TCONS_00048023 (transcript) - C. hemisphaerica

transcript sequence

>TCONS_00048023 ID=TCONS_00048023|Name=TCONS_00048023|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3326bp
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acaataatGACAAAAGACAATTAAAAGTTGACAATTAAATCGAAGAGAAC
ATTGACGACAAGACAAGAGCTGCTCAATTACAAAAGGAAGGAACTCCGTG
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ATTTTAGCCTCTCTCCGCTTAGCGTTCTAGAAGCTAAAAAAATGGTAGCC
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CTTCAAGCCTCTTCCTTGCTAAAAAGAAGATTAACTTAGAAAATAATTCT
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AGACTGCTATTACGAAAAAGATGGTAAAAGAGAAAGTCACTGTTGTACCC
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GAGGTTTCGATGGGAGAACATAACAACTGTTGGCATCATCCCTGGCCCAA
ACGAACCTTCACTCAATGTCAACAGTTATGTCAAACCTCTTGTCGACGAT
TTGCTGACGCTTTGGCAAGGAGATATGTTTGAGGAGAAAGAATCTAGAGC
TATGTACAAGTTCGCTCTTTGTTGTGTATCTTCTGACCTTCCAGCTACAA
GAAAATTATGTGGTTTTGTTTCATACAATGCAAAACAAGGTTGTAGTAAA
TGTTTTAAACAATTCGAACACGATGGTCCTGTGGGAACTACTAAAACTGA
CTATTCTGGCTTCGACGAAGAGAACTGGACTGAGAGGGACCCTAAAGAAC
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AAAGAAACAGAACGTGATTATGGTGTTAGATTTTCTGAATTGTGTCGTCT
ACCGTATTACGATCCGGTTCGTTGTCACCTCATCGATCCAATGCATTGTC
TCCTCCTAGGTGTAGCCAAGAACACGTTGAAAATCTGGATAAAAACCGAC
GTTCTGACGAAGGAGAAGCTGGAAGCTGCAGACGCTCAGATGAAGCTCAT
CAAACTTCCACCTGGTTATGGTGTTCTTCCAAGTGCTGTGTCAGCGGCCT
TTCGAAAAATGAAATCCGATGAGTACAAAACATGGGTGTTGTACGTGtca
ttgtttgttttgaaagatcttcttcCTAAAGCTCATTACAATATGTGGCA
AGATTTTGTACGTGCTTGCCAGCTATTGATCAAGCCCTACATTATCGTCG
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GAAAAAGTCATCGGTCCTGATAAATGCGTCCCAAACATGCACATGATGAT
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AAGAGTTGAAGCTGATCTCCAACGTTGACGAAAATTTGAAGCATCTGGTA
GCACTTTGCAGCTCTAGAGTCGGCATAGTCGATATTTCCTCATTGCTGTT
ATCAAACCATTCTACTTTTCTCTCTGGAGCGAAATTCCGTCGTATCCGTA
AAGATGACGCCGAGTGCATCGCAGAATATCTTAAAGCTGTGTTTTCTACT
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atcaattcatttttatttcgtatcaaaatcaaaatcacccTGGATTTGTT
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ATGGAGAAGACTGTCCTATGAAAATTTGGAACACCACCATTATGACAGAA
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ATAGATAGATATAGGCTAAGAATTTAAGCCAAATTTTGATAGTTTAAACt
gacgaaattttttttttcgtactTTGAGCAGCTTGGAGGCctactttttt
cataaaaagccTGCAATTCATAGAGA

protein sequence of TCONS_00048023-protein

>TCONS_00048023-protein ID=TCONS_00048023-protein|Name=TCONS_00048023-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=935bp
