XLOC_004709 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004709
Unique NameXLOC_004709
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000085:114344..137078+

Legend: gene
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>XLOC_004709 ID=XLOC_004709|Name=XLOC_004709|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22735bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000085:114344..137078+ (Clytia hemisphaerica)
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TCATTACTCACATCCATTTCAATACACACATTCATTTCATTCATTCCATG TCACTCATGCAAACaaacacaaattttcatttccatCTTCAAGCAAAATT AGGTCATCTCCAGCGTTTTTCATTTGTGTAGATCCAGAGGTTGCATAATT GAAATAAACTTCCTTTTATCcattcatttattcattcataTTCACTTGAA CATTCATCCATTCAACCACGCCTTTTAATTAGCCGTCGTTATTTGAACAC tactgtctcacagccccggtggaacttttttcctaatactcctattgaaa tcctaatggcgatagaaattctatttttccaaggttaaaaaatccatttg gatggttttgaagtgcaatttttaaacatggaatttcgagtggggatgaa atcaaagtcaatatcCCAGTGGGGCTTAAGTTCTTAAGGGTATTTTCAca ccgggacgaaatttttgcttaattttctagtggggctggggtcccagcgg gtctgtgacacaggggtgttttgagACATAATGATTTCCAAATCTCTCAC AACATATCACATCTTCATCCTCATTGATCTCTCTCTCTGTTTCACTAATC ATTCCAATACACTGAAATAAGTTATATTTTTAAATAGCATAACCCACCCT GCActatttttttcgcttttttttcaaaaaaatatacacGTGTCACACCT TTTGAAATGTTATGAAAACTAGCTTTTGATAATATGTTGAACATTCTTTT CTAGAACAAACTCTGAGACAATGCATGATCAAGCAAACTTTATTTGCACT TCTCTGTATCACTTCGTATTATAAATATGCACATATaatcaaaaacattt cttttttgcACATCACCACCTCATACAGCTTGGAGAGAGCACTCCTTTTC AATTTGGCACCGACTATACAAAGAAGAACAATACGCCCAAACCTGAAAAC ACGCCCAGATCTTTCAACAAATACACGCCCGGAGTCGCCACTGTTAAAGC CCCGTACACACCAGTAACCAAATCAGAGACAACGAACGCACATTCGAATG GGAGCGTTGAAAGTACAGGCGCACGCCGACCCTCATTTAATAAATACACG ACACCTGCCATGAACTTTAAGAACTCTCAAgctataaaagaaaatttaga cAGTTCACAAGAGCCACAAGAGTCCAAAGTGTCTAGTGACGTTGGTACGG CTTTTGTACCGAGAAAATTCTCTCCCACTAAAGACATTATGAACCAATTG GAGAAAAATAAGTCAAGCACATCGACACCCAGTTATAATAAATACACACC CAATAAAAATCCGGATAGTGGTTTAAACAAAGTAAGCCGGTCAGTTTCAA TGTCTGCTTATGAGAGGAACCTGAAGAAAACACAAACACCTCCTGAGCCT TCAGTGTCTTATAACAAACTGAACAGATCTATCTCGGACTCTACCAATGT TACAGGACTTAATCGAGTTGGAACGAACAATCTAACCGGATTGAATCGGG TTAATTCGAACAATTTGACCGGTTTAAACAGGGTCGGTAGCACAAATAGT GCAACTGGTTTGAGATCTGTTAGTGAAGAGGTAAGTCTTCTTCATTATAA GACGATTAATATACGGTTTGATAAAGTTTCACAAGCGTTTATTTATGCCC TTTATGGTTTTTAATCTACGGTTTGGTAAAGTTTCACAAGCGTTTACGCC TAACATGTTTAACAAGTCTagtgaaaaaaatttctgtCTGTTATGAATCC AAGCATCGACATTTAACGGCCTCAACGACCGTAAGAGATCTATGATTTAT AGGGTTCTCAAATCTCGTTCATATCTTCAATAAGTCTTGTAAATTGTAAG CACTAGTTGTCTTCACTTTTATGATTGTCAATTAAAATTTATTTCTCATT TAGAGTAATTCTTCATCAACGACAAAACGACCCGTTTCCTCGTACGGTGG TGGTGGCAGATTTGCAAATTTGTAAGTTCGCGTAATGTTTGATGTGTCAC TCCTCTTGCAAAGTTCACTTTCGTCGTCATGCTTGTAAACTTAACCTAGG TTGTATTAGGGTTAAAAAAGTCCTAAATTTTATATTATCAATGTTTCATT CTTTGCTTGGAAATATTGAATGCTGTTTGTTGTTAGACGGTTTATGGTAA ATATACCGTTCCCTTATTCTATTCACACCAGGAGCTCTGACCCTGTTCCG CCACCACAACCCAAACCAGAACCACCAAAGCAGAACGGAACGCCTTCTTT TGGTAACCCAACTGGTACCCAATCAGCGGCCGATCGAATGGCGTATTTCA GACAAGCAGCAGAAGCAGAGAAGAAGAAGGTGGAAGAAAAGAAGGCGGCG GCAGAAGCGCGACAAAAGCAACAAGAAATGTTGAACGCTGTGATGAATGG AGAGGTCTCCATGGGTAGCAACAAGAaagaggaagaagaaaaaacaccAG CTACACGTAAAGAGAGTAATGAAGGGGGCGCCAAGAAAGGAGGATCTTCT GCGTAAGTTATCCATCACTTGTGCTGTTTATTTGATTAAGTAAAAATCTA