XLOC_002112 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002112
Unique NameXLOC_002112
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000031:269768..278929-

Legend: gene
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>XLOC_002112 ID=XLOC_002112|Name=XLOC_002112|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9162bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000031:269768..278929- (Clytia hemisphaerica)
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GCTATGATGGTATTATTCCAGACTTTAGATGCCCTTTCATCTTCTGATAA ACTTATATAAGAGGATAACTCTTTGGCGAAGAAATTGAGAAAAATCTTTT GATTAAAATTGTCCTATATATGTTAAATGTGGTCCAATAAAATTAGTAAT AGGAGCATTTAGAATTTCCACCAATATGGAAGCAAACGTTCGATTTGCGT AAGGGATTGTCTTACAGATACGAACATTCGCTTCCATAATGGCGGAAATT ACGTTACTTAAACGAAAGAGAGAGAGAGTTCTCTGCACCTGAATTTAAAT CGTCACTTTATCACTTTCGTTTTCAGCGTGTTGTCATAGCAACGAAGAGT TCCGAACAAATTTCTTTTCCTTTATCTCTAATGACCGTTTGTAATTGTTT TTCCTGGCTTGTGTATGGTTATCTTATCAAAGACAGCTATGTACAGGTTT GTGTGGTGTTCTTTTTATGAAAATCTTCGTGTTTGGACCAGCGAATAATT CTCAATTTGAATAGTGACTGGTTCCCTTAAATGGGCACGTTCTAAGCCCA TTTCTAAAGTAACGGTATTTTACCCTTGATTAAGTTTCCCTTAATTTCGA CGTGATGTCATGTGTTTTAAGGTCTGTTTCCATCGATCGCGCGACCGTGC ACGCCAGGGCAAAATTTCCTAAAATAACCTATCGACGTCACAAATTCAAT TTTCTTGTACTCAAAAAGTGTACGCTCTTGTACGCTTTTGTGCTCTTTTC TACGCTGAAAATTTTCAAATTTTTTGAGCGTACAGGAGCGCACATCTCAA TTGATAATTTTTCAACCAATCAAGAAAGAGAAAAACTGCTGAGTAAACAA AAAAATGTAAACATACAGATTGTGTATGTTTTTGATGGAAATCAAACATT GATCGCGCGGAGTGTGCGGCCAAATCTATTTTAAGAATTTTGGCCTAGCG TGCACGCTCGCGTGATCGATGGAAACAGGCCTTTAATAGATAATTAATTA CGCTTTTATATCGTTTGGGATGTTCGGAGGTTTCACATTATGTACGTAAT GTTATGCACCCCCTTTTCTGGGATTGTTGTAACTTCTTTTAACAAATCTA TCTTCTCATTTTGCTTACTTTTTTATTTTCCCTTCTTTTCTAGGTACCCA ATTTCTTTGGGCTTGTTCTAGGTATTATCCAAGTCCTAACGATATACCAA TATCCAAACAAAACAAGCCGTGTGGGTTTAACGTCTCAAGTGTAATACAA TCAATTTTTTCTTGGCCCTATTAAATTGAAAAAATTATCTTGATTTTTAC AAGAAGGTTATTGAGTAACTGACGCGTTCTGTGAGGCTAACATCTCTTGG CTTTAGCAAGGTCAACCTCCTGTAAAATGAAATATTGAGTAATAATTATG TAATATGTTCTGGTTGATCTTAATCACATAACGTTTGTCATTGGATTGCA TCACCCACTTTTACATGTACAATGTGATCACCAAATGCATGTTTCTTGGA TAATGCTTCTTGTCCATGCTTTTGGATAATCTACATTTGTCTATGCGAAC CAAAGCGTTTGTTGACTTGACTGGATATCTATGTGAATTTTGCGGCGGGT GTGATTGGGCTTTTCCAGAAAAAAAACCGTATACCCCCTGTTGAGGAGGG CCCTTCCTCTGTGGCTGGAATTCTGAATTTTAGTAGGATTTAAAAAGCTA CCCCATGGAATTCCAGTTATTTTTGACAGATTTTTGTATCTCAATATGGA ATTCCGCCACATATCAAACCTTACCCCCTTTGGAACGGAAATGAACTCCT CAACATTGGGTATACGGTTTTTTTCTGAAAAAGCCCATTTTCAATTGTTT TCACAATGAACATTATATATATTGTTGTATCATTTTCGCTTCTCGATATT TTAGATGTTTCTATATATTGTGATTTTTAGTTCATGATGACTTTGCATGC GGTAGTTCATTTTTAACTTAGGGTGACAATAATACAAATTTAGAGAATTA TTTTTGATGTGCATTTTCCTATTTATGACTACGAACAAAACTGGTAAGAT AATATAAGGTTTTTACAAAAAACTTGATCCTAATGCTTGCTATTAGATAT TTTCCTTAGACAAGCCATATTCTAAAAAGGTAGGGTAGCGTCCGTTTTAG ACCAAAAAGGGCACTTCCTACTGTTTCTCCACAGAAAATCATAATTTGTT ACAAAGAAGGGCAGGGTCTGACGCCTAAAAGGCATGAAGAATGGTCTGTT AGATTTTGTATGCAGTGTTTTCTGCAGTGGAGAGTTTTTTATTAGGTTTG ATCCTGACTGGCCGAGAACGACTGTAAATCATAACTTTCTACACTTTAGC GGTCTTTAGAGGTTACTCTTCGAGAGTGAAAATATCACTGTAATCAAGAT TTCAAATTCTAGTGCTCTAACAGTCGAGTGTATGTTTTTTATATAAGAAC AAGCTATATAAAAATACGAGGCAAAAATGTCAAGAACAAATTAAGAGCAT TTTAAGTCTTTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003796TCONS_00003796Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003795TCONS_00003795Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003795-proteinTCONS_00003795-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000031supercontigsc0000031:269768..278929 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC50A1sugar transporter SWEET1 isoform a Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
23.95 22.16 20.73 23.66 6.26 5.73 9.4 9.82 9.14 7.3 7.5 8.07 7.53 9.34 7.73 9.89 8.39 10.22 7.41 7.2 6.06 6.05 18.54 17.28 7.87 9.96 4.78 3.67 12.38 12.52