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transcript from alignment at scaffold_14:805017..812772+

>TCONS_00048023 ID=TCONS_00048023|Name=TCONS_00048023|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7756bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_14:805017..812772+ (Clytia hemisphaerica)
CAGGCAGATGGAAATTCCGTTGATGATGGCATGTTGTATTcaataatata
acaataatGACAAAAGACAATTAAAAGTTGACAATTAAATCGAAGAGAAC
ATTGACGACAAGACAAGAGCTGCTCAATTACAAAAGGAAGGAACTCCGTG
CAGTCACGCGGGAATATGGTGTAACTTGGTCACTCTCACTTAGACACGTC
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ATTTTAGCCTCTCTCCGCTTAGCGTTCTAGAAGCTAAAAAAATGGTAGCC
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gaaagcatagttataaatatacttagggtggaaatatttgctagtaaact
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ATTGATTGCCTATCGATTATCGAGACCAATCTGGACCAATCGATATTCAA
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AAGGTCTGGATTAAATTAGAAATGGTTGctttacaaaaaataatttctac
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tttttttggacttagcTTTCAGCTAACTCAACTTTCTTCATAGTATTATA
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TAATGTTAACCGACTAACCCTACCTTTTGAGTAGTTTGGCGGGCAAAACA
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GACAcaggaaattttgaattaatcGGACATTTTTACCTGCACTTTTTAAG
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ACAGagggctgagaatgagaaatgTCACAAAAAAGATATTGCAAAAATAA
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AATATCAatgatttcttgatttcttcTTATTTACAGGACGATACTCCAGA
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CTATATACAAGCCAGAAGACTGCTATTACGAAAAAGATGGTAAAAGAGAA
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TAGAGAGCCATGTGGCGAAACACTGATGAAATCTGTTTCAAGTGGTGATG
GTAAAAAGAATTATCTTCATCCAAAAAGGTTATATTGTTATCAACCCTTA
AAACAGTCTCTACAGAACCTGATTAGTAGGAATGATCTTAGAGAAAAACT
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ATGGCAAGTTTTGGAAAGAATTTAAAGACAATAATGGGGAAATTTACTTC
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ATCTTCCAAGAGAGTTGAGGTTTCGATGGGAGAACATAACAACTGTTGGC
ATCATCCCTGGCCCAAACGAACCTTCACTCAATGTCAACAGTTATGTCAA
ACCTCTTGTCGACGATTTGCTGACGCTTTGGCAAGGAGATATGTTTGAGG
AGAAAGAATCTAGAGCTATGTACAAGTTCGCTCTTTGTTGTGTATCTTCT
GACCTTCCAGCTACAAGAAAATTATGTGGTTTTGTTTCATACAATGCAAA
ACAAGGTATAAATCATAGAAATTTAGTATGCGCATTTGCTTTTGTTTTAT
CCATTTCATTTTGCGGAAAGGAGTCTGACCCCCCTTGTTAAATGATCTCC
CCTTCTTGACATCCCCAACTTTTTAAAATGTCTATCCCCAAGGGTTTTgt
gctaaattttcaaaaatacatagTGTATAGTGCGATCTGCTAATCCCCTT
