XLOC_012060 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012060
Unique NameXLOC_012060
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000388:104079..111056-

Legend: gene
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>XLOC_012060 ID=XLOC_012060|Name=XLOC_012060|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6978bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388:104079..111056- (Clytia hemisphaerica)
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TTAAGAGGTGTTGTACATGATATGAATTTTCTTTATTCTTCTGATTACTG ATCTTCAAATTTATGATGACTATGGCCTCCTACTAAGAATCTTTGAAATG AGAAGTTTTTTTGTGAAATTATAGATCCCTAATTCACAAATTATTATTAT TATTTTTTTTTAGGTCTCTATTAGCTGCACAGTAAGTTTAGCTTTAATTG ACTCTCTTGAAAAAGAAAAAATTACTCCCACTCTACACAACCTATGTCTG TTAAGTCTGGTTGTACACAACCTATGTCTGTTAAGTCTGGTTGATACAGT TGTGGATTTCAGAATAAATATGAATGAGAGTTCATTTCCTTACATACAGT ATATGGATTATGAAACACTCTTTATCATAAATTTTGAACCCCTCCTTATC CCTTAATAAGCTATCTTTGTCAATTTGCATTATATTATTATACGTCAGAA TTTTATAAGGACTAAATAAAGTAAGCAGCATTTGTATTAAAATTATTTGA TTATTTTTCTGTTTAGACTATCGAGGCGTATCTTCATGCTTGGTGTAATG AATTTCGTTTTTTGTCCATTCATTTTGCTGTACCAATTCCTCTATTCATT CTTCATGTATGCTGAGGTAAATGATATACCATAATTTACGCCTTATCTTG TGAGCTGAATAAATTAAAAATATTCAGCCGGAAATACAAATGTAGGGATA TGAGAATTTGGGTTTTGTGGAACAAAACAAAAGGATACACTATTCTGGAT CCGCTTATTTCGTCGAATGACTTAGTGGGCTAAGAAGACAATTTTCTGAT TTTCTGACTCGAACCCTCGCTCCTTCTATGTTCAATTTAGTTCAATGGTT GGACTGGTTGGCCTAGAGGTTTCTCGCTAACTATGTTCAATAGATCTTGA CCCTATTTAGCCAATAGCTTCTCACAAAACCAGCGGGTTTTATGCGAATA AATGCAACGCAATGCAAGTGAAAGTGAGAATTTTGTGTGCGTTTAGGGTG CAGGATCTACTTTGATTACATTAGATTACCCGTATACTGAATATTGAATT TGACTACACGTGTGTCAGGTAGTTTGTGTGTTGATTAAAAAACCATACTG GAATTCCTGCACTTTTACACGGTGTGATAATGTATTTCTTTGCCTTTCAG TTGGTGAAAAGATCTCCAGATCTCTTTGGTGCAAGGAAATGGTATGTGCC AAAACAAACACAAGTTTTTAATGGTTACGACAAATGCATGTGTTAATCTT AAAACAATATATTGTTTTTAACTTTTTTACTTTGGAATAGATGGAATAGT ATCAGTATAATACAAGGTACGAGGGCTTTTTTAAACAGGTTTCCATTCAA CTTTGAACAATCAGCAGTACATTTTTTATTTATTTCACAGGTCACTATAT GGTCGTGTATATCTTCGCCATTTCAACGAGCTCGATCATGAATTTCAACA ACGATTAAGTCGAGCATACGATCCATCTAAGAAATACATCAATTCGTTTA TGTCACCTGTTCTTACAATCATTGCTAAGTATGTTCATTGAGGTTAAAGT TCAACATTCAAAAAAAAAGTTTTGAATTTATCATTTTATTGCTCCTTCAC GTAGAGCACAGTCTTTGGTGATACAAATCCCCTCCATCAATACTAATTGA GGTTATTACAATCTTTGAATTCACATGGTAGGACCTACGACTCCTACGGC TAAAATCGAATCTTCTATTGTAGGATTTGAAGCCACTTATTTCCTTTACA TAGTTGCACTACACAAGTGATTTTTATAGAAACGCTGGACTGGAAATAAC ATTTACCTCCATAAAACGAAAAAAAATGTGATTGCGCAGAAAGTTCAATT CGTCATCCGAAATGCGACGTAAAATTCTAAGACATAACTTTGACTTGTCT GGGAAGTTGAAACAATAGCTTTTAGCCTTAAAAAACAATTAATGAGATAC TTTATAATAGGTTTTTATGTGGGTTGCTCGTATGGAAAGAAATGTAGTCG GATTTTTTACCTCATAGAACTATCAAACTATAGGCTAAATACTCAGATTT GCCTACAACCCAAACAAAACAATATAATAAACAAAATAATTATAATGATA TTTTCTCTTTTTTTAGAAACATTGCTTTTTTTGCTGGCTCAATTTTGGCA GTTATGTTAGTATTGTCATTTTATGATCAAGACGTTTTAACAGCCGAACA TGTTATTTCATTCATGGCTATACTAGGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021510TCONS_00021510Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021509TCONS_00021509Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021508TCONS_00021508Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00021507TCONS_00021507Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021510-proteinTCONS_00021510-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000388supercontigsc0000388:104079..111056 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
16.7 14.83 17.83 16.56 21.49 14.71 16.72 17.23 15.45 15.6 15.11 14.54 20.67 21.29 13.32 15.68 29.1 39.56 21.11 21.1 38.62 40.41 25.58 29.14 63.04 62.61 14.21 9.28 21.12 23.93