XLOC_004088 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004088
Unique NameXLOC_004088
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000075:15915..61370-

Legend: gene
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ACAACTTTGCAGAAGTTGAATTATTCACCAATAACTTTATCTGTTTGATA CTGTAAGCCAGATCAATGTATCCTTGATATCCTGATTAAGATTACCAAAA ACTAAAGATAAGACAGTTGAAAAAAAGTTACAATCGTATTTTCTAGCTAT ATGACCAGCGAAAAGATTACAAGCAGATGATCATCATCCCATGCGCTATC ATTTTAATCGGTATCGGATGGAGTCCCGAGATCAGAAAACTACAAATCGA TCATGATCTTGCTTACGTTTGGTCCGACATATCGGAAGAAGCACTTGCTG AACAAAAGCTGCCAGTCGCGCACCGTGTACGATATTTCCGTAGCGATAGC ATAGCCGATACGACGGACACCGACTCTACCGTAGCGTCAACCGTTTCGAG CTACGATAAAGACAAACGACGAAAATCAAACATTTCTATGTTAGATAAAT TCCAGCGACGTAAATCGAATATCCAGGATGACGCTCGGAAAGTCGTTGTC CAAACCAATACGTCTCGTGGTAAAGCCACATTGATCAACTGCATCACGAA GTTGATCGCCATCCCAATTTTCATGTGCATTTTCACATACGTGTTCCAAA CAGCTGATTTAACACATGTCCACCATGGTTTCTTCTACTTGACTTCTGAT ACAACACTTTTTGTAATGTTCGTATTACATCTTTTGACCAGCATCTTTGG CTACCATCTTTCTTGGATGAGCTGTTCAATCAATCTACAGCNATATTACA TCTTTTGACTAGCATCTTTGGTTATCATCTTTCTTGGATGAGCTGTTCAA TCAATCTACAACGGTTGTGTTTCGCTATACCCTTAACTCTTGCAACTCCG GTTTGCATTATCCTGGTTTTAACTGGTAGATGTGGTTATGTTGGGTTATC AGAATGTTCAGCTCATTTGTATAGTGAACGAGGTTTGATTGTAGCGCTGG 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GAAATAGGAGATCATAAGATTTCATACGTTATAGTTACACCATCGGTTCT GATATGTAAAACACTGATAAAAGCATGGAAAATCTATCTCGTTTTCAGAA AATCAAGACTACAGTTACATCCTCACAACTGATGCTGACGTCCAATTCCA TCCCGAAGATGTATCTGCCCTTATGGATTTCATGTCTCGTGATCCTTCAG TTGGCGCTGTATGTGGCCGTACCAAGCCGAAAGGAACAGGCCCAATCGCT TGGTACCAGATGTTTGATTATGCGATAGATAGTTGGTTGTTGAAGGTTGC TGAACATGTGATGGGATCTGTACTCTGTTCACCCGGTTGTTTTTCAATTT ATAGATGTCGTGCGATTGAGGACGTGCTACCGGAATATGCTTCATCTGTT GGTTCAGCAATCGAATTCTTGAGAAAAGACATGGGTAAGGATCCTTCTTC TCGCTGATATTCGTGTTATTCATGACGTAATGTTTTTTACGGGAGCACTT ATTTTGAATTTAAACAATATGGCAAACGCCCAGACTATTTTGGATGTTTC TGTATGAAACATTTACTTCATGAATATCATGAATCCTAAGTTTTTAAGTT TTTAAGTTTTTTTTTCTATTAGATATTATTCCATTCCAAGTATACTATGT AGTAGTATATTCGAATTCATCAAAAGTTACAGCCTTTTTTGAGCTACTGT ATATTATTTTGAGGCAGTCTAAGTACTAAGTAAGGATTTAGTTTCAAGCA ACAATTGATTAATTTGAAGAGCCTAACGGTTTTTGAATAGCACGAAATTT ACTAATCTACAAGTCTATCTTCCAAGGTCACCACCTAAAAAAACTTTGTT ACTTCTCCTAAAGACAAGTCTAAAACTGTTCTAATCACAAGCATCTGTGA