Blg02465.41 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg02465.41
Unique NameBlg02465.41
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000329:157482..179885-

Legend: exonCDSpolypeptide
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>Blg02465.41 ID=Blg02465.41|Name=Blg02465.41|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=22404bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000329:157482..179885- (Branchiostoma lanceolatum)
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CATTTTTATTAATCAGTAGCTTGACTCTTGAATATGTGTTTTTTTATAGT CAATATTCATGAAAATGATGGTATGTGGCATATTTACTTTATATGTAATT TCTTACTGATTTTTTTGTGGAAATGTCCAATGTAAAATGCAGTGACAGGA CCATTTGAATCACAAATCTAGCTAGTTTCTTTACTGTTTGTTGGCATCCA ACCGGAGAAGTTGCATACTACAGTACAGTATAGGGCAGCACATGGGTCTG TGCTCTGGTTAAGGATCAACACCAGAATGAGTTATGCCATATTGTTTCGT TATTTGTTGTCTCATTCTAATGAGAGCCACTGTTAACCATTGTTATGTTA AGCAAAACTCTACACCTTTATACTGGTGCATAATATACGTAATCTAACAT ATTTAGGTTAAGTATAACCAGCATACATATATAGTTTATGCTAAAGGTCA GAGGTCAAACTAAAAGGACAATGAATTCGGAGGTACTGTGTGTCAGAGCA ACGTCAAACAACATATTAGTTAACAGTTCTGTACCATTCCATTGCCTTGT AAAGAGTATTTTATTAGGTATGTGTGAGAGTGATTTATAGTTTAGTAATT ATTTAACAGTAGCAGGATGGTAGTACAATGTATACTCCTTATAGTTATAC TCCTTATATCATGAGAGGCCCCAAAGTTTGAAAGTATTATGTATGTCTTT GTTGTTGTTATTGTTATTGTATGTAAAAAAATGACATATCAGGACCCAAT ATTGTACATGTACTTTAGGTTTCCTGTATCCCATGTCTTGGCTTCATACC TTTACCAGCCATATTTGTCCATTCAAAGGAAGTTCATCATCATGATCAGT TTGGTTAGGTTTGGGGAGGGGAGGGGGGCATGAGTGCCTGAAACACCCAC TACCTTGCACAAGATTCCCTCAGGCCTCTCTCTTCTTGCCCTTCCCCTTA 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AAGAATATTAGTTCACCTACCAAACAACCTACTTCAGATTAATTTTTTTA AAGCTGTAAACCAACCAATCCCCTTGATGTTGATCAACTTTATACCAATA AACCAATCCCATAGCCCTGTCAATAACAAAGAAATACGAAACCAAAGTGT AAAAATGCAAACATTTGATGGACATGCTGCCACTCTCTCATTGGTTTAAC TGTTTTTGATTGACAGCAAGTCTTACCCCACTTTACAAACATTTTTTTGC CACTCATGGCTTATTTTCATGGAACAGCTTTAAGTACAGTTTTTTTTGTG CCAACACAGGAAGAAGTAGACCATTGAAGGAACAACATACTTGTGCATTG ATGTTAATGTTTTCTCCAAGACTGTTTCATACTATGAAACCAAAATGTAA ATAGAAGCATGTTGCCATGGCAACTATACTGAGATGCCATTCCATAGGGT GATTGCACGTGACGTCACAGCCACCATGCGGGCTGGTGAAACTAGAAGAG TCAGACGTATAAGTTAGCAGGTGATTACGTCATAATTACTGTGATTACAT TACAAGTTTACCTGACAACTTCCAACCAGCATGGTGGACATTGATTATGT CACAGTCACCCTATACCCTTGTACAGTATCAGAGGAGGTTGACTGTTATG GCCCAGGAGGTGGGTTCAAAAATTAAAGTTAGGAATGATTAAATATCTAG TATGGACAGATAAATGACCACTTAATAAATATCACTGCTGATTCAAAAGC AAGTTTTGTGCACTGACCTACCAAGATGAAACTTTTAAAGCAAGGTTTGA AGATTTTTCTTCACCCACCTTATGGATTACCTTTGCAGTCTTCCCCTATT GTATACAAATGTATGTTGTACTTGTAGGCTTGTCTATAGCTAGACTAGGA ACGGTCACAAAGGTCAAGGTTTGAGTCTGTGTTGTAAACTGCATTGCTAA ATACAGACATAAAGAATGTTCACAGTTTTAGAAGCTTCAAATGTTTTAAG AAATGGGTGGGGGGCTTTAAGAGAAAAAAATGCAGAAAAGTGAATTTGTG ATCTGAATTTTGACAGTGTTAGAGACAAACTTGGTAAAAGGTGCTCAGAC CTAGAAAAATGATGATCAGTGTAAAACAAAATCATGTTCAAAGAAATTTC TGAACATCTGGAAGAGACCTTTCGGATTCAACCATTATTTTATGGATGGG TGTTATTTTATTAACCGTCTCAGAGTCTTCCTTCCAATCACTAGTAGTAA AGTCAAAGCAGCAAAATCTGACAAATAAAAACGGGATGTCTACACTTCAG TAACATTGCAAGAAGGATGAAGACCTTGACCTACCAGTGGGGTTCACTAT ACAAGTAGTTTTGTACGGCTGGACTTTGTATATGTGAATATGTATTTTGT GGTTGAATGACCAGTATTTTGACTATTTGGCCATACTGGCCATTTTTTGC TTCACGAAAAAGCATCAAATAAAAAGCATGATTCCAACGTTCTGTTTTAC AAGT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000329:157482..179885-

>Blg02465.41 ID=Blg02465.41|Name=Blg02465.41|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=912bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000329:157482..179885- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAGCTGACCCATTCTTCTCCTCTCCCTTCTCCCCCTTCTACAGACG
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TTGTGGTGGGACGCTTTCGCAACAGAATTCTTTGAGGATGATGCAACGTT
AACATTGTCCTTCTGTTTGGAGGATGGACCAAAGAGATACACGATCGGTA
GGACGCTGATCCCGCGGTACTTCAGAACGATATTCGAGGGGGGCGTGACG
GACCTGTACTTCACCTTGAAGCACCCAAAAGAGTCTTTCCACAACACCTT
CATCACCTTGGACTGTGAGAACACCACCATGACCACTCACCATGGCAAAC
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TTTTTAATGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:173236..173250Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:173236..173250Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:172175..172277Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:172175..172277Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:167123..167245Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:167123..167245Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:166658..166735Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:166658..166735Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:165248..165560Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:165248..165560Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:159316..165218Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:159316..165218Branchiostoma lanceolatumexon
Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:157482..159079Blg02465.41-exon-Sc0000329-1570713199:157482..159079Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg02465.41Blg02465.41-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
GeneIDBlg02465