XLOC_001448 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001448
Unique NameXLOC_001448
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000021:310558..323769-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001448 ID=XLOC_001448|Name=XLOC_001448|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13212bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021:310558..323769- (Clytia hemisphaerica)
CATTGATAGTTGAAGTTCCTGTCTCTAGAGATTTAATACTGGAACATTTA CATCCTAGGAAACCCTAAACGTGAGTATACATATACCAATAACTATTTTG AAGCTGGATCAACCATTCAAGGGGAAGTTGATCATGAGGCTATCCTAGAA AGTGTAAGAGTCGCTTGATAATGGACAAATTTATTGAAATCTGCAAAGGA CGTAATGTAAACATATTAAAACAGCCTTACAGCATTACTTATCTTTTCAT CATATCTGTATAAATCTGATCTGTACGTAATATCCTCTTTGCTTGATTTT TTATTTCGATCCCTTCCTTCCTTGCCTTTAATTCTTGTTATTATTGAATC TATTTCTCCAAGCGTTCATTGACTTCTCCCTTTTTTATTTTATTTGCAGT CTTTTTTGAGCCTATCAAATTTAAAATCTTTCTTCACTTAGGGGAGACCA ATTTAATTTGTTGTTCTACGGGCCTGACTGACCCTATTTTTGCTAAAATC AAAAAAAAATGATAATATTGAATTTCCCACTACAATATATTTTAAAAACA ATAGTTATTTGTAACAATTAAATTTGAATAAAGCTGAAAATTAATTCAAG AAATTGAAAAATTTAGAAAATTAAGCATTTTATACATTTTATTATGATCT AGATAAAGATCTGAGATAAAAAAAAGTGAATTTTTGATCCAGATATTTTT TGGAAAATATTTTTGNCCATCGAAGATAAAAAAAAGTGAATTTTTGATCC AGATATTTTTTGGAAAATATTTTCGGTATCTTACCAACCCTGATAAATGA AAAATTACAGACCGACCCATATTTTTTTAACGATCTGCCTGTAGAACAAC AAATTAAATTAATTTAAAAAATTAAAAACATTTTCACAACACACAAACCA TGGCAGCCATTGTTGTACCGGGTGCACCAAAAAAAAGTATACAGGTTTGT 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GCTTATCTGTTCTTTGCTCTTATTGTAATTCAATTCTCTTTATTTTCACA GGGTACTCTTCACATTACCATCGTGAAGGAGATCGTATAGGAATATGCAC CATACACGAGATTCCATATGTTCCTATGGGTTTATATGGTAGGTTTGGTG TTTGGCTTGGAAAAGATCTAAACTTCCTAATTTTATATCTTTCTTATTCT CCTTTTATGGTGACTACAAAGAATGAATGTTGAAAATAGACGATGTTATC GCCCGTTACAGTGATAGTAAAGGCGGGAAAATATGGCGTTATGGCGGTAT ACGGAAAAAATCGGCAGGAGAGTTTCGAAGAAACGACTGGCAACTCTACC GACTGTTAACTCTTTTCGGCAAAAAAACCCGTTTGCGAATTTTCTTCGGC TTTGGCCTTTTATTTTTAGATAGTGATTCGTCTTAGACTATAAAATAGTC TAGTTAAAGCTCCACTTTCGCACGATTACTTTCATCTTACAGAATAGCCT GAGTATTCAGGCTGTAGTAAACCTTTTTAAATTATTGATATTTCGGTTAA CCGCCTGGTCTTCCTAAAAGAAGAAAGTTAGCGCATGTCGTGTGTTATTG TTGTGAAGCTAAAAACTTTCTGACCCTGGGTTTACAATCATCAAGGTAGA TCAAGCTGTGAATAGCAGAAGCATCGCAATAAGAAATAATTTTCAGGCTA CTTACTCTGCTGATATCGATGAGATAATGGTATTTTATTAATCACTTTTT CACATTTCATTTTAGAGGATGGATTGATGCTCTCAGAGGCAGCCTATCCA CAACTTTTGAATGATAGTGTCAACAAAAGCAAAGAAATTTGTGAAAAATT TAAACAACGTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002685TCONS_00002685Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002684TCONS_00002684Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002683TCONS_00002683Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002682TCONS_00002682Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002681TCONS_00002681Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002680TCONS_00002680Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002679TCONS_00002679Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002678TCONS_00002678Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002677TCONS_00002677Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002676TCONS_00002676Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002675TCONS_00002675Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002674TCONS_00002674Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002673TCONS_00002673Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002675-proteinTCONS_00002675-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000021supercontigsc0000021:310558..323769 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
68.07 65.97 65.48 65.24 20.85 15.95 10.91 8.72 10.97 7.71 9 12.25 8.7 9.52 10.67 13.23 11.91 8.18 8.2 7.39 4.26 3.95 26.53 20.74 10.8 10.13 1.8 2.39 9.11 9.4