XLOC_000752 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000752
Unique NameXLOC_000752
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000010:414932..443511-

Legend: gene
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>XLOC_000752 ID=XLOC_000752|Name=XLOC_000752|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=28580bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:414932..443511- (Clytia hemisphaerica)
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CAATATACTGACTAAGGAGGCTCCGCCGTGGTAAGGGTCCTAAAACGCAT AAAACAGATTTGTTTTAAGGTTACTAAATAGAATTTGGCTTGATTAGTAA ATTTTCTGTTTGCTTTGAAAACGTGGTCGGGCAAATTCCCCCCACCAGGC TGCGTTAAAGAAATTGATTTATAAAAAGAATAACAGGCTTCAAGAGGTTT CAAGAGGAAAATTTCGATATCCTTTAGATGAAAAGAATTGTGTTTAGGTT AATTGATTTAATTCTTATGTTCTTATGAATAGATACCAGAATTCTTTAAA TTTCGATTTTGGGTTGCTTTTATAATTACTTACACGGAAACCAAAACTCT CCGTCATGAGTTTTGAACGCTATCAGTTCCTCCACTCTAAAGTGTCTACA TAATTGTTTTGGGTAGATAGAAAAGATAGCTACAGTAATGTATTTTCATG AGATGGGTAAACTTTTTAAAAAAGGTATTTAAACTATGTGTCACTTATAA TATTGCGGTAATACGGTAGAAATCTGAGATGTGAAATTCTATTGAAATGT GTTTTTAAACGGGTATTATTTCAATGAAATCAATAAAGTTATTGCCCAAT TTTTTTGACAAGATTTGTGAGTATTGATTTTCGTTCTGCTGTTTGTGGAG TACTAACTATGTCATCACTGAAAAAGTTAAAGGGATTTAGAGAGATTTTT GGAGAGTATTTGCAAAATGACTTTCAAGTGGTCAGTTGTGAAAAGTTTCT TCTAATTCACAACGAAAACGATTTTAAGGAGTTTTCACTCTCACGTCCAA GAAAGTTTGAGTAAAATACTTGATTTTTATAATATAATTTTTTTTTGGGT TAAAACCTTTTAAAATATTATCGTGAGAGATTTTAAACACTACAACTAAA GACACACCCCTTTTTGTGAATAAGCTTTAAAATCCAATGCTAGACTAACA 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TTCTTTGAATTCGTCAAACTTTTTTACGTGCAAACATGAAGATAATTTTA TCATTATTGAAGGCGATATTTTTGTTAGTGCTGGAATCGGAAATGAAAAT TGTATTGCTGGTTGCGTGTCTGAGTAGATGTTTTGGCAATTGAACTTTTG GTACCTATCTGTACAGCGTATTCTCGATAACTTCTGATCCTGCAACGATG TTCAAAGTCCTAATAACTAGAAATTGACTTTTCGTTGGGGAACACAATTT CCGGACAAAGTTATAATCATCATCTTAAAACTTACCTATGTTATTCTCAT TTGCATTAATAGAGATGTATAGAAAATCAATAGTTAAGTAAGAAGCTACA ACGGGCTACAGTATTCAGGGGTCTTTTATAGGCCAAATTTCGCCGATCGA AGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCTGTCTAAAAGTNGACTTTCGCCGAT CAAAGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCACTCGAAAAGTTCGATTCACCG TCTCAAGTACTTATTCACGCTAATCAATACATTGGGGTTGCTAAGAATTT GGGGGCCCAGAATCTAGAATTCACCGAGGGAGATTTTTCATTTGCCAGCC TATCGAAAACAAAGCAAAACCCCCGATGAAAAGTGCTGTCAAGTAGAGAA ACTGGTAAAACACACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAG TCTTCGAAGGCCAAAATGTTAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGTGGACA CTAAAACACCCAGTTTCTTAGGAAAATGAACAAAAATACTCTGGTAAAAA ATAAGAACACGTTAAGACCATTTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGA TTATTCGAAGCCTTCAAAAAATTTAGATGTTCTTATGAAATAAACATGTA AGCGAAATCAAACTTACGAGCTTTACTCTAAGTGAAATAGGGTTTTGAAT TATTAGTAGAACGTCTATGGTTGTAAGAACGGGCAACAACGGGCTATTAA AGGGAATTTAGGACGCTATGAAGAGCTGGGAAAATGGCCTTTTTTAACAA CTTTGTACCATTTTCTTTTCAGAAATAAAAGAGATCGAAGTGACAGGTGA ACGACCTGATGAATCAAATACTGATATGAAGAAACAGAAGAAATTACAAC GAAGAAAATCCATTGATAAAGAAGAACTGAACGTCTCTTGTCGTGCTCTC