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XLOC_000669 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000669
Unique NameXLOC_000669
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000007:1297246..1308991-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000669 ID=XLOC_000669|Name=XLOC_000669|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007:1297246..1308991- (Clytia hemisphaerica)
CACNTAAACTGTACAAAATTATGGCTGGCTTTTTACGATTCGTTCGCTTT CAAGGATCCTTGTACCGTTGGGGTAGATGATTACAAGACGTTCTTTTATA TGTTACATACCTCTCGAAAAATCAAGAATGCTTTGTTTTGGTCTGGTATG CATGACTTGGTAACTGACTTCACCTTCATAAATGACGATTACATTGTTAT CGGTGATACGCTTACAGGGTAAGATCTTTGTTGAACCTGATCGAGAATTT CTAATATACCTTAGTCCAAAATAACCCAATTGTGCTTTTTTCTCGAGTTC GATTTTAATTTTTCATATAAGAAATTTTTTTTGTGATTGATCTCCAGGTA CCTACTAAACAATCTTAACTGGTGCGGTGGAACGGACGCAGATGGACTAA ATTCAACATCTTGTCCGAAAACGTGTAATGTGATGACACCTGCTTGGACA TTGGCATCTTCAGAGGTACGAGGTATGTTTTTACCATCGTAAACCTTTTC AAAAGTTCCTGATATTATACTATATATTTTTATTTTTTATTAAAAATCTT ACAAACTGATCTCGTGTGAACTTTTTCTTCGTTTCATAGTTTGCTAAACA AGCAACTGGCGTATCGAAAGTTCTCTTAAATGCGACACGTGCTAACAATA AGGACGCGTATGCTGATGGCAGGTTTGTTACACATTTCTGTCAGTTGTGG TTCTCTGTTTTCCAATATTCGTGATTGTCGTAGCATTAGAAAGTCGCTAA GAAAACCTCTTTATCATAGTGAAAAGATGAAGTACCTACCAAGCAATATC CGCTTTTTTGAATTAAGCAGTGCTCTCAAGAGCAGATTTTTCTAAATTTA TAATTTCAATGTTGTGTAGTTTCTGCATAAGAAAAGTGAACGCTACAAAT TGTTGTTGATTTTATTCGATTAGGGCTCAAAAGTTACGCCCAGTAAGCCC GCTACGCCCACGTGAAGCACGTAGTCGAAACGTGATCGTATTCGTTAATT TTATTACAATATACAAATTAGTCCTGATTTATTTCATGCTAAAGGATAAA TATTTAGTATCTTTCAAAAATAATAATTTGATTAGTTGCTTTCACTTTTG ATTCTTGTTTCAGTTTCTTCCGAACTGTTGAAATGCCCGAACTGCAAGTG GATAAACTTGTCGTGNTGTTTCAGTTTCTTCCGAACCGTTGAAATGCCAG AACTGCAAGTGGATAAACTTGTTGTATATTTAGCTTCCAGTATTGGTAAA GAGGTCAGGTACGTAAATTACCATGCTACAATATGAAAATATATAGCGAT TAGAATTATGTTTATAATGTTGATGTCCCTTCATCCTTTATTCTTTGCAT TCTCTTGCCTGCTATTGCATTTTACTNTTGATGTCCCTTCATCCTTTATT CTTTGCATTCTTCTGCCTGCTATTGCATTTTACTCTCAGGTATCTGATAA ATTTGAGTTTGAAAGGATTGGCGAGTTGTATAAAATATAATAATTGACAG AATTGACAAGCGAGGGTAGGGTCGTATCAAGGCACCTTAGATCTCGGAAT TTGATAAGGAAATTGTAATTTTCCAATTCTCTCTAACTACAGGGAAACGT GCAATGACTCAATATCAATGGAAAATATACGGAAAGACGCAGAATCACGA AATATTGCTATTGAATGTTTTGACCAACCAAGGTGACCAATAATAAGAAA TCCTTTTGTTTATGTTTTATCTTTAAAGCTTCAATGATCTAACTGACTGG