TCONS_00070700 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00070700
Unique Name	TCONS_00070700
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3319

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_57:725320..737284-

transcript sequence

>TCONS_00070700 ID=TCONS_00070700|Name=TCONS_00070700|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3319bp
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CCAGAGGCGGTAGTCTATTACAGTGGTCATTTACCTTCACTTCTACGTAT
GAACAGAACTACATCTGAATTTGCTGTCTCTGTCATTTTCGATGGGCTCC
TTCGCGCCGCCATCAATTTTACCGACGTCCATGAGCCAAGTAGACAAGCA
TGCTGTGAGGACAATTTAGTGGAATACCTTATGACAGAAATTATGTCGGA
AATGCACAATATCAAATGGGGAAAGGCTACAGCTcgtgaaatgtttttga
aatcgaTTAGTGATCTCATCTACAATTGTGCTCAATCATATAGTAATTCA
TCCTATCTTTTGGAACGCAACTGTGTTGATATTTTCACTCAAATGAGAGA
TGAAACATTTCATGTAGTAGATGCACGAAAAGTTAACATGACGCTCTTAC
TGACGCTGTCATATTTGATTGATGATAATAATTATGATGTCATCATCCCA
GATGAAGGTTCGGTCATTCGTGTTCTTCAATTCTTGGACAAATCATTGGA
GCATTCTGAACACACTCACCATgatttttatgctgctgaactAGCTGGTT
GTTTGTCTCGATTAGCTGGTCATAACAGTAATAAAGTGCTGATTACTCGG
AATTCGGGTCAAGAAATCCTTcacaaacttttgaaatatgCGTATGATGA
CGAGGAGAGGATTGCTGCTTGCAATGCATTGTGGAACCTGTCATTCTGTC
GGGAAGCCAAAGATATTTTACGTGGAATGTCCAAATTGATCAATATGCTA
AGAGAGCTCTCGGCGTCATCGAACATGCGTTTACACACGGCAGCTGCTGG
TGTCATCTGGGAATGTGAAGATAAATATGATATTAAAGGTACACGAGAAA
TTCGTCCAGCATCCCCAGGTCACGTGATGATTTCATACGAAAGTGACGCG
CAACCGCTCGTCATCAAAATTCGCGACGAGCTTAACAGGAGTGGATTACA
GGTTTGGATGAACACTGAGGGCGAAGGGCGTTCACTTGAAGATGTAATGT
CCAAGGGTGTTGAAAGGGCGTCAATTGTGATTGTGGCTGTTACAAGACAA
TATAAATTGAAACCTGATACTTTTGCAGaaaTCGACTATGCTCACACCCT
ACGAAAAACCATAATTCCAATCATCATTGATGTCGACTTTGTTCCTGATG
GATGGCTTAAAGAACTCGTCTCAAATGAACAAACATTTGATTTCTCACGT
CGTTCAATGTTTGCTGGTAGCTTGGACGCACTTGTAGAGCATGTTAGTTC
CATCTGCACTCCAGGCTCACTAAATGGTGTTACACTGAATATTGAAAACG
GTGAAGCAAAACGAAACGAAGATGTTTTGACATGGtcaaatgctgacgtc
atctcTTGGCTAAAAGAGAACCAACTGATAAGATCGGTCAGTAATGCAGG
AAGATTGAACAAATTAACTGGTCTTCATCTCTTCATGTTTTTCGATCTCA
AACGGGAGAGCCCTGACTATTATTATTCTGTGCTCGACTCGCATTTGGGA
TTCAAAGATGTTTTGGATACACTTGAATTCACATATGCCATGGATAGATT
ACTGGGAAATGAGCGTCTCATCTGATTGGCTGACTTTGTATGAATACTTG
ATTCTGATTGGCTGGTATCTTGGTGAATGCCTCAATGAAATTGGCTAATC
