TCONS_00001475 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001475
Unique Name	TCONS_00001475
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1477

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000010:414932..431214-

transcript sequence

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ttttttcagataGCTTTTTTTATCAACTTGTTCAAAATGAGATTTCTTAA
GATAAATCTTGCAAAAACATTCAGTAACGGAAAGAGTGGTCGTAGACGTT
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GCCAATCAGAACACGTCAAATATATCACACGATAAAGAGAACAAAGAACC
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atggaagaaaaaacgaaagaaaatgAGGAGCCGACCCCAGAGCCGGCACT
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CAGTTGTTCTTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTGAAAAACCAGAG
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CGAGACAGAAGAAGCAATTGAAGTCGC

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transcript from alignment at sc0000010:414932..431214-

Legend: exon

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>TCONS_00001475 ID=TCONS_00001475|Name=TCONS_00001475|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16283bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:414932..431214- (Clytia hemisphaerica)
GAATTGTTGTTGAAAATTGTAGAGAAGATTATTAGAGAAAAGCGATTGAT
TTTTTTCAGATAGCTTTTTTTATCAACTTGTTCAAAATGAGATTTCTTAA
GATAAATCTTGCAAAAACATTCAGTAACGGAAAGTAAGTTGCTAAACTAG
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TTTGGACATCGAAGCCTTATGTTCTTATAAAGTTTTTCTTATAAAAAAAA
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AACACTACGGTTTGACTTGAATGTTCTTTGAAACATTTGAAGCTGAATTT
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CTCTTTCTGTTCGGAGGTCAAACTATTGGTAATAGCTCCTGAAATAATAG
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CCCTAAAAGCCTAGTTTGAATAGGGTTTATGCTCTGATGAAAAAAAGGTT
TTCTTTAATATTTGGACCATTTTGAGTCGTATCCTTATTTCCGTTTTGAA
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ATAGATTACAAGGGGAAGTTGTTGTACTGTACATGTTTTTTTATAATAAC
ATCCAAAACTTTTGAAGCCTGCGGGTGTTCTTAACTTTATTTTTAAGTTT
TAAGCCTAAGATAATCTTATTTTCGCCATTTTTTGAGTATTTTTGACCAT
TTTTCCAAGAAATTGGGTGTTTTAGAGCTTTGAAATGTTTTTAACTCATT
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CGAAAAAACGTGCATCTTATACACCCTTCCGTCTTCCTGGTTCAATTTTA
