGTTTAAGTGGGTATTGTCATGGCTCCCTTCTCCT TTCTTTTGAAGTAGATTGTGGTTGTGGTAGATTGTGGATGTATTGGTTCT TTATACGAGGCTGTCTCCTCTTCGTTTTGAATTGGATTTGGATTTGGATT TGGATTGGGGTTTGATTTGGGATGGACAAGTTTGGCCTTCTTTATGCAAA TAAAATTTTTAATTGCTTCTACTCCATTTTTAAGATTCAGTACCAGATGT TTGATCTCTTCATTTGATTTCTTAAAAAATAAGTTAGCTCGTTGGTCCCA GCATGAAGTTAAAAACGACGCGGACTTCATGGTCGGATTTGTTTTCGGTT TTATAGTACTCTCCTTCAGGTTGCTAAATTGATTGAAGTAGCGTAGCGAT CGTAAAAATGACTCAGTATGAAATTAAACATGTTACAAAGGTGAGGCTCT GACCTGCCAAACTTACCTGCATGGAAGTGCAAGTCTTCGACACAACAAGC AAAAGAGCTCAACAATACTAGTGTGAATGTAGGCTGGCCTAGGCAAAATC ACCTCATCGCCAAGCCCAAGCATGGCAGCAATCCTTAGCATATCCCTCTT TCGGAATCTGCAGTCCACCCAGCATTCTTTATCACTCCACAAGTCGAAAT TGAAGTTTCCCCACCTAGCACCATAGTCCTTATCAACTGCACCTACAAAA TTTACCTCTGTAACATCAGCCAGCATGAGGTATTCTTCATCAGAAATAAC TCCATTTACATATGCATCTCTTCCAGCCATGATAACCTAATTAAAACTTT TCACTTACTGCTTTCAAAGTCGAAAGAATAAAGTCTCAAAGAAGAGGGAG GGAGGGTAAACAACTTGCTCTCAATGGGGTCACCCTGCGTGTTGCCTTCG GATCATAGAATTTCGACACCACCGAGGACGAAGAGTCTGGACGGCGTATT ATAGCAATTCGAGGCAAGTGTTGCTATTGAGGGGCAGATGACTTTTACGT TGTGTAAGAATGCTTCACGGTTGAAATCCCGGTAAAATGTGTAAAATGGG AATAACTCGCGAAAAAAATAGATTGTCAAAAAAATGAAACTGAAGTTGAG AAATGTTTGAATGATCTTTTTTTGTGACCTTTTGTGACTCTATCTCAAGA AATTATTTAAGGTCAAAGTATTAGGTTTGTGACACCTTGGCCAGGTGTTC TTCTTTAATTTTAACCCGTTATTCAAAAGTCTCTTAAAGGCGGAGATCTC TTAAAGGCGGAGATCTCTAATTAGCGGATACCTCTAATTAGCGGATACTA ATATGACTCCCTGATGTTGTCCGTTGATTAGAGTCTCCACTGTAATTTAT CTGCTACTTATTTCTTCTTTTTATCAGGCCTGCAAAAATTTGATCAAGAA TTTTGAATGAAAATCATGGCATTCCTAATCTAAGGTCTAGCAAACTTCTT TCTAAATTGAAAAACCAGCTAAAGTGAATGAAACGGAACCAGTGCATTGT TTTGTTTAGCAAGTTGAAGAGTTTTCGTGGGGATTTATATTTTTGGAGTG ACACCATAAATAAAGTTAAAATAAAATTATTTACTTATTTGATGATTTTT AGAAGTTTTCATTCCCTTAATTCCGTGGATGGGAAACGATGTCCATTCGG GAATTGATGATTTGAAGCGACGATCGTTTGACCATGATGATGGTTGTTAG TCTTTCTCAATATCTTTTCAACAAATTTTTGTTCGAGCAGAACATTTTCG TTGTTCAATTTTTGCAAATCTGCTTTTTGTCTTTTCATTAAAATATTGGC TTTGTTGATGTTATGTTCATCATATTGGTCTTTTCGTCGTTTGTTTCTTG GACAGAGGCCAGCATCTATGAGATGAGAATATATTATATATTTAGGAACA ACTAGACGGTACCCGTCGTCGCAAACGCCGGTTAAGTGATTTAGATATCG TCTAGATCATTCGATATAGCTGACATTATAAGATGTTGACAAAAATAGAT ACCTCCACGTTGCTCTTCAACTATGTATGGCTGACATCAAATTTCATTTC CCAATTTCCATTGACGTTTCTGGTTATTTGAATATTTTTCTTATTATTTT TACTGAAAATGAAAAGAGCATATAGCGTATGACATTAATTAAATCAACAC AAATATTTGTTTTCTTCTCGATCCCTAGTCGTCATCCATTAATAATAGCA GTCACCATTATTCGTCATGAATTTCCGAAATAACAGAACGTGATGCCGAA AATTTTACCTAGTTCATCATCTAGCTTGCTCTATAATTTTATAACTGGCA