TTGGTCACCAAGACCAATGGTGAGTGTGGTAATTTGATTGGCTGTCCTTA
CTAGCTTCCTCAATCTGATTGGCTGCCGTCAATGTACATGTGAATCTGAT
TGTATGATGTCTGTGGGTCAACCGATTTGATTGGGCGGCATAAATCTTCC
TCAACGCCTAGTTGATATGGACGGTGTATCTGTTTGGCTAATATCAAAGG
ATACACGAATCTGATAGGCTCATGTCCAAAGATTAGCGATTCTTTGAAGA
GAATCATATGTTTTTCAATCTTGGTGGATCATTGGATCATATTGATTTCT
CTGGCAATCCCTCCATTTCCTGTTTGGCTGCTCTAAAGAGCCAATCATTT
AAGGCTATAGAACTtagtaattaaaattttatgtaATGAAATTATCATTA
TACTTATTGGTGTTTAGCATTGAATTAAAACGGTAATTAGTGatatttgt
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ttgaagcaCTCAAATTCAATGCCTAGCCACGCCTAAAATttgtaagaata
aacaatcatacTCGAGGTCAAAGATACAATAGTAAATCATTCTTTGGGGT
TTTTCGTCAAATGTTTAATAAtttacatacacgtttttttctataagaac
atccaaaatattctgagttttaagcctaaagatattcttaacatgttgat
aaatttatgagcatttttgaacctttttcttaagaaaaaaggTGTCTTTG
AGTCCACAGAGcctcaaaatattcttataactTGTTcataacattttggc
catcgaagccttatgtttttatatagtttgttcttataaaaacaacgtGT
AATCTGTTCTTAGGCATGCAAACAAAAGAAGGATACTTGACACAGTTTTA
TACTTTAGAATTGCAATAGATAAATAACATGGATGATTTTTGATTCAATA
ATTTTTTGTATCATAGAAATTTTTGTATGTTTATTTCCTGATATGGAACA
TTATACTTTCAATCCAATCTTGCAGTTCAATATTCCCCCGCAGGAATCCA
TTTTACCCtcctttggaaaggtttttGATGCCTGATATTTCCATTTATGG
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GTGCAAAATACTTTTTAGAGGGGGCTGGACTCGAGTTTATTTAGGGTTGA
ATACAACTTCAAACGTCAGGTTAATTGTTTCATTATTACTGTACACACAG
CTATAACGATTTGACGTCATTCGACCAAGATTAACTCGAACCAAATCTTC
GTGTGGCTTTGGATTTTGGAATTAAGAACAAATTAGGTCACTACTGGGAT
CTAGTTTATCACTAGAAAATTTGTTTATGTTATATTTGCTTGAAAATTAC
AGAACAAAAACAGTTGAGTGCTGCGATTTGAAGAGAATCTTCGAATTTAT
CTCTCTCATTAAAGAACAG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_57:725320..737284-

Legend: exon

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>TCONS_00070700 ID=TCONS_00070700|Name=TCONS_00070700|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11965bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_57:725320..737284- (Clytia hemisphaerica)
TCAAGAAATTGAAAGCAGCTTATCCGCACGTTTTTGTTGAAGAAACTTCA
CCAGAGGTAAGGCTTTACTTTTTTTTTTTTGGTTCCGGGAAAATCATCCT
TCAGCCCTTAACGACGTGGTCGGCCTTTGAGTGGTCTGTTGATGAATTTA
GAAGGAAATAACATTAAAAGTCTTTGCTTTATGAGAATGTCACTGCAATT
GGGTAAATTCGGGTAAACTCGAACCAAATTTGCCCAGTGATCTGATTTGA