AGCCTATAATTTATTTTAAATTTAATGAGTTTTTATCTTGTCGAGCATAG ATATCGATTGCTCTCGACAAAAACAAAGAGCTATCTTCGATATTTCAATC GATATTACTTTTACCATTTTCCAATTTTCCTTAATTGCAAGCTTGGTATT 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ATCTGAGGGTGCTTACCCTAACTCTCTCATGGTGAGATCAAAAGGGGAAA AAAGAAGAATTTTTTAACAGTTAAAGCCATCATAAAAAGGCGTCCTTTTT GTTTTCATTTTCTCACTGCGTGATCTCGCACATTGATGGTCGAATATAAT CAATAAGAAAAATCCACAAGAGAGCTCCCTATTCGTTGCACCTGCTATGT ATATTATGAACCAATTTCTTTAATCATCAATTTTGTATGAGAACCAGTCA GAGAAGACTCTTCCTTCCTTANGTTCGATGACATTGAATTGGAACAAGAT TGCTGTCAACCTGTTACTAGTGACTGGGAAAAGTGAAACTGGAACATCGA AATTCAAAGGTGAGTACTTTCGAACTCTATTTTACCAATTTTCGACAAAC GTCTGGCAGCAATATACACCATTGATGGTATTTGTTTTTCATTTCAGATA TCCGTTATCAAATTTGACCGGATAGTGATCGAGACAAAATAAGGCATATT CATATTAGGTGAGTTTAGATAAACACTTAACAAAGGAAATTGGCATTTCT TTAATGTAGCGCGAAATTGTTATTGTTTTTGTTGAATTTTAAAAGTTTTT GCGGTTTATCACTTTCGCAATTTCATGCTATCATTTAAGTACGGAAAACT TTTGCATTGTTCATTTACTATGTAGTTGATATGGGATAAGCTCTTCAAAA AAACTCCAATTCTTATCTTGTTCTAATCAAGGGGAAGATCTGAGGGTGCT TACCCTAACTCTCTCATGGTGAGATCAAAAGGGGAAAAAAGAAGAATTTT TTAACAGTTAAAGCCATCATAAAAAGGCGTCCTTTTTGTTTTCATTTTCT CACTGCGTGATCTCGCACATTGATGGTCGAATATAATCAATAAGAAAAAT CCACAAGAGAGCTCCCTATTCGTTGCACCTGCTATGTATATTATGAACCA 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GGTTGGGGTTCTCTTGCTGTTGTCTGTTTGACTGGTGTACATTATGTAAT GACACCCCGACGTGTGCTTAGTAAGAGGTACCTCACTGCGATTTTACTCT GTTAATAAGATTGTTTGGTACTCTAACGACCTATGATCTCTTTGGAATTT GCACTCTCAAACTGTGCTTTACAATGGAAGGATACTGTGAAATTTAAATT GATGACATTGAATTATTTTCTTCTGGTTCCTGATGTTTTTGTTCATTTCG TCATTTTTCTCAGATCTGTTTTTATTGTCACTTCAAACAATTTTGTCTCT CTAAACATCAGTTTTTAAAAACCTACTCGACACGGTTTTAAAAGCATACA TCAGTCAGTTCACGAGAAAATCACAGAAGGTCAGTCCGGAAATTTTATGC TGAATTATTATCATCTGACTTCCTTTTAATTTTTGTCTATTTCTCTTTAA AGCGAATAGATTACAAGCAGAATCCATAGACAAGCTATTTTGGAAACAGG TATGTTGAGTTTTGTTCTTATAGATAGTACAACATGACATCCCGATATTT TGAAGTTGTCACGGATCACTTCTAATTATATAGGAAAGTTGGTTTCTTTG AAAACTTTTGTCATCAGTCTTTTTCTTACAATCATTATCACTAAGACTTT GTGAAAAGTTAAAAAAATCTTTGGGTTAGTTTGTTGATGTATCAAAAGAC AAGTGTAAAATGGATCAAGTTCCACAAGTGAAATAAGAGATCGATCATTT CTCTTTAAGTAAAGAAAGCTCCACTCATAATCTGTCATTATAATCAAGAA TATACTATTTTTTGCCGTCATCAAATAAGACTTATATCTCGATCAAAAGT ATCAGTTTAAAAAGAACAGATGTCATTCCACACTTTGTTTCTCTAGGCTG