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transcript sequence >TCONS_00004780 ID=TCONS_00004780|Name=TCONS_00004780|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2398bp GAGAAATCAAGGCTGACAATTTGCGCACTTGAAATTCGTTCTTAGACGAA TTCACTGATTGTGTAAAAACAGATTACACTTTTTTATGCAGAGCCATAAA TCTTAATTTAACGAAATttatgttaaaaatttcaaaaaatataaatcgcT GATACTATATCTTATCGTTTGCTGTACTCAGAGCAAGGCCTTGTTTGTTA AAAGGAAGATGTCACTGGGTTCCAATGAAGCTAAGGAGGCAGTTGCAACA CTTCGTGATCGTTTGAAACATGGGCAAAACATGACCAAGATATTGGAATC ACAACTGGATACAGCGCAACAGAATATAAGTTTATTGCAAGGGCAAGTGC GTTTAGCCAACGAAACCATTTTGAACTTGAAGAAATATTTCACCGAAACG GAGAACACTTTGAATGATTTGTTTACATCGAATCATTCCTCAAGAAGTTT TCAATACAATGATGGTGCTACAAAGGAGCAATCAGATATggataaaaatc aacaaatgtCGAAAGTTGCTCGAGGTTCTACTAGATCACCAAGAACACCA GAGTCGATGGATACTAAGACACACCATGACGACAAACGCAGGGAGCGTGA GCACAACAACAAATCACCATACGCACAACAATTACGTCAAGTTCTGGATG CTCTACAAGACGAAGAGCCGAAGAAATCTTCACACACTCATCATCGTTTA CACGAGAAAACAGAACCTTCAGAACACAGTCCATCACCTCCGCCTGCAGA CCGTCGTTTGATGCAGGCTACAAAACATTATCACCATGAGAATGAAGGTG GTGCCTTTCAAAGACGACAACCTCATCCAGAAGAGGACTATCCAAAGATG AAACACCATAAAATGAACGGTCATCCTTCAAGAGAATCAACCAATGGGAA CCATCATGACCCAATCTCCCCTAAACCATCCTATTATCAACAACACCATT CTAATGAGTTGTCACACGGTCATCATCAGCCACATCCTCATAGCAACCAT TGCATGGGACCATGTTGTCCCAGCGAAACGCCACCATCAAGCTACAAAAT GATGGAGAAATCATATCATTATGGTTCAGATGAAAAACCGACACACTATG TGGAGAAATCACCAAATGGAGGTGTTCACTATattgctgtacattcacca gagaGCACTACCAGCTCTGGCAAACATGGCGAAAGACATCATAGTCATCA TTATGTTCCTTATGCTTACCACATCCCTGGTGAGAATCCACATAAAATGA TACACGAAATGCCACCGCAACCACTTTCACCGACAACCAACAGTGGTGGT GGGCGCCGAAAGAGGGCGTACGCCCCATTGTTACCAAATGAAGAACCACC ACATTTGAAATACACCAAAGTGAAGCGAATCGATGGTAGCAAGTTGACAG CACAAAAAGTCCTCCAAGATTTCACAAAGAGGCGATTCATTGCTTATAAT CCACGATACGATTTGGACTTATTAATTGTTCCTCCGCCCATCCCTGCATC AGACCTCCTCAAGGGCGGTCATCAATTCAAAGGAACTGAACAAAAAATGA CCAACATTCGATCTCCAGTAGCCTCACcacaagaaaacaaaattcaaagc GAACGTCGATCAACAATTTACGGAAAACCATCCAATGAGAGTCACTCCGA TAAAGAGGACGAGGAAGTTTTTACGGAACCGAGAAGTCCTCTTGATGACG CAAACAATAATAATCACCATGACGataacaacaacaataacaaaactGTA AATAATAATTCATGGCCGCACAAGCCACAAATATATTCAGGGAAAGGTGT CTCTGTGTTACCAAGCATCAAAGAGGAGCCGAGGAGCAATAAATTGGAAG ATCAGATTAATAAGTTGAGACATGATCAAGAAGCGAATACGATTCCAGCC GTCTACCGACAACAAGACAGTCCTTACAGTGATACCAACAATAATAACGA AAACAGTCCCATGGTGGTCAGAGAGAATGCAGCTTCGCCGATTCCTATTG TTAGACGTACCGAACAGTATTGCAGTTAGAAATGCGtttccattttttcc atttctaaaaactaaaaattttgaatttgtagTGAGTTTAGCGCGTCTTT ATGTTAAATTTTGTAATCCTTAGGCTCGAAGTGGAGGTGTATTTACTTTA CAGAGCAGAAGATAGATTAATCTTTGTATCAATGGTGATTTTTTTGTCAC GTTGTCTTGTTGCATTTGGAGATTGGATTATAAAGCCAGTTGCTTTTGTT ATTGTATATCCTCATTAAAAAAcgtaaatttttgaaactttgttgatatt tttcctCTTCTTTTTGTATAGTTTACTAGATAGatataattttgaaagtt tttggatGATTAGACaactttgaaaatattgataaataaataattcat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000048:126098..143641- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004780 ID=TCONS_00004780|Name=TCONS_00004780|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17544bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:126098..143641- (Clytia hemisphaerica) GAGAAATCAAGGCTGACAATTTGCGCACTTGAAATTCGTTCTTAGACGAA
