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XLOC_000613 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000613
Unique NameXLOC_000613
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000007:111454..123440-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000613 ID=XLOC_000613|Name=XLOC_000613|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11987bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007:111454..123440- (Clytia hemisphaerica)
GAGATGATACAATGATTGAGAAGGATCAAGGATGCGATATTGGACCTTTA AATGGTGTTCAAAGCAAACAGTTGACCCACCATTGGTTTCCATTTTGTCC TTTGGTAAGGAATTAACTCCATTTCGCTCGCTACCTGTTCGGAAAGCTTG GAACTTATACTCGGATGTTTAGAGAGTTCGGTTTCTAAGCTACGAGCTGC ATTGTCTATCTGAGAAATGCCTGATAACTGTTTAGCTTTTTGATAATACG TAAAAGATCGTGAAATGAAAGACGTGGGGAGGGAGTCAAAGATTGCTTGA CACTTTATCTCCCATCGGATATTAAATACTTGTTACATTGGCTACTACCT TTGTCAATCTCATTTTCTCACGCCCACCCAGTCTAATGATGAAGTTTTTG ATTTTCGCGTGGGCGTTCCTTTTCCAGCGCGTTCATTATTTAGTTTAGTG CTAATGGGAGTAATTACTTGATTTGTCAACCGATCGACTGAACGACGGAT GAACAATTTGAGATTGGCTTTAGAGGAGTCTCATTCGCGACAAAACAGGA AATCAAGTCTTCATTTTCAAACGACATTCCTTACAAATTGGCGCCTGACG AAGGACGAAGCAAAAGTAGACAACATCTCGTGTTTTGATACAATAACCTT ATGCATATGCTTCTTTTGATGAAAATTAATTAAAATCATTAAGGTTGATG GCTTTTTTGACATTTATTTAATTGCGTGTGTTTGGCAACATAATCACAAG TGAAGTTATTTTTGAATAAGGTTAAGCAGAAATATAAACAAACAAAAGCC GCCATCTTTAAATAAACATTTTCCGCCGCTCCTCAAAATACTGCCAATCA CCTTTCACCAGAACTATAACTATCTATACAAATTAGACAGAACCAGTACT GGAATCATACCAGCTTTAACCTTGGTAAACAATTGCTGAATATTACAAAA 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CTTTCCCCTGCTGTGTTTGGAGGGGGCGTATGTTCCTTCTCTTTGTCTAT CATGGTTATTGATTTATCAAGATATTTATTCATTACTATCGATTGCCGAG GTTACCATTTATAAGTTGAAATATCTGAAGGTAGAGCATGTGTTACTTCT CAACTAACTTCCTTTTTTTTCAATGAAAGTGCCTTGGGTAACGTTTTCCC TAATGCCTCTTTTTTTAAATTGAAATTTTTTTCACAGAAGCTTTAACGAA CTAAACTAGAGTCGGTCTGGATAAGAGAAGGCTTCTGAAAGGTTTAAATA GTCTCCTAAGTTTCTAAAATCCTAGAGCTAGGAAGATCCCCTATGGGCAG ACCCTACCCTTTTTAGCAAGTTTACCGACAATATTCTTTGACCAAAACTT TAACCACACAACATTTCATCATGAAGTAGACCTCGTCAGAAGTTTTCAAA GGTCATGCATTCAGACAAACACTTGATCCACTTATCAGGTGTCTTTGATG TTTAAGTCAATTAATCGCCTTATCTTTCGATAAACTAATCGTTATTAATT TCTTCTGTTTGATAACATCTTTTCCCACACGCGACCTTTTCACTTTCTTC CCTCTTGTTGGATGCCAAATAATTGTGCTACAACCTACTACCTCTTGTAT GTCTAGCTCGTAAAACAATTTTTCGCCTGCTGGTTCTGCTAGAATCTACT TAAAGAAAGCAATGAACGGTTCAAATGATTATTAGAATCGGATCTGACAC TGAGTGACATATTTTACATGCCACTCAATTTTCAATTTTCATTTTTTAAA CTTCCGTTACTAATCATCATCTTGCAACAAACTCTTGCCAAAAAAGGTCT