TCONS_00016946 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016946
Unique NameTCONS_00016946
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1134

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016946 ID=TCONS_00016946|Name=TCONS_00016946|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1134bp
CGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGGAACAGTCGGCAACAACAA
TGGCGGAATACATCGACAAGATGGCGGCCAGCAAAGTAGTATAAAGCGTT
ACAAAAGGTTTGATGAAAAAACTGGTATGGATTCATACAAAGAAGCAAAA
GAAGCTCATCAACAGAAAACGTTGAAATCTAGCCTGGATAAATTAAAGAA
TCAAGCATTAGACCCGTTTCCTATTACATGGAATTATACAGATAAATATT
CTAACCGAACATTTGGTGTTACTCGAAACAGTATTGCGTTAAAGTCACAA
CCCACTGAATGTGTATACGCTGTCAATAAAGTGAGACGTTTACACGGACT
TCCAGAATTATCTTGGGCCACAGATATCGCATATACGGCACAAGAATGGG
CGCTCGCATTAGCCCAGATTGATAAAGGTTGTGAAGCTACTCACGATGAT
TATCCAAATTTATGGTTCAATGGAAAAGAAATAAGATTGggtgaaaacat
ttttctttcagatgataaattttttgatgattgtGCACAATCAATTGCTG
CCTGGTACAATGAACAATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAAACCA
GTGTACAACGTGGATCCGAACGGCCACGGTCATTTTATAACACTGATGTG
GCCGACAACGAAATATTTTGGTGTGGGAATATCTTATGATTACGATATCG
AATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTTGATGGTGTTCCAAACgaaaatgat
ttttacaaaaGCAGGTACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAaggtGACTGT
GACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACT
TTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCA
ACTTGTAGTACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTG
CATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCGGACA
AAGAGAGAATGCAAATCATAATGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGG
GATAACgatgaaagaaagaaagacgGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAA
TTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000255:93648..111636+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016946 ID=TCONS_00016946|Name=TCONS_00016946|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:93648..111636+ (Clytia hemisphaerica)
CGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGGAACAGTCGGCAACAACAA
TGGCGGAATACATCGACAAGATGGCGGCCAGCAAAGTAGTATAAAGCGTT
ACAAAAGGTTTGATGAAAAAACTGGTATGGATTCATACAAAGAAGCAAAA
GAAGCTCATCAACAGAAAACGTTGAAATCTAGCCTGGATAAATTAAAGAA
TCAAGCATTAGACCCGTTTCCTATTACATGGAATTATACAGATAAATATT
CTAACCGAACATTTGGTGTTACTCGAAACAGTATTGCGTTAAAGTCACAA
CCCACTGAATGTGTATACGCTGTCAATAAAGTGAGACGTTTACACGGACT
TCCAGAATTATCTTGGGCCACAGATATCGCATATACGGCACAAGAATGGG
CGCTCGCATTAGCCCAGATTGATAAAGGTTGTGAAGCTACTCACGATGAT
TATCCAAATTTATGGTTCAATGGAAAAGAAATAAGATTGggtgaaaacat
ttttctttcagatgataaattttttgatgattgtGCACAATCAATTGCTG
CCTGGTACAAGTAAGTTCGATCATTCTGTACGATATTGacctacacgctt
ttttctttataagaatgtaaATCCATTTTATCATAGATATTCCTAACTAT
AATCCTAAAgtattcttacaacattcttaggtaaggatcctaattcagac
tagatttaaacatttagtacatacgtctcaagcataaattggcatttttg
taaaaggagtgagccttacttgggggtaattggtaatttataattgaaaa
atggcattcttagttTGAGTAGCCAAATtcaatgatggtgatattcttag
catattcttaattttttggcaattttcatcatggacattcttataaagtg
tattcttataaaaaaaagcgtgtagctgGTCATTTTCACAGTTAACCTAA
GTCCAAAATTATCAGTATTTAGAGCTTCTTAACTTTGGTATAAACTGCAA
TTATGGACAAAAATGTTGACACAAAAGCGAATTCTAAGCTGCTTCCCCCT
TTCCCCCATTTACAATGTCCAATGCTTGGTGTGACGGCCGTGCGGACTGA
ACATTGCAGCTGGGGAAAGGGGGGAGacttttttctatatttttactACA
AATTCCtgtgtttttctcaaacatgTTTGTCCATGATTGTTTTCTCAAAT
TCTAAACCATTCTCCTTTTCTCAAATTAAGAGCTAAAAGTTGTCAGTTGA
TAATCACGAACCTATAACCCTACACGAGAAGTGACTACAGTTGAGaccta
gtttagacggccgactttctgccttGCCTTCCGTCGTTTATGACGAAAGT
TGACAGTCAAAAGTCAATACAATGCCTTCATTTGACGtctctttcaatct
ttttcaagcaaagatttgaaACTGCAAATTTACCGTCAATCTTGTGCCGT
CTCTCACATCGAAAGGAGGCAAGGCAGAAAGTCGACTGTCTAAACTAGGT
CTGTCTCCCGCttattcgaactcgaacgggaatGTTATTTGTTCGAGTTA
CAAAGAGAAAATACTTTATAGAAGGTACTAAATGGGGCTGGAAACaagat
cgaattatagaaagattcgcaTAAAAGAAGCTCGAATAAGCGAATGTTTG
TATATCAACTGTCAGTCATCCCCGATTAGTGGCGCCACTTACTTTTAACA
TGTGAAATATTTCATTCTGTTTTTTATAAGTGAACAATTCAAAGGTACCC
ATTACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGATCCGAACGGCCACGGT
CATTTTATAACACTGATGTGGCCGACAACGAAATATTTTGGTGTGGGAAT
ATCTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTTGATG
GTGTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAGGTACAGAATCCCGAAA
CCTAAAGAAAGTAAGTTCCAACCCAGCTTGGCACACAacgctgtttcaac
gttcatctaacgttatatggacgttgtgaacattagatgacgttgaaaca
acgttttgcaCCAGCTGGGAAACTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAG
TGCTAAAGACCCCCGGCCctaaaaattactaaaaaaacAAGTAACTTGGC
TTACAAATATTGCCCTGAAACTAATTATGGACTGTGAAGGCAACCATAAg
caactaaaaataatttttttttgttatccCGACATTAACATTATCAAAGT
CGAGGTTAAAAAGTCAATCTTGGTTAAATCCATCAGCGAAATTATAAAGG
TTGATATCCTAATAATCCTGAAAATCCTTAGCAACTCCACCTCTGAAAAT
TGGAgctgtttataaaaaatatgtacagGCATAAATCTTCGTATCCAGCG
CTAAACTCGAAAAATTTTCATCGGCCATCCAaataaagttttatttcata
ctCTAACTTAAATTAACACAATGATCTCAGACTTgtcttaaaagaaaaga
aaaattggaagctTAGCGAAAATTGGAAAGCTGAATAAATGATATACCGT
TTAGTTGATCTCTATATTTTAATTCATGTCAGCCATTTCGTCAGCCTTTG
GTGATCTTTCAGCTTACCAAGATCGAAAATATAatcagttttttatttta
atctttcatctttttcatccTTAAATAAAATGACAGAGTTAAAAAAAGGC
ATCTGGAATTAGGACAACAATACGGTAgttttctcttattttcacAAGGT
TTTCCAACTTTCCCTTTGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaattt
attttatttttcagaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGA
AGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGA
TGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCAATA
AGAATTTTAACAACGCTGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtccggt
atcggaattgcaattgtttcaattgttttaaaagtttgttttggacacgt
gattttaattgttctctttaatgacacgtggtttgcgcaatgttatattt
tactacttttatatccctttaacgttagatggacgttgaaataacgttag
GTGTCAGCTAGGCAACCAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGC
AAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAA
TGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCAGACAAAGAGAGAATGCAAATCATCA
TGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaa
gacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGC
TAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTC
GGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGT
AGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGA
ATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGAC
GACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAA
GAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCA
GGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTT
AATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCAC
ATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAA
TTCCATATACAAANTTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTC
AAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCC
ACCAAATTGTGGTGCGGACAAAGAGAGAATGCAAATCATAATGTGCGAAC
GACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAG
TCACAACTTTTAAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTT
GGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCA
AAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATAC
GTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTG
AAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCA
ACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAG
GGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTAC
CACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGT
TAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGT
ACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATAta
caaattgtttttttctagGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGC
AAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGA
TACGAAAGAACAAATGACACGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCG
AGCGTgagtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtc
tgcgCTTTTGTAATATCACACCATAACACAACCAAAACTGCAACATTGTc
tccgtgtattccaggctttatctacgttactgattgacgccagagaatac
taTCTAGCGCTATCACTAAGCATTGAAAATGCTGGTAATACACACGGAAC
GAGGTTGCCaaaactgtttaacaatttCTATCCGTTTATGACATGTCCCG
AGGATTGAGAATCTGTCGGTATAATATCAAATAGCAATTGTGGATCGACA
CAAAAAGCGTTCAAAGGGTGCAAGAATTGTCTTCAAATTTGAGAAACATC
CAAATCATGGATATGGACTATGGATATCGTGCATTCTTTCTTTGCGCATC
ATATTTAACTAGATCTAGAGcgataaattttactttcaatacaGCGTTTG