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TGGTATTACTCGCTAGCTTCGCTATTGAGTAATTTTATTGTCAGATTTTC
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CATTTTGATCTTGCCAACACGTCGCTAGAAAGACTCTTTCTTTTAAGCTT
TAGCTTGAGCCTGAAAACACCCTACTTAGACTGATTTTTCTCCTGGAAAT
GGTTCCTCTCTGAAAGAAGGACGTTTTTTTTTTGCTGCATAACAATCAAT
GCGTTATGCATTTTCGCTAAACGCTATATTTTCTGACTGATTTTTTTCAT
TTTTCTTCTCGCATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCA
GCATCTAGCTTGCTCTTGTAAGAATCAAAAATAATATCATGTGAAAGATC
ACCAAAATAAAGGCTACACTCCTCTTGTAATAGTTGGTATTTCTGATGTT
TTTGTTGACTTCTATGAAAACCTTCTGAAATTCGTATTCTATATAATATC
AAATCTTCATAAATTTAATGAAACATTACCTAAAGTAACTCATATTCTAG
AAAAGAATTTATGGTTTTTCAGAGGGGGATATACAAGAAGAGAACCACCA
CATCAGGGAAAGAAAATTGAAAGTTTTTACAAACAGAGTTTCACCGTTAA
AACATTGTCAGCTCAAAGCGTGACCTAATATTGACACAAACGATTGGGCT
CTGTTTTCGTTTGACTGTGTTTGACAATAACACATTTTCTTTATTAGATC
ATACTAAATTTTTGAAGCTTTCAGATGTTCTTAACTTTTTGGGATTCAAG
CCTAAAAATGTTCTTAAGATGTTCTTATTTTCAACATTCTTTGAGTATTC
TTTTCCATTTTCCTAAGAAAACAGGTGTTTTAGAGGCAACAAAGACTTAA
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TTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAACGTGTAATTTGAAAAACACGATGA
TAAATCATTGGAAAAATAAAACTTTTTTACCCAGTTTTTCTTCCTAATAT
TTTTTTTATTTTTGCAAACTCAAAGATAAAAAAGATATCGAGAGAAAAGA
GGTTGGATTTGAAACCGCCTTGATTTTTTGATAAGGACCTGGCTTTATTG
GATGGTTGTTTTATCTGATTGTGCATCGAATTTGAAGTAGAAAGATGCCT
GCTCCAAAAGGTCAGTACCTACTTCTTTTGCTTCTTTTCGTCATGGGCTC
ATGGATTTTCATTCCATATAGTGGTTCTGGTTACTTTCGTTGGAAATAAT
TACTTGCCAACACCTCAGTGACCAGTGATGTTTTGAAATCCACCAGTGTG
GTTATAAAAAATTGAAACTTCACCGGGTTTGAATTTTAGATCTCAAAAAT
TTACTGTTCGCTGTGGTAGGGAGAAAATTCATTTTCAAGAATGGACGAAT
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TATGACCATAAATTTCCTAGTTTTGATCGGAGTAGAGAATTTCAATAAAA
TTTGACCGAGTTTACTCATACTCCTACCGGGGCTCAAAATTTGATCATTT
TTAGTGATTACTTTCACTGGGACGGATCTGACCGGGTCATCGATACAGGG
GTATTTTGTAGACCGAAAAAATCTTGGAATAAATATGTAAAAAAACATGA
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GTCAATAAAAATCTGCGCGATGAAATGGACAACAAAATTAGACTGCGGAT
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TTTCCTGGTTACTACCATACAAATTATCTTTTCTTGTTTGATTCGCAGAC
TTCCATACTTCTTATATATAGAAACTCCCACCAGAATTTAGTTTCAATTT
TAGCTATTCAAGGAGGGTCGGCATTTTGAATCCCGGTGATTCTGCTTATT
AGAGATTCCACTGTAATAAAAAAAGATCACGATGGAAGTTTTTTTCGTGA
TCAGAATAAAAAGGTATCGTGATAGTCACGCATGACAAGACCAAGCTGGC
ACGCAACTTTGTACGTAACGGACGTTATGTACGTTTAATGGATGTTTTGA
