TCONS_00047160 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00047160
Unique NameTCONS_00047160
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4473

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00047160 ID=TCONS_00047160|Name=TCONS_00047160|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4473bp
gtttttaatttaattttgagaaacaaattgttttaattgttttgtttaca
tttgataTACAAAGGATCATTGAACTTTTATTGAATCTCAGACAAAAAGT
TCTTCCATTTGAAAGACCTTCAGCACAATTCTTAAGGTGAAAACCACTCA
AGCGTACCATatctcatcaattattcatAACccattcaaattttcaataa
tgTAAAATTACAATTCGGCATATTCTTAAGACGTAGAACAAGAAAGTTTA
GATTCCTTTTAATTAACTTTAATTGGATGAAGAATTAACCCAATTTAGgg
gttcaaattaaaaaaaaatgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCC
CTAGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGA
GGAAAGTCCCGATGCAACTCCAGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAA
ACACTGAACAATCACCAGATGAAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGAT
CAACCTTCTTCATCAGAGAAAGAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGA
AGCTTCAGAATCTGAATCCACCAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATA
CTACTGAAGGTGCCAAGAAGACTGAAGTCCCTAATAagGACGCCGAAGCA
TCTGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGATGA
TGCTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCACG
GAGACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGACAAT
CATCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAGA
ATGGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACGAAG
GAGGACATCACGGTGAGCACGGACATCATCACGGTGGTCACCACGGTGGC
GGCGGCGGATACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactGC
TACCCCTCAAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAGA
AATGGTGGTTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTGG
GGACACCCTCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACCA
TGGCTTACACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGTG
GTTTGGGTGGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGGT
GGCGGCAACGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTGG
CTGCGGAGGAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAACG
GCCATGGTGGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCAC
TACAAGAGCAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCAC
CAAGAGATGTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACACGGTCCAGCTGGTA
ATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGA
TATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGC
AGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCA
ATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTG
AACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGA
CAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCAC
GATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTT
CATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATT
CGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAG
AAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCC
AACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGG
TCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGG
GTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCAC
GCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGG
ACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAAGCTTATC
ATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGAT
GCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGG
TTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTATGGGGAT
GGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGGTGGTGGA
TACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGG
ATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCG
CTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGT
TTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGG
ATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACG
ATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCCATCAT
CCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTG
CGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTG
ATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAA
GGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATG
GTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGAGAAGGTC
ACGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTGGCCAT
CACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTAT
GGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCAAGCTT
ACCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAA
GATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATA
CGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTCTGGG
GATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAAActcaaa
gaaaagaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTACCAAGGA
TACTGCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGACAAACCA
AAAAACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGACAATTAT
CGCCTCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGATTCACATC
ACCCCACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCACGAATTCCAGCTG
CTGAATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAACATGGCTTTTTCT
CAAGAACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCACACACCC
AGGGTTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCTATCGAAG
CACAAAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatttatcGCAATCACCAA
CCTAATGTCTAACCTATATTTGTATTACATCCATCCATCCACTCACCATA
CAAGATGATGTTATCCTGTTATTAATTGGTGTTATAACGTCCCAATAGTA
CCATAGTTCGTCTTTATAATTGTGTTATTCTGTAATACGTAGCTCTTGTA
ATAACCCCATATTTGTTAATGTAGTTTTATGTATGTTTTATTATGTGTGT
TAGATCATTTGTAAGATCACTCATTATAttattaggcgagaccaatttaa
tttgttgttctacgggcccgaccgaccctattttcactaaaatcaaaaaa
ataataatattgaattcccactacaatatattttacacactagttatttg
taagaatcaaatttgaatataacGATCTGCccttagaacaacaaattaaa
ttggtctcgccttatttAACAAAATAGTCGTGTTATATGATTTTAACCAT
TTGTACAATAGATTTTATTCTAATAGAAAAattaatcaaagtcaatttca
caTTTTATATTATCTCCAAGAGTGCAGGTCAAATTTTATCTCAGCCGCAA
CCAaaacttttttcccaaaattgctATCCCgaaaaatctcgttttttctT
CCCTATGAGAAGTCAAAGTTACCTCACAAGATTTTAGCATTTCCTAGAAT
GCTTCGTTTAAGTCAAATAGCAT
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00047160-protein

>TCONS_00047160-protein ID=TCONS_00047160-protein|Name=TCONS_00047160-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1154bp
MRLRLLVLLLALALCLTNAKPLTDTQTEESPDATPEKKDNTPEPNTEQSP
DEDQKSTEEVDQPSSSEKETSTESQPEEASESESTKEVEESNDDTTEGAK
KTEVPNKDAEASEESSDDVADTEDNTDDAAKRDFGGGHEGGGHHGDEGGH
EGQHGHHEHDNHHHGHQHHDHGYEFYEEWGEHGGHEGEHHGHHEGGHHGE
HGHHHGGHHGGGGGYKREKVDKTKTKTATPQKAEDATDGEDASKKWWLVG
DHWGGWGHSHWGHPHAIGDGGGWQWGHHGLHGGHGGGYGGGYGGGLGGYG
GGYGGGLGGYGGGNGGYGGNGGGCGHGGCGGGYGGYGGHGYGGNGHGGCG
HGGCGGHVGGHYKSKIPDCCKSKDPKVTKRCGCHLGTTGHGPAGNGFFGG
LGGGYGGLGGGYGGLGGGYGGLGGGYGAGSGGFGLGGAVGGCGCNAGGCG
CGPGFALGGGLNNYGVYGHSGWPVRKFDNYRVCHKCHDLPSGGSRCLCKS
VRHHPLYLPVVHRPAHVYIDCDTSAHKFGHNRCYARADIPTPEEENTETG
AAKQGVFYPYANYGPWSAYPWWGDWWGGHGHHAFGEGHGSGHGQGQGHGG
GCGGCDGCGNHAGGCRGRCSGCGHHGMGRNVGFSFGHGAHLQAYHCKDQV
EKVNGADDHEDATTKRFCVPIGYNGGYGFPYFHGYPGVGTGLWGWGWPWI
KNKVPGXLGGGYGGLGGGYGGLGGGYGGLGGGYGAGSGGFGLGGAVGGCG
CNAGGCGCGPGFALGGGLNNYGVYGHSGWPVRKFDNYRVCHKCHDLPSGG
SRCLCKSVRHHPLYLPVVHRPAHVYIDCDTSAHKFGHNRCYARADIPTPE
EENTETGAAKQGVFYPYANYGPWSAYPWWGDWWGGHGHHSWGEGHGQGHG
GGCGGCGGCGHHAGGCRGRCSGCGHHGMGRNVGFSFGRGAHLQAYHCKDQ
VEKVNGADDHEDATTKRFCVPIGYNGGYGFPYFHGYPGVGTGLWGWGWPW
IKNKVPGSKLKEKKVTSKDSSASKSTKDTASKDTKKSAIPRRQTKKQTIH
VGYGYASGDNYRLGYGMGGMGGVAGFTSPHGAPLTQFARSRIPAAESTKD
VTGTKRNMAFSQEPSSTGSMLGHPVTHPGFTTMGFPGHADSSIEAQKSRI
PKKL
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_123:57464..66929+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00047160 ID=TCONS_00047160|Name=TCONS_00047160|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9466bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_123:57464..66929+ (Clytia hemisphaerica)
gtttttaatttaattttgagaaacaaattgttttaattgttttgtttaca tttgataTACAAAGGATCATTGAACTTTTATTGAATCTCAGACAAAAAGT TCTTCCATTTGAAAGACCTTCAGCACAATTCTTAAGGTGAAAACCACTCA AGCGTACCATatctcatcaattattcatAACccattcaaattttcaataa tgTAAAATTACAATTCGGCATATTCTTAAGACGTAGAACAAGAAAGTTTA GATTCCTTTTAATTAACTTTAATTGGATGAAGAATTAACCCAATTTAGgg gttcaaattaaaaaaaaatgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCC CTAGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGA GGAAAGTCCCGATGGTATGttcaatttttattgttttgcttctttttcat ttataacTGACTGGTTTCAGCAAAGTTGTTTTTCTAGGGTAATATTTATT CCtgagaaatttttcttgaaagcaTTCCTAATAAAGTCTTTTCTCTTGAT AGttgatttttttcgtttttctctTAATTGTATTTGCATACAGATTCCAT TAAATCATGAGTTTTGAGCTTGTGGACAACGCACTTTTTCGTTGTTTGAA TTTTCGGTTGGCTAATAAATGCTGAAACTTGCCAGAAAATTATCTTTAAT TGTATCAGAAAGAACCGAgaatagattttaaaattgGACTTCGTTTCCTC CGAAAGCTTAAGTTAACCAAGATCAAATACCAAGCTTCTCCAAAAACCTT CTTATAAATTCCCTGGTTATTTCATCTTCTATTCACACATTACAGCAACT CCAGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAACACTGAACAATCACCAGA TGAAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCAACCTTCTTCATCAGAGA AAGAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAGCTTCAGAATCTGAATCC ACCAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACTACTGAAGGTGCCAAGAA GACTGAAGTCCCTAATAaggtatttttcttttcttatacaAGTTTGTTGC CAATCTATTGGCATTTTTAAAATCTATGGCTCAAACATGAGGTTTGAAGT ACTCACAATTTAGTTAAGCACGAGAATGTTAAAAAAAGACTTTCGAATTC TGTTTGATTATCTGTTTCATTACAACACTCTAAGTTGAACCGTTTATGGA TTTAGAAAATCACACTGTTATACAAAATATCCAGTCATGGCATAGTACAG TTTGTCGGAAAGATATATTCTACAAAGAAATACACCAGCAAACATTAAAT AGTTTTCATGTTTTAAGTAACTAGATGATTTTCGTCCTGAACAAGATGAT aggcaaaaaattttctttcttttccacaAATGGAATGCAGTCAACGGAGT