ACATATATCATGGCAAAATTCACGTTGCCTTGCGCAACAGAGCCGTTATA CAATTAGTATGACGGTGCTGCTTCGAATGGCATCTAATAAAAACGCTTTT TGATTCCTATACCCAGGTGAAGATCGTTGGTTATGTACACTTATGATGGA GCGTGGTTGGCGTTTGGATTACTGCGCGTCAGCCACCGTCACTACGTATT GTCCAGAAGAATTTAACGAGTTCTTTAAACAACGTAAACGTTGGGGTCCA TCTAGAATGGCCAATCAAGCGTTATTGATTCAACGTCAAAAAGAAATACG AATGAGTAATGATGATGTTAATATAGTATTCATTGTTTATCAAGTCATCA TGTTGGTCTCCATTATCATTGGGTAAGAATCTTTCTCAATCAAACACGTG ACCTCGAGTACTGTCATGACGGCTTTATAGAGGCTTCATCTCCCTTTAAA CCAGCAAAATCATTTTGTTTTTGTGGGTGGTTATTTTTAGGAAAACTAGT TAAATGATGATCTGATCTTCAACACCATCTGGCTTCTTCTTCAGTGCATA ATTATATCTTTGTCGTTTTAAACAGTAGAAATCCTTACAGAACCTCTTCA AAATTCTTCGGAAAAAGACGATTTTTCTTCAGATTACATTCAAGAGATTA CTCTGACACAGAAGAATTTTCTTCACCCTCTTATTACTATCTTTATTCCA AATCCAAAATTATGACATTTAAAAATCCATTACTTTTCTTACAGGCCCGG TACAGCGATCCAAAGGATCAGCTTTTTATTTTTTAACAAATTTTCTTTCA ATTTAGGCTGATCCATGGCTAGTATTCTGCATTATCACGGGATTTTTTTT CACTGTTTATATTAAAACAACTCTTGCCATAAGTCTTAAATGTATTAGGG ACCGTGTACAAATATTGTTCCACTTTTCAACGAATTTACACGATTTCTTT CGTTTCCCAAATGATTTTAATCGTTTAAGAATCGTACCAATTTAAAGCAA TGTCAGGCTGAAACGTTATGGAACGATTTTAAACGTTTTTCTTTGAACAA AAAGTGGTAAAACGATTTGAAAAGAAAGTCTTCAAGTTCAAACGATCTCC TAAACAATTAAACGAATTTGAAACTATCAAAACGAATTTGAAACTATCAA AACGAATTTCTTACCTCTAAAACGAATATCATACCTCTAAAACGAATATC TAAACTATTAAACGAATATCTAAACTAGTAAACGAATATCTAAACTAGTA AACGAATATCTAAACTAGTAAACGAATATCTAACTTATTAAACGAATATC TGAAATATTAAACGAATATCTGAAATATTAAACAAATATCTAAACTATTA AACGATTACTAGCTAATAGTCAATGCTACGATGCGCCCGTTGCTAAAAGT ATTATTCTGGAATAACATTACCGGATATAGTACTCTATCTCAATGTTGGA TACGTAAAATGCGACTTTTTTAGTCAAAGCACTCGTTATACATTTTTGGA AAACTAAGGGGTAGGGGAATCAAAATAGCATGGACTTTCACACCAACAAT TAAGAGTCCACATAGTTTATATATGGACCTATGCATAGTCTCTCCACTCT TGTACCTTTACTTGGCCTTGTATGGTACACGAACTGATTTTTGATGGATT TTAATCGAACAAAAACGATTTCATTTTATTGAAGCGTTTTGCCTTCGGAT GGAACGTTTTTCTATTTGAAAGAACGATCTATATAAACCTAAAAGGATTT TGAGAACACCAAACCGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACAAC AAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTT TGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACC AAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTT TGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTTGAGAACACC AAAACGATTTTGAGAACACCAAAACGATTTAGAGAATACCAAAACGATTT