AATGGTACGTAACTGAATGCAGCATTTCCATATTTTACGAGCCGAAAATC
CTCTAATATTTGGTTTCAGGTATAACCACTTTTTTGTTACGAAAGCGTTC
AGGGCAACCTGGACTTAAATTGAGAATTAAAAAAAAAAAAGTTTCTACCT
GTATACCTAAAATTTAAAAGATTTAAAACTGTAGAAAACTGTAATACTGT
GAAACGTAGTATACTACTTTTGACCATTCAGATTGCTAATATATTTTTGA
GTCGCCAATATGTTATACAGTGGAATCTCCGTAACTCAAACACGCACGGG
GAATACAAATTATTTCGACTGATTGAAATTTTGTGTTATAGAGTAAGGTT
TATAAGGTATTGTCAACTGAAGGGACGAGCAAACTTGCTCTAGTTAAAAA
GACACTCGAGTTGGAGAGGTTCGAGTTAAGAGAGGCATAAGATTATAAAA
TGTTCGAGTTAAAGACTCTATACGTTTTTTTTTTATAAGAACAAACTATA
TAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACA
TTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAACATGAAATTTCTTAAGAAATTACAT
CAAGATGCTCAAAAAATGCTGAAAATAAGAACATTTTAAGTACATTTTTA
GGCTTCAAATCCAAAAAACTAAGAACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTCTG
ACGTTCTTATAAAAAAAACGTGTACTTTATTATCTCTTCTCCCTTTTTTC
AGGCGGTAGTCTATTACAGTGGTCATTTACCTTCACTTCTACGTATGAAC
AGAACTACATCTGAATTTGCTGTCTCTGTCATTTTCGATGGGCTCCTTCG
CGCCGCCATCAATTTTACCGACGTCCATGAGCCAAGTAGACAAGCATGCT
GTGAGGACAATTTAGTGGAATACCTTATGACAGAAATTATGTCGGAAATG
CACAATATCAAATGGGGAAAGGTAATGTTTTTACTGGAATCTCCCTCGGT
GTCCCTGTAAGCTTTCTTATAAGAAAATTATATTTAATCTAAGAAAAGAT
TGGTCCATAAAGTCAACGTGACCAACATCCAATACCCAAGAGGGTCGAAA
TTTTTTTTTTGCATTTGCTTCAAGCTGATTATAATGGCTTAGTATTGAGA
ATGTTGAGAAGATTTTTAGAAAAAAAAATGACAACTCATGTATTAGGTGA
TGATGATCTTTCTGGGTGTTGGTCACGTTTACTTTATGGACCAATCAAAT
CGTTCGATAGCTCAAAATATTTTTTTATGAATTAAGCCTGTCCCATATTT
GTCCGATTTACCGAAAAAATCGCTCTAAGTTTTTTTGGGCTAAATTTTAG
ATTCTAAGCCTTAAAAGTAACAAATAATTCCAAGAAAATGAACCGTAAGG
GCCGATTTTTCACCCACATTTATACAAATTTGGTTTAATTTTCACTTTTA
GACCCTAATTCTTATCCGCCCTCTCACTCTTAGTCAATACCCCCATATAG
TAACCTGCAATCTCTGGTAATTAACAACTCTGCTTTATATTTTCTTTTTC
CATAGGCTACAGCTCGTGAAATGTTTTTGAAATCGATTAGTGATCTCATC
TACAATTGTGCTCAATCATATAGTAATTCATCCTATCTTTTGGAACGCAA
CTGTGTTGATATTTTCACTCAAATGAGAGATGAAACATTTCATGTAGTAG
ATGCACGAAAAGTTAACATGACGCTCTTACTGACGCTGTCATATTTGATT
GATGATAATAATTATGATGTCATCATCCCAGATGAAGGTATTTTATGTTT
AATTTTCATGCAAAATTCGTTCCCAGTATAAACCTGAGAGTTGGACTGAA
ATTTTTCTTGGTTAATGAAATGACATTGTAAAGTCTGAACCTGTGTCTTG
AAGGCACTAGAGCTGATGTAGAAGTATCCTCACACGGTCAGTTTTTTCTA