AACAGCTACAAGTGACTTGCGCTCGTTTTATTCAGATTAGCTTTTTTACA TTCCATAACTATCTTCCATTTCAGGCCATGTAAGAGGCGCGAGAAAAAGA AGGTTACCCGTCGAACGATGTCCATCGGAAGCATCGTCCTCGATTGGGTG CAAGAAATGATCAAAGATTATCCAGTGGAAGTGACCAACTTCTCCTCCAG TTGGAACAATGGCATGGCTTTCTGCGCACTCATTCACGCTTTCAATAAAG ATGAGTTTGATTTTAGTGAGCTCAAACCGGAAAACAAACGCTACAATTTT GATTTGGCATTCGACACAGGATAGTAAGTGTATTTCTTTTAGTATTTCAT TGCTTTTGTTCTGCAGGCCTTTGGCCTCACCGTATCTGGATAAGGTATCA TTCGCCCATAAAGTAGCAAGACAGGCCTTTAACGGACGGATAATCTACAA ACTAATCAAAGAACATAAGGAAGCCGTTTTCAAACTAGCCGCCCATAAGA TTAAGAAGACGAATTAAAAGTGGGAATTCGATTTTAACTCAAACATTGTG AAAANCAATAAGATTAAGAAGACAAATTAAAAGTGGGAATTAGATTTTAA CTCATACATTGTGAAAAATTTGTTCAACTTTATTGACGTCTGTTGAAGTC AATGAGTTTAAATTTGGgctttataatttattttaaatttgacgaatttt tgaaaatccacCCATGAGTTGTTTTTTCAACTTTGCTTTTTCATTATGTa actattttcgaaaaaaaaaatttatgataaTACCCCACTCATAGAACTCC ATCAAAAGTTATTCGCACTTGTAATTTTACTGATAACTAATTTGAAAATG ACTTAAGTATCGTGACATTAAGACATCATACCAGATGTAGAAGGAATTGA AACTAAGAAACGTGTCATCACGCAAGAAAATTTATGATAATACCCCACTC ATAGATAACTCCATCAAAAGTTATTCGCACTTGTAATTTTACTGATAACT AATTTGAAAATGACTTTAAGTATCGTGACATTAAGACATCATACCAGATG TAGAAGGAATTGAAAATAAGAAACGTGTTATCACGTTTGAAAAAAGACCT AATCGTAATCAAGCATCAAACTAAACCGTTGGGGGCTTCtagaaagaatt tctttttaaaaagatcTCCAGTAAAATTTTCCTGTTTATGTTTCAGTAAA GTGAAGAAGATTCCAAAGTTGTTGGACACAGATGATATGGTTGCTATGGC TCGTCCTGAACCCAGGAGTGTTCAAACCTATATTCAATGGATTTGGAGTG TTTACGGACCAACCTCTGGGTACGGGCCTACCCCACAAGAAgtacaaaaa tgaaaacataaaaaGTCTTTGTTAGAAAATACTTTGGAAAAGATGATGGA TGGCAAAATTATCcacaaatttcagaaaaaaatagagAGACTTGTAGTGG AATTGACGGGTGCGACTGAATTTCCCAGAAGTTTTGATGGCTTGAGACCT CTACAATACAAACTGAATACATGATAGATGAAACCTCATAAGTGAGCAAA GCTGAATAGACGacttataaattatttttcttcttcgatTTCTTTCTGAT ACAATTTTTCTCACATTTGTCTGGTTTGAAAAGCTTTTGATTTATACgag aaagaaatttatttctAAGTTAAAGAGTTTCGGTAAAACTAATTTGTTTA TGAAGCACTGAAATCATACGAAGAACCAACTTTAACTTTTTCGTgtatat aattattttatccTCGATATTTCGTTGATGCTTTTTGTATATACATTCTT CTtctaaatttattgtaaaattaTTGAATAACACTTTCCTTTCCCTTCTT attaattttcccaaaattacaataattttagttttatgaatatacttaaa aaaaaagttttatacgATTTTATATTCGACAAAATTCTTATGTTGACTAT GTTTATTTTGACTAATAGAAACGGAATAGAAAATTATTTAAGTTTGAGGA GACCGGATTTTTCTCATCTAAAAATTGCTTACAAAAGGGCTGACCCTTTT TCAATTACCCCTTCCCCCTTTATAACCTTCAGGTGACACCTtgctgtcag aaatgtcatcattcTCAAAGTGTGGatatttttag
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008382TCONS_00008382Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008383TCONS_00008383Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008384TCONS_00008384Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008385TCONS_00008385Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008386TCONS_00008386Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008387TCONS_00008387Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008388TCONS_00008388Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008383-proteinTCONS_00008383-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000085supercontigsc0000085:114344..137078 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.04 0.06 0.05 11.76 10.69 84.26 100.18 78.34 98.15 33.46 64.28 48.56 48.27 20.45 17.62 67.39 80.58 54.96 60.85 93.13 91.16 72.74 82.16 93.95 100.66 9.48 2.13 1 1.24