XLOC_000645 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000645
Unique NameXLOC_000645
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000007:901125..909553-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000645 ID=XLOC_000645|Name=XLOC_000645|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8429bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007:901125..909553- (Clytia hemisphaerica)
ATTTCAGCTATGTTTGAAAAGTTCAAGAATGGCAAGCATGAAGTGTGTTA TTGGAATAATATTTTCAATATCAAGTGCCATTTTATTTTGTAAAAGTTGT AAAGGATACAATTTTTACGAAAAATTCCTCATCCCAGCACAAAGTTATAC AAAAGAAGGAGGAGTTTTTCGAACGAAATCACCCACCGAATGGTTATTAC GTTGTGGGAAAAGAAAATGTATGAACACCATTATTGAAGATGAACATTGT CAATGTACGACTTCAAACTGTGTAAAAGAAGAATCTGAAGCAAGTGGAAA TCCTTCAAATGTTCAATGTTATCAAAGTAAGACGTTCGTCATTTGCCCTT TAATACAATTACATTAAGTGTGTGTACTTATGGAAAGGTTAAGGAAGTGA TTGTCCTCATCAGGTCACTGTGACGGCTTGTCATTCATGAAAATTGAATA TGGCTGTTAAACGACCCTAGCATAAACTCAGAAGAGAACCTTTTGCGGCT TCACAGGCTTACTTTGTGTAATACAGTTAACTCTCGCTAATTCGAAGTCG AATGAGAGAAGTCAAACTTGTTCGAATAAGAGAAGCATTCGAACTGTATC GAGTATTTTACGAGGGCTTCCTTTTGACGGGGTTCCAGAATTAAATTCGA ATTACAGAAAAATTCGAATAATAGAAGTTCCAGCCAGTAAACTCTTACAT TGTTAAATTAAAGTTTCATTTTTAGCTCCATTTATACCAGCCACATTAAC ACCGATCTGTTACGAAGCGAAGAACAACCAATATGCTTCATTCACAATCC CACTAAAAGGAAAAATCAACTCTATCAAACTCCAACATGCCTCCGGTGGC ATCAATTGTTCCCCAGTTTACAATGGAGGTCAAGGCTTGAGTAATTGGGG TTGTCACCATAGCCATACAAGCTATCGAGAAGACGAAACTTTAACCGCAG 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TGTGCTTGAAGGTTGATTTTGTTACTTGGCATAATGAAGAAATATACAGC CATGAAAACAGGTAGGTGTCTTTATTCTTCGTCTATCCAATAGATTTAGA TCTCAGAGTTAAATATTTAGGGTAAGATTTTTCACAATGCTTTCATCTAA AAAGAGGTGCTAGCTGGGGCAGCGTCTCGAAAATTCTTCGTTTTAAAAGC TATTCATGCATCACGCAAAATTACCCATAAACAAAGCTCTTGGATTTTGT TCTATGGATTTACAGGCTATGTTAATATGCAAACAGATCCTGATTATTCC GCGCATGTCATCTTGGTCATGGCTCTGTAAAGGAACACAGGTTAGCGGAT CGATTTGTTGATTTTCATCCATATTTGGATTTAGTGAAAGTGTTGGTTGG CTGAAGCAACGCAATCAGACCAAAATCATACGCCAATCACAAACATAAAT ACTGTATTAGAGCAAAGCAATTTTTTATGTATTGGCTGGACAACCAAGTC AGATCTTCACATTCAACATATCCTTTTAGAACATAGCGTGGTGTGTGATG ATCTACCATAAGATTAGGGCCCATATATTACAGACCTTTTCAGACCAAAG AAGGTTAATAAAAAATGTAATTCACACCATGAAGTCCTCTAATTTCAAAA TTTGAAAATAAATTAATTTGAGTTTGATGCGAATAGAGTAATGACCAAAT TATTCCATCTTAGGTTTTTCCGTGGGTTTTCCATATAAATTTCTACTTTA ATTAAGTTATCATGTACATCTAATATCTAAATACTCTCATCAAGCCTTCT CTAAGATTTTGACCGATTTTCTCGCCTTTTCTTTTAAATTAAATGCTTAG CACAAATTCTTAAGATTTCAAAATCACAATTTGATAGAAGTTAAATACAC CCCTTCTCACAGACCCACTGTGACCCCTTCCCACTGGGAAAATTAGCCAA 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ATTTCAAAGTTATGTTTTGCCTTTGATCGCTCTCATCGAAAATTCAAGCT GAAAGGAATTTTTGATAATTATTTTTAAACTGTTCTGGGTGTAAACCTGG TCTAGTCACGTAAAAGCTCTAAAATTTCAGAATTTTATTGGCTGAAGTGG TTTTATTTTTTCTAAAAGATCGCGGTAACATGTTCTTCGACAGGATAACG ACGACTGGGTTTTTTATTAAATTAAGTAAAATTTAATAGATGATAAAAAT TTGTTCACGGAAATTATACCATTGTTGTTAAAGAAACATATCAATTAAAG ACCGGTTAAAATACCATACACAATTTTTTTGTTATGGAAGGAAAAAAAAG TTTTAATTTGCCACGTACTTAAAAAAACATCAAGAGTGCATTAACGGGAC AACATTTGAGCGGAATCTCATTAAAACGAAAACTACATTGCGCAACATCC TTACACTCCTACCATTCACAAATTCCATTCTCATGATTCAATATGTCTCA