ATGAAAAAACCTTTTTCAGGACCTTTTAATTATACACATTATTTTATAAG
CTAAGGCTCAAATTTGCCAATTTTTTCACTATTTCGTAAAGTAAAAGCTT
TTTAAGTAATCTAACCAGGGGCGTATCTAGGATTTTTAGGATACCGTGCA
AAAAAGATTCAGTTATATATAGTGATTCAGCTATATATAGTGTCTAAGGA
GGGCCCACCATGGTTGGGCCCGACGGGCCAGAAAATTTTTGAATTTCGAC
CCTCTAGATTGGCTAAAACAGCCACCTTTTTATGCCCAATGTACCACGAA
CCAGAGATAAAGAATTAAAATTAATTTCATTTAAACATAAAATCAAGCTG
GTAAAACTAAGATAGTTTTTTGGGTTATAGTGTTTTAAGAACCAAAAAAG
AGTGGCATCTAAAATATGGAAAAAATGAAGGAAAGAGAAAGGAGGTGTAA
AACATTGGCAATTCATTATATCAATGACAAAAATCATAACTATCATGAAT
TTTTATAAGAACTTTTTGAACTTTACACAAAAATATGAAAAATGATAGCA
AAATAATACAATAGAACACCAAAGATTATAAATTATACAAAAACCTTTAT
CTGATCGTGATAAAAGCAATAACAATAATAATAATATTTACTGAACTGTC
TAAAATTTTTTGATATAATTTTGATTCTTATTATGTCAAATTTATTTATC
TTATTGCTGCCAAAAGGTGACTTAAATAATTTCAAGCAGATTAATAATAA
TAGCCTTTTGCCATTTCAAATGAAAATTTAGAGAAAAAGAGCAAAACTAT
TTCATTCAGACTGCTCAAGAAAAGAGTATTTCATTAGAAAATTGATTAAT
GTGTTGTTTACAGGGAAAATTTTGAATCCAAAAACTTCCAAGAAACTAAA
TGTTAGGTACACATCATCAATTTGATTGAATTATTCTTCCATTCTGTTGT
TTCCTTTAAGTTTAAATATGGTTTCACTCATNTTTTCTTAGCCAGAGCAG
AGTGATTGGCCAAACAAACAGTAACTACGTACCCCGATTGATCAAATATC
TTATAAATATTTCATGATTGGCCACTCACTCAATCATCACNACACATCAT
CAATTTGATTGAATTATTCTTCCATTCTGTTGTTTCCTTTAAGTTTAAAT
ATGGTTTCACTCATCTTATTAGCAGACTTTCAGTGTTTACAAAGATTTCG
TACCAACCATGTGAAGGTGCAAAATAATCCATTCATCTAGGGGCTACTGT
ATGGTACAGTATGATGGCAACTAACCTGAAAGTATTTGATGAAGAGGGAA
TTAGGATCTTTGCAAGCTACATCTACATTAACAAACACAAAACAACAAAA
TTTAAGTCAAATGACAACTGGACATTCNTTCTTAGCCAGAGCAGAGTGAT
TGGCCAAACAAACAGTAACTACGTACCCCGATTGATCAAATATCTTATAA
ATATTTCATGATTGGCCACTCACTCACTCATCACTCACCACACACAACAA
GTGGTTTTGTTGATTACCAAAAATTATGACAGGTCATAGCCCAGAGGCAG
ATAAGTAGAGAAAAGAGGGGGAAGGGAAGCAGTTTTTCCTGCACTTATCA
GATTATCAGATTATAATTGATAACATGCAGGCAGTAAATAAAAGAAAAAA
ATACCACATACCTTACAGATTTGACTTTCCTTGTTGCAATGGATTTCAGA
AGATAACCATAAGAAGAAAAACAAACATTGATATGNNNNNNNNNNATGAA
AAATAAAAGAAAAAAATACCACATACCTTACAGATTTGACTTTCCTTGTT
GCAATGGATTTCAGAAGATAACCATAAGAAGAAAAACAAACATTGATATG
ACCTTGATGGCAGCCCTCAGATGACGAATTTGGAGAAGATCGAAAATGTG
CAGGCTTCAAAACCCTTCAGAATTTGCGACAAATTAGATAAAATCAGGAC
TGTCTATTCTGTTTTTTCTTCTCCAAGCATCCAAAGCCATTTGACGAGTC
TTGACTTTTAACGTTTTGACACTAACAGCCATCAAATCCCGGGCAAACCC
TGCATTTTGACCTCATCCAGGTCTTTCTGCAAAATTTTGCAGGATGCAAG