TGAtgagaaaaaaactgaatttcggTTTTCTGAAAATACTTTTTGTTAAT AGTTAGTAGTTTTTTCACGTAACCTTTCCCCATGAAAACAGCTCTGTTGG CTGCTTTTGATCAAACTTGcatgtttttatcaaatgatgTATATCAATTT GCTGTCCAAAAAAAGCCAATTTTTATGGTGAAAGAATCCTGAAGATTATC CTTTATTGATCTGGAATGTTCTTAGTTCCCGACCGAATAAGGTACGTGCT TTTCAAAAGCAGCAGTCAACACGGGTTGTTTTTAATGAGAAAGGGCTGTC TCTATCACACAAacaatttgaaagttttaataatAATTACAAGTCTCAAA GTTTTATTGGGCACAGGCTTTCTCGTAAAGACAGCTCTGTTGATTGCTga ccttttgtttcttttcacttttttttctaatttctgaaaattttgatcAG TTCTTTAAATAACCTATTTACCTTTCAACCATTGCACAAAAAGGTTGCAT GAAAAAAGGTTCTACCGAGGGTCGAATAACGTTAAACGGAGTATCATTGC TTTGCGTTAACGGAGTCGGTAGTACTGACATTTGACGTCATCGACCCTTG TAAATTGCTCACACTTATTTCAAGTGTCTTGTTGCTTTTTTACTCCTTTG GTGATTATCGAACGCCGTTGAACGCCATGAACTTGTACTATTAGACAAAA TTCTTATCTTAACTTATCTGCTGCATTTTACGCACATTTACTTAATTTAC ATTTACTTCATAGCGGAACCAATCTAACCCCAGTTCTTTTATCGcattct cttttttttcatttttagaaaccgaagaagaagaagaaatcttccaaaag caaGAAAACAAAATCCAAAGCCAAATCTACTAAAGAAATAGACCGTCGAT ATGGTATGGGCGGTTATGGCGGTGGTATGGGCGGACATCATATGGGTGGA CATCACATGGGTGGACACCACATGGGACATCACGGTCACCATGGACACCA TGATCACGATCACGGACATGAGCATTATGAAGAATGGGATCACCATGGAG AGCATGGAGACCACCACGGTGGAGGACACGGACATCACCACGGTCACCAT GGACACCACGATCACCACGATCATGGTCACCATCATGGTTTCCACCACGA TTGGCATCATGATCATGGAGGTCATCATGGTGGACATCACGGTCATGGAG GTGGAGGAATGATGGGAGGTGGAGGATACCGTCGTGATGAGCTGACTGCT AACAAGAGGTTTTTCATGCCATTCAGTCCTTTCAGTGGAGGAAATCCTGG ACCCTTCAATGAGGGAATAGTTGATGTTTTTAACATGAATCCACTTCAAT GGCCCAACCCCTGGACACGAAATTGGATCGGTGCTAACGAAGGAGGACCA CCTGTCTCTGGTGTCTTCAACACACAATACCAAATACCCGCACTTCCTGT TGTAGCCGCTTTGAATTCAGGATTACTAAGCAATTCAGCGGGATCATGGG AAAGTCCGGCAGTGTTGGCTGGTAGCAGAAGATCATTAAAGAGCACTGGA TGTCAACCAGGAGATTCTGGTAAACGTGGATGCGGATGTGCTGGTAATCA TGAGAAATGCGGTGGACAGGGATACAGCGGTGGGTTTGGTTTGAACCACG GTGATCATTATGATGATGGCTTCCACGGTGGCCTACATTTCCCACTTGGT GGATGGTATGGTTGGGGTGCATGGCCATGGGGCACTTACGGTGATTTTGT CGGCCACCATGGTAATGCTGTACCATGTGATGTACCACACCACGAACATC ATTTAGATAACAACAGTGGTTATGATGAAGGTGAAGGACGAGTTGGTCAT ACCGGTGGCTACGGTGGTGGTGAATACAGCGGGCATCACGGTGATTGTGG TCACGGACACGGCGGTTGTGGAGGTCATGATGGACACCATGGATCAGGAT ACGGTGGATATGCAGGTCATCACGGTGGTCACGGCAGCTACGGAGGAGTT GGAACACAAAGCGGACACGGTCATCACGGAGGTGGTCATGGTCACGGCGG CTACGGTAACCACGGAAGTTACGGCGGCCATGGACACGGACATTGTAGAA GTCAAATTCCTAAAAGCACAATCGATAAACCATTCTTACCAATGTCAGCT GTTATGGAAGACTTTTAGATCAATCAAATAATAATAGCCAATAAACACTA TTTATATAACCGTCatagtattttttcattgattAATATTTAATCTTTTG TCATCCTGTGTTTCGTCTTGTAAATATTCTAGCATCcattattcaaaaag aaaagaagtatGTTTTTGTTAATTATTTTTGAACACGTTTTGATTCGGAC AGAACCGGCGGATAGAAGAAGAGATCTCGCATTAATTTTGAATTCGCATT TTATGCTTTTTCATCAACTCCGTTTACTACAATGAAAccttttttaagct aaaaacaTTTAGACCACATATCAAATATCTTCATAgttattcaaaatgaa attaaatttttaaaaaccaacACTTTCGTAAGGACCCCTTTTTAGCCTCA TTTTCAAGTATTGCTTTCCCTTATGACTtgtcaaggaaaatgaaaaacag tGTACTGTAAACACTGTAAATCTTCTATCTTTCTTAATCAGGACGCCGAA GCATCTGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGA TGATGCTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATC ACGGAGACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGAC AATCATCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGA AGAATGGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACG AAGGAGGACATCACGGTGAGCACGGACATCATCACGGTGGTCACCACGGT GGCGGCGGCGGATACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaac tGCTACCCCTCAAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCA AGAAATGGTGGTTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCAC TGGGGACACCCTCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCA CCATGGCTTACACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCG GTGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATAC GGTGGCGGCAACGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGG TGGCTGCGGAGGAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAA ACGGCCATGGTGGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGT CACTACAAGAGCAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGT CACCAAGAGATGTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACACGGTGGGTACC ATTTTAGTGATCATGGTTCAGGGCATGATAACCATGATCATCGCATCCAA GGCCCATGGAGTTTCGGATATGACCATTTCGGGGATGATTGGTCTGACTG GGATCATAACACGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTTGC CACATGATGATCATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACGGT GTTCACCGATTCTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCAGC TGGTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTG GTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATAT GGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGG ATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTG GCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAA TTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGG ATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTG TTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACAC AAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGA AGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCAT ATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGG GGTGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGG TCAGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTA ATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGT ATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCCCATCTTCAAGC TTATNTCATAACACGCATTCGTTCCGTTATTTGACTGATATGACTCACTT GCCACATGATGATCATTGTGGACATGGCCGTGCATGTGTTCCATTGAACG GTGTTCACCGATTCTCACGATTTTATCCTTCTCTTCATTTTGAAGGTCCA GCTGGTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGG TGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGAT ATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGT GGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGG TGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCA AATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGT GGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACC TGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCAC ACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCT GAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCC ATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGT GGGGTGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCAC GGTCAGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGG TAATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACG GTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAA GCTTATCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCA CGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTG GATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTA TGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGG TGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGAT ACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTT GGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGG CCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGAC ATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAA TGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCG CCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACA TTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCC AGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGC CAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCT ACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGA GAAGGTCACGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTG TGGCCATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACC ACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTT CAAGCTTACCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGA CCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATG GTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGA CTCTGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAA ActcaaagaaaagaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTA CCAAGGATACTGCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGA CAAACCAAAAAACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGA CAATTATCGCCTCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGAT TCACATCACCCCACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCACGAATT CCAGCTGCTGAATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAACATGGC TTTTTCTCAAGAACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCA CACACCCAGGGTTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCT ATCGAAGCACAAAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatttatcGCAA TCACCAACCTAATGTAAGTTTACCTCAGATTTATAATTTGGCTTTATACA GGGAACTAATTACGTTACGTTTATGAGAGAAACCTCCTTAGGCTAAAATC AAATGTGATATTTGTAGATATTTTTTTCTTCGCTTTTGTTATTAAATTTG GACTGAAGTTTTGATTTTGttattgaaaactttttgctttCAATTGATTT TTCATTGACCAATCAAACAAAAGAATCAATCATTATAATTGGTATTGTGA TTTATTTTCCTATATTTTATCTTTACAGGTCTAACCTATATTTGTATTAC ATCCATCCATCCACTCACCATACAAGATGATGTTATCCTGTTATTAATTG GTGTTATAACGTCCCAATAGTACCATAGTTCGTCTTTATAATTGTGTTAT TCTGTAATACGTAGCTCTTGTAATAACCCCATATTTGTTAATGTAGTTTT ATGTATGTTTTATTATGTGTGTTAGATCATTTGTAAGATCACTCATTATA ttattaggcgagaccaatttaatttgttgttctacgggcccgaccgaccc tattttcactaaaatcaaaaaaataataatattgaattcccactacaata tattttacacactagttatttgtaagaatcaaatttgaatataacGATCT GCccttagaacaacaaattaaattggtctcgccttatttAACAAAATAGT CGTGTTATATGATTTTAACCATTTGTACAATAGATTTTATTCTAATAGAA AAattaatcaaagtcaatttcacaTTTTATATTATCTCCAAGAGTGCAGG TCAAATTTTATCTCACCCGcaaccaaaaaattttttcccaaaattgctAT CCCgaaaaatctcgttttttctttgtcaatttGATTTAGGTTCACATTTA TGTTGTCTCCAAGAGTGCAGGTCAAATTTTATCTCAGCCGCAACCAaaac ttttttcccaaaattgctATCCCgaaaaatctcgttttttctTCCCTATG AGAAGTCAAAGTTACCTCACAAGATTTTAGCATTTCCTAGAATGCTTCGT TTAAGTCAAATAGCAT