TGACGTTTTGTGTCAGCTGGGAAGCGTTGCATTCTCTTGTGAATGAAGCT
TAGCACTTCAACATTAGCTAAATTTTGATAGAAATCTAATCTAAATTATA
CTAAGTCTTACACTCAACCCTTATATGGAAATTTGTTTTGCTTGTGGGTT
AGATGAGTATAACGTATGGAATTTTGTTGCTTCACAAAACAATCGTTTTT
TCTGAAAACATATTTTGTTTTAATTTTGATATATTTAAGCTAAATCTTGT
TTATGTTAGCTATCTGAGAAATTCAGGCTCACTACTCTTTGCCAAATAGA
TTTTGGATACCCCATTCTCACAGACCCGGTAGGATTTTTTCAGCCATTGG
GGATAAAAATAACGGACTGAAACTCGATGGGGATTGATTTTCTCATATTT
TTTATAGCTGGGGGTCTCAATTCTTTGTTTTCAAATCAGAAAATTCGGTG
GGGATGGGAAAAACAGAAAATATTTTACAGTGAGGATTGGTTTATTTTAA
TTTCAATGGGGACAAAAATTGAAGGAAATTTTTTCACTGGGGACGATATT
TTGGCCAATTTTTTAGTGGGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTTTGAGAAGGGG
GTGTTTTTGGTTTATAATTTCAAAATACTGTAACGTCAAATGATGTCTTT
CCTTCCCTTTCACTCGCAATTCTATCGAAGTGATAATTTTACCTAAAGGT
TGCTGTGTAATCCACAAAGCTTTGACATAATAAAGTTTTCTTAAATCTTG
ATTCTTTCGATTAATGTCTTAAGATTTTTCTCATAAAATTAATCCAAATG
ATTAAAAATCGACGTCAAATTTTCATTCATTGATTCAATAAAATTTTCAA
TTTAAATTTTCAAAACGCTATGTTGTTTTTTGAAATTTCTAAGATATTCA
AACATTGACAAACCATAGTAAATTGTAAATCAAATGCGATTGAAAATTTA
AAAATTGAAACCAACCGTACTAATGCAAAGCAAAGAATTTTTAAATTCAC
AACTAATACCAAGCGCTCACGAAAAGCTCTCACGATGGTATCACCAGTTA
AATCAAAAAGTGGTGCTAGTGGCTCTGGTTGTGAGATGAAACCAAAACCA
TACCCATGTCATGAAATGAATCAAATAATATATATTTTTTGTGGTGATTA
CCTTTCATGAAAGGCAAAGGCTTCCTAATTTTTAGTGAATGGCTTATTTT
CACATTTTATTTTCACTGATGACACCAAACTCTCTTAAAATTTCGTCCCA
ATTTAATTCTATCCACTTCTTAATTTTTAGAACAACGAAGTTTTGAAGAA
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GAAACAAGTCCTCCGTGATGGAAGAAGTAAGTTCTTCGACTGCAATGCCT
TATTTCATCTAATTTCACAAAACCATTGTCCTGTGGTTTTTAATATATAT
ATTTTTTCGTTTTATGGCAAAAGCTTAGAATTTTGGCTGGTGGCTTGACC
ATTATTTGGTGGTGTCAAAAGCTTTTAGGGAGTATCTTTTGCCAGATTTT
GTTCAGTTATACCCCGCACCAAAACCATGGTGTCGAGCAGTTGCCATGCC
ACTGGTGGCTGATAAAACAATGTTTTATATTTCGTATCGATTTCTTGAGA
GGAAAAGGAAATAAGAATTTATGCATTTGCAATGATTTTTCTGTCATGAA
ATTTGATACCTCTAATATAAATGTCGGATTAATAGGGTATATTTGATTTG
GATTATAGTAGAGCCGTCTGTAAAAATAATCATTTTTCATCCCATATCAA
ACAGTACATTTTCATCATGAAAGAAAGTCTGTTATGTTGTGAGNTTCCAA
TATCAAACGGTACATTTTCATCATGAAAGAAAGTCTGTTGTGTTGTGAGA
AGAGGTTTTTTGTTAAGTTTGACCTAACATAGAATTTTATTTAGGAGACC
TTCTGTCTAGAGGCTGTTCGACCATCTTGGAATTGTATGCATTGCTTTTT
AACTGGATTTATTTCATATTAAAATGTGTACTTATATATAAATTCTGATG
GTTACTTCTCTTCCAAAAGTGTCTATCTATGGAAGTTTTTCGTCTGTTGA
TCAGTAATGGCTTGCTAAAGTTTCCGTATTTCAAATGATGGTTTATTGCA