ATTATCATAGTAGAAGTCATCATGTGCCGTCATTTGGTTGTCTACATTTT GCTCGTTCTGGCTTCTCTCTACCGAAGCACACACTCAGCTGGTACTACAC CTGGTATTAAAGAAGTCTTTGTTGGAAGATGTTGGCAATATCAAAGCATC TCTGAACATAACAAACTACCTGAATTAAAAGTGAACATAAACTGTACAAA ATTATGGCTGGCTTTTTACGATTCGTTCGCTTTCAAAGATCCTTGTACTG TTGGGGTAGATGATTACAAGACGTTCTTTGATATGTTACATACCTCTCGA AAAATCAAGAATGCTTTGTTTTGGTCTGGTTTGCATGACTTGGTAACTGA CTTCACCTTCATAAATGATGATTACATTGTACTGGAAGATACACTTACAG GGTAAGTTCTCCATGTGTACCATTTGAACATCACTTTCAAAGAAAGATTT ATCCTGTTAAAACTGCCCATTCCCAATTAGCTCGTACAGCATCGCCCATT TTTCTGTTATTTTTTACGTGAAACTTTCAGGTACCTGCTAAACAATCTTA ACTGGTGCGGTGGAACGGACGCAGATGGACTAAATTCAACATCTTGTTCG AAAACGTGCAACGTGATGACACCTGCTTGGACATTGGCATCTTCAGAGGT ACGAGGTATGTTTTTACCATCGTAAACCTTTTCTTTGTAGTCTAAATAGA ATAGTGCTCAGTACGATTGGTACATGAAAAGGAAATTACGTCAAAAAGTT TTCAGCCAGTAAATTGTCTTCGGATTTTTTTAGACTCTGGATGTTCGCTT ACATTGAAAACCGACATATTGTTAATTGGTTTTATTTTTATTAATCCTTT TTTCAGTTCGCTAAACGATCAACTGAAACAGCCAAAGTTCTCTTGAACGC GACACGTGCTAACAACAAAGACGCATATGCTGATGGCAGGTTTGTCCGTT TTTCTTGTTCTTTATCCGCAGAAATATTTGCTTTTGCTTACTACCATCGC AACAGACAGTCTCTGACCTCCTCAATCCTATTAACCCTGATTATCGGTTT CTACGTAGACAGCTCTATATGACGAGGCTTTTTGCCAAAGAGATTAAACT TTCATTATTTTTCACTTTCGATTCTTGTTTCAGTTTCTTCCGAACTGTTG AAATGCCCGAACTGCAAGTGGATAAACTTGTCGTATATTTAGCTTCCAGT ATTGGTAAAGAGGTCAGGTACGTATTCTTAATTTATTGAATTTTGACTTT CTTGGAATATATCCAGGAGTTGGTTGTAAAGGGAAGGGAAGGATTTTTAG AATTCTTTGTTTTGTCTCCATAGCATAGATCTCATTACACTTTAATTATT GGAAAATTAGTTTTTGCTACCCACAAAAGGAAATTGACCTCTCATTAAAA CCCTTCATGAACATTCAAAAAACAAATTATGAAAAGCCTTTATTTCTAAA TTTTGCCATCTGTTGTAAGGTTATATAATGATCAGGCTTAATCAAATGAC CAATCGACGTCAATTTCTGAATGAATTTTCGCGATGCTAAACTGCTTCCT GTTTTGTATATAATGTTAATTCAATTATTGAAAAAAATGAAAAAATCGAT TTTATTAAGATTAAGCCTCTTTTGGCTTACGTTGTAAGGGGGAGGGCTTT GTGTTATTGCGAAATCCTTAATCCCATGTTCGTTTGAGATTCTGTCGCTG AATCCTACAACTTCCTGTCTTCCAGAATAAAAAACAATACAACTTTTGAG GGTAGAACCGTTCATTTTCTCTTCAATACTTGAAGTCACATCTTGCAGTA TATGATGTAATAAAAGTTTGAATTCTTTCTCTCCAGGGAAAGATGTGCGG ATTCGATTTCGATGGAAAATATACGGGCTGATGCGGAAGCTAAGAATATC CAAGTGGAATGTATTGATCAACCAAGGTAAATGTCTGACGAACCTCTTTC TTGAGTGTTGAAAGCAAATACCTTTCCTCAATTTAACACCCTCTCTAACC TTAAGTACTTTGAAAGGTGTTCCTTGGTAATTTCATTCCATTACAAATAT CATCTCTTGCTTTCTTAAAAAACTTTCATTCGAAAAGACTTCTATCTTTA TTCTTTGGCCAGGAAATGTTTAGTAATTAATAAAGAACATTTTCGACATT