XLOC_002710 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002710
Unique NameXLOC_002710
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000048:378866..459114-

Legend: gene
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>XLOC_002710 ID=XLOC_002710|Name=XLOC_002710|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=80249bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:378866..459114- (Clytia hemisphaerica)
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GCTAAAGATATTTTATAAATTCCTTTGACATGATAGCAATAATAAGAAAA CAACAATCGAACAATTACTTTATAATGAGTTTTATCACACCTTTATACAA TCAAATGATTAAAAAAGAGAAAATTTTCTTTCTCATGAATGATGTTTAGA TTTTGCTTTTAGCAGCTGTAGTATGATGTATTCCGTTCCTTGTTCGACAT CTTGCTATAGCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAGTCCCTTATGAAAACTAATA AACTTTGCAACAACTAATTATTTCAATTAATTTGAAAAAAATATTCTCAA CCGCTGACCGGGGTTCGCAGATTCGCTACGACAGACATGTGTTAAAAAGA GAAAGAGAAATAGCCGTTGTACACAGTCCAGCTACGCTATACAAGTGTCC TTGCTTGATATTTTGACTCTAAAACTGCTTAAAATACCAAATATCCCAGG CTCACCTTTGTTTCTAGATTGTTCTTAACTTTATATCCTTTGTTCCTAGA TTGTTCTCGTGTTTGAGACTCATTATTCTTATAAAAATTTTCTTACACGT TTTTCTTTTTATAAGAAATTTTTGAAGCCTTCAGATGTTCTTAACATTTT GAGTTTTAAGCCTAAAAATATTCATAAGATGTTCTTATTTTCACTATTTT TTGAGCAGTTTTACCCATTTTTCTAAGAAACCGGCTTTTTTAGAGTCGGC AAAGCCTTAACTTGTTCTTATAACATTTTGATAATCAAAGCCTTATGTTA TTTTAAAGTGTTCTTATAAAAAAACGTGTATATGAAAAAAAAATGTCAAG AATAGACCTTATCAGAGTTTTTTATTTTTCTAAAAAAGCGATGCATTGTG GGATTGTTTCGAGTGTATTACAATAGAAATCTCTTAGGAATTCCTCCAGG GAATTCTATTGTAATACACTCGAAACAATCCCACAATGCATCGCTTTTTT AGAAAAATCAAAAACTCCGATAAGGTCTATTCTTTAGAATTGAAGGGTTT TTTTATGAAGGGTTTTTATGTACACGCTTTTCTTTTTATAAGAATGATTT CATAAGATCACAAGGCTGAAAATTTATCAAAACCTAAGAATGAATTAAGA AACGTCCGAGCTTAATATTTTAGAAAGTACTGATTTTACTGATTCTAAAT TAATTTTCCAAGTAAAGAAACTAAGCATATTAAGAACATCGCAAGAAACA TTTAAACTCGGGGAGCACTGACCTTGACGGCTGATGGGGACGTGCCGCTG GAGTTTGAAAAGTGGACCCTGCCAGATTTCAATGTTTGATAAATTTTGGA CCTTGTCGGAAGGAAAATCGAAAAAAAATTCCCATTTTCACCCTGAAAAA TGGCAAAAACGACGAAATGTAGACAAAAGATTTTTTCTAATTTTTCTAAT TTCGACCCTGAAAATCGTTCAAAAATCAAACAACGACCCTTTTTGGTAGT AAATTTGGGACACTGTCAGATATCCTTCAGAGAGCATAAAAAAGGGACCC TCCTGACCAGTGGCACGTCCCCGTTCCTAAGTTCGCCTGAGTGCCTCCCC CGGGCATTTAAGCCTATAAAAGTTTCTAAAAATAAAGAGCAGCCCAGTCT