CTCGCTGCTACCCCCTTCTTAAAATCAATCCTCTGTTTTCTCTATATATT
TGTTTATGGTAAAAGGgagggaaacagtaaagaaaaatgaagtctggtaa
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ttttgatttaTTATAAACAAATATTGTAAAACTTCAATCGATTTTTTATA
AAAGCGTCATCAATTATAGGCTGGGGTTAGGGTTTATGGGTAATGGTTTT
TCTTGTGGTCCAagtattgaaatcataaaatcatTTTAAACTGGTGTGCT
TTCTACTGGACCTCATTAACATTCAGGCGTAATAGTAATACAACGTTGAC
GCATATAAATCATTTTTACTCGCGTACTCAACCATCACTGGATCACTATT
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GAAGCTacgtttttctcttttcttaaTATTGTAGGTTGTAGTAAATGTTT
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AGGTTGGCGTTCAAACACAAAGCGGCGAAAACACTAGCTGAAGCAAAAGA
AACAGAACGTGATTATGGTGTTAGATTTTCTGAATTGTGTCGTCTACCGT
ATTACGATCCGGTTCGTTGTCACCTCATCGATCCAATGCATTGTCTCCTC
CTAGGTGTAGCCAAGAACACGTTGAAAATCTGGATAAAAGTTAGTATAAT
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TGTTTCTCATTCAGGAATGAGACGAGGGTGTTTTAATGATTCTCATTCAG
GAATGAGACAAGGGTGTGGTCAATGTTTCTGATTTAGGAGACATGGGTGC
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GGAAGCTGCAGACGCTCAGATGAAGCTCATCAAACTTCCACCTGGTTATG
GTGTTCTTCCAAGTGCTGTGTCAGCGGCCTTTCGAAAAATGAAATCCGAT
GAGTACAAAACATGGGTGTTGTACGTGtcattgtttgttttgaaagatct
tcttcCTAAAGCTCATTACAATATGTGGCAAGATTTTGTACGTGCTTGCC
AGCTATTGATCAAGCCCTACATTATCGTCGAGGATGTCGAAGAGGCCCAC
AAATTGCTAAAGTCTTTCAACGAGAACTTCGAAAAAGTCATCGGTCCTGA
TAAATGCGTCCCAAACATGCACATGATGATGCACATAAAAGgctgtattt
tagattttgggCCAGTATATGCATTTTGGTGTTATTCATTCGAGCGTTAC
AATGGTAAACTAGGTGAATACCAAACTAACAACAAGAGCATTACGATGCA
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AGCTTGATATAGATGATATTCCGTCCTTTGAAGAGTTGAAGCTGATCTCC
AACGTTGACGAAAATTTGAAGCATCTGGTAGCACTTTGCAGCTCTAGAGT
CGGCATAGTCGATATTTCCTCATTGCTGTTATCAAACCATTCTACTTTTC
TCTCTGGAGCGAAATTCCGTCGTATCCGTAAAGATGACGCCGAGTGCATC
GCAGAATATCTTAAAGCTGTGTTTTCTACTGATGATCTATCAATTGAGCG
CATCGTTCAAGGCTACTCACGAATAAAAGTTGGTAGGGATGTAATAGCTG
TTTCGAGTTACAGAAGAAATGATAACCGCaatcaattcatttttatttcg
tatcaaaatcaaaatcacccTGGATTTGTTACAGATATTGTCGATGTCCC
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TTTTTAACACTCACCAGTATAAGAACTTTTATGGAGAAGACTGTCCTATG
AAAATTTGGAACACCACCATTATGACAGAAATCTTTGTCCCTGTAGTGGC
CATGAAAGGAAAATGTGTTGTCATTAAAGACGATTGTAAGTTTGATCGTA
TACCAATAGCAAATGGCCGAGTGGCTAGAGCTAACTTTGAAGATATCGTT
TATTTTGTATTAGAAATGTAGATTTTAATTATAGATAGATATAGGCTAAG
AATTTAAGCCAAATTTTGATAGTTTAAACtgacgaaattttttttttcgt
actTTGAGCAGCTTGGAGGCctacttttttcataaaaagccTGCAATTCA
TAGAGA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_14:805017..812772+