CCTGCAAAACGTTTTGTACACAAAATCTAAAATACAGACTCGAATTCACG
CTTCCTGTAACGCGACTTGATAAACAGTTTTCTCATCTTTACCGCGGACT
TTAAGTCAGTAAAATAAATCTAATGACACTAACGAATGATTCGGAAAAAC
AACTCCGGGTAGGCTAAAAACAAGCTGCGACAAAAAAGACTCCGGAGCAT
ACCCTGCGAGTGCATGTTTTGCAGGGGTGTCGCACCGCCCCTGCTAACCA
TAGCCCAGTAAGTATAAAAATGGTATACATTACGGGTGGTCAAAGAGAAT
CTTTCTGAAAATGAGCTAGAATGCTAAGCAACCCCAGGGCTGACCCGAAA
ATAGGAGTTGTTGATCTAAAACAAAAATATGTTTAGTGTTTTACATAAAT
TCTCTCTAAATTTATGCATTTGTGTTTTTCAACGACGGAGATGGTTAATT
TCTGATTTCTCTAGATCTAGATCCTGATTGATTCAATGCGACGGTAAATC
AACACTTTTACCAAGATTTTGTGGGTCAAAACTGTGGATTATTTCAAATC
ACTCTGATGTCTTCAAAAGTTTAGCACATAAACTTTCTATTATTCTCATT
TCAGGTTCGGTCATTCGTGTTCTTCAATTCTTGGACAAATCATTGGAGCA
TTCTGAACACACTCACCATGATTTTTATGCTGCTGAACTAGCTGGTTGTT
TGTCTCGATTAGCTGGTCATAACAGTAATAAAGTGCTGGTAAGTGCTGTG
GGTTATCGAGCTCCATACTGGCTATTGATCTTTTTCTGCTTTAATTACTT
AAATTTGTGCCTCATTCCATCATCTAGGCTCTAGCGTTGTCCAGCATTTC
TTGAAATTTACAATTATATTTTTTGTTGAACAATGAACGAGACCTTAGGT
CACTCAAATTTGATGTAAGAGGAATTTTGTTTGAGATTGCAGCTTCCTAA
AGTAGTTAAAAGTGGGTGATGTTAATTTCTTATCAATTTTTTAGATTACT
CGGAATTCGGGTCAAGAAATCCTTCACAAACTTTTGAAATATGCGTATGA
TGACGAGGAGAGGATTGCTGCTTGCAATGCATTGTGGAACCTGTCATTCT
GTCGGGAAGCCAAAGATATTTTACGTGGAATGTCCAAATTGATCAATATG
CTAAGAGAGCTCTCGGTATAATTTGAATCCTTCTTTCTCATTTTGTCTGG
GAACCAATTTTCAACGTTTCAGATTTCATTCAAATAATTGTTGCTGAAAC
TGCACGCACTGTTAAATTGTGTTCCTAAATTAAACATGGACATCCTATTG
TCAAAGCTCCTGTAGATCTTTACATACCTAGTCTAATTGGTAGATCTCTA
CAAAACCACAGGAGGTATAAAGAGCACGAACCCGTTAGTGGGTACCGGCA
GCCTATTACCTACCGGGAAAAGTCTTCCTAAATATCGTCTTCGGCGACGG
TGCATTTCCTAAAAATGTCATCCATTTTTGAAAATTACACTTAACTTTAA
TCCCCACTCACTGGAAAAGACACAAGTTTTAAGCCACCCAATAAGATAGG
GCTGTAAGTAAAGTATATTTTTTTATATTTTTTAATATTTCATATTTATA
TTTTCCAGGCGTCATCGAACATGCGTTTACACACGGCAGCTGCTGGTGTC
ATCTGGGAATGTGAAGATAAATATGATATTAAAGGTAAAAGAAGGGGATA
TGTGCACCGCCGATTGAATACCCTCTTTATGTCTTAAATCCTCGTCGGAA
AAGCTAAGGTCTGTTAGATACAACATCTCACTCAAACTTGGAAAGATACC
ATAATTTTTAGAATCCCCATTGAATTTCGAGTAGCAAATAATTTGAAATC
TCCACAAAAAGAGATTTTCAATCCTTATTGGTATTTAAGTTTTGAATCTT
ATTACCCACTGGTCAGAGAATTGAAATTTCTGTACTCCAATTTTTGTATT
AGCCCTCCCGCCCCAAACAGTGAAAAAAGTCAAGTTCCAGTTAAGAGTTA
TGTTAATTTTCGATTTTGTTTCTCCTCATCTAACCTTAAGAATAATCTTC