GAGCCAAAATTTTTTTCTTCTTATAAAAAGTCATGTAATGGACGTTGAAA CGGACGTGCAGTTGGGTACCAATACTTACAAAGGAAGTTTTCCATACTGA 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AAGAGAATCGAATATTAGCAGAGCCAGCTCAAGGAAATCACAAAGTAAGT ACACATTTTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAAGCCTTCGGATGTTC TTAACTTTTTCAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAACATTTTCTTATTT TCACCATTTTTTTTAGCATTCTTGTCCATTTTCCTAAAAAATTGGATGTT TTAGAGTCTGCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAACATTTTG GCCATCAAATCCTTATGCTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAGAAACGTG TACTCTGGAGTGATAAAATATTTTGATTGATTGAAAGAAGATACATTACA CATTTTTTATAACACCCCTGTCTCACTGCCCCGGTGGGACTTTTTTCTTC AGTGGGGATAAAAATTCCTATTGAAATCCCAATGGGGAGAGAAATTCTAT TGTTTAAAGGTTTAAAATCCAGTGGGGATGGTTTTGGAGTGCAATTTTTA AACATTTAATTTTGAGTGGGGATGAAATATAAGTCAATTTCCCAGTGGGG CTAAAATCCTACTATGCTATTTTCCTACCGGGGACGAAATTTTTGTCAGA TTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCGGCGGGGGGGGGGCAGTCAGGCAAATT GACCGACGGGTATGTGCGGCGGTTAAGGGTATGTTTTTCAAAATATCAGA AATGCACTGTAAGGGTAGACTTTTGATAAATGTATTGTAAGGGTGGAATT TCAGCAAATCTGGGAAAAATTGCAAATTTTTGCTCAAAAAATGTTGATTT TTTTGCTCTAAAAGAGTTTAAAATTTGAAAAAAATGCACTGTAAGGGTAT GAATTTCACCGATTTTTTTCTGCACTGTAAGGGTGCGATTCTAAAAGTCA ATTTTTTCGCTGCACATACCGTCAGTTGGTAAACCCACTGCCCCCCAGCG GGTCTGTGACACAGGGGTGTTTTATAAAAACATTTAAAGCCTTTGGATAT TCTTATCTTTTTGAACTTCTTATAGTGTTCATGTTTTCACCATTCTCTGT GATTATTTTCGTGCAAAATTGGGTGTTTTAAAGTCCATAAAGGCTTAAAA TGTTCTCAACTTTTATTCTACATGTATTTTTGTGAAAAGGTAAAAAAAAT TTGAAGCCTACGGATGTTCCTATTTTTTTTTAGATTTATCCCTAAATTGT TCTTAATATGTTCTTATTTTCACCATTTTGCGAGTATTTTTGTGAGAAAT CTTGTGTTTAGAGTCAAGTCAAGTTCACAAAGCCTTAAAATATTCTTGAT TTATTCTTAATATTTTTGTCATTGAAGCTTTATGTTCTTATATATTTTGT TCTTAATAAAATATGTGCAAAGTTCTAATGGCAAAGTATGAAAATTCATA ACTTGTCATCAATTTTTTGTGTCATTTCTCAGTTTACTCCCTAAGGTCGA TTTCAATTTGTTTTTAGTCAGCCCCGGTGACTCTTCAAATCGGTTCGACG ATTTTTTCCCGCTGGTCGTCGTTAAGACTTTCATTTTTAATTCCGATTTC GGATTATGTTCGGGAAACAGGATTTCGGGATTATTTAGCGCGCGAAAATA NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGA CATTTTTATTCCAACCCCCCCGCTTATTAATTTTCGAGATTTTTTCCAAC CCCCCTGCTTATTCCAAACCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTATATC AAAGAATTTTTTTTCCTTCGAATAATGTTAAAAGTTATGTACCACTTGTA GACTATTTCTTCTATCTGGGTCTTTTATTATTGTCATGGAAAGAGTATAA CAACAACGGAATAGATCTTTTTCACCGACTTCTGCTTTGGATACGGATTC CACACTATGCACTGCTCTGTTTTCTTCTGAACGTTTCAAGCAAATAGTTA CGTTCTTTCAAGCTGCTCAGATTTTAAAAGCCAGATTTCTTATCTGTACT TCCTATTAATCATTCTAAGCCTTCTAAGCATTTTGGGCTGACTTTCCAGC 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTAAATTATTTTAAGATTCTTTGCGTAACTTATAAAGTTTTTATAAAGAG ACTTTCCAAATCTTAACTAACTATTATGTGCAAAGAAGCTTTAAGATTTT TAGTGGTTCTTATCAAGTTCGGGTTAAGAATCTTAAAAATACGTAAATTT CTGGTTATGATTGTTTTTCATAAGAAGGAGTCAGGAGAGCAATCTCTTAG GATAGTATTTACGAATCAGTTTTTGGCCAGCTTCGAAATACGGTAAGTGG TTTTTCTTTTGTGTGTTTGTTATCATTGACTGTATTAATGCTTGGATGAT TAATGGGAAGTATTCACGAGGTCATCAGTTGAATGCTGTCACTCGAGCGA AGCTTTCGGCTCTTATTCAATAACTGAAGGGGAATAGTAGTAAGATTTCG TCAGTGACCGTAGTGCAGTGGTAGAGCATCCGCCTACGGTGCGCAAGGTT GTGGGTTCAACCCCAAGCCGGGTCATACCAAAGAGTCCCAAAATGGTACT TGATACCTCTCTGCTTGATGCTAAGCAATTAAGAGAATGATCAAGGGTAA GTGGAGCAATCCAGGGAGAAAGAGTGGCACCCTCCCCTACCTTCGGGTGG AACTGCGGTCGTAGACTTTTTTTTACTTAAGATTCCGTCAAGATCTTGAA TTACTGTAAGGGACAAAGAATCTTATTCAAAACTTATAAAAAAATCTTAT CAGATCGTTAAAGATCTTGATAGATCTTGGCACGTTCGTAGTAAGAAACT GAAAAAGAATATGCAAAGTTTCTTGATAAGATCTTTTCAAAAACTTTTCA AGAATTTTTACCAGGGTAACTACAGTTGTCTCTCTGTCTCTGTCTCTTTG TTTCATTTGATCCTCAAGGCACCAGGGATTTTCTTCGAATTAGAGAAAGA TTCGAATTACAGGGAGTACTTTCTAGATGAAGGGTCCAATATTGTAGTTT GAATTGTAGAAAAATTTTAATGGTAGAGGTTCGAATTAGAGAGAGAGTTG AATGTGCCACTTCAAGATTGCTAATTGCCCTTCCTTCCTTGATTTTTTCT TCTGTTTCTTTGTTTATAGATGGAGCTTTAAAAGAAGATATAGTCGACCT TCACCAATGGTTCACAAAAGCTTCAAACCAAGGTATTGTTGAACCATTTC CGTGCAGATGTAGACATATAGTACAGAAGACATCCCTGTCTCACAGCCCC GGTTGCAGTTTTTCCATCAGTGGGAATGAGAAGTTTTATCCAAATCCCAA TAATGGGATAAAAATTATATTGTCTCTCCTCAAAAATTGCAGTGGGAATG TTTTATGGAGCTCAACTTTTTCCATCGAATTTCAAGTGGGATAGAATCAA AGTCAATTTCCCAGTGGGGCTGAAATTGCAGGGTATTTATTCCACCTGGG ACGAAATTTTCCGGTGGGGCTGGTAGTGTTACCACAGCCACCATTCTCGT CGGTCCAATCAGTCCGCGTTGCCAGAGCTCTTTTTGTTCATCGATGACTG AATATGCTTGAGATCTGCTGAATATTATGCTTACTAGGGCCAACTATAAA AAATATACTTTAGCAAAACTCTGTATTTAGCTTAGGTATTCCCTTTTCCA TATGAAGCTTTAAACGTCTCAAAATACGTATTTTTTTCACAGAGAAAGAA CTAGCCATCGACATACTTGCAGCGATTACAAGAAAATCAAGAACCGGTCA