XLOC_003277 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_003277
Unique Name	XLOC_003277
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000059:508925..519763-

gene from alignment at sc0000059:508925..519763-

Legend: gene

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>XLOC_003277 ID=XLOC_003277|Name=XLOC_003277|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10839bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059:508925..519763- (Clytia hemisphaerica)
GGTACATATGGAGGACTTTAAAGGACTCAAAAAATTCCCAAGGTTTGCAC
CTACACCTTAAAAGTCGACGGAATAATGTGTTACCTAGTAATTACCTGGC
GACGTATTAAGTCAAATTATGATCCTCTTCATACTGAACTCTCAACTGCA
CCTAAATTTCGATCACTTTTTGCTCTTGAAAACTTTTCCAGGGTGATCAA
AAATCGTTTCGATACTTGAATATCGAGGCCGTTTTCTTTTCTTTCTTTAT
TTCCGATCCCATCCTATCGCCACTCGACACGGCCTCTCACTCGAGCTAGT
NCGCAAGGCCATCGTCTTTTCTTTACTTCCGATCCCATCCTATCGCCCTT
CTACACGGCCTCTCACTCGAGCTAGTGTGTTTTGGGTTTGTACATAATTT
TCCCTTTTCATCGTTTTCAGGTATCATTGAATAAATGATGAGATGTATCC
AAAACAATCCGAACAAGCCAAACCACCATTATGTTGCCTTTTCCAGAACC
ATCAAGGTATTACGACTGCGATTTTCAGTTTTATGGCAATAAAAAGCATG
TAGACACGAATTTTATAAAGAAATTGTGAGAGGTTCTAATATTTCAAACC
GTTAAAAAGATACTACGAACCTTCAGAATTTCGTTCAACTTTACTTTGTC
AACCATACACCAGCCAGGGTACATATGGATGACTTTAAAGGATTCTAAAA
ATTCCCAAGATTAGCAGCACCTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGACAAAACAATGCAAATTCATATGTTCA
TTATATTTCCATTTGATCACAGGCTTTTCGGCAGTACATTTATCGCTGAT
TCTTTGCCATTAGCCTCCGTCTCAGAACGCGGTCAGAAAATTTTGCGGAT
AATTTCACAGCGAAAATGCATCTAGTGAAATGTGAGTAATGTATCATAAT
TCAAGTCGACTGACATAATTATCCACATAATACATGTTACAAGTTCTGCC
TACGGATTCACAAGCTCGGCTATAATAAAACTATTACATGTTAGTAGCAG
ACCCGACTGACCAATGTTATGTAGCAGGTTGAAACATGAGTTTCTACTGG
AAAGATGCAGTTTGTTTTCAAGTTAAATCTTCAAAATAAAGCAAAATGTG
TGGGTTTCTTTACTTTCAAACAACCTACCAATAGTTTTGGAACACTCCAT
AATAAAGGAAGATGGCTCTTCTTGTGGATTGGCTTTCTGATACCCCATAT
AAACACGATGTGACATGAAAGTGAAGAGACACGATTTGTTGCTTTTTGTT
TGATTTGTTGACTCATATATCTCATGGCTAGCGGGATAGCAAATGACTTT
TCATGTATTGCTTGGTTCTACATATGACACCTCTAACTTTGAACACCTCC
AGAATGTTGAAAAAAGCATTTCACGAGATAAGTTTCAATTATAATTTTCA
TGGAAATTTTTAATCGACAGATTTGGCTTGGCGTCAGTTTTGTTTGGTTG
ATGTTTGGTATCGTGATCATTAAAAGCAATGAAATGCCACAGTCACTCTA
CACGTGATGCCTCCAGCCATGATTGGTATCAGAATGTTGGAAAAAAACAT
TTTACGAGAAATTGTTGATAGAAATTATATTGACTTGTTTTTACAATTTT
GGCGGTGTGGGTTTTGTTGGTTGATAATGTTTACACCGTGGGATCCTGGG
ATAGTTTTCAAAAAACTGTTATATTGATTGTTGTTTGTTGGAATTGGGTA
CCAAAAAAAAAGAGGACCTTATAAATACTTTATTTTTCTCATGAATCGAA
AAAACCGTGTGGATAGTATGTCTTGTAGTAACCAATGCAGTGTCTGTTTT
CAAATTTTGAAAGCTCTACCTATACCTACTGAATTGAAGCTCTGACTAGC
TCTGAGCCATGTTTTATTCTTTGTTGCTATTAAAGATAGATTTTTAAATT
GTCGTAATGTAAATTTATGGTAAAGTTTTAGTTTTTGAGTTTAGTTTNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCCCGAACGTTCCT
CAGGAATGAACTTTCATGACGTTATTTTTAAGCGTTCCTCACTCGTTCCT