>TCONS_00048023 ID=TCONS_00048023|Name=TCONS_00048023|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=16848bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_14:805017..812772+ (Clytia hemisphaerica)
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AGCACTTCATCGTCATAAGCAGCTTTACTATAGAAATGgcttttggaaaa
agaaaaaaagtgataaaCAAGatgtGAGACAAGGACATGATGACAATTCA
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AAATGATGACCCAATGAGTGAAGAATCATCAGATACGGACGATACTCCAG
ATCACAGAATTGATGCAGAAGTTTTGGATGATACTGATTCGTGTGACGAA
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AAAAATCATTATTATGCTTATGTACCAACTTTTTGCCCTTCAAACAACAT
ACTCAATTTCAGACAATGTTATGGGGATCTTGTTGAAATTGTTCCACTCG
TTTTTGACACAATTGAAGTCGCATGACGGTGTTGATGATAAATTGGAAAG
GACAATTGAGTTGTTTCCTTCAAGCCTCTTCCTTGCTAAAAAGAAGATTA
ACTTAGAAAATAATTCTTTCGTTAAGTATGTTAGCTGTGGAAAATGCCAC
TCTATATACAAGCCAGAAGACTGCTATTACGAAAAAGATGGTAAAAGAGA
AAGTCACTGTTGTACCCACGTTCCATATCCTGACCATCCTCAAGCACGCT
TTAGAGAGCCATGTGGCGAAACACTGATGAAATCTGTTTCAAGTGGTGAT
GGTAAAAAGAATTATCTTCATCCAAAAAGGTTATATTGTTATCAACCCTT
AAAACAGTCTCTACAGAACCTGATTAGTAGGAATGATCTTAGAGAAAAAC
TTTTGGGTGGCCCATCAAAAGGTCCCGAAGGCGTTTTGTTTGACACCATT
GATGGCAAGTTTTGGAAAGAATTTAAAGACAATAATGGGGAAATTTACTT
CAAAGACCCTCGAAACCTTGGAGCCATTTTAAATATAGACTGGTTTCAAC
CATTTGACGGTGTGGAGTATAGCTGTGGAGTCATATATATGGCACTCCTT
AATCTTCCAAGAGAGTTGAGGTTTCGATGGGAGAACATAACAACTGTTGG
CATCATCCCTGGCCCAAACGAACCTTCACTCAATGTCAACAGTTATGTCA
AACCTCTTGTCGACGATTTGCTGACGCTTTGGCAAGGAGATATGTTTGAG
GAGAAAGAATCTAGAGCTATGTACAAGTTCGCTCTTTGTTGTGTATCTTC
TGACCTTCCAGCTACAAGAAAATTATGTGGTTTTGTTTCATACAATGCAA
AACAAGGTTGTAGTAAATGTTTTAAACAATTCGAACACGATGGTCCTGTG
GGAACTACTAAAACTGACTATTCTGGCTTCGACGAAGAGAACTGGACTGA
GAGGGACCCTAAAGAACATGTCAGGTTGGCGTTCAAACACAAAGCGGCGA
AAACACTAGCTGAAGCAAAAGAAACAGAACGTGATTATGGTGTTAGATTT
TCTGAATTGTGTCGTCTACCGTATTACGATCCGGTTCGTTGTCACCTCAT
CGATCCAATGCATTGTCTCCTCCTAGGTGTAGCCAAGAACACGTTGAAAA
TCTGGATAAAAACCGACGTTCTGACGAAGGAGAAGCTGGAAGCTGCAGAC
GCTCAGATGAAGCTCATCAAACTTCCACCTGGTTATGGTGTTCTTCCAAG
TGCTGTGTCAGCGGCCTTTCGAAAAATGAAATCCGATGAGTACAAAACAT
GGGTGTTGTACGTGtcattgtttgttttgaaagatcttcttcCTAAAGCT
CATTACAATATGTGGCAAGATTTTGTACGTGCTTGCCAGCTATTGATCAA
GCCCTACATTATCGTCGAGGATGTCGAAGAGGCCCACAAATTGCTAAAGT
CTTTCAACGAGAACTTCGAAAAAGTCATCGGTCCTGATAAATGCGTCCCA
AACATGCACATGATGATGCACATAAAAGgctgtattttagattttgggCC
AGTATATGCATTTTGGTGTTATTCATTCGAGCGTTACAATGGTAAACTAG
GTGAATACCAAACTAACAACAAGAGCATTACGATGCAACTAATGCGACAA
TTTCTGGACAATCATTCCATTGTCACTGCCTACCAAAAGCTTGATATAGA
TGATATTCCGTCCTTTGAAGAGTTGAAGCTGATCTCCAACGTTGACGAAA