ATTTCGTGTTTCAGGTACACGAGAAATTCGTCCAGCATCCCCAGGTCACG
TGATGATTTCATACGAAAGTGACGCGCAACCGCTCGTCATCAAAATTCGC
GACGAGCTTAACAGGAGTGGATTACAGGTAAGCAGTATAGGCTCAGAAGA
GTCATAAAAATAGAGCTTATCTGTCCCTGGCTGAAGCAAGATAATCCTTT
ATAAGAACATTGACGTGTCGGCAATTTGATCAATGGAAACCATTCTAATC
GCCTCCTTGTTTTCCGCCATGTAGGTTGTTTGTTCTGATTGATTATATTG
CCGGTACTGAACTGTGGTTTGCTCAGTAAAAATGGCTCATTAATATGCTT
CAACAGCCGTCGCTCAAGAAAGACAGAGCTCTATCTAGTGTTTTAGATTT
GTTATATTAGAAGAGTGTTACGATCTCTTTATAGGGCAAGTCGACTCGCT
AAAACTCAGATCCTCGAAATATAGTCCATATATTGTTCAAATCTTTCTTA
TTATTACTTTGTTTTCAAGGTTTGGATGAACACTGAGGGCGAAGGGCGTT
CACTTGAAGATGTAATGTCCAAGGGTGTTGAAAGGGCGTCAATTGTGATT
GTGGCTGTTACAAGACAATATAAATTGAAACCTGATACTTTTGCAGGCAT
GATAGACTTTCTTGCTTCTGAAATCTTTGAAATTAAAAATGTCGAGAGGA
AAATACTATTCGTCTCTCATAAATACCTTAACTTAAAGGTCTGCTTGATC
CTAATTAATCTCAATAAAATCCATTATTGTATTGTTTTGTTCCGGTTGTA
AGGCTCATCTATAAAAGTTATTCCTGTGGATCGAGAATATGGTATATTTA
CCATAAGTGATTTACCCTCGGTCTTGGACATTACCTTTGTTAATCCCTTG
GATAAGCATTAGCCAAACCAGTTCCCTGGATTGTGCAAGTTTAATCCTTA
AGAACCTCACGACAGGAGAATTCATAACAGTGTTCTTGATACGCGTGAGA
CAAGACGACGTCGTCTATTTCAACGGAAGCCGCCAAAAATAGCTGGATTT
CGACCACCGTGTTTCTATTTTTAGTAACAAAGAGGGGTCAAATCCCGGCT
TTTTTCGGGTGTTTCCTTTGGAAGAATGACTTTCTCATATCAAGTATATC
TCATTTCAATATGCTGAGCTTGGGTTAAACGAACGTCCTCTAAACGAGAA
CATTTTTTTTCATTTTATAGAAATCGACTATGCTCACACCCTACGAAAAA
CCATAATTCCAATCATCATTGATGTCGACTTTGTTCCTGATGGATGGCTT
AAAGAACTCGTCTCAAATGAACAAACATTTGATTTCTCACGTCGTTCAAT
GTTTGCTGGTAGCTTGGACGCACTTGTAGAGCATGTTAGTTCCATCTGCA
CTCCAGGCTCACTAAATGGTGTTACACTGAATATTGAAAGTAAGTCTCTT
TGATCCCTGTTTGCTTTTATGATGATATGAGCCCTCCCCACTGGGGAATG
GTTCCTACTCCTTACGAAGTAGGAATTCCTCCTTTTTCAAGTTGGAACGC
ATAGCGCTGTCCAGACACCGCTGGTTCTGTGCACGCGAGACAGAGATACC
ATGATGCGTAGTGGTGAGACTCGAACTACGCGGGAGAGCATATAGCTCGT
CGTAGGCGCAAAACGGGATGAGTGACATCACACACCAGGATGTCTGGCAT
TGTTTGTTTTCAATATATTTATAAAACACCTGTAGAGCAACTTAAGCATT
TTAAGGGAAAGTCTTGAATATGCTGCATCCTTGACTTGACCTTTCCTATT
TTCACTATAAATAGCGGTCAAATAATTAACCATTGCGCACCGAAGCAATC
CTCGAATGTGATCGTTTTGATCTGGTAATTGGAGTACTTAATTCCTATGT
GCTTTTCCCTTAACAATTGACAATTTGAGGCTATATGGGACGAGACAAAA
TTCCTTAAAAATGTTTTATTTTTACATAAATGTTTCCGTTTCAAATTATA
CACATATTTCATATAAGGACAATGTCTTGCTATTGTTATATTATGCTGAT