TTCACTGATTGTGTAAAAACAGATTACACTTTTTTATGCAGAGCCATAAA
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TGCTCATTTGCTGTCGTCAGAAAGATTCGTCACTTATTGGTAACTTTGGT
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ATTGTAATGTCGCGTGATCACGGTACACTTTTCAACTAAAGGCTATCTAG
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GATCTGAAAGCTACTGTACACATACGGACGAAAATTTGGGTTCCCAAATT
GGACCATTGTCCACTTAAAGGAAAAAATATGCATCTTTTGGAACCAAATG
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CTTGTCCCTGAAACTTGTCAATATTTGATTAACTTTTAAGCTTAATTACC
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CCTCATGTTTACATAGGGAATTAAATGTATTTAATCAATAAGGCTAGGTT
TTAACTAGGACTAAATTTATTTTACCATATTGAATTGAACTGATTTTAAA
GTTAAATTCGAGTTTTAAGGATAAAAATCCTTTTTATGCAGAAGGTGTGA
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AGCAAGCCCTTACGTGAATTAGAGGAATCAATTTTTCAAGGTTCAAGCAA
TCCATGTATTTTCTTTGTTTTATAAAAATAGGATTGTTTTTACAACTAGT
AATAAAACAAAAGAAATGACTTTGATAATTTTATAAATATAAAAAAGAGG
TTCACATTTTTTGAAATGCAGAGATTTTCATTTCGACACTTCAAGGCATA
CGATTAGCATCAGAAAAGAAATTTTTTGAATTTTTAACTTTATGGTTGAA
ATTTATTTTGACTATACAATTAAAGCTTCGGTTAATTAGTTAGTCATTAG
GATTTTATGATATTTTTTGAGTGTTATTTGAAATTAAACATTTCAAAGAA
ATCATGAAAACAACAAAGAAATCAAGATCAGGGTAATTATCGAGAATTTA
TAATTTTTATTGTTTTTCATTAATTACGATTGAAGGCCCTGTAAAGTAAA
GTGTTCTTCTAAATGATGAATTTCAGTTTTCATTTTCAAGAATTTCAGCT
TTGATAGGAGGTTGGTACAGTATCAAATTTTTATAAAATTTTAAAATTAC
AAATCAACAGAGCGCAGTAGAGATTGTTTTTAAAACATTTTAAATTAATG
AAAATTGAGACTTCAATAGCGAGACGACACAGTCAAAAAAATTTTCTCCG
TTTTTTTTTTAGATGTGTTGTGTCCGTTCTTGATTACTTGTATGCCATTG
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TGCTTTTTTTGTTGATATAGCTATTTGAACTTTTTTAATAAATTGCGGAT
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CTAATAAATGCTTTACGGTAGATGTACAGGAGTATTTTTAGGTCTTAAAC
TCAAACGTTTGAGAACATCCACAGGTTTAACATACCTACTTCTCACAGTC
ACATTGGAAACCCTTCCCATTGGGAAAATTGGCCAATATATCGTCCCCAG
TGGAATTATACACTAATTCTTGTCCGCGCTGAAAATAATCCGATAAGCAA
ATCCTCACTGCAACGTATATTGTGCTAATTTTTCAATTCCCACTGAATTT
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AACTAAAGGAGATGTACTGTGTCAGTTTACATTTCTCGTGATTGACTTCA
AATTGAATTTCAGCCTGTTGTTTCAAGTGTTTAAAAAGTCACCCCAAGGT
CATCAGCTATTTAATTTTGAACGTATTGAAATAAAACTCTTCCGTGAAGA
AACAAGTACTATCTCTTAATTTCTGTGCCCGATGGAGGAGCTTACACGTT
TTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAA
AATTTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAGCATGCATTTTCTT
AAAAAATTACATCAAAATGCTCAAAAAATGCTGAAAATAAGAACATTTTA
AGAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAAGAACATCCGAAGGCTT
CGAAAATTTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAAAACGTGTATAAGGACATGG
AAAATTCTTTTAACCTGTTGGATGATCCTTAACAAAATATTCCTATTTTA
ACCAACTTGTGAGAATTTCTCTCTCATTTCCTACGAAATTGCATGCTCGA
GAGTTCGCAAAGCATTGTATTCTCCTAGAATACACCCTGTGTCACAGACC