GGTAAAGCTGACCATGAGGGCTGGATGTTCAAGAAAGGTAGATTGATAGC TTTTTGTTATTAGAATGGTGTTTTCCACTCATGGATATTCTTTAACTTTT TGGGGAAAATCATTCTGAAATATTCTTACAGCATTCTTAGGGCCAGAATC CAAACCCAGCCTAAATTTAACATGTAATGCTAAAATTTGACATTTTTGGG AAACAATTGAGCATTGCTGGGAAATAATTGTTAGTTTAAGGTGAAATGCT CAAAAATTGGCATTCTTAGGTTCAGTTCCCAAATTCCGAGATGCTAAAAG AAAAAGCGTGTACCTATCAACCCGTATTGAATTCTGACCTATTTAGTAAA CTGCAAGGCAATTCTTACTACTTTGATGCCAAACTGAAAAAATACTGACA AAAAATACACTATCGTGACGAGTTAAAGAGGTTATCTACCGATCTCCTTT CTTTATATTTTCCATTTCACTCTCTACTTCTAGTTACCCGTGGGATTTTG AATGTTTTAATGTTTTTCTCCTTACAGAGTTAAGGCTAATTCATATAGGT GGTTTTAGACTATGTCGAACTTATCAGGGGAAGAGATTTGTAATTGTAAT TTCATTGTCTTTTAACGAGCGTTGCACTCCTTCGCATGCTTCCGACGTAC TTGCTCTGTCGTCTTTGCTGGCTCTTTGTTGGTTTTCATCAATATAATTT GCTGTTTTCTTTTTAGCCGGTGGACATGGTATTGTTCCAGTAAGCTGGAA GAAATTTTGGGTGGTTATCAAATTAGGGAAAATATATTGCTACAAAACGT CATTCAACATGCAAGCAGATTATTTGTTTATGGTCACTGACTACAGTGTG GATAATGCTACAGAGAAAAAGAAAAATTTGTAAGTATATCTTAAAACCAT TATTTTGATATGGGCTTTAAAACGCTATATTTTCAAAGCCTTAAACTTCA AACTTTTTAGTTTGAAAGCTATTTTCTCCCTCCTCGGTATATCTAATATA TCACATGAAATTGTACTCGACATGGAAGCAAAACTTGTTTTAGACCTTCT CTGACAGCTAAAGGGTAGCATACTAGGAAGTTCTTGAGTACAAAAGGCAG GGATCACATTAAGGCCCTCCAAACGAAGAATTTCGCCGTTCCAAGGCACA AACAAAATTACAATTCACCGGTCTTAAAATTTGTTTCATCGCCTCAAGTA CATATTCACGCTAATCAATACACTAAGCTTGCTAAGAATTTGCCGTCCTA GAATTCGCCGGAGCTAATTTTTCATTCGCCAGCCTATCAAAAATAATGCA AAACGTGCCGTTTCATTTCAAAACGTACCATTTTATTTTCGTAGCGCTTT CGTATTGAAACCAAACGAAGAAGACAAGAAAGGAGTGATTTTCGCTTGTG AGACAGAACAAGAATGTAATGATTGGATGGGAACTATCAACAAAATATTG TCCGGTGTCCATCTCAACAATGAAGAAGGTTAGTACCATTGAGTTTAAAG ACCCGAAGAGGCTAGAGATGAATCTTTAACCTTGCTCAAGTAAGTAAAAA AAGTGAAGCGTTAAGATTTGCGCCACATTAAGAATGATGGTTTACATATA ACACTTTCTTTGTTTTCAAGTGGCATATTTTTCGAATTCTGGCGATATGT TTTACTTTCAATCTAGCGTTTGTAGGAAAACTACGCGGGTCACGCGCTAA GAATGGGAAATAAGTGACTTTATTTCCCATCCAGGAGTCTCGTATTTAGT CCTTCCGTCTTGGAAGTCAATGGTTAGTACGCATGCATGTTCAAACAAGA AGTTTATCTTTTTGTCATGAACCTAAACCTAAAGTCCATTTGCTTAAACT TTTCTTCTTTCACTATTATGTGGAAACCACTCTTAAAAGAATTAGTCTAA TTGAGCTGACATGGTTTCCACATGAAAGATAACATAGTTTACACTTAGTT ACAGCGAATATAGACACAGCGTCAGCTTAAGTTTGAGTAGATTTTTGTCA TCAACTTTTGCCTCTCATGCCAAAAATTAATTGGGCTTATTAGCTTGATC ATGATTCGCGTGCAGCCCTTCCTTAGTTTTATATATAGTTTAATATCACT TCATTGATTTACCAAATACCAATCGACCCCAGAGTTTAAATAATAATTCA TATCTTGCCCAAGTTTATATGCATCAAACCAATTCAAATCTAACGATAAT CAACTCTCTTCTTTTTCCATACGCCGCTCCTTATCACCTACCCTTCAACC AATCAATAACAATCATTACGTCATTATTACATCATTATTCATTAATAAAA TCAACAACCAATCAGATCATTCGGAAGTGCGAGATTATGAAGACCACAAG CGATTGAACGCCATCAAACCAACATTTAAAGAAGAACACCAAAATAATGG TGTTCGAAAACATCGACCTATTTCTATCGCTTTCCAATCTCAAGAAGGTA AGGTTTTGCTAAACTGGAGCCCAGTCCTTTAGTTCGATTTTTTATGATTC TGCTTAATTTTATTGCTTTCCAATCTCATTAAAGTAAGGTTTTACCAAAC TCGAACCCAGTTCCCCAGTTCTCTTTCTCATGATTCTGGTAGCGCTCACA AAAGGTTACGTTCATCAATCAAATCAAAAAGTGGTACAAGTGTTCTTGGG TGAGAGATTTAGGTTTAGTATATCCAACAAATTGCCATATCCATTTTTGA GTTACCACTCGTCACTTTTAATTTCAAAACTTCGAAAATATTCTTTAATT TGACTTTCGGATGACAAGACGCTTTTTCGAATTAGAGATTCGAATTACGG