TTTCTATGAAATTCTTAGCCAGATTAGAGATTAGACTTAAAGACCAAGAA
TTAAATGTCCTCTGAAATTTGTTGTTTCTACTAAGCTTCCTCGTACTTTA
AGGAAGTTTTATAGCGATTTGAAAGGATGCACTTTTATACCAGACTGAGC
TTGATAGGTTGGTTCTTGGTCAGGTTTGCTCGTCTCAGATCTTATATAAA
AAAATGTCTACAAGCTGACTAAATTTTGAATGATTGAATCTTTGAAACAT
AAATTCTAAATTCGTGGTAATTCATTCGAGATTTCAGGCAATATTTCGGC
AGCTTTTGTTTCTAAAGAGCATGAACTTTTAAGAAAATAGAGTGCCGTTC
TAACGCAAGGGCGAAGTACTATGATTTTATTGGAAAATTTCTGATTAAAA
TGGTTTCAAATTCAGAAGCCTGAATAAACAGTCCTTGTCGATCCGCATCA
ACATTACATCATCCTAACCCAATGATGTCAAACTCTACAAAATATCTCAG
TATGTAGTCCTCGTTGACTTCCTACTAATCTGACTAACTCACAATACAGG
ATCTTCTCTTGACTTTTTATGGTCAGTAGTTTATACGTTATTCAGGTTGA
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GTGTAATAGTATGTTATATTGATAAGGTATAGAGAATTTGAAATTAGTAA
CGTATTGTCAAAAAACCTACACGATAGAGCTTATATAATCAAAATTAAAC
CCTTATGAAAAACGCAGTCGACCTTTATTTTAATCATAACAGAAGTCATT
TTTTGGTTCGATATAGAGAATCACGGGAAAAAGAAACACGTTAAAGTTAA
AAGTTTTTTTGAGAGAGAATACGCTTTTGATTCGGTTTTTTTGAGATTTG
AGAATTTCGTCAGATCATGGATTGGATTTCAAGGTTTAGTTCCAATTCAA
AGAGAAGATTGAGAAGAAGTGTTTCAACGTTCAGTATCTTTGGCGGAGGA
GGTAAGTTGTTCACCATAGGGGCCATGGCTCCACATTGAAAGTGATAGTG
CAGCAATATACTGACTAAGGAGGCTCCGCCGTGGTAAGGGTCCTAAAACG
CATAAAACAGATTTGTTTTAAGGTTACTAAATAGAATTTGGCTTGATTAG
TAAATTTTCTGTTTGCTTTGAAAACGTGGTCGGGCAAATTCCCCCCACCA
GGCTGCGTTAAAGAAATTGATTTATAAAAAGAATAACAGGCTTCAAGAGG
TTTCAAGAGGAAAATTTCGATATCCTTTAGATGAAAAGAATTGTGTTTAG
GTTAATTGATTTAATTCTTATGTTCTTATGAATAGATACCAGAATTCTTT
AAATTTCGATTTTGGGTTGCTTTTATAATTACTTACACGGAAACCAAAAC
TCTCCGTCATGAGTTTTGAACGCTATCAGTTCCTCCACTCTAAAGTGTCT
ACATAATTGTTTTGGGTAGATAGAAAAGATAGCTACAGTAATGTATTTTC
ATGAGATGGGTAAACTTTTTAAAAAAGGTATTTAAACTATGTGTCACTTA
TAATATTGCGGTAATACGGTAGAAATCTGAGATGTGAAATTCTATTGAAA
TGTGTTTTTAAACGGGTATTATTTCAATGAAATCAATAAAGTTATTGCCC
AATTTTTTTGACAAGATTTGTGAGTATTGATTTTCGTTCTGCTGTTTGTG
GAGTACTAACTATGTCATCACTGAAAAAGTTAAAGGGATTTAGAGAGATT
TTTGGAGAGTATTTGCAAAATGACTTTCAAGTGGTCAGTTGTGAAAAGTT
TCTTCTAATTCACAACGAAAACGATTTTAAGGAGTTTTCACTCTCACGTC
CAAGAAAGTTTGAGTAAAATACTTGATTTTTATAATATAATTTTTTTTTG
GGTTAAAACCTTTTAAAATATTATCGTGAGAGATTTTAAACACTACAACT
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ACATGTTCAAGGGGTAAGATTGACTGTGTTAGAGGTCACATTTTGTCACG
CTATCACTGACACTCTTACATTTCTTTTCCTGTAACTCTTTTCTGGTCAG
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GTAACGTCTGAACATGACATTAATGTCCTTAATTTAGTTACTTAATTGTT