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TGGGAAAATACCCTACAATTTCAGCACCACTCGAAAATTGACTTAGTTTT
CAAAAATTGCAGTCCAAAACCTTTCGATTTTTTGACCTGAAAACAATAGA
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AAGAAGTTCCTTCGGGGCTGCAGGGCAAGGTTAAACACTCTTGGGTTTTA
AAACTATTGCCTTGAAGCCTATTACACTTATATATACTTTGTTCTTTATG
AAACGAATGCTAAACAAATGATAATCAAAAGCAATAGCCTGAACAATGAA
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CTTTAAATTTCAGCTGTCAAACCGTTTCAGCTGGAATGTTATCTGATTCT
CCCAACAAGTTTTGACATGTATGAAGTAGATTTTCTTTAAATAGAAACTG
AGTTACATCACCTTCAATAAATGACATTGTATATCTCCTTAATTTTTACC
CTTCCTTCATTAAGCCACTAGTTGAAGTGTCCTCAAGTGTTTTTTGTCTC
ACAGCATTGCAAGCATACTTAAATGTCTCGTTTTTCTGTACCAATTGCCA
AATGAGAGGTCAAGTTTCACGTGTTCAAGTTTTCATACCCCTCCTCTTAC
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AATGGGCGGCTTTTGTTGCGTGGATTTTTAGTTCGTTTTCTCTTCTCCAT
ATACCTCAAAACACTCGTTGTAGCTTTGAAACAGGCCGTACATGAACCAG
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TAAACATAAAATTACAGCTTATCAAAACTTCAATTTTCTCACCGCACATA
TTCTGAGTTTATCCAAACCTTACATCGATATTTATCTAAAATACCAGCTG
ATCTTACAAAGGTTGTAAAGGCTTCAATTTAATAAGGCTCTCTAAACTGC
AAAATTTAATGAAGCCTCTAAAAGTGCCATTATAAGAATTGACAAACGAA
CAAAATAACTAAATTGAAGCTATTTTTTGTCCTTTCATAGGAAGATGTCA
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AGGCTACAAAACATTATCACCATGAGAATGAAGGTGGTGCCTTTCAAAGA
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GAACGGTCATCCTTCAAGAGAATCAACCAATGGGAACCATCATGACCCAA
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TTGTCCCAGCGAAACGCCACCATCAAGCTACAAAATGATGGAGAAATCAT
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AATGGAGGTGTTCACTATATTGCTGTACATTCACCAGAGAGCACTACCAG
CTCTGGCAAACATGGCGAAAGACATCATAGTCATCATTATGTTCCTTATG
CTTACCACATCCCTGGTGAGAATCCACATAAAATGATACACGAAATGCCA
CCGCAACCACTTTCACCGACAACCAACAGTGGTGGTGGGCGCCGAAAGAG
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CCAAAGTGAAGCGAATCGATGGTAGCAAGTTGACAGCACAAAAAGTCCTC
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GAATTGTTATTTCTATCCTTTCTATCCTTACTTGAAATTAAGGGACAATC
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GCTTTTTGTTTCAGATTTCACAAAGAGGCGATTCATTGCTTATAATCCAC
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CTCCTCAAGGGCGGTCATCAATTCAAAGGAACTGAACAAAAAATGACCAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00004780-exon-sc0000048-1575043694:143438..143641 | TCONS_00004780-exon-sc0000048-1575043694:143438..143641 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00004780-exon-sc0000048-1510915933:143438..143641 | TCONS_00004780-exon-sc0000048-1510915933:143438..143641 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004780-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | TCONS_00004780-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000048 | supercontig | sc0000048:126098..143641 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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