TCATCCACCACAGCAAACACATCGAAGAACTGTCACTTTCCCTTCACGAG AAATCGATAGGTAAGCTTAACGGCCCTTGCACGTAAGCCTGAAAATGTTT TGGATTGGCGACAATCCCCCAAATCGAGGGGCTGGGGTGCAGGCCTTCTA CTGCAAAATCCTTGATGTGGTCTGGCGATATTCCGTAATATAAAGAATTC TTCCAGATGCTGGAAAATATCCCGCCCTTCAGCATTTAAATGTATGTGTG TTTTTTAGCGACAGAGACGGTAAGGTTCTAATTTGAGTAGATCCTGACCA GCTGAGAACGACGGTAAATCAGCACCTTTGCCGTCCTCGATTTTGCGGGG CGGAATTGTGGGTTTTTGCAAATCGCTTCAGTGAATCTACCGTCCTCAAA AGTGCAAATACATAAACCCGGTAAAGCTTTAGCGTGTCGGAAGAAAAGAA CATTTTTACACCAAGTGTGTTAAAGTTCCAACAAATTGAAAGTGGGCCAA AAATAAATAGAGAAAACGCGAAAGCTTTGTTATAAACACGAACCAAACAT TTTGCTCTTACGCACGGTTTGATTTCGTGAATAAATTTGGAACAAAATAA TCATGATAACAGCTTTTGAATTAAAATGGCCCGAAGAACAACAGATGAAT CTTTAAAAAAATGAATCTTCAAGATTTGAGCCGCATTTGGGATGACTGTA GTATAAGAAGGCCTGCTCTATGTCTGAAAACCCGCAAAGGAATTAAGTGG CTTCAGTTCCCATATCATCCAAATGATTCTTTTCTAACCTTTCGGGCTTT TCAAATAACTGAATGTTAAGATCGAGCAAATGATAACAATCTTTGTATAT TTTGCTTCTAGTCGATGCAGTTCCTCACTTTCCGCAGCACGAAGTGTGGA AAATTTACCAAAATTGCACTCCAAGAAACATACTCGATCGCGGTACATTT TCCACAACGAAGATGTAACCAATGCTGGTGCATTGGCCTATCGGACAACG AATTATTGTCCCAACGAATTTGTTATTCATCCGGAATGGAGGAACCGTGG TGATTTAGTAGCTCTTCATGAATTTCATCAACGTGATGAAAGAAGCGTGA TTCCTCACCATGGCTATTGGAGGAGATAAATTGAGGAATGTGGACAGTTT CAAATCTTTTATAGATGACGAAGTGAATTAACTGTGGTGCTATTACAGTA GTATTGAACAATCCTGAAAATAATTTTATTTGGATGGCGAAGGTTTTTAT GGACTAAAAAACTGGAATTCTAATTGGGTAGGCTGTACATATAATATGAC ATTAATGAACAGAAATATCTAACAATCTAATTGGTATTTTAAAGATTCAA CGACTGATGTAATTAATATGGTTTTATAACAATAAAGACCACAATATGGA AAAATTCCTGCTGCCCGTTAAATTTCCTTTTACATTAGATAACTTTTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004796TCONS_00004796Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004795TCONS_00004795Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004794TCONS_00004794Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004793TCONS_00004793Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004794-proteinTCONS_00004794-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000048supercontigsc0000048:378866..459114 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.12 3.32 3.35 3.02 544.6 400.76 157.96 173.94 105.74 129 74.78 95.63 14.79 13.74 8.83 13.54 8.7 9.52 6.21 7 12.23 12.38 6.87 8.7 19.9 21.04 6.18 5.89 2.22 2.27