TTTTATTCGAATAGTCTTTTACAAATCAACCTGTCCGACTCTTGGTTCTC
CCAACCTGGCCTGGTATATGGAGTAACAAACGGTTTGTTCGATTAGATTG
TTTATAATTGATTATTTAGATATCTATTAGCTAAAAAAGCTAATTTGCTT
TTAGACTGGTAGCTAGTACCAGTCTCCAAAGGATTGTGANGTTAGATCGC
AAGCTATTGATAAAAAAGCTAATTTGCTTTTAGACTGGTAGCTAGTACCA
GTCTCCAAAGGATTGTGATATTGTATGTTGGTGTTTGATGCAGGCTAAAC
GTTTTTTTTTTATAAGAATAACTTCTATAAGAATATCAGGGTGTGATTTC
AGAGTTAGAACAATAGGTCTATTGTTTAGAACAATAGAAATATAAGAATA
ATGCACACCCTCAGCCAAAGTACACTATTCTTATAAAAGAAAAACGTGTA
TGTGTATTTGTTTTTTTCTTTCCCATTATTGGTCACTAATTAAACTGAAG
CCATTTACAATTAAGTTATATCTAGCGTAATAGCATGCAACAAGCTGCTA
TTTAGATACAATATGGCAATTTTTGTTGATATTGGTTTATTTTTACTTTG
TAAGGTTATTCTATTTGTTTCGTTCTGATATAAACTTTCGGTTGTATTGT
GGTTTATCTGGAGGCATATTGGATAAACTACGGTATTATTAGCAGAGTAA
TGCTTGCAGGTGGGCAGTTGGAGCGAAGCTAATTCACTCCTGGAGAAAAA
GCCACCGTTCCCCACTCTATGAAAAGCATGAATTAAGTTATCACGAAGAC
ATAATCACAGAAGTTTTTGTTGACTAAGAATTCGCATTTGAATGGCTTGG
GTCTCTGATATCAATGATTATTATAGTTAACCCGGGGGGTTAATTTACTA
ATTTTCAAGATGTTTATCTGACAGGGTCAAATTTTGGTTGCGATGTTTAT
CTGGCAGTGTCCATTTTTTCAAACTCCAGCGGCACGTCCTCGTCGGCCGG
TAAGGTTAGTGCCCCCCACCCCAGGAGTTAACTAATTCGAATTCGAAACG
GGTAGCCCATTCTGTTCGGATAACAGAGAGATTCAAATAATAGAAAGTGT
TTTACTAAGAATTAGTTCGAATTATAGAAAGATTCGAATAATAGATGTTC
GAATTAGCGAGTTTCAACTGTATGTAGACTATCCACAACAAACTTATCAA
AAAACTAATGATTTTTTCATTCACGTGTGATGACTTTCAGTTTTTGGTTG
ATTGGTGCCAATTGAATGATATTAGATTGTTGGCAATCTCCCTCTAAGCT
TTTATCAAGCTTATTTGCACTATTTAAAGAGCTTATAGCTACAATATGGA
AGATCTTTCAATCGAAAAGAATTCCTTATTTGGTCATGACTGCTCTCCTC
GATTGAGTTTTTGTTGACTTTTGTTTTAAACGGTGGTTAATATTTGCATT
CTGTTCTTTGAATTCGTCAAACTTTTTTACGTGCAAACATGAAGATAATT
TTATCATTATTGAAGGCGATATTTTTGTTAGTGCTGGAATCGGAAATGAA
AATTGTATTGCTGGTTGCGTGTCTGAGTAGATGTTTTGGCAATTGAACTT
TTGGTACCTATCTGTACAGCGTATTCTCGATAACTTCTGATCCTGCAACG
ATGTTCAAAGTCCTAATAACTAGAAATTGACTTTTCGTTGGGGAACACAA
TTTCCGGACAAAGTTATAATCATCATCTTAAAACTTACCTATGTTATTCT
CATTTGCATTAATAGAGATGTATAGAAAATCAATAGTTAAGTAAGAAGCT
ACAACGGGCTACAGTATTCAGGGGTCTTTTATAGGCCAAATTTCGCCGAT
CGAAGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCTGTCTAAAAGTNGACTTTCGCC
GATCAAAGCCACTAAAAAATTACAATTCGCCACTCGAAAAGTTCGATTCA
CCGTCTCAAGTACTTATTCACGCTAATCAATACATTGGGGTTGCTAAGAA
TTTGGGGGCCCAGAATCTAGAATTCACCGAGGGAGATTTTTCATTTGCCA
GCCTATCGAAAACAAAGCAAAACCCCCGATGAAAAGTGCTGTCAAGTAGA
GAAACTGGTAAAACACACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACAT
AAGTCTTCGAAGGCCAAAATGTTAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGTGG
ACACTAAAACACCCAGTTTCTTAGGAAAATGAACAAAAATACTCTGGTAA
AAAATAAGAACACGTTAAGACCATTTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTA
AGATTATTCGAAGCCTTCAAAAAATTTAGATGTTCTTATGAAATAAACAT
GTAAGCGAAATCAAACTTACGAGCTTTACTCTAAGTGAAATAGGGTTTTG
AATTATTAGTAGAACGTCTATGGTTGTAAGAACGGGCAACAACGGGCTAT
TAAAGGGAATTTAGGACGCTATGAAGAGCTGGGAAAATGGCCTTTTTTAA
CAACTTTGTACCATTTTCTTTTCAGAAATAAAAGAGATCGAAGTGACAGG
TGAACGACCTGATGAATCAAATACTGATATGAAGAAACAGAAGAAATTAC
AACGAAGAAAATCCATTGATAAAGAAGAACTGAACGTCTCTTGTCGTGCT
CTCGGTAAAGCTGACCATGAGGGCTGGATGTTCAAGAAAGGTAGATTGAT
AGCTTTTTGTTATTAGAATGGTGTTTTCCACTCATGGATATTCTTTAACT
TTTTGGGGAAAATCATTCTGAAATATTCTTACAGCATTCTTAGGGCCAGA
ATCCAAACCCAGCCTAAATTTAACATGTAATGCTAAAATTTGACATTTTT
GGGAAACAATTGAGCATTGCTGGGAAATAATTGTTAGTTTAAGGTGAAAT
GCTCAAAAATTGGCATTCTTAGGTTCAGTTCCCAAATTCCGAGATGCTAA
AAGAAAAAGCGTGTACCTATCAACCCGTATTGAATTCTGACCTATTTAGT
AAACTGCAAGGCAATTCTTACTACTTTGATGCCAAACTGAAAAAATACTG
ACAAAAAATACACTATCGTGACGAGTTAAAGAGGTTATCTACCGATCTCC
TTTCTTTATATTTTCCATTTCACTCTCTACTTCTAGTTACCCGTGGGATT
TTGAATGTTTTAATGTTTTTCTCCTTACAGAGTTAAGGCTAATTCATATA
GGTGGTTTTAGACTATGTCGAACTTATCAGGGGAAGAGATTTGTAATTGT
AATTTCATTGTCTTTTAACGAGCGTTGCACTCCTTCGCATGCTTCCGACG
TACTTGCTCTGTCGTCTTTGCTGGCTCTTTGTTGGTTTTCATCAATATAA
TTTGCTGTTTTCTTTTTAGCCGGTGGACATGGTATTGTTCCAGTAAGCTG
GAAGAAATTTTGGGTGGTTATCAAATTAGGGAAAATATATTGCTACAAAA
CGTCATTCAACATGCAAGCAGATTATTTGTTTATGGTCACTGACTACAGT
GTGGATAATGCTACAGAGAAAAAGAAAAATTTGTAAGTATATCTTAAAAC
CATTATTTTGATATGGGCTTTAAAACGCTATATTTTCAAAGCCTTAAACT
TCAAACTTTTTAGTTTGAAAGCTATTTTCTCCCTCCTCGGTATATCTAAT
ATATCACATGAAATTGTACTCGACATGGAAGCAAAACTTGTTTTAGACCT
TCTCTGACAGCTAAAGGGTAGCATACTAGGAAGTTCTTGAGTACAAAAGG
CAGGGATCACATTAAGGCCCTCCAAACGAAGAATTTCGCCGTTCCAAGGC
ACAAACAAAATTACAATTCACCGGTCTTAAAATTTGTTTCATCGCCTCAA
GTACATATTCACGCTAATCAATACACTAAGCTTGCTAAGAATTTGCCGTC
CTAGAATTCGCCGGAGCTAATTTTTCATTCGCCAGCCTATCAAAAATAAT
GCAAAACGTGCCGTTTCATTTCAAAACGTACCATTTTATTTTCGTAGCGC
TTTCGTATTGAAACCAAACGAAGAAGACAAGAAAGGAGTGATTTTCGCTT
GTGAGACAGAACAAGAATGTAATGATTGGATGGGAACTATCAACAAAATA
TTGTCCGGTGTCCATCTCAACAATGAAGAAGGTTAGTACCATTGAGTTTA
AAGACCCGAAGAGGCTAGAGATGAATCTTTAACCTTGCTCAAGTAAGTAA
AAAAAGTGAAGCGTTAAGATTTGCGCCACATTAAGAATGATGGTTTACAT
ATAACACTTTCTTTGTTTTCAAGTGGCATATTTTTCGAATTCTGGCGATA
