XLOC_002186 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002186
Unique NameXLOC_002186
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000038:486248..509258+

Legend: gene
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>XLOC_002186 ID=XLOC_002186|Name=XLOC_002186|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23011bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000038:486248..509258+ (Clytia hemisphaerica)
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CAACACGCGACCGCTACACCAGCCGATGCGGAACAATGCCGGATGGACCA TCCATACGGTAAAAATCCGTTTTCACGATTCATCTCCGATGAAGATAACA TTAAAGCTTTAGCTGATTCTTTACAAAGATCATCAAACTCTTTCACAGAT CCAACATCTACATCATGCTCTAATTTCGATCTCAGTAGTTCTATGTTATT AAACACTTTCGCAAACGCTATTAGGACGGATTGTAGTTGGAGCGCTGAAC ANTGTTATTAAACACTTTTGCAAACGCTATTAGGACGGACTGTAGTTGGA GCGCTGAACAAAATTTCAATCATAGCGGAAATACGAGTGATTTGTTAAGC GGCAGTATGTCGATGGTCAAGGAAGAACTCCTAGAAGCTCGTAATTTAAC TTCGGAAGGTGAACATAGTTCAACTCTCTTAGCTAAAGGACTGACAAGTA GTTTGAATTCTTCCGGCGGGTTCACGGCAACGTTCTGTTTAAGTCCGCCG TTATCGGGTGACGACGATACATTGTCGGATGATTTGGACGCCGATGAAGC ACCGTTTAACGACTTGGATTTAACGATACGTGGTACGAGTATGACGTTGT TGAATCCGACACCGGAAATGATGGAGCAACTTGAAAATGACATTAAGGAT GAGCCTTTATCTCCAGAATCAATTGATATGCAAAGCGAAGAATGAAATTT ACCGTCAAATGTTGTTAAGGTCGGTGATTCTTGAAAGTTGTAAATTTGGA GAGATAAAATGGAAAATGGAGGCTGTTCTTTGGTAGTTGATGGGGTCCGT GCATAAAACAACTACATTCCAACGCCGAAAATTGAAGACTGGAAGATTTT ACCGCCCTTTATTTAAGGGCGTGGTCCTCtaatttgaacatttttcatga tttcatgGTCATATCTGTTCCTTTGTTCTCGTTCGatttttatgaacttt ctaaTCTAAAAAAGACACTATAAAAAGCTTATTAACTGAGTGAattaaaa tgtttaattttgcaaattttgttaaGAAACTATTACGGTTTTTTCTTTAT AGCTAGTTTTgaatttatacatttttttctcgaatttgCAACCGTTAATT TTTATGCTTTAAGTTTTTAGCTTTTTATAACGGCAGATATTATGTCCAAA TAGTTTACTTTGCTTAGAAGTTCTTTAGAACTTCTGAAACATTTTCAGTT TCCGAGACATTCTCTATCATTTTAGGCTGTTTGCTTTCCTCTACAACTAG TATAATCGAATTTTTGCTTCTTACTACtagcggttttgtagaggtctgcg attcagacttcTATCATCTGAATTTTAAGAATAACATATTCGACAAATAC GGTTGACAGACGGTCGTTTTAACAACGTCTAACGTTCCATGGATGTTATC TGGATGTAAAACGGACCTAGATACGACAATTTGTGGGTATGGAACGAACA ACCAGGCTATTTCTAAAGATTACTAGTATAAAAAAAGCATCAAGTTGAAC TTCACGGAACAAACTGCTTCCATTTACGGCTAACTACCTATCCAAAAGTT CACACTTAACATTTGAAATGATATAACATTCGTCTTAAAAATGCAAACTC GTACCGAATATTTTGATATATTAACCAAGCTTGCCGCTCATAAAACTGTT CAACAATACCCTCGCAAAATTATGTGCCAGCGTGGTTTTAACTTATTTCA AAGTAGTTGTGCCGCAGCACTATCCGAATTTTGGCGATTTTATTAGCTCG TTTGATTGTAAAGCGAACTTTTGGATTTTCAGCCGTAATTACGGTAACAa taatctctttttttttcgaatattcTCTTTGAAGAGAAGTAGGATTTAAT TTTGGATTTTCGTTGTTTCATTTATCATACAGTTTTCGTGTTTataaatt aatattttcatttgaaggagaatttgaaaaaataaccatTTAGTCATTAT TGTAAAAGCAATTATTAGGTCCATTATGAAAACAATCATTATTTGTACAT AATAAACATTTATGgccctgtttttttttgtaaacataCTGAGTggtaaa gttaaaaaaattagattttccatgaaaaataatATCTGAAATATTATTCA GTCTTTTCAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003898TCONS_00003898Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003899TCONS_00003899Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003900TCONS_00003900Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Forkhead box proteinTCONS_00003898-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000038supercontigsc0000038:486248..509258 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.81 3.04 1.35 0.93 61.81 42.24 24.47 26.47 11.56 28.55 12.75 11.19 4.25 3.72 2.47 3.37 4.01 4.99 6.35 5.73 4.51 4.51 7.64 6.54 7.44 8.76 3.9 6.24 5.25 7.11