TTTTCACTTCTTTCCTTCTTCTGACTGCCCATACATCATGTCTTTAATCG CAGATTTCCTTGCCAAGATTTGCAACTTCTCAATCGAAATCTTTAATGTA TTTATAGTTTTCAAAGCGACAAAAGAATTTCTATAGCACATAATAACACC GACTTTATTGATACTGAACTTTGGGAAGTCGGTTTTAACTATCACATTCA CTTTCGATGGTTGTCTTACAAGCTTGTGAAAATCCTACTAAGTTTTTGAA TATCTGTTAAGATCGCTTCCCACTCTGCTTAAAGCTTTCTTCTACTAAAT AATTAAGCATCGCACGTTGTTCAACTACTAAAAAAGCTGATTGGAAAGCA AACTTTAGTAGTAATTCTCCTAACGCCTAAAATTGAAAGGGACATTAACG TTTAAGTCTACCTGGAAATGCTATGAAATGATTTCATGAGAAAATCACTG AGGGCCACATTTAATCGGATTTGCATATCCAAAAATACCCATGCCACTCT CGCATACCTCTCAGATCAACATTTTAAAGCTAACTGCACTCAAATGCCCT TATCCTATCCACTTTCAGCCTGGTACTCAATGTTTATTGTTTGAAGTACC CAAAAGCCAAAGAATGTGTCAACAAGGATAACTTTCGAAGCGATTCAAAC GCCGATAAAGAAGAAGCTAGGTAAGCAGTAAACCTTTTACGGGATTGACT TCTAAGGGCCCTTGCATACATCATCAATTTAGTAATTGAAACCGCTCTCA CTCCCAACTTGGACTACCTGCACATATTTGAAGTGTTTTTAAAGTGCCTG ACTTGGACTGTTATTCATATTACAACAATTAAAAGAGGAATTTCAAGAGT ACTGTTAAACAAGTTTTGTCCTTGTTTAAACGTGTACCTCTTGACAATTC ACGGAATTTAAAAGCAATCATTGATGATATGAAAGAATATATACCTTATT ATGGTCCATTACATGAATCTATCCCATTTTTGATCTCGCTTATCTATATG TCATGCAATTTCATCATCTTATAAACGATTCAACTCAGGACATTGAAATT GGTGACCATCATTTTATCAATCACTCTCTTCGTTACCTTCCTGGGCTGTG TACTGTTGTTAGCCTTCCATCATCGTAAAACTATTCGCAAAAGAGCATTA AATCAGAAACATAATAATAAGACCACAGACAATAACAATTCAAATGAACT TTTATCAAATGAACCAAATGGAAAAACAATGTGGTTATAGTTTCATGTGG TGTTCATGACGCTGAGGTTATGCATGTCCTCCTCACAACCTGTGTCTTAA CCTTCCCTAACCTCCATGCACCTTGTAGTTTACACTCGATTGTTCGAACC TACCCTGCCTGCCCTTTTTAGCATGTTCTGTTTGAAAATGATGTGAGATA GCGTTTCAAAGTCCCGTGCTAACTGGGAGAGGAAGAATCCCCTTCGCTAT TTCTTTAATTTCAATTTTTGAATCAACTCGCACTGGATTTTTTGAAGTTG AAAGATATTGATTTCGAAATCTGAAGCTAATGAAAGACTTTCCTTCCGTT TAATCATGCCCTTTATTTCTCAACCCTTTCTGGGTAAAAACATGGTCTAT GGGGCATGGGTGTCAACGTAATGACGAGTGCATGAATCGGGCTGTGAAGC CCTCAGTTAATTGTTAATGCATTCATTTTCATTCATTGTTATGTATAGGA AGTGGATGATAGTTGGTATTGTGTTTTGCACACTGTTTGTTGTCTTCTCT CTCACTGCACTCATTGCATGGATCCTCAAACATAAACAATCCAAACATCG AACTGCTGTCCAAATGACCAAAAGTGGTGAAGTCATCGCTAACCCTCAAA CCATTAACAACAATGTCTAATTCCCTACCCCTAACTACTTACTCACACTC ATAATATTCATTTTGGTGTAATTTTTATAATGATTTTGTATGGGAGGGTT TGATTTTTTACAAGGTTTTTTTATATTTTGATAATAAAATGGTGTTTGGT GTAAGTCTATCAAATTATATTTTCATCCTTTCGAATTTCGAGTCGTTAGC TAATATCTTCCATTCGTTCACTCAATATCGTGAACATCAGAAATTAGACA AATTTTTGCTTTAAAACATCGAGTTTAATGAAGCCAAAAAGTTGACTCCT