TGTTTTACTTTCAATCTAGCGTTTGTAGGAAAACTACGCGGGTCACGCGC
TAAGAATGGGAAATAAGTGACTTTATTTCCCATCCAGGAGTCTCGTATTT
AGTCCTTCCGTCTTGGAAGTCAATGGTTAGTACGCATGCATGTTCAAACA
AGAAGTTTATCTTTTTGTCATGAACCTAAACCTAAAGTCCATTTGCTTAA
ACTTTTCTTCTTTCACTATTATGTGGAAACCACTCTTAAAAGAATTAGTC
TAATTGAGCTGACATGGTTTCCACATGAAAGATAACATAGTTTACACTTA
GTTACAGCGAATATAGACACAGCGTCAGCTTAAGTTTGAGTAGATTTTTG
TCATCAACTTTTGCCTCTCATGCCAAAAATTAATTGGGCTTATTAGCTTG
ATCATGATTCGCGTGCAGCCCTTCCTTAGTTTTATATATAGTTTAATATC
ACTTCATTGATTTACCAAATACCAATCGACCCCAGAGTTTAAATAATAAT
TCATATCTTGCCCAAGTTTATATGCATCAAACCAATTCAAATCTAACGAT
AATCAACTCTCTTCTTTTTCCATACGCCGCTCCTTATCACCTACCCTTCA
ACCAATCAATAACAATCATTACGTCATTATTACATCATTATTCATTAATA
AAATCAACAACCAATCAGATCATTCGGAAGTGCGAGATTATGAAGACCAC
AAGCGATTGAACGCCATCAAACCAACATTTAAAGAAGAACACCAAAATAA
TGGTGTTCGAAAACATCGACCTATTTCTATCGCTTTCCAATCTCAAGAAG
GTAAGGTTTTGCTAAACTGGAGCCCAGTCCTTTAGTTCGATTTTTTATGA
TTCTGCTTAATTTTATTGCTTTCCAATCTCATTAAAGTAAGGTTTTACCA
AACTCGAACCCAGTTCCCCAGTTCTCTTTCTCATGATTCTGGTAGCGCTC
ACAAAAGGTTACGTTCATCAATCAAATCAAAAAGTGGTACAAGTGTTCTT
GGGTGAGAGATTTAGGTTTAGTATATCCAACAAATTGCCATATCCATTTT
TGAGTTACCACTCGTCACTTTTAATTTCAAAACTTCGAAAATATTCTTTA
ATTTGACTTTCGGATGACAAGACGCTTTTTCGAATTAGAGATTCGAATTA
CGGAAAGCATTTTTGTAAGACCTTACAAGCCTCATCATTTATGTTCGAAT
TACAAAAATCTGAGTTGTAAAGGCTTCGATGAGAGAGTGAACTGACTTGA
AGTGATCCATTTTTGATACGATCTAGAAGAGAGGGAAATAATATGGGCTA
AACACTCGAATTTTCTCCAGTCAACCATTTTTAAAGAACAAATAATCTTA
CACGAATATACTTTTTCTGTAATGACTATCTTGTATGTAGAAACACTATT
CGCATGACTATAGCATTACTTTAGCTAACATAACAAGCACAGTAACATGT
ACATCTTATAACACCAGTAAAACTGTCTTAGCCTTGAAATATATGGTTGA
ACAAATCTTGCACGAATGCTAGGTTTTATTGACACTTAATTTCTATTATG
TTAGTTATGTAAACTTCCCGTACTTGAATCTGTATAATTTAGACCTCTCT
TATTTCTAATCTTTTGAACTTTTGTTGTCTGATCTGTAGGTCCTCGTTTC
AAATAATTGATTGCAAATTTTTGAATAGTTTTACTGATTTGATTTAGAAT
TTCACCAAAGAAATAAAAAACATCACCAAATGGATTACGTGTTTAAAGAT
TTCAACACTTTTCCACCTCTTTTCTTAGATGAAGAAACGACAGGATTACC
TGCAGGATTCGGTACTCGCACATCCTCAATGTCACAACCGCGCGTACGAA
AAATGAGCGCTGGAACGGGTGCACCAAGCTCTGTTCTATCTGGTAAGACT
ACATGCTTTGATTTGAAGTTTTCTAAAGTCGTTAGGGGTGCTTGAGGTTA
TGGATATGACACCCCCTTCTCACAGACCAACTGGGCTTCCTTCCCATCGG
AAAAATTGTCCAAAATATAGTCCCCGGTAGAAAATTGTCCTCCAAGTTTT
GTCCCTACTGAAAATAATCAAATAAAACAATTCTCATTGCAAAATATTAT
GTTATTTTCCCCATCCCCACTGAATTATCTGAGTTGAAAACAAAAGAATT
GAAATCCCCGGCCATAAATAATATGGGAATATCAATCACCATCCAGTTTC