TAAATTTATGGAACCAGAAAATAACACAACATTGATTTAAAATTTTAATC ACTTATTTTCTTTGTTCAATATTTACATAATGATAATGCAGTAATCTAAT ATAAATATCTTAAAATAACAGAACAGATTAAAAGACCAGATTTAAAGGTT TATTTCCTCAGACAAAACTTTGTCATCACTGGAAATACTGAATAGAATGA ACTAAATTTTATTTGAAATATTCAAGAAATCTTATTCATCACTGGCTTCA GAGCTTTCTAATCTCAAAACGAATTAAATAAATTAAAGATCACAATGATA AATACACAAAATAAAAAAATAATGTATACTTTTTAAAAGGGCCTTAAATT CTATAAGGCGATCGAAAAAGTGATTAAAAGACTGAATTGAACAAAGTGCT AAAAAAACTGAAACTTATGCTCACAAATCAAAGCTACTATCTTACGATTT TCCTCAAGAAATACACAATCATCACTAGGAAAATATAGTAGAGAGAAATG CTCTTACGTGGATAGGCGGTTGTCGAATAATGAACAGTTGACGAGTGTGC AGCAACAGCAGCGAATAACGATATCAAAGAAAAATGTATAAAAACGACTG TATAAAAACGATTAGATTAGGTTATTTGTAAATGAATCAAATTTTTCCAC TAGCTTTGGGTGCTCTTTGCAGGCTTTTTGATAAGCTGACTTTTTTGTTC GATTTTGAGCTTTTTCTCGTAAACTTCACCCTCGATCACCTTTTTTTCAT CGTTCAGTGACAGTGAGTTTTGATGAATTGAACTATTACCTGTTCGCCAT TCGCAAGGATTGAGTATATTTCAATAAGATATTATTATTATTATTAACAT CTCTTTTATCACCATAAAGCTACGGTATATATATAAAGGTTTTTGAAGAA AAAAAAAAATATACATCGTTTTCGTTTTTCTTAGACAATATGTGATCCTT AATCAGTTTTGCACGCCGATCGTGCAGGGTAAGCTCCAAACGAGTCGCAA TAAACTCAGTCTTTCTTTTTGCTTTTTGAGTTTCAATATGCTTTGAAAGC GAATGTTAATCTTCTCCAGCATGGAAATTTGGGAGATCAATCCCCAAAGA TTTTTTGGATTTCTTCAGCATCAAGAAATAATAGTCAATAAATAATCTAG CCTAATTTAAATAATCTAGTTCACGCTGGATCATCTTCTTTTCATCTGTC AGATGGCTGACAGTGAGTTTTGAAGAATCGAGACACTCTAAACGCTTCCA TAAGGTCTGTTTAAACCAGTTTGTTCTCTTCTCCGTCAAATCTTCGATGA TAAAACTCGATACTGAAAGCTTCTGACGAAGGATATCGTGCGATAAATCT TCCATTGAAGTGNACCGAATGCTTTGAAACCGAATGTTAATCTTCTCCAG CAGGGATATTTGGGAGATCAATCCCCAAAGTTTTTTTGGATTTCTTCAGC ATCACGAAATAATAACAAAAGAGAGATATGTTACAAACTATCTTCATTTT TCTCCAAGCCACTAAATCATGATTCAAAATAAATAAACAACACAAAAATT TGATTCAAATTTTTGTGTTGTTTATTTATTTTGAAAAAGATATGTTACAA AAACAGAGGTACAAAAACACTAAAGACTATGTATTTACAAGAGTAGGAAA GTATATTTACAAAAAACAGAGCAATAAAAAACACTAAACACTTTCATCGT CCGAGGACACAACAATTACTACTTTGTCATCTACAAAGTTTTCTGGTGAG CAATATCCATCATCGTCAGATTCGTCTGATGATATTATAATGGATTCTAT TGGCATGTCTTCTAAAAAATTGTCCAAAATTAAATTGTTTATTATCATAT CTTCCACCACGTGGTCCACAAAATTTTCGTACATTTGAAATACATGATCC AAATCAATATCAATTATGGCAAATGGAAACGTCAAGTCTAGAATGAAATC ACCTAATAGTTAATAAATAATCTAGTCTAAATTAAACTAGTTCACGCTCG ATCATCTTCTTTTTATCGGTTAGTTGGCTGACAGTGAGTTTCGAGACACT CTGACGCTTCCATAAGGTCTGTTTCAACCAGTTTGTTCTTCTCCGTCAAA TCTTCGATGATAAAACTCGATTCTGAAAGCTTCTGACAAGGGATATCGTG CGATAAATCTTCCATTGAGGTGTCATCAGAGCTTGCTTTAGGGAAGNGAA GGAGAGAGGTCTCGTGTGATAAGTCTTCCATTGAGGTGTCATCAGAGCTT GCTTTAGGGAAGGTTCTGGGTGTTTGATCAGTCTCAAGGGCACGATGGAT GATCGAGTTTGTATTAAGAAATTAAAGATTTTAGTTTGAAGTTTTTTGCG