GCACTTTTATTGTTGTTCAAAAAATGATGTCATTGTTGAGCTTATCAACA ATCATCAAGCCTGATAGCTTTCAAAAAGAGTCTTTTCCAAATATTGGTAA GGGAGGGAGAGAAAAAACAATCGGGGCTTGGTCAAGGAAGGCATATTGAA TTAATTCCTAATCATTAAACCCTGTGTGCATATTCAAAGTTAATTGAGTA CTTATGATCGACTAACATAAACTTTTTGGGACTAATTTCTCACACAGGTT GTGGAAAACCGTTTGTTTGATTTTGGTAGCCGTGGTGGCTGTTCTAATCG TTTACATCACGATCAGTCTCGTGCACCGTGCAGTGTGTTACAAACCGGGT GATTACAAATATTCACATAGCTGGTCTTTCTCAAAGAAACCCATGCTGCA GGACGATGAGGTAGAAAATAATAACGATATTGAACGTGTGGTGTGAGACC TGCTTTGTCATAAAAAGGAAAACTGCAACAGTATATTAACCTGAAGTTAT GGTTAGTTTTTGGCAGGAGATGACAGGTGGAGGATGGAGGGTTCTACTTC GCGTCACTAAGCCCACCGCTGTATTCACCAGCCGTCAAAAGATATCTAAG AGAACAAGTGCTCTGTATTATATGACGGAACGAACACTTTTACCAAGAGA CATTCAAGTTATGCAATGTTAATTATAATTTGATTCACAATTTTTCTGAC AAAAGAAGAAACTGTGTATAAAGATATTTTAAATATCCGGGATTTCAGTT TATTCAAGCTTCTTTAAAGTATTGTAAAATTAGATGTACGATTTATTAAG GTAGAAATATTAATGAAGATTTATGCTTGAAATATGTTTATTGATA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001260TCONS_00001260Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001259TCONS_00001259Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001258TCONS_00001258Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001257TCONS_00001257Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001256TCONS_00001256Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001255TCONS_00001255Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001254TCONS_00001254Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001253TCONS_00001253Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001252TCONS_00001252Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001251TCONS_00001251Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001258-proteinTCONS_00001258-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007supercontigsc0000007:1297246..1308991 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CD38ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Homo Sapiens
BST1ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 2 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.74 9.34 4.13 3.79 4.25 2.84 5.99 6.87 11.21 10.22 8.07 12.78 24.52 23.47 13.98 12.31 16.4 14.65 26.87 27.2 65.96 71.02 20.23 26.94 24.9 27.66 10.26 12.12 10.62 10.64