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transcript sequence >TCONS_00009491 ID=TCONS_00009491|Name=TCONS_00009491|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2121bp ATACTTTTATGACATAATTTCAGTGACAAAGGACCCATTGAAGAGATTCG AATATTTGAGGAATGGCAAAGCAACCAGTGTTATGATTCGGGCTACACCG AACGCTGTCAGGTGGGACGAAATCAATCGTATCCAATACCGCTTCCAAGC ACTCAATTTTCACAGTGATgTACTTGATGCTTTGATTCAAAACTCACCAC CACTTTCAAGACGAGAACACAACGTTGCTTCCAACAAACcgaaaaacgaa aacgaaagtgataaaaacaataacaatattCCTTTAAATCGTCGCGATGA CAACAATAATAACCAAAATGGTAGCCTTAGCAGCGACGACGAAGACGATG AAACAGATCTAATTGACGCGACATCAACAAAAAAGAATGTCGAGAAAATC CGTAATACGCGCTCCGGTAAATTGCGTTCAATACGACGATCGAATTCGGC CGACGTTCGAAACGAAATCGAACGAAAAGCCTCGGTAGTGCAAGTAGGAC CGAAAGACGATACAAGTGACTATAATAGCGATGAAGAAGTATTTCAAACT CGCTCAGAAGGAGATATAGACTTTAATACAACAATATGTCATGTTAAAAC AGGTCAAATAAAAGACACAACACAAATTCATGTGCAGTCTTATAATACTA CGACGAATAATATGGACAATGATAATAAACCGTTTACTAAGAAAGACTTG AATCTACTAGCAGATCCTTCTACTTACGGAAAAGCGAGTCAACGACAAGC TTCATCTGCTCCAGCGTCTACGAAAATTTCCGTGGTTACACCAATAGAAA GCGTTTCAATCAACGATCGATTTCGAAGTGAAATAACGAACCTTGGAGAT ACAACAAACGAGGATTTATCAGCTAAATCGAAAGAAGATCTTATCGAATT GGTCAAAAGTTTACAAAGGGAACTGGAAACGAGTAAACAACAACAATGCA ATCACTCTTCACCACAGATGCTTTCTACGAGATCTTCGTGTAGTCGACAA GATTCTATCAGTGAAGAAATCAGCCCCGAGGAGGAAGCGGACGACGGGCG GTCAACGCCCGCTGTTTCAACGTtgattgaaaatttcgaaaaacgtgAGG GATTTAGGCTACAAAGGAGCAGTACTCTACCGTACAGGATTCGAAAAGCA CCAAGTTGAACGCAAACAAATATTCTGTATGTGATATCGAGGAACCGTTG AAAAGACGAAAGGTTAATTACATTACGTTGAGCAAAAGgaatatgctgac gtcagctaTACAGACGATACATGTATGTAACATAACCATGCTCTTTATGG ATCTTGCCATGCATTGTGGCGGTACGCCCATTTATTCAAGCCACCAGCCA AACAGAGATCATCGCCCAATATCACCCTTTATATTCTCACCACGAGTATG CTGTTAAGGCATGAAAGttggggacgagatggagtttttacaagctctta tttgatttggttggtcgttaaccagtaataaaacaattttgttacttttt ctaaagaacgcgtcatttttattacttcaaatgaccaattattaaagtat cttataaaaactccatttcATCTGGAAAGTTGAGCCGTTGCAATTGATGA TTGACGTTAAATTCAACGCTTGAAGAccaaataaaaactttacacagAAA GATCACACGTAAATGAGCTACTAGTTAGCCACTTGatttttttatccatt tttggGAAAGGATTGACATGGTTAGTTTGACAATGGAGACTTCTCAGATC TTTCTCTTTAGTCTCAAAATTTTGACATTCAATTTTATTCGATGTTATGT TCTAATTtgtaaaaaacaacatttttattcaagaaTACCTATAAcctttt aatttgtttttcgaaaaaagCAATTTGTACATTCTACATTAGGTAATGAA ATAATTATTAGCGAGTACTATAAAACTTGTAAAATTTTAGTTGAGTTTTA TATCTTAAAATTCTGATTTGTAAAAtagttaattttcaaaaataatagcA TAATCTTTTAATACCAATTAAAAACCCATTAACGACCTATTGTAAAATAT GAGAATATTCGGTTTTCTTTTTCTAGTATAGTAAAAtaataatacaaaaa tatatcaaaatacaaatttaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000095:483903..498152+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009491 ID=TCONS_00009491|Name=TCONS_00009491|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14250bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:483903..498152+ (Clytia hemisphaerica) ATACTTTTATGACATAATTTCAGTGACAAAGGTAATTCATaacttgtttg
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AAACCCATTAACGACCTATTGTAAAATATGAGAATATTCGGTTTTCTTTT
TCTAGTATAGTAAAAtaataatacaaaaatatatcaaaatacaaatttaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00009491-exon-sc0000095-1491911889:483903..483933 | TCONS_00009491-exon-sc0000095-1491911889:483903..483933 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00009491-exon-sc0000095-1510915933:483903..483933 | TCONS_00009491-exon-sc0000095-1510915933:483903..483933 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000095 | supercontig | sc0000095:483903..498152 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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