TCTGAAAGCCACGTCGGTCACACTTCATTTCCTATCCAATAATTTCTCTC
TAGCCATCTGCcttaaactgattttttttattttcagcttGTATGAATTA
CCACAGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCACTG
ATGATAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTGGT
TATTGTAACCAAAGTGAGTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTTCTGATAAAAGAGAATCATGTTGAA
CCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCA
TAAAACACGGTCAGTATTACATGCATGAGAGatcaacaatgatagaaatC
AATTTGATTTTCCTCTTAACtaatatatttaaatattttgactaaaagtt
cataatttttctttaacttcTGATAAAACAGAATCATGTTGAACCTTTCA
TCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACA
CGGTCAGTATTATATGCATGAGAGATCAACAANNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtgatttttcatgg
aaattcactgcactgtaagggtccgattttagaagccaaattttgggccg
aacgtatggtcgatttcagatcgagtgccccccccgggggcaatgcttaa
gttttttttaagatttgagcatggatatgcttataagagtTATGGCTATC
AATAAAAAGTCGTAAAGTGTGTATTATCAACTTCAATACTTATTTCACCC
GACCAAAATTTGCCACAACTTTTTTTCTAGTTCTGTTAGTGTTTATTTCG
AAATATTAATCTAGTGCACTGTAACGTACAAATTCCCAATTATAGATACG
ATTTCTCAATATgaggaaaaaatccaaaaaaatttaaatccctTTTTTGG
CAATGTCTATAGTTGATAAAGAATTTACTGATTACCCGAGTTaggaaaat
aaaattcttaCTGTTAATATATGCTGACGgtttaaatctttaatttacAT
GCGGTATTTTTTAGAGTGGCGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTATGTGTA
TGTGATGGAGGGATGAACAATGCGTATATCTCAGGTGACACAAATGTCGT
TTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCATTGACGTATATTCAACGTT
CATTTGACGTCCAcagtagtctagcaagctacacgtttttttttttataa
gaacgtcaaaaattttcgaagccttcggatgttcttagttttttggattt
gaagcctaaaaatgttcttaaaatgttcttaNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNacattttgatgtaatttcttaagaaaatg
catgtttttaagtctccaaagccttagaatgttcttagaatgttcttaaa
tttttgggcctcgaagccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaa
aaagaacgtgtagacgactaatttatacatatagtagaaataaagcaaaa
agtaatgaatggaacaattttagtcgtctagaaacctttgtgcactaact
ccaaacaaaaaaaaaagagtcaattaatatcgcaattaaaattttttcct
gctcaaaataattcttgagaaaaaaaaatatgtgtggatttgtgtattga
aagtttttcatttgagttgatttcgttttgagagtttgttNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNtccagtcgtttatacaaactaaatcccgtattattattat
tattattattattattagtattggtattattagtattacacgcattataa
acgactccagtctacgtCCACAGCCATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAG
AACATTTGAATTTGTTAAAGATTGACGTTTTTACTACTGGTATTAATAGA
ATTAACGTTCGACTAATACTATCTGATGGATAAATGGCTCGTTAACGAAA
CTCAAATGAAACCATTGCTTGGTTGTAAAAATCATCATCTACTGTAAATG
AAACAAATAATGGACGGATATTGCCTTGTTTACTTAAATAGGCAGCAACG
CTCATTGCAGGACGGCACTACATAGACCAAGCACGGCATTGTAGAGTTAA
ATATATCCTTCATCAGAGAAAGACAACAGTTATATTCCGTAATCCTTCTC
CTGATTTAATTCATTAATCTGCAAATTTACCGTCAATCTTGTGCCGTCTC
TCACATCGAAAGGAGGCAAGGCAGAAAGTCGACTGTCTAAACTAGGTCTG
TCTcccgctaattcgaactcgaacgggaatGTTATTCGTTCGAGTTACAA
AGAGAAAATACTTTATAGAAGGTACTAAATGGGGCTGGAAACaagatcga
attatagaaagattcgcaTAAAAGAAGCTCGAATAAGCGAATGTTTGTAT
ATCAACTGTCAGTCATCCCCGATTAGTGGCGCCACTTACTTTTAACATGT
GAAATATTTCAttctgtttttttataagtGAACAATTCAAAGGTACCCAT
TACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGATGCGAACGGCCACGGTCA
TTTTATAGCACTAATGTGGCCgacaacaaaatattttggtgtGGGAATAT
CTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTCGATGGT
GTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAGCTACAGAATCCCGAAACC
TAAAGAAAGTAAGTTCCAACCCAGCTTGGCACACAacgctgtttcaacgt
tcatctaacgttatatggacgttgtgaacattagatgacgttgaaacaac
gttttgcaCCAGCTGGGAAACTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTG
CTAAAGACCCCCGGCCCTAAAAATTACNGCTACATTTTGCAATAAACACG
AACAGAGTGCTAAAGACCCGGCCctaaaaattactaaaaatacAAGTAAC
TTGGCTTACAAATATTGCCCTGAAACTAATTATGGACTGTGAAGGCAACC
ATAAGcacctaaaaaaaaattttttgttatcCCGACATTAACATTATCAA
AGTCGAGCGTAAAAAGTCAATCTTGGTTAAATCCATCAGCGAAATTATAA
AGTTTGATATCCTAATAATCCTGAAAATCCTTAGCAACTCCACCTCTGAA
AATTGGagttgtttataaaaaatatgtacagGCATAAATCTTCATATCCA
GCGCTAAACTCGACAAATTTTCATCGGCCATCCAaataaagttttatttc
atactCTAACTTAAATTAACACAATGATCTCAGACTTgtcttaaaagaaa
agaaaaattggaagctTAGCGAAAATTGGAAAGCTGAATAAATGATATAC
CGTTTAGTTGATCTCTATATTTTAATTCATGTCAGCCATTTCGTCAGCCT