AGTCCGTTATTTTTATCCCACTGCTTGAAAACATTTCACCGGGTCTGTGA
GAAGGGAAAATCTCTTCTTTTTTATCTATATTAGTTAGCTCAAACATATT
ACAAACATTAAAGGTTCTTTTAGAAATGCGATCTGTAAAAGGTTTATCTT
TTAACCTGTTCGTTTATGATCGTTGAAACTCATGCACAAATATTGATGTT
GTTGACAGAGTCTTGTATGACAATAAACTTAACTATTCACTTTCTTATTA
TCCAGTGGGTTCAATGTTTCACAAATTAGAAGAAAAACCGAAGGAAGACC
AAGATGAAGAAGATGATGAAGATGTCGAATTAAAAGATTTATTATACAAA
GAAGTCGAAGTCGAAACTGAAGCGCCCGCAAAAACACCTTCACCCAAACC
CGCTCCCATTCGTGTGGTGGAGCCTGTCGCTAAGCAAGTCATTCAAACAA
AAGAACGCGAAAACGAGAAAACCGCCTCCATTGATGCTGAAACTATCATT
AAAGAAATGGAAGAAAAAACGAAAGAAAATGAGGAGCCGACCCCAGAGCC
GGCACTAGCTGGTGCTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTAAAAAAC
CAGAGCCAGTTGTTCTTCCCGTCTCTGTAGAGCCAGAACCAGTTGAAAAA
CCAGAGCCAGTTGAAGAGTCAAAAGCGCCAGTTGCGGAGCCAGAAGCATC
AAGTGACGAGACAGAAGAAGCAATTGAAGTCGC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000752	XLOC_000752	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000010	supercontig	sc0000010:414932..431214 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.39996	0.0585568	0	0	0	0	0	0	0.398035	0	0.0100061	0.0998954	0	0	0	7.74018e-08	1.19575	0.0634852	0	0	1.79628e-05	0	0	1.47656e-08	0	0	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00001475 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ICEF1 (Interactor protein for cytohesin exchange factors 1 OS=Homo sapiens GN=IPCEF1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 79.337 bits (194), Expect = 8.160e-16
Identity = 42/111 (37.84%), Postives = 60/111 (54.05%), Query Frame = 3

Query:  534 VSCRALGKADHEGWMFKKAGGHGIVPVSWKKFWVVIKLGKIYCYKTSFNMQADYLFMVTDYSVDNATEKKKNFAFVLKPNEEDKKGVIFACETEQECNDWMGTINKILSGV 866
            +SC+ LG AD +GW++KK      +   WKKFWV++K   +Y Y      +AD    + D++V+ A+E KK  AF  K +    K   FA E  QE N W+   NK+ S V
Sbjct:   34 ISCKDLGHADCQGWLYKKKEKGSFLSNKWKKFWVILKGSSLYWYSNQMAEKADGFVNLPDFTVERASECKKKHAF--KISHPQIKTFYFAAENVQEMNVWL---NKLGSAV 139

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001475 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001475 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
ICEF1	8.160e-16	37.84	Interactor protein for cytohesin exchange factors ...	[more]

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TCONS_00001475 (transcript) - C. hemisphaerica