ATAAGCAAAACATATTTTTCTTTCCCTCTTTCTGACTAATCTTGCTCCAC
ATCCTTGTCAACCCAATATGAAAAAGCTTGTGAACGAGTAAACAAAACCT
TTAAATAAAGATTTCTCTTATAGACGGTGAAGCAAAACGAAACGAAGATG
TTTTGACATGGTCAAATGCTGACGTCATCTCTTGGCTAAAAGAGAACCAA
CTGATAAGGTATTAGTTCTCTTCTTCTTAAGTGATAAGATAAGCCATACA
CGTGTTTTTGATAAGAGCATAAGGCTTTAATGGCCGAAATGTGAAGAACA
AGTTAAGAACATTTTATGGCTTTTCGGCCACTAAAACACCCGTTTTTTAA
AGAAAATGGACAAAAATACTCACAAAATGGTAATATCCCAAGCCTTCAAA
AAGTTTTGAATGTTCTTATAAAAAAATGTTATTTTTTGAAAAAGATTGTG
AGTAAGTTAAGCNAAATTCTATTCTTTGCTGATAAGATGAGCTATATTTC
TTTGTAAAAAAAGATTGTGAGTATGTTAAGGGACGCCAAAAAGGAAAACT
GAATGATTCCAGACTTTATAGCTAGATCAACCATCACTTCAAGTGCCTTT
TAAATAGAATTCCAAAATGAATTTTCCTTCTGTCCACTTTTTCTCGCAGT
TTGAACCACAAGTAATTTTTGGTTTTGAGATGCCAGCCGGAGTATAGTAC
GCAGTGTTGATGAGTACCAGCTCTAAGTGAATATAGTTGGACAGAAATTC
TTTGACGCCTTCGAACTTTGGCACCACAGGCGGATTAGACTACTGGTATC
GAATGACATCAACAGCTTATATTTTTAGCAAAACAATATCGAATTCAACA
ATTCGAAGTAATTTGACCCTAGTCAGAACGCAATCAGTGTTTAACAGTAA
TATTGAGATGTGAGTCCAACGATAGTTTTCGGAATTGGTCCCCCGAAGCA
GGACTATGAATCACATTGTTAAACAGACATTGCGCTTTTTACAGACACGA
GTCTCCGAGCTATGATGGAGAGTATACCTCGCGTGAGGCTGAACTCCATA
AATGTCAGAATGAATGTAAAATAACGCCTGTCCAAATAGGAGTATTTACA
TTGATCTGATTTACATCCATTTTTTTCTACTTCTTCTTTCTCCAGATCGG
TCAGTAATGCAGGAAGATTGAACAAATTAACTGGTCTTCATCTCTTCATG
TTTTTCGATCTCAAACGGGAGGTAAAACTTCTTCTTATTTTTTTAACGGA
AGGACAAACTTTATGCTGATATCTAAAACATGTCCTTGCCCTAAACTGCC
TAAACAAACTAGGACCCCAATGACATGGTGGGAATTCTGTTTAACTGGAA
AGTTTTGCAGAAAAATTCGTCTCCAGTGGGAAAAAAAAACCCTTCGATCT
CAACCTCACTGGGAGATTTTATTTCATCCTAATTTGAAATTCAATTGAAA
AAATTGAATTCCAAAACCATTCCTACTGGAGTTTTGACCTGGGAAAAATA
GAGTTTGTATCCCAATTAGGATTTTGATTGAAATTTTCCTCCCTACTTTT
CGAAGAAGTTCCACCGGGGCTCTGAGAAAGGGGGTTATAACCAAGTGATT
GAGACAGGGGTGGTTGTAAAGGCAAAAACAAAGAATGACAACTTAAATTT
CCCAGCTCCCAGTTAATGAACTTAAAATCATTAATAGCTTCAGCAGTTGA
GTAATCTCAAAGAGGAATTTAAACTAATTGCTTCGTTCATTTTCACTTTT
ATAGAGCCCTGACTATTATTATTCTGTGCTCGACTCGCATTTGGGATTCA
AAGATGTTTTGGATACACTTGAATTCACATATGCCATGGATAGATTACTG
GGAAATGAGCGTCTCATCTGATTGGCTGACTTTGTATGAATACTTGATTC
TGATTGGCTGGTATCTTGGTGAATGCCTCAATGAAATTGGCTAATCTTGG
TCACCAAGACCAATGGTGAGTGTGGTAATTTGATTGGCTGTCCTTACTAG
CTTCCTCAATCTGATTGGCTGCCGTCAATGTACATGTGAATCTGATTGTA