TGAGTACACCAAAACGAAATCTGGATATTTAAGACAATTGTAAACGATTT TCAAGATTTTGAAACGAATGAAAACGAATTCCTTTTCATAGTTTGTCAGT CATCGTTTAGAAAACGATTTTTCTTCAAATTCTTGGCTACTAAATCGTTT CATACCTTTTCACTATACGATTTTTTCTCAAACGATTAAAACAATATTTG TACACGGTCCCTTAGATATTGTTTTTCTTACAGACCTGGTACAGCGATCC TTATCGTCTCATCTGGTCTCCACGCCGCGTTTCCATCGACCATCACTCTG ATTGAATCTTTCTGCATCAACGTGGCGATTGTTGTATACTTTGTATGGGT CTGTTTGTATAAGAAACAAGAAAAACAACTGAGAGTGGCACAATTTCTGA CTTTCGTTTACGCCATGCTTATGAATGTGACTATAGTTGGATTTATGGTG ACGGTAGGTTTTACAGTTAGCCCGCACGACGCGATTTATTGTATTTTTCC AACTCCGTGTTATCTTTTCAACAAACGAAGAAGAGTTCGGTACAGGCTAG GCTCGGTACAGGAAGACTTTGATGCTTTGAGACCTCAAAGATCGTATTGT TCCTTTCATCATCAATAAAAGCTACTAAGAATTTTCTCTGTGGTCCCAAC ATCTTACAACCATCAGGTAGTACCGTATTTCTTAACAGACAATGTTTCAA CTAAAGCTCCATTGTTCTTGCTTTCTATCGTAGGTAACAAATGACATAAT TAAATTGAACTTTGTTTCTTTCTCTAGATTGCAGACGATTTGTACAAACA ACGACTGGAAGGGGACAGTTACTACATTCAGAACGTAACAGATATATACC 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TTTTAAGAGACCAAAGGAGGTGCTTCGAAAATTGACCAAAAATCTGTATG GGATGGATTTTTTTCGAGATAACGGGTCAGTAAGGTGAATGTTTACATCG AGCAATAACTCAGGGTCAATGATGATATTTAAAATCCAGATTGTTAGGGA GCTACGGTATAGCTATAAAACCAGCAAGTTCCAAAACAATGTAGGCGGGA TGGTGGGTTAACAAAGTTGGATAAACTTTCGTGACGATTTTACACCCTGA CATTTCATTTGTAGATAATGATAAGGACGTTGATTCAATTGGATTCGGTA AAAATGCTGAAGATGAGAAAGAAAATTCAACCAAAAGTGTTTGGGCGAAA GCGAGGAATGTGATTGGTCGATACACCAGTCAGCGTAGGAAAGATTTCGA ATGGAATATGCTTGAAGAGGCGAACCAATACGATTTTGAGCAAGCTTATA CAAGTGGTAAGGGGAACCTATATTAAAAGTTCATTTTTTCTTTGGGTTAT TTTTCCCAGAAATTACATACAGTGCTCTAAATTATATTTTTAACAATACA TAATTTATAATGTTAGAAAACAAGGATTTAGCGCACACTTAAAATGAATA GACTTTGCTGGTAAAGCCTATATTGTTTATATAAAGCTTTTGAAAAAAGA AAGTCGTGGTATTAAGAACGACTTAAAAACAATTCCAGAAATCCAGAACA GGGAAAACCTTTACTTTCCAATAACAAAGCATGTGCCAAAAAAATTAGAG ATTTTCTATCATTGTGGAATCTTTCAGGTTACGACCAATACGGCAACTAC ACCGGTGGATACCAACAATATCTTTCCAACGATGACGATGAATGCTTTTG TACAGTTCTCATAGAGGATTGGTTGTATGGGACATATTCTGTTTACATCT CCTTGTTCAAAGATGCTGGTTACGATGATACCACATTCTTGATGGGAATG AAAGAACCAGATTTGATTGAAATTGGAATCGAAAATCGTGGTCATCGTAA GAAGATCTTGAGTGAAATTCATCGTTTACCTCCGGAAGATATGGATCAGA ATGTACCCGTAAGACATTTTGGTTATTTTGCTCTTCTTCTTGTATTTCTT TGCTTTTCTAGACCAATGGTTTTTGGGTGAATGTTTAGAGTCGATATTGT TTGAAAGTGGATAGCCCAGTAATCTAGGACTTTTGGATAGTCTTTCGATT GTTTTCAAAGGGTTTACGGCCAGCCGACTCGGCTATCGAAGAATTAAACG