XLOC_002276 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002276
Unique NameXLOC_002276
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000039:721640..730645+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002276 ID=XLOC_002276|Name=XLOC_002276|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9006bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000039:721640..730645+ (Clytia hemisphaerica)
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TGACGAATGCGTAACTAAGCAACATGATTGCCATGACAACGCTTCATGCA CCAATACGAACGGTTCATTTAATTGTCGATGTAATAAAGGTTTCTATGGA AACGGAACACATTGTTTTGATCAAGATGAATGTCTTTTGCGGTTGGATGA TTGCCATGACAACGCAACTTGCTTTAACACCCATGGTTCATTTGTGTGTG AATGCAACCGCGGGTTTACCGGTGATGGTCAAAACTTATGTAATGACCAA GACGAATGTTTGCTAACAACAGCTAATTGCCATAGTAACGCGTCGTGTAT CAATACGATTGGTTCTTTTCAATGTACATGTCATCCTGGGTTCCAGGGAA ATGGAACTTTGTGTGAAGGTGAGAATTAGGAGTTAGATAagccttttttg gattttagttTTAGATGATAAGATGTTTAGCTTTTatttgtattcatgat atgcaccgttTCAATGTCTTCCGAGGACCCAAccgctgattggttgtaag tgacgtgaAATCAATCAAtatgtcactttcaaccaatcagctgtttggcc cgtggaagacattgcaatgttaCATATCATGAAAAGTATTTTTCCATTAA AATAAACAAAGGACGGCTATTTAGTAGAGTCAATTGCCTGTTCACAAGGT GTGGTTGGAAGGAAGGTTATCAAATGCCTTTTTACTACAGCATAATCTTT TCACACCACCTTGTCGGTGGCTGCTACTAAGCAGTGATTTTAAATGTTTC CTAAATTGCcccttatgttaaaaagcaactttttctttgttttagatATC AACGAATGCTTACTCGAAATAGACGATTGCCATCCGAATGCCACGTGCTT GAACAATGAAGGTTTCTACACATGTCATTGTCAAACTGGTCTCTATGGCA ACGGAACTtcgtgttttgattttgatgaatgtTTATATGACACGCACCGT TGTCATGCACAAGCGCAATGCATTAATACGTATTTTCATTACAACTGCAA GTGTAAAGAGGGCTTTAGTGGTGATGGATTCGAATGTATTGATGTGAATG AATGTTTGGGAGAAAATGAATGTGATCAGAATGCCACGTGTTCGAATACG ATTGGTTCATACGACTGCAAATGTTTTGATGGCTTCTATGGCAACGGGAA AGAATGTTTTGACCGAGATGAATGTTTCTTGAGGATCGATAAATGCTCGG TCAATGCATCATGTGTGAATGCCATCGGTTCATACAAATGTGTCTGCAAC CAAGGTTTATCTGGTGGTGGTTTCACTTGTTTTGATATCAACGAATGTTT GGTGCCCAATATCTGTCATCCACAAGCCACCTGCAAAAATACTTATTCGT CATACTCGTGTCATTGTAATGATGGTTACCAAGGAAACGGGACGCACTGT GAAGGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004067TCONS_00004067Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004068TCONS_00004068Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004069TCONS_00004069Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004070TCONS_00004070Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004071TCONS_00004071Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004072TCONS_00004072Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004073TCONS_00004073Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004070-proteinTCONS_00004070-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000039supercontigsc0000039:721640..730645 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NOTCH4neurogenic locus notch homolog protein 4 preproprotein Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.73 0.76 2.08 2.38 4.19 3 1.14 1.51 0.55 0.47 0.52 0.65 0.71 1.11 0.21 0.17 1.5 1.99 1.97 2.21 2.48 2.92 0.53 1.4 2.98 2.65 0.62 0.77 0.22 0.1