CGAACGTTCCTCAGGAAAAGAGATGTTTCAACTTTGTTTCAGCATTCCTC
GTCTATTCCTCGAACGTCCCTGAGGAAAGGACATTTTATGACGTTATTTT
TAACCGTTGCTCACTCGTTCCTCGAACGTTCCTCAGGAATGGAAATATTT
CCTTTTCACTTTATTGTTCCTCATGAGCCGAAAAATCTTTTTTGCAAAAA
TCTGCTTTAGCCATCTTTTACCTAGGCCTCAAAACACCATCTTTTACCTA
CGATAATACCCTACTTTTGTGCAAAAAATCATGATCCAGTCGGGCTCTGT
CATATTTGATGGTTTATAGTCATGCACCTTTGTGCCAATATCAGAAACTT
TGAATGGGTCAATCTTGAGAAAAGCTGGTAACTAACGTTGTCCGTGGGTT
AATTTATAGGACCTCCATCGGGTTAAGTTCAAAAAGCCTGTAGGGATTTC
CAATGAACTTAAAACACAGGGTGAAAAAAAAAAACCCTAGTTGTTTGTGA
GCTTCCGTTACTAATGTGTTCTAAAGGACAAAAGTATTTCTCTAGCCCTT
TCTTTCATAAAAGTTTTTGATATTGAATATCTTATCCTTGAAAATGTATT
AACAGCTCCAAAAGTGTTTTTTCCTGAGAAACAAATGAGGAACTCTTTTA
AATAACGTCATGAAAGCCCATTCTTCAGGAACGTGTGAGGAAAAGATGAT
AAACGATAAAGTGAAGAAGAAATATCTCGCTCGAGTGAGGAGCGCTTAAA
AGTAACGTCATCCATTCCTGAGGAACGTTCGAGGAAGTAGTAAGGAACGC
TTAAAAATAACGTCATGAAAGTCTATTCCTGAGGAACGTTCGAGGAACGA
GTGAGGAACGCTTGAAAATAACGTCATGAAAGTCCGTCAGAAATGTTCAT
TCCTGAGGAACGAGTGAGGAACGCTTGAAAATAACGTCATGAAAGTCTAT
TCCTGAGGAACGTTCGAGGAACGAGTGAGGAACGTTCGAGGAACGAGTGA
GGAACGCTTGAAAATAATGTCATGAAAGTCCATTCCTGAGGAACGTTCGA
GGAACGAGTGAGGAACACCTAAAAATTACGTCAGAAATGTCTATTCCTGA
GGAACGTTCGAGGAATAGATGAGGAATGCTGAAACAAAGTTGAAATNATT
CATGTAATTCCCTCAACGTACCTACTTTTGTCTTCGCTTCGCAGATAGCG
ACGATGTGAGGCTTTTCCTCATGGGCCATGGACTGTAGCTCCTTAATTTT
AAATGAAGTCAACTGATCGGGATTTGTATACAGAACTTTCATATCTTTGA
TTAATTTTTCTTTTTGAGCAAAGTTGGCTTCTGTTGGTCTATGATATTTG
TCTCCGTTAGGTTGTTCGAGAAGGAGACATTCTTCATTGTTGGTGACTGG
TTGGGGGTTGACGGTTTTCTGAGTGGTATCTTCTTGACAGTGAAGCNNNN
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NNNNNNNNNNNNACATTTTAAAAAAACCACAAGTAGTTTTTAAGCGCCTT
AACTTAGGTTTGGGAAGTAAAGTTTTATCTCTGAGTTTTAACATAAGACT
TAAGACTGAGGATTGTAAAGCTTGCGAATAGTCCGACTAGGCTGAGAATA
TACCTAATTTTGGACGATCTTTTCTTCGCAAAGGCTTTTCCAGGATGTTA
AAAATCCATTTTGATACTTGAATGTTGCGACACCGTTGTCTTTTCTTTCT
ATTTTTCCCGATTCCATCCTCTATTCACTCAACACGGCCTCTCACTGCAG
CTAGTGTGGGTTGAACTTGTACATAATTTTCCATTCTCAATTTTTTCAGG
GACACGATTCGATGAGATATATCCAAATTAGTCTATACAAGCCAATCCAC
CATTATGTTGTCTTTTCTACAGCCATCAAGGTATTATTTTAATGCCATTT
TCAATTCCACTCAAATAAAAATCTGACAAAACAATGCAAATTCATATATT
CATTATATTTCCATTTTCCATAACAAGCCGATAATTTTAAAAACCATAAA
ACAAAACAAAGTCCGAAAAGATTCATTCTGACATCAAAAATCTTGAAGTA
ACAGACGAAGTGATCTCATGTAAAAATGCTATATTTCGTATTCTATCTAA
TACATCATTCAGGCAAAAAGTAAGTACAAAGAATAAAAGCTACTATTTAT
AAAAGTCATGGTAAAAAAAAATCGTAAAAATGTTATCAATAAAAAGGCAA
TTAAAATGTAAAATTGGCTAAGTATAATGATCCCAAGTGACTAATGATGA
AAAGAAACTAATCTCGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTATTTGACGTCAGAAATTTGATTGTGACGACAATTTTTTTGAAATATGC
AAAAAAGTAAGGGTCAAAAGTGATGTGCCCCCATATAGACGAAGAGTTTT
TTAAGAAGTAGGGAGAGATTGTAATGTTTCAATTTTTCAACAGTTTCTAC
AAACCATGGGAATTTTGGTCAACTTTATTTTGTCAACCATACACCAGCCA
GGGTACATATGGAGGACTTTAAAGGACTCAAAAAATTCCCAAGATTTGCA
