XLOC_009492 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009492
Unique NameXLOC_009492
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000255:93213..116441+

Legend: gene
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>XLOC_009492 ID=XLOC_009492|Name=XLOC_009492|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23229bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:93213..116441+ (Clytia hemisphaerica)
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agtctagctttaaaactctacccttcgaacctactttagagcacttacaa atcgattgtgttttcaaaacttcctggggaatttcccttttttctcaaat attatgaccttgattgtaccaTCATggaaaaaacattcgattatgACGAG ACGATTCCTGATGCAAACTGAATGTTTTCTTTCATATTTGGCGAGAATTA TAAGTAACTTTGGGACAAACTTACCTACGAAAATAAGGAGTAATAAATTT CTGAGccttaaagcgattttaagaaaGTAAGAAACAAGGCATAGTGACTC AAGAGAATGATTTCATCAAAGTGAGCAGATATCATGTAATGTTAAgattt ttatttgaataaatAAGCCCAGCGGTACTTAAACTTGAAGAAAAAGACGC AGTCATAAATTCAAAGGTCCCTTCTAACAGTATAAAATTTCAGTCTTTTA AAAAAGCTTTCCCGATTATAGATCAAACGAAACCGATGGGCGACGACTGT TACGATCTTTCCGACAAATGTCCCGATTATGCCGATCATTTTGATGACGA TTATTGCAATCATCCGAAATACGCCAAGTGGATGTCGCAAGCATGCAAAG AAAGTTGCTTATATTGCAAAGGTAAAACACTTATTAAGTCTTTGAAAAAG CCACGTACTACAGACCCAGTGAGACCCCCTGCCCGTccgaaaaatatata aaaaaatcgtCCTTTAGTAAAGAATATAACCTGAAGTTTTATCACGTACC AGTCCCAAAAGAAATACTGGTCAAGTCCTTTCTTaggggaactaattttg acgaacagcaaaaatcctaaaaagttgtaaatttatcaaggaacttattt tggtgaggtagtatgttttttaaattcaaatttgccaaagttagttctcg ccaaaaatAAGTTCCCTCTTGAGATAATCAAAAGTAGCATTCTATCACTG ACCACCTTTAGAGAAAGATAGATTAACTTAGATATCAAAGGACTGACAGC TGCAAGTAGGAATTCAAGTTATCTgggaaatttctagcatctaatggtat ttttgtcacGATCCTATGTCCAATATATTTTTGTGGGAAAATTTACCTGG TAGATTGTTTACTTATTAGATTGTACTGNTGTCACGATCCTCAGTCCAAT ATACCTTTTTGTGGGAAAATTCACCTGGTAGATTGTTTACTTATTAGATT GTACTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTAAAAAAGAACGGCTTGTGC GTCGCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGATGGTAATGGAATGCTCCAA ATCGTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTTTCCAAAAAGACATTACAA AGTCAGTAACTACCTTTTATATTCAAAAGTTTCCTCACATTTTAAAGGct acaactttttttataaggcaTAAGGTAAATTTTTGTGAGGACTCATTTTg caagaaaatacattttttgagCCTCGAATAAGCTTAAATGTTATGCCTAT GATGTGATAATGTACTTAACATTTTAAGCATGCTTTTTTTTGTACTTCAg ataattaaaaatattttgaaatttcgtaAAATGAAGGACAGCATACATAT GCTTAGGCAatgcttaatttttttttaagatttgagcctggatatgctta taagagtTATGGCTATCAATAAAAAGTGTAAAGTGTGTATTATCAACTTC AATACTTATTTCACCCGACCAAATTTTACCACAACTTTTTTCTACTTCTT TTAACGGTTATTTCAAAACATTAATCTAGTGCACTGTAACGTACAAATTC CCAATTATAGATACGATTTCTCAATATGaagtaaaaatccaaaaaaattt aaatttcttttttggcaATGTCTATAGTTGATAAAGAATTTACTGATTGC CCGAGTTaggaaaataaaattcttaCTGTTAATATATGCTGatattttaa atctttaatttgCATGCGGTATTTTTTTAGAGTGACGGGACAAAGACCAT AGTGCCTGTATGTGTATGCAATGGAGGGATGAACGATGCGTATATCTCCG GTGACACAAATGTCGTTTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCATTT GACGTATATTCAACGTTCAATTGAAGTCCACAGCCATTGAATGGTTTTAC CTGAAAGAAGAACATTTgaatttgttaaaaattgacgtttttacTACTGG TATTAATAGAATTAACGTTCGACCGATACCATCTGACGGATAAATGGCTC GTTAACGAAACTCAAATGAAACCATTGCTTGGTTGTAAAAATCATCATCT ACTGTAAATGAAACAAATAATGGACGGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016942TCONS_00016942Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016943TCONS_00016943Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016944TCONS_00016944Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016945TCONS_00016945Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016946TCONS_00016946Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016947TCONS_00016947Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016948TCONS_00016948Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016949TCONS_00016949Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016944-proteinTCONS_00016944-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:93213..116441 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.18 0.54 0.47 0.17 4.6 4.68 4 5.01 2.48 1.95 6.79 2.71 4.35 5.23 6.05 7.12 2.31 2.16 0.16 0.04 1.07 0.26 0.83 1.33 3.32 3.05 0.32 0.05 0.23 0.63