TGATTGATTTCAAAAAACTTTTGCAAATTCTTTAAAATGTTCTCGTTTTT TCCAGCAGAAAATGTTTCTGTAGTGCAAACACTTTGTGAATTATCATGTT AAAAATCATCAACCAAGATTACAGAGATGTTATCTTACCAAACCAATTTA ATATTGATCATTTTCGCCAATTAATTAACGTTTTAATTTCCTGTTTTTAT CTGTTAAATTCATTTGCAAGTCACTTTTCACAATACCTTAAAATCTGCTT CCCTGATAACATCAACCTCGGAATGTCCTAAAGAGATTAATATTTTGGCT TAGATTTGTGCAACCAAGCCTCGATACACGTGTTTCAGGCGTAATTGTAT TAACACAGAGTCAAATGATTTTAATTTTTAATGGCTCAAATTTACGTCAA ATAGGAGTCAAACTTTCAGCTTTCAAAATCAGTTTCGGGCTCCCATTCAT AAAATTACGTTACATTTAGCTCCCAGCAAGAGACTTAATTCCATTGAAAT GTGGTTATAAATTCAAAATCAAAAAATTATCTACTTTTTAAAATCCTTAA TTTTTTCCACTCAGAATTCTACCTACCAAGGCAAACAGTTTAAAATCACT TTAAAAGGGAGTAATTCTTTGTATTTTGCAAGGGAATTTATTCGTTGTAT TTTCGAAGGAAAATCATTTTGAAAGTTTTTTTTTTGCAATGGAGATCATT CTTTGTATTTTGCAAGGGAAATCGTTCTTTGTATTTGTAAGGGAAATTAT TCGTTGTATTTTTAAAGGAAAATTATTCTTTGCATTTTGCAAAGAAAATC ATTTTTGTATTTTGCAAGGGGAATCATTATTTGTATTTTGCAAGGAAAAT CATTATTTTTCCTTTTGCAAGGAAATTTAGTCTTTTGTAAGGGAAATCAT TCTTTATTTTTTGCAAGGAAAAATATATTTTGTTCTTTCAAAGGAGAATA TTTCTTGTATTTTTGAGGGAAGCTCATTCCTATATCCACTGGCGTTGTAT TACACAGCTCATTTCATCAAGATTTCCAAATGAAATCCATGGTTGTCTCG 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TCTTCTTCTTCTTCGTGACAGTCGCGTCATTTCATCGTTAACTGACCCTG TCTTTTAGGGTTCCAGTTGGTCTGTCAATTTTATTCTTGTGGTTTTGAAG ATATAATTTTTTTGGGACTTTAATGTTCGTGGATTCCAAAGTATTTTCAT GCTGTTAGGTCTGTCATTAAATTGACTGGGATTATGTTGATATTCAAGTC GCATTACTGACATCGTAACGTATTTGTGTATTAATGATTCCCCTTTTCTT CATGTTTGTTAGAGATAATATGAAGATATTCCATTTCTGTTGCTCTCCTT TCAAAACATTTTAATGTCTTGAGGAAAACTTGCTTCATTAAGCACTTCCT TTGCTTGAGGCGCTTGACTTTAGTTGCTAACACGACGTGTTGTTTTTGGT TTGACGTTTCCAACGATAAAATATTTAGTGACGTCATACAGGTCAAATAC ATTGAGATTAGCAAAAGTTCTTTTTTTAATAAAACCATCTGGACTCTGTG TCCGATATCCACAACTATTTTATTAAAAAATCCATTAAAAGAATGGAACG GGCAGCCCAGTATAATTCTTTAGGCATTCGTTTTGTTTTCTTAAGGTTTC TTTTTGTTTTCCTCTGGATTAATGTCATTAGAGATGGTTTCCTCTTCTTT ACGTCTCGTCACCACAAACCCAACACTTTACAAGTCTGCTGTTTCAAATT CCAAATCTTTCTTATCCTGAAATCGTCGATAGTAAGAAAAAGTAGGGATT AAGTTCTGCGGTGTAACACTAACTATTCACCAAATTGTCATTGCTCTTGA TGACGCGCTCGCGCATGTCATGTAGAAGATCTTTTCAAGGTCACCTAAAT GAAGTGTGTTTTCTTTTCAAGTCATCATGTTTTCTGACAAAATTTTTCTT TCCCTTTTTTTTTGAAAGTTGTTAAAGGTTTTAAATAAGAAACGTCACTT TGTTGTTGCTCATCACTGGCAAATGTGTGTGTTGATATAAATACATTGGA AGAGTCGGTCACACTCTTATAAAATCTCCGTTACTCAACAAGACATTTTT CGCTGGTCATAAGACTTACTTAAAAAGACGTTTGATAAATTGAGAGAACG ATGTATTTGATTTTTGTACTGATGTTACAATGTTTTTGTTTGACTTCTGG TGGAAAGTTCGTTAAAGAACGAGGTTTGTAAAATTTATGCTATTGTTTTA TAGTGCTTGAAGCACTTGAATCTCATCGAGATTTTGATCATTTTACGTTC