CCTACACCTTAAAAGTCGACGGAATAATGTGTTACCTAGCAATTACCTGG
CGACGTAATAAGTCAAATTCTGATCCTCTTCATACTGAACTCTCAACTGC
ACCTAAATTTCGATCACTTTTTGTTCTTGAAAGCTTTTCCAGGGTGATCA
AAAACCGTTTTGATACTTGAATTGCAAGGCCGTTGTCTTTTCTTTCTTTA
TTTCCGATCCCATCCTATCGCCACTCGACACGGCTTCTCACTCGAGCTAG
TGTGTTTTGGGTTTGTACATAATTTTCCCTTTTCGTCGTTTTCAGGTATC
ATTGAATAAATGATGAGATGTATCCAAAACAATCCGAACAAGCCAAACCA
CCATTATGTTGCCTTTTCCAGAACCATCAAGGTATTACGAGTGCGATTTT
CAGTTTTATGGCAATAAAAAGCATGTAGACACAGATTTTATAAAGAAATT
GTGAGAAGTTCTAATGTTTCAAACCCTTAAAAAGTTACTACGAACCTTGG
GAATTTCGTTCAACTTTACTTTGTCAACCATACACCAGCCATGGTACACA
TGGATGACTTTAAAGGATTCTAAAAATTCCCAAGATTAGCAGCACCTACA
ATCAATGGCAGACTATTTGGCACAATAGGAGTTTCCCTCCGCATTTTAAA
AAAACCACAAGTAGTTTTTAAGCGCCTTAACTTAGGTTTGGGAAGTAAAG
TTTTATCTCTGAGTTTTAACATAAGACTGAAGACTGAGGATTGTAAAGCT
TGCGAATAGTCCGACTAGGCTGAGAATATACCTAATTTTGGACGATCTTT
TCTTCGCAAAGGCTTTTCCAGGATGATAAAAATCCATTTTGATACTTGAA
TGTTGCGACACCGTTGTCTTTTCTTTCTATTTTCCCGATTTCATCCTCTA
TTCACTCAACACGGCCTCTCACTGCAGCTTGTGTGGGTTGAACTTGTACA
TAATTTTCCATTCTCAATTTTTTCAGGGACAATCGATTCGATGAGATATA
TCCAAATTAGTCTATACAAGCCAATCCACCATTATGTTGTCTTTTCTACA
TCCATCAAGGTATTATTAATGCCATTTTCAATTCCTCTTACAAAACAGTG
CAAATTCATATCCATTTGATCACAGGCTTTTCGGCAGTTCATTTGTCGTG
GATTCTTTGCGATTTCTCTTCATTTAATTCTTACAGGTCGAGTCCTGTAG
CACCTTTTCTCTAAAAGAGAGCATTTCTTATTGAAAAATATCGTAACATA
CTCACTTTGTGTCAAGATTCTTCAAATGCGCCCGACACACCAGCCGTGTG
GTCCGAGTTTCTTTTTTTAATGCTGATTTTTTTACGTTTTTATTTATTTT
CTAAGTTGAAAAATATTATTGGACGTCAGAAATTTGAATATGACTTCACT
TTTTTTTGAATTATGCAAAAAAGCGAGGGTCAAAAGTTATGTGCCCCCAT
ATAGACGAAAAATTTTTTAAGAAGTAGTGATAGATTGTAATATTTCAATT
TTCAACAGTTTACTACAAACCATTGGAATTTTGGTCAACTTTATTTTGTC
AACCATACACCAGCCAGGGTACATATGGAGGACTTTAAAGGACTCTAAAA
ATATCCAAGATTTGCACCTTCACCTTAAAAGTCGACGGAATAATTTTACC
TAGTAATTACCTAGCGACCTAATAGTCAAATTATGATCTTCTTCATACTG
AACTTTCAATTGCACCTAAATGTCGATCACTTTTTGTTCTTAAAAGCTTT
TCCAGGGTTGATAAAAACCATTTCGATACTTGAATCGCAAGGCCGTTGTA
TTTTCTTTCTTTATTTCCGATCCCATCCTATCGCCACTCGACACGGCTTC
TCACTCCAGCTAGTGTGTTTTGGGTTTGTACATAATTTTCCCTTTTCATC
TTTTTCAGGTATCATTGAATAAATGATGAGATGTATCCA

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00005775	TCONS_00005775	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00005774	TCONS_00005774	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00005773	TCONS_00005773	Clytia hemisphaerica	transcript

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000059	supercontig	sc0000059:508925..519763 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
26.65	28.46	17.9	5.26	3.06	3.3	3.61	7.22	5.29	8.1	5.81	4.61	8.22	6.95	2.48	3.44	3.07	3.26	2.01	2.37	1.46	1.81	2.48	5.35	19.91	31.46	5.73	1.12	19.3	17.2

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XLOC_003277 (gene) - C. hemisphaerica