AAAGAATCGCCTTCCTTCACCAGAATCAATGTGATATTCATAAATCAATA AACTTGAACGCTTGAAGGACAGCTTGGGTTGAGTGATTGGGAATGATTGA CCAACAAAAAATTAGGACAATACGCACATGAATTATTATCGAAAACCCAA AAACCTATACTAACAAAAATTAAAGGGGTGGGCAGTAAATGAGGAGTAAG TTGGTGACTGGAAAGAAATTAGCAAATGAATGGACGGCAAAGTAAATGAA TGGTAAATTAGAGAGCGGATGCCATGCGCGTGCCAACATAATTTGATACA ATTCTTTCTTCAACAAAACTCTAAATTTGTAATTGACAATATCTAAGGAA GAGTACTTTTCATGATGAATCAACTATTCTTTAAAAAAAAGGAAAAAAGA TGGTCAATTATTAGATTTCCCTTTTCAATCAAATGCAATACTTTACTTGT TAGAATTGAAATATTTGATGCCCTTCCACGTGACAAGTGAACAGGATATC AAATCCTTCCTACATTCATTGGCTGTATACTACCAGGTATGCCAATCTTA ACTTCACGAAGGGGCTGGGTTCGATTTTAACAATGTCAAATGTCAGTATT GTACTGTTGTGTCACGTCAAAACAATGACTTGTTCCATTCGACGCTCTTT CCGCTCTACAAAACTAAACATACAATCCTTTCTTTATAAAACTTTTTGAA CAAAGATGTTGGGTGTATATTAAGTAATTTCTCCGAACTATTATGTTGTA TATTTTGAGTTCTCAAAGATATTGTTCAATATAACAGTCATTATTAATCC TTTGGTCCAATATATTTTCCCGATTTTTTCAAAGATGATTTAAGGACCGT TAATTTCCGAGGCAAATTATTTAACGTTCATCACAAGATCCCTTGTCATG AAATTAATCATCCGAAAAAGCCATTTTGACATCCGCTAATGGGTAATATC CAATCAAGTGTGGTTGTAACAGAATAAGTTACATTCAAACATTTTATTAA TGTTCAAAGTTTGAGGTTTGCTAAATAACCTCACTTCTGTCAAGTCGCAT TGATTTATGATCGCAAAAATTCATCTTTGAAGTGGTCGTCCTATGGGACA GTCAAATGATAAATTTAGATTGTGAAGATATATTTAGTTGAAGGCGTTTG AGCAGTCGTCTTTATCTTAATTCCGATAGATCATAGTCGAAGAGGCACTT TTATATCGGCTTGCCTTTCAGAACAATCAGAGGAATTTGTATTGTTTGAT TGTTTGATTGACATCTTGTGAAAGCATTAAATGTGATTTCAGAAAGGTTT GTTCGTCATTACTGAATGAACGATTTGATGAACAAACACTCACCACACAT AACAAATTGAATTTGATTATCCAAAAATCATGAAAGGTTCGTTTAGAAAA TGATTTTGATGATTTCAACTTTACTTTGATAAATGGATTTCTATGTGCAT GGCTTTGTTAAATTCTTGCATACTGGAGACCTTTTAATTTCAATGAAATG ATCTCAATTTCAGACGCATTTAGTTGTTGAATAAGCGAGTCCAGCCCAAA TATTAAAATGTAAATGAATGCAGTCATCAGAAATAGACAAACTAATCTAT TAAGTTTGATGTTTTAGTTGTATGGAATGCTTAGTGGGTATACAAAACCT AGTGGTCACTCGTGTCAACACCCAGCATAACATATAAGAAGAGGACTTTG GGGGGGGGGATAGGACTTTAGGGGCTCGATCAGCTTTGATGTTTACGAAT GTTTCTTTTTTTCATTTAGATTTTCTGGTCATCGTTTTGGTATGTGCATT TCTGTTTGGAATTTCAAGTTGTGAAAGCAAATATCTTTCCAATCGTCAAC TCAAACCCAAGAAAACACAATCGGAAACAAGACCCAAAGCGTTTATTACA TTACGACAACGTAATTGCCATGATGTTTGTCGGTTTAAACATAGACTTTG CAATGATATTGCATCGATGAAGAAGATCAGGGAAGAACAGATCATCTGCA CAGCTTCGAAAACTACTTGCTTGCTCAAATGTTCAGCATTGAAATAATTG GACACAGACATTATTCACCATAAAAAGGAAAACCAAACTCAGTATTTTAG TTTTTTTGTATAAAATTTTAAATTATAGTATTGACAGAATCAGCTCTTGT AAATAAAGACACTTTATTCGAATATTTAGAAGTAATACTTTTTAAAAGAT GGACGACCTATATTTTAGGGAAATTTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001191TCONS_00001191Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001190TCONS_00001190Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001189TCONS_00001189Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001188TCONS_00001188Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001191-proteinTCONS_00001191-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007supercontigsc0000007:901125..909553 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.23 0.13 0.07 0.09 0.1 0.08 2.98 2.56 2.26 7.89 15.45 2.74 3.35 3.91 11.51 2.98 1.23 3.17 0.08 0.35 0.98 0.58 0.93 0.78 1.09 0.72 1.07 1.25 0.6 0.32