GAGAGTCGCAAAAAATGAAGAAAGACATCAAAACGAACGGGAGCATCGTC GTTCCTCTGAATTTTAAAGATCCACCTCTGACAATCCTAACCCGCTATAA TATGGACCAAAATTAAGTAAATGGTTCTTAGGTCAATGAACCCCAATAAA GAGTTGGGTAAACAAATAGGACCATTTTGTGATATGAAAATTTATGAAAC TATGAAAATCTATCACAAATCGCTTGTTGATGTAGTCTTAATTTGTTTAG ATGTTTGTCTCAAACCTTACAACTTTTGAGGGAAAATTATTAAATTTGTT GATCGACGGTACCATCTTAAGTTGTCAATAGAAATTTGAGAATACATGCC TTAGGAAATACGTCGGTTTTTTTTACCGGATGAACTTTGTTCTTTCACTT GCAAATTACAAGTCAAGGCTTAGGGCAGTCTGTTCTCAAAAGTATTTCCG ATATATTGAGCAGTGTGACGTTTTGAAGAGGAGCAACGGATTTCACGTAA TGCGACTGTCTTCTGATAGCGGATGAAAGATGCCCGTTACCACAGGCTTA TTGATGTTGTTGTTGACAGTGTCAAAACCACATGAACTTCCACTGGTCGC ACTATTTTTATGAATATTATGCAAGAAAATGTTTGAGGTTACAACCTATG TTTCTTTTATAAAGTGTTTTATTTATCTCATCCTTAAATTGTGGTTGAGA AGCGCTAAAAACGTCAAAATGTTGACTGCTTGATGTCTTGTTTCATTCTT TTTTTCAGTGCATTCGCGGACAAGACGAGATACGGTAGCAGACGAATACC GGAAATGGCCGGGAGGGATTGTTCCGTATACTTTCGGTTTTACTGCAGGT GAGTGAGCTTCGTGTTGTCTTCACACGAAATCCATGTTCGCAGAAATCGA TTTCATTTGATATTTGAGTACCACTGAGGATTGACTTTTCTAATTTTAGC ATGCCTGGGATATAGTACACTGTAATTGAGTTGCGAAAAATATATTTGTT ATTTGAAACAGGAGAATCGTGTTAGTAAAATATTTGAACCGTATTTGAGC TAATGCCGATAAAGATCATCCTATCCTTATTCTGTTGGTTTCAGGAATTA GAAACAAACGACTAAATTCCGAGTACCTTTTTCTTTGTGAATGATTTCAT TAAGTCCCTTTCTACAGGTTACAAAGAGCAGCAAGTTTTCAAGCAAGCCA TCAAAGAAATCGAGAAAGTTTCTTGTGTTCGTTTCGTAAAGAGGACCACT GAACGAGATTATGTTCGAATCATATCAAGCAGAGAAGGGTAAGAACAAGC TAGCACTAAATCGATGTGCACTTGCAGTCTAATTACCAAGGATTGGGCTA TTCCAGAAATAGTCTGTACCCTATGTCGAAGAGGTGTGACGTCCAGGGTG GTCTGGAAAATCTGGAAAATAAAAAAACCTGGGGAGTCTGGTTTTTGAAC GAAAAAATCCAGGGTGGTCAGTAAAATGAGGTTGGAAATCTAGGGTGGTC AGTGACACGAGGTCGAAAATCCAGGGTGGTCAATTTTTTTTAAATCCTCC TCAACATAGGGGGTACAAATTTCTCCTGGAATAGCTAGGTTACGGCTTAG CGTTATCGGTGCTTCATAATATTTAAGGACTTTCAGTTTTCTAAAACTCT GTCCAAATATAACATTCAGATCTATCGAGTGGTAGCGCCAATTTAGCTTC GATTTCAAGGCTAATGCACTATGTGCAACATAAGCCCTTTATTTATGAAT TTTGTGTTTTTTAACATGACATACCGGTTTTTGTTCTCGAAAACAATCTT TACCTATGATTTGGGTCCAGGTTGAATGATTCGTTTCTATTCAACATCTA TCTTCACTTTTCAGATGCTTCTCAACGATTGGTCGTGATGGAGGGCAACA AGATTTATCCTTAGGAGATGGTTGCCACACCAAAGGCATTGCACTACACG AGACTTTCCACACTTTAGGCTTCTATCATGAGCACGTGAGGAGGGACCGC GATCACCATGTTTTTGTTGATGTCAGCAATGCGATGGAAGGTGTGTCTCT TTATCTTTCTTTTTATTGTTGTTCAACTAAAAGAAGTTGCCTTTTGTTGT AGACTCGATTTTCAACTTTGATATCAATGGGCAACGAGTACGTTTTTCTT CTGATAACGAAAAGATTTGACAGGTGTGAAAACATTAAAAAACTTTATCG TTGCCCTCTTGTTGTAAACGTGATCGCTTGAAATGAAAAACATTAATCCT GTAAACTTTTTAACGAGGTGCGACTCATGTATATTACCTGTCAATCGACG