AAGTTCATAGTTATCAATTTTTAGCCTTGAATCGTCCGTAAGAATCAAGA AAGAATTCACCAACACAAAAATATCAAACTTATGAACAATTTGAATAAAT CCGTTTTTTGAGAAATCTTAGTTGGTTCGTCAACGATCCCAATCAAAAAT AGTCATGCTTTCGTGAGTCTAAAAATTAAGGGTGATACTTTTCTCCACTG GTCGAGTGACTGAGGTTCATATTTCACAAGGAGTGTAAAGTTTTCGGAAA AATCAATATCAATATAAGCTGCGTTAAATAGTTCATTGAACTCTTTGGTC AGGATCAGCTTTACCAACCGTTTATCAATGAAGTCAAGGATTGCTCTCAT ATAAAGATATTTTTTCACAGCTTTCAGTTTGTGTTTCAGTTCACCTTTTT TGGTTGTAGAAGGTAGACACCAACTGGTGTTATACTTTAATTGATTGAGT GCCAAAAATTAAAAAAATGTGAAACATAAAATTTCCCTTGTGTAAGCCAA ATTTTTGCCCACTCAACAAACTGTAAGTCTCAAATAAAAAATGTAAAAAA ATTTCTTGGAAGGGTAAGCCACATGACCAGTATGCAATGAATAGCTACTT TCCTCAGCTTAACCATCAAAGCAATCCTACGTGTAAGCCACATAATGATC TCAAGTTATGGTCAATTTAGTGACTGGCAATAAAAAGGTCACAAAAAGGG GTTTATTTTTTATTGGGATCCAACCCAAACGCTATTAAGGCTCCAATGAC AAATAGACATAGGCGTTTCCCTCTAGTTTTTTAAGAATTTATGATTGTCA TGAAGAGAAGGTGATCTATTTTCTCTGCCATTGTTGTAGCGGTACATCTT GGTGCTAAAACTGAAAATTGAGATTGCAGAGATTGTCGGTACTCTAATAG AAATTAGATCTGGTATAGAGGGATCCTCAAGTTGTGAATTATTTTTCTCG AGCAAGGAATGAGTAGTAGAAAGAGGTAGATATGAATTCTTGAGTGTTGA AGTGTGTTAGGAGTAGAGATTATTATACTCAATGAAATACGTGACTTTAA AGATTGGAAGGATTCATAAAAAGTCTAGTCATGTGGGTTTGTGTTGGAAC GTTGGAACAGTGTTATAGTGATAATAGCATACGAAATGATAGAATTGTTT TAAATTTAGCTGGAATGTTGTTATTATAATTTAGTGTTTCAAGTGTTAAA CTTTTTAAAATATATATTAAACTTTTTAAAGTTTTTTAAATAGTCACGTA GCAAAATGTTGTATGCTGCTTGATTTAATTTGTGTCAGTTTGTGTTGTAT TATCTTGTTGATGTATTTTAGAGAATCATTGCGTTCTTTCAGCTTGTTAA AAAAAGGTGAGGGAGTGGTCGTCAGATTTTCTTTGGAGGTAGATTGTGGT GTGTAAATGTTGGATTTGGTATTGGTCGTTGGCTGACTGGAGGTTGCCAT AGTATCTATTTCTGGTGTTCGCTGGTCAATGGGGGTTTGGACTGTCATTT TCTAGGATTGTTGCAATTTGAGATAGTGGGTTCTTGTATAGTGTTTTGGA TTTCGTCTTTTGCGTGTTGGTTGTTGAGTTGTGGCTGAGGGTTGCTATAT TGAGCCATGTATTGTCGATTTTTGTTTTTTTCTGAGGATTGTGTGGTATG GATCTTCGTTTAAGTGGGTATTGTCATGGCTCCCTTCTCCTTTCTTTTGA GGTAGATTGTGGTTGTGGTAGATTGTGGATGTATTGGTTCTTTATGTGGC TGTCTCCTCTTCATTTTGAATTGAATTTGGATTTGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047493TCONS_00047493Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047491TCONS_00047491Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047493-proteinTCONS_00047493-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_13supercontigscaffold_13:171387..178572 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.61 0.34 0.71 0.61 1.27 0.59 1.13 1.4 0.8 0.59 0.62 0.61 0.49 0.34 0.59 0.46 0.48 0.4 0.85 0.71 0.6 0.61 0.48 0.63 1.11 0.91 1.43 2.27 2.07 2.24