ATTTGAAGCATCTGGTAGCACTTTGCAGCTCTAGAGTCGGCATAGTCGAT
ATTTCCTCATTGCTGTTATCAAACCATTCTACTTTTCTCTCTGGAGCGAA
ATTCCGTCGTATCCGTAAAGATGACGCCGAGTGCATCGCAGAATATCTTA
AAGCTGTGTTTTCTACTGATGATCTATCAATTGAGCGCATCGTTCAAGGC
TACTCACGAATAAAAGTTGGTAGGGATGTAATAGCTGTTTCGAGTTACAG
AAGAAATGATAACCGCaatcaattcatttttatttcgtatcaaaatcaaa
atcacccTGGATTTGTTACAGATATTGTCGATGTCCCTGTTAACATTTCT
GGAAATGAGTTTCACAtccctttttttcaaatgagtCTTTTTAACACTCA
CCAGTATAAGAACTTTTATGGAGAAGACTGTCCTATGAAAATTTGGAACA
CCACCATTATGACAGAAATCTTTGTCCCTGTAGTGGCCATGAAAGGAAAA
TGTGTTGTCATTAAAGACGATTGTAAGTTTGATCGTATACCAATAGCAAA
TGGCCGAGTGGCTAGAGCTAACTTTGAAGATATCGTTTATTTTGTATTAG
AAATGTAGATGTCCAACGAAAAAATTTGCCCTCATTGTAATGAAGAACTC
AGCAGACAAGCACTTCATCGTCATAAGCAGCTTTACTATAGAAATGgctt
ttggaaaaagaaaaaaagtgataaaCAAGatgtGAGACAAGGACATGATG
ACAATTCAAAACGCAAACATGATGTTATGGCTccagaagaaaattttaat
gataatgGAAATGATGACCCAATGAGTGAAGAATCATCAGATACGGACGA
TACTCCAGATCACAGAATTGATGCAGAAGTTTTGGATGATACTGATTCGT
GTGACGAATTTGAAGATACCTCTCAAAACGAATCAATTATTTTTGATGAT
GGAAACGAAAAAATCATTATTATGCTTATGTACCAACTTTTTGCCCTTCA
AACAACATACTCAATTTCAGACAATGTTATGGGGATCTTGTTGAAATTGT
TCCACTCGTTTTTGACACAATTGAAGTCGCATGACGGTGTTGATGATAAA
TTGGAAAGGACAATTGAGTTGTTTCCTTCAAGCCTCTTCCTTGCTAAAAA
GAAGATTAACTTAGAAAATAATTCTTTCGTTAAGTATGTTAGCTGTGGAA
AATGCCACTCTATATACAAGCCAGAAGACTGCTATTACGAAAAAGATGGT
AAAAGAGAAAGTCACTGTTGTACCCACGTTCCATATCCTGACCATCCTCA
AGCACGCTTTAGAGAGCCATGTGGCGAAACACTGATGAAATCTGTTTCAA
GTGGTGATGGTAAAAAGAATTATCTTCATCCAAAAAGGTTATATTGTTAT
CAACCCTTAAAACAGTCTCTACAGAACCTGATTAGTAGGAATGATCTTAG
AGAAAAACTTTTGGGTGGCCCATCAAAAGGTCCCGAAGGCGTTTTGTTTG
ACACCATTGATGGCAAGTTTTGGAAAGAATTTAAAGACAATAATGGGGAA
ATTTACTTCAAAGACCCTCGAAACCTTGGAGCCATTTTAAATATAGACTG
GTTTCAACCATTTGACGGTGTGGAGTATAGCTGTGGAGTCATATATATGG
CACTCCTTAATCTTCCAAGAGAGTTGAGGTTTCGATGGGAGAACATAACA
ACTGTTGGCATCATCCCTGGCCCAAACGAACCTTCACTCAATGTCAACAG
TTATGTCAAACCTCTTGTCGACGATTTGCTGACGCTTTGGCAAGGAGATA
TGTTTGAGGAGAAAGAATCTAGAGCTATGTACAAGTTCGCTCTTTGTTGT
GTATCTTCTGACCTTCCAGCTACAAGAAAATTATGTGGTTTTGTTTCATA
CAATGCAAAACAAGGTTGTAGTAAATGTTTTAAACAATTCGAACACGATG
GTCCTGTGGGAACTACTAAAACTGACTATTCTGGCTTCGACGAAGAGAAC
TGGACTGAGAGGGACCCTAAAGAACATGTCAGGTTGGCGTTCAAACACAA
AGCGGCGAAAACACTAGCTGAAGCAAAAGAAACAGAACGTGATTATGGTG
TTAGATTTTCTGAATTGTGTCGTCTACCGTATTACGATCCGGTTCGTTGT
CACCTCATCGATCCAATGCATTGTCTCCTCCTAGGTGTAGCCAAGAACAC
GTTGAAAATCTGGATAAAAACCGACGTTCTGACGAAGGAGAAGCTGGAAG
CTGCAGACGCTCAGATGAAGCTCATCAAACTTCCACCTGGTTATGGTGTT
CTTCCAAGTGCTGTGTCAGCGGCCTTTCGAAAAATGAAATCCGATGAGTA
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