TGCTATCTGCACTTGTTTTCTTTATTGTGTTGATATTTCATAAAATACCG CCCCAAACCGCTAGATCGATATTTTTTCCCCAAAAAATAGCTTNTTTTTC TTCTGATAACGAAAAGATTTAACAGGTGTGAAAACATTAAAAAACTTCAT CGTTGCCCTCTTGTTGTAAACGTGATCGCTTGAAATGAAAAACATTAATC CTGTAAACTTTTTAACGAGGTGCGACTCATGTATATTACCTGTCAATCGA CGTGATATCTGCACTTGTTTTCTTTATTGTGTTGATATTTCATAACATAC GGCCCCAAACCGCTAGATCGATATTTTTTCCCCAAAAAATAGCTTACATC TGTTATAGGAGCGAAAAGACAATTTGAAAAATACAAGCCGGGAGAAGCTC ATACTCTCGGACACCCTTATGATCCGGACAGCATCATGCATTACTCCAAC AGAGCCTTTAGTAAGAATGGACATAAAACCATCACCTACCGGAAAGACCC TTCAAAGAAGTTGGGACAGCGAGTAAAATTGAGCCCTATCGATATCAAAC AACTGAATGAGCTTTACAGGTTTGTAAATCTCCGAAAGATTGAATGAAGG ATTATTGTATTTGAATAATCTAACATCTTCCTTTTTACTACCGGAAACAC GTTTTCTGCTCTTATTTTGGTAAGAAAAATGGCGTAATCATATGCCCATC CAATAATTGAGTTGAATTGCCCATAGAATGTCTTCTCTATCATGTTCTCT TTTTGTGTACAACTTTTTGACAGTGACTTCATTCTACCTTTCTTTCCAGA TGCAAAAACAACACCTCGAATGTGAAGAAGCCGAAAAAGACACGAATCGA GATAGGTAAGAATACGAACAAAATTTTCAACTTGATTCTATCTATTTCTT TCAATGGTCAACGCCCCCTAATCTAGCTCAATCCAATTTTGAACTTAAGC CAAAAAGAAAAGTTGGACCATCTTGCAATAGGTAGAAATTGCTTCTTGCA TGTTTGAAACAGAGATTCCAACCATCAGACCATTCCGTACCCATATTCCG TAATAGATGTGGGCAACTCGCGCTTCACCTAAACCAAATTTTTTTAGTGC AATTATCAGCATGATGAAACATTTAGCTACAATCGTATAGCGCTAAAACC AGCAAAAATTACTAAATAAATAGGCCTATAAATGTGTTTGTGAACTGTTG AAAATTTCATTGAAAACCAAATAGTTTCGTGAAATTTGGGATGATCTACA TCCGAGGAGTCCTGGGTAGAATGAACATGTATTAAAAATGATTATTTTAT AACTTTATTCGAAAGTGTTCCATATTTTCTCGTTTCCATAGATACTTGTC GCGATGACCCATGGGTTGGCTTCCAGTGTTTGTTTTACAGATTTTCTGGT GGCTGTTATTTCTACCGAGAGCGCATGCGTCAAGCTTGTCCGAAAACGTG CGGATTTTGTCGTTCGACGTGTTTTGATACGTCGCAATATTGCAATTACT TCGTGTATCATGGTTACTGTACAAGGAGCGAAAATGTTCGAAAACGATGT CGTAAAAGTTGTAAGATCTGTCGCATTGCGTAATCGTCATAACAATCTCG ATATAATTTTTATTGCGACAAACGAACTTGATTTCCAATCATTGAATATG TCGATACCACTATTGTAAATTTTTCTGTCGATGAAATTTTGATTGACGAT TCCTCTTAAAAACGCGTTTACATTATTGTAAATATGAAGAATTGTTTGAG GTAAATAGCTAATGTGTTGTGTGTATGTAAAATTGAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001095TCONS_00001095Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001094TCONS_00001094Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001094-proteinTCONS_00001094-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007supercontigsc0000007:111454..123440 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.21 2.19 0.73 0.86 12.65 10.68 20.63 22.62 28.15 16.39 22.54 33.06 34.76 37.53 20.16 15.72 18.28 18.49 49.05 79.6 36.87 35.67 25.98 31.94 54.02 48.96 6.7 15.87 34.07 34.16