XLOC_027978 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_027978
Unique NameXLOC_027978
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0005421:13..4420-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_027978 ID=XLOC_027978|Name=XLOC_027978|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=4408bp|location=Sequence derived from alignment at sc0005421:13..4420- (Clytia hemisphaerica)
AACACGGATTGTCCATACGTCGAAATAACGTGCCGTTTTACGGGATGTGA
CGTATGCTTCTTACGTAAAGCGAAACAACAACACGAACAAAATTGTCCGA
TGAAAGAGGTGAACTGCGTGTACTGTCAAATGGCTTTTAAAGAAAGTGAT
GAACAGGTAAAATTGCTTTGCTCTAAATATTACAATACAAAGCAACAATG
GCAGTAATCTTGGATAAATTCCGAACTAATCATGCAAGCACAACTAGCAA
ACGTAGAAAAGATCCGATGAAACCAATTTCAGTTTCAATCATAAGTCCCA
GAAAAATTCTAGAAAACCTGATACAGTAAGAAACGATATAATCTGCATAA
GTGATCCTGAGAATGTCAATATGATTGAAAGCTACGCGAGTCTTTCTGTC
CTCATAGGTTAAATGTCATACAAAGCTAAACTTTCATGTTTATGGTCAAT
AGACGAGATGGATAATATAGGGGGGGGCGTACGGGTTTGTCGGTGTGTCG
GTATTGACCCTTTTTTGCATCGGTGTTTCGGTGTTTTAAGTAAAAAGTGT
CAGTATTTCGGTGTTGGACCTGCCTTGCGGTGACGGTAAAATTGATTTTT
TGGGTCGGTATTTCGGTGATTCGAGAAATACTGGCGGNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCGGTGTCGG
TGTTTTAGGAAAATTTTGTCGGTATTACGGTGATTTAAGAAAAATCTGTC
GGTATTTCGGTGTTGGCAACCCTCGTACGCCCCCCACAATATAGATGTTT
AAATCCCCCGTTAACGTGTTTATCAGAATAATCAAAAGCGTGAGATCTGT
AGAACTTTACTGGGAAAAACAATAAATTCGGCACATAGGGGAGAAACTCA
CGTAGTCCTCTGAGCTTTACACACTATCATTTGTGTTTTGAAAAGCTGGT
AAAAACCCATGCCATTTTTTGATAGAACAATATATACTATTGTTTGAAAA
AAATTCTAAAATCTGGATAGAAAAGTACAAACTTTCGGGGAAGAGCTTTC
ACTCCAAATCATTATCGTTTTTGAATGGTAAATTAAATGTGTTTATAATC
CGTGATGTCATAAATCTAATAATGAAGAGATTTTCCATCTTAAATTCTAG
AATCATTATCGACAATGTTTGAAATATCCAACGAAATGTCCAAATCAAGG
ATGCGAAAAAGTATTTCCAAAGAATGCGGTATGTAAACCTAGGCTGTCAG
CACCCTATACTTGTTTTGTTATAAACGATGTGAATCGACCTCAAAAACCA
CGTCTGCTTAGCTTAGTTTTTTTTTTAGTTTTGAGTGGAAACCAAAGCTT
GATGTAATTTTTTTAGAAAATAGCTCGGAAAATAGGTCACAATTTTCTAA
ATTTTTCTTTCAGGTTTCTGGTCATCAAAACACAGAATGTCTTTTTCAGA
CAATTAAATGTGAATTTGAAAATTTTGGTTGCAATGTTCAGGTATTAACT
TTTTTATCTGGTAAATCCAAAGCACTGAGATACGTCATACGGGGACCGTC
GTGGACGTTATCATATATATTTCGCAGTGATGTAGAGATGGACTCTGTTA
ATCAAATTATAGACCCAAACAGACGAATTTTTTCTAAAGTAACTTTTACG
TACATATGAATTATCATTGTTTTGATCATCTTTTTTTTTCAGGTTCTTCG
AAAAGACT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00044345TCONS_00044345Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00044345-proteinTCONS_00044345-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0005421supercontigsc0005421:13..4420 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.46	0	0	0	0.35	0	0	0	0.44	0	0	3.25	4.55	0	0	0.52	0.02	2.4	4.75	0.07	0	0.78	1.05	0	0.44	0	0	0.43	0