GAAATTTGGAAGGAGCGGGAATTCGAACCGCGAACCCCTAGTTTGAGGCC CTGACACTTTGACCACTTAGCCATCGCTCCTGTGAACTTTCAAAAGTACT TGGCATATTCATTTTAAAAGTGGATCCACTGCAGCGATTGATACAGTGTT ATAGTCTACCTCTTTGGAAAAAGACAGAAAAATTTGAGCAGAAAAATTTG AGCAGATTCTTATTAGAAAAGTGTGAATCAATAAATGAGCGAACGAACGC ACGAAAATTCTGAAAACATTCCTCTCCATTCACATCAATTTTTAGGAAGA TGTTTACCAGTGGCTAGTGCTCCTTGGTTTAGGACAATACTGGATGAAAT TCCAGGAAAATTCTTACGACGAACCGAACTTCTTGGCTGATTTGAAATTA ATGGATAAACCGATGTTATCCAAGACCTTTGGTATCAATAAACCAGGACA TTTAAAGAAATTGGTGAAAGCAATCAAGAAGTTGAAATACCCAACTTCTG GTAAGTAGAAGTGTGCGGGTTTTAAGTTAACAGATAGTGTTACATTCCGT CAACAGAATTTTTTCAGACGAAGTATGTTGAAAAGTTAACTTTCTTGGAC TTGCGTTTTGGAATAAAAAGTAACAAAAGTTATGAGTGTAATTATGTATT GAGTATTGGCAAGAAAAATGATCTGATAAAGCACACGAGAGGTTAAGGTT TTTTTTTCTTCATAAAAAGCAAAATGGTATAAAACAACCTAGACAATCCA ACAACTCATCATATATAAACTCAACTTCTCTACTCAAGGAATTTCTAAAG CGGAAAAAAATGTTGATACAGTGTTCGCAGCGACGGGAACCGTCTAAAAG TATATCATAGACAATAGTTTTAACATAAAATAAACAGTTATATACTTTTC TCTAAACAGCACAACGAAAGATACGCGATGCAAAGCGAGCACTGGACAAA GTTCAAACGTACAATCTAGCTGAAGACAACATCAACGAGCATATTTTCTG GGAACAGTTACGTAAAGTTTGTTTGCACAACGAAGAGGATGCTTTCTCAC AAAGCGATGAGTTGAAATCAAAGTTGATGGAATTGAGGAATTCTGTTTTG GTTGTTTTTGCTGTTTTCAATGTCTTATGGTTGGTGGTAATGATGGGCAT TTTGAATCAAGGCGAGAAACTGAAATTGTATAATTCGAACTTTTTAAGTG TCACTTTTTTAGTGATTTATGTTTTGATGTTTGTTATACAGTTTTATACA CTGGTCATTCACCGTATCTCGACCTGGATGCATTTCGTATCTCGAACGCC TTTCAAACCTGGAGCAAGTAAAACAGCAGCTTGGGATTTCAATGATGATG AATTGAAAGAAGAACCGGCACACGAAGAATTAGAAGAACACGGTGAAGTG TTGGCTTGGAATCTTCGGCGCCGTAGCATGAGACGTACTAAAGTTGCCAA ACAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007282TCONS_00007282Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007281TCONS_00007281Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007279TCONS_00007279Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007278TCONS_00007278Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007279-proteinTCONS_00007279-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000075supercontigsc0000075:15915..61370 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.05 0.08 0.17 0.12 0.84 0.72 4.68 8.52 34.85 39.5 15 188.6 195.51 130.19 198.38 113.13 16.15 98 1.57 2.95 0.47 0.53 0.14 0.26 1.72 1.65 1.09 0.04 0.02 0.04