TGATGTCTGTGGGTCAACCGATTTGATTGGGCGGCATAAATCTTCCTCAA
CGCCTAGTTGATATGGACGGTGTATCTGTTTGGCTAATATCAAAGGATAC
ACGAATCTGATAGGCTCATGTCCAAAGATTAGCGATTCTTTGAAGAGAAT
CATATGTTTTTCAATCTTGGTGGATCATTGGATCATATTGATTTCTCTGG
CAATCCCTCCATTTCCTGTTTGGCTGCTCTAAAGAGCCAATCATTTAAGG
CTATAGAACTTAGTAATTAAAATTTTATGTAATGAAATTATCATTATACT
TATTGGTGTTTAGCATTGAATTAAAACGGTAATTAGTGATATTTGTTTAC
AAAATTTTTGTATATAAAACTCGAAATCTTGTTTTAAAAAAATCAGAAAT
TTTATATTTTTTACACACAACATAAATTTGATTAATTCTTTTTATATAAT
TGATTCTCTATCTTACATTTTATTTGTTTGTTTTAAATGTCTTTATTGTA
ATATTATTTTTGTATAATTATTTTAATGGTTGATAATTATTTTTCTTTGA
AGCACTCAAATTCAATGCCTAGCCACGCCTAAAATTTGTAAGAATAAACA
ATCATACTCGAGGTCAAAGATACAATAGTAAATCATTCTTTGGGGTTTTT
CGTCAAATGTTTAATAATTTACATACACGTTTTTTTCTATAAGAACATCC
AAAATATTCTGAGTTTTAAGCCTAAAGATATTCTTAACATGTTGATAAAT
TTATGAGCATTTTTGAACCTTTTTCTTAAGAAAAAAGGTGTCTTTGAGTC
CACAGAGCCTCAAAATATTCTTATAACTTGTTCATAACATTTTGGCCATC
GAAGCCTTATGTTTTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAACAACGTGTAATC
TGTTCTTAGGCATGCAAACAAAAGAAGGATACTTGACACAGTTTTATACT
TTAGAATTGCAATAGATAAATAACATGGATGATTTTTGATTCAATAATTT
TTTGTATCATAGAAATTTTTGTATGTTTATTTCCTGATATGGAACATTAT
ACTTTCAATCCAATCTTGCAGTTCAATATTCCCCCGCAGGAATCCATTTT
ACCCTCCTTTGGAAAGGTTTTTGATGCCTGATATTTCCATTTATGGAGAA
TCTAAAATCTGTATGATTAACACATCAAATTGAAACGGACGATCTCGTGC
AAAATACTTTTTAGAGGGGGCTGGACTCGAGTTTATTTAGGGTTGAATAC
AACTTCAAACGTCAGGTTAATTGTTTCATTATTACTGTACACACAGCTAT
AACGATTTGACGTCATTCGACCAAGATTAACTCGAACCAAATCTTCGTGT
GGCTTTGGATTTTGGAATTAAGAACAAATTAGGTCACTACTGGGATCTAG
TTTATCACTAGAAAATTTGTTTATGTTATATTTGCTTGAAAATTACAGAA
CAAAAACAGTTGAGTGCTGCGATTTGAAGAGAATCTTCGAATTTATCTCT
CTCATTAAAGAACAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043983	XLOC_043983	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_57	supercontig	scaffold_57:725320..737284 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.0963411	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.269127	0	0	0	0	0	1.16979	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00070700 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00070700 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00070700 (transcript) - C. hemisphaerica