TCONS_00009492 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00009492
Unique NameTCONS_00009492
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2165

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00009492 ID=TCONS_00009492|Name=TCONS_00009492|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2165bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000095:487321..498152+

Legend: exon
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>TCONS_00009492 ID=TCONS_00009492|Name=TCONS_00009492|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:487321..498152+ (Clytia hemisphaerica)
aagaaataaaTTGGATCAGAAATTGCTTGGTTCTTTGCATCAAGAAGTAT
TATTTGGAGTTTGAATATGGAAATGGTGAGGATTGTTAACTGCTTTATAC
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GTACCTTttagtatgcttataaaagagaGGAAAACTTATTTAGACTATGA
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GTCAAACTGTCTTTCACGTGAATGAATATGATGGAAATTCCCTGGTTTTt
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AGAGTACGCATGCGCGataaaaatgttttacttttcaagaattttgaggC
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AAAAggtttcaaagatttttaaatctCGGGTTTCGAATCTTCATGCTTTC
CCAACTTGTACATAATGTCAAGCCACGGTCAAGCTGAATTCTATCCAACC
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CGTAATATCATTTCTGTCTTACTCAAGATGGCGAAACTTTTTTCATGTAC
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TCGTTTCCAGCTACCATGATAAGTATCTCCAAGTCCTCTCCTTTTCGTGA
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ATTCTACGACtgttcttttatgttttaacgcAACGGAACGAATTTAATTC
TTGGACTTGGAAGTTATTTTGTGTTCTTTTTGAGAGAGATTGTGTtagaa
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GGCCGACGTTCGAAACGAAATCGAACGAAAAGCCTCGGTAGTGCAAGTAG
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AACAGGTCAAATAAAAGACACAACACAAATTCATGTGCAGTCTTATAATA
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TTGAATCTACTAGCAGATCCTTCTACTTACGGAAAAGCGAGTCAACGACA
AGCTTCATCTGCTCCAGCGTCTACGAAAATTTCCGTGGTTACACCAATAG
AAAGCGTTTCAATCAACGATCGATTTCGAAGTGAAATAACGAACCTTGGA
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gaaaatttcgaaaaacgtgAGGGATTTAGGCTACAAAGGAGCAGTACTCT
ACCGTACAGGGTAGGTTATATATTGAATTATCTTTGATCCAAATGTCATT
GGAAGCGTTCAGAATTTAAGGTTCGGCTCCGCTGTAAAACATCGAGAACT
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TTTAAAAGTCATATCTTGACAACAACAGGcttataattttgaaattttgc
tcgGAAAAGTTCTTCTGGGATttgatatgttttttttcttcatttctagA
TTCGAAAAGCACCAAGTTGAACGCAAACAAATATTCTGTATGTGATATCG
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GCAATTGATGATTGACGTTAAATTCAACGCTTGAAGAccaaataaaaact
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TTGTAAAATATGAGAATATTCGGTTTTCTTTTTCTAGTATAGTAAAAtaa
taatacaaaaatatatcaaaatacaaatttaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005304XLOC_005304Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00009492-exon-sc0000095-1491911889:496673..496930TCONS_00009492-exon-sc0000095-1491911889:496673..496930Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000095supercontigsc0000095:487321..498152 +
Expression

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Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.66843e-09	0.802169	0.111948	0	0.000275986	0.141581	0	8.835e-09	2.47536	0	1.01839	0.714964	4.13251	1.42008	1.66893	3.48487	11.2791	6.88096	1.57827	1.42101	5.73826	2.56112	1.73501	4.4994	0.618057	3.04435e-09	4.60159	6.75239	8.67542	16.5508
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00009492 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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