AAAGCATTTTTGTAAGACCTTACAAGCCTCATCATTTATGTTCGAATTAC AAAAATCTGAGTTGTAAAGGCTTCGATGAGAGAGTGAACTGACTTGAAGT GATCCATTTTTGATACGATCTAGAAGAGAGGGAAATAATATGGGCTAAAC ACTCGAATTTTCTCCAGTCAACCATTTTTAAAGAACAAATAATCTTACAC GAATATACTTTTTCTGTAATGACTATCTTGTATGTAGAAACACTATTCGC ATGACTATAGCATTACTTTAGCTAACATAACAAGCACAGTAACATGTACA TCTTATAACACCAGTAAAACTGTCTTAGCCTTGAAATATATGGTTGAACA AATCTTGCACGAATGCTAGGTTTTATTGACACTTAATTTCTATTATGTTA GTTATGTAAACTTCCCGTACTTGAATCTGTATAATTTAGACCTCTCTTAT TTCTAATCTTTTGAACTTTTGTTGTCTGATCTGTAGGTCCTCGTTTCAAA TAATTGATTGCAAATTTTTGAATAGTTTTACTGATTTGATTTAGAATTTC ACCAAAGAAATAAAAAACATCACCAAATGGATTACGTGTTTAAAGATTTC AACACTTTTCCACCTCTTTTCTTAGATGAAGAAACGACAGGATTACCTGC AGGATTCGGTACTCGCACATCCTCAATGTCACAACCGCGCGTACGAAAAA TGAGCGCTGGAACGGGTGCACCAAGCTCTGTTCTATCTGGTAAGACTACA TGCTTTGATTTGAAGTTTTCTAAAGTCGTTAGGGGTGCTTGAGGTTATGG ATATGACACCCCCTTCTCACAGACCAACTGGGCTTCCTTCCCATCGGAAA AATTGTCCAAAATATAGTCCCCGGTAGAAAATTGTCCTCCAAGTTTTGTC CCTACTGAAAATAATCAAATAAAACAATTCTCATTGCAAAATATTATGTT ATTTTCCCCATCCCCACTGAATTATCTGAGTTGAAAACAAAAGAATTGAA ATCCCCGGCCATAAATAATATGGGAATATCAATCACCATCCAGTTTCAGT CCGTTATTTTTATCCCACTGCTTGAAAACATTTCACCGGGTCTGTGAGAA GGGAAAATCTCTTCTTTTTTATCTATATTAGTTAGCTCAAACATATTACA AACATTAAAGGTTCTTTTAGAAATGCGATCTGTAAAAGGTTTATCTTTTA ACCTGTTCGTTTATGATCGTTGAAACTCATGCACAAATATTGATGTTGTT GACAGAGTCTTGTATGACAATAAACTTAACTATTCACTTTCTTATTATCC AGTGGGTTCAATGTTTCACAAATTAGAAGAAAAACCGAAGGAAGACCAAG ATGAAGAAGATGATGAAGATGTCGAATTAAAAGATTTATTATACAAAGAA GTCGAAGTCGAAACTGAAGCGCCCGCAAAAACACCTTCACCCAAACCCGC TCCCATTCGTGTGGTGGAGCCTGTCGCTAAGCAAGTCATTCAAACAAAAG AACGCGAAAACGAGAAAACCGCCTCCATTGATGCTGAAACTATCATTAAA GAAATGGAAGAAAAAACGAAAGAAAATGAGGAGCCGACCCCAGAGCCGGC ACTAGCTGGTGCTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTAAAAAACCAG AGCCAGTTGTTCTTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTGAAAAACCA GAGCCAGTTGAAGAGTCAAAAGCGCCAGTTGCGGAGCCAGAAGCATCAAG TGACGAGACAGAAGAAGCAATTGAAGTCGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00001478TCONS_00001478Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001477TCONS_00001477Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001476TCONS_00001476Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001475TCONS_00001475Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001474TCONS_00001474Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001473TCONS_00001473Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001472TCONS_00001472Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001471TCONS_00001471Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001478-proteinTCONS_00001478-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000010supercontigsc0000010:414932..443511 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.43 1.86 0.85 0.9 65.98 46.93 111.22 119.45 38.14 58.4 28.69 20.59 82.32 67.1 16.71 19.32 32.55 34.57 64.38 75.75 26.32 29.39 10.64 13.31 25.23 22.41 9.25 6.4 4.59 5.35