TTGGTGATCTTTCAGCTTACCAAGATCGAAAATATAatcagttttttatt
ttaatctttcatctttttcatccTTAAATAAAATGACAGAGTTAAAAAAA
GGCATCTGGAATTAGGACAACAATACGGTAgttttctcttattttcacAA
GGTTTTCCAACTTTCCCTTTGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaa
tttattttatttttcagaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGA
AGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGC
GGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCA
ATAAGAATTTTAACAACGCTGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtcc
ggtatcggaattgcaattgtttcaattgttttaaaagtttgttttggaca
cgtgattttaattgttctctttaatgacacgtggtttgcgcaatgttata
ttttactacttttatatccctttaacgttagatggacgttgaaataacgt
tagGTGTCAGCTAGGCAACCAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGT
GGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTT
GAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCAGACAAAGAGAGAATGCAAATCA
TCATGTGCCAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaag
aaagacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCT
TGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAA
CTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCAT
GGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTC
AGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCA
GACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGG
AAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGT
TCAGGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAA
GTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAG
CACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAA
GAATTCCATAtacaaattgtttttttctagGAATTTGCGAGGACAAGACT
CCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009492XLOC_009492Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:93648..94207TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:93648..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:93648..94207TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:93648..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:93648..94207TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:93648..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:95378..95607TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:95378..95607TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:95378..95607TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:96462..96580TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:96462..96580TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:96462..96580TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:97527..97652TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:97527..97652Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:97527..97652TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:97527..97652Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:97527..97652TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:97527..97652Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:111015..111054TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:111015..111054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:111015..111054TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:111015..111054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:111015..111054TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:111015..111054Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:111578..111636TCONS_00016946-exon-sc0000255-1491911889:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:111578..111636TCONS_00016946-exon-sc0000255-1510915933:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:111578..111636TCONS_00016946-exon-sc0000255-1575043694:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:93648..111636 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4.70745e-09	0	0.0387746	0.199863	0	0	0.0394607	0.0120312	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016946 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top