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_123:57464..66929+

>TCONS_00047160 ID=TCONS_00047160|Name=TCONS_00047160|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=13860bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_123:57464..66929+ (Clytia hemisphaerica)
atgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCCCTAGCTTTATGCTTGAC
AAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGAGGAAAGTCCCGATGCAA
CTCCAGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAACACTGAACAATCACCA
GATGAAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCAACCTTCTTCATCAGA
GAAAGAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAGCTTCAGAATCTGAAT
CCACCAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACTACTGAAGGTGCCAAG
AAGACTGAAGTCCCTAATAagGACGCCGAAGCATCTGAAGAATCGTCAGA
CGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGATGATGCTGCCAAGAGGGATT
TCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCACGGAGACGAAGGTGGTCAC
GAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGACAATCATCATCACGGTCACCA
ACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAGAATGGGGAGAGCATGGTG
GTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACGAAGGAGGACATCACGGTGAG
CACGGACATCATCACGGTGGTCACCACGGTGGCGGCGGCGGATACAAACG
TGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactGCTACCCCTCAAAAAGCTG
AAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAGAAATGGTGGTTAGTTGGA
GATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTGGGGACACCCTCACGCTAT
TGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACCATGGCTTACACGGCGGTC
ACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGTGGTTTGGGTGGATACGGT
GGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGCAACGGAGGCTA
CGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTGGCTGCGGAGGAGGATATG
GTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAACGGCCATGGTGGATGTGGA
CACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCACTACAAGAGCAAAATCCC
TGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCACCAAGAGATGTGGATGCC
ATTTGGGAACAACTGGACACGGTCCAGCTGGTAATGGTTTCTTCGGAGGA
CTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGG
TGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTG
GCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGT
TGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATA
TGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTC
ATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGT
GTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGT
CTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTT
ACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGT
GCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTC
TGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCACGCTT
TTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGGGTCAGGGTCACGGTGGT
GGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCACGCAGGCGGTTGCCGAGG
TAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTA
GCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAAGCTTATCATTGTAAAGATCAAGTT
GAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATT
CTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACG
GATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTATGGGGATGGGGATGGCCTTGGATC
AAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGG
TGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATG
GTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGA
TGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGG
CTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAAT
TCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGA
TCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCCATCATCCATTGTACTTACCTGT
TGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACA
AATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAA
GAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATA
TGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGG
GTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGAGAAGGTCACGGTCAGGGTCACGGT
GGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTGGCCATCACGCAGGCGGTTGCCG
AGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGAT
TTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCAAGCTTACCATTGTAAAGATCAA
GTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCG
ATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTC
ACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTCTGGGGATGGGGATGGCCTTGG
ATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAAActcaaagaaaagaaagtgACATC
CAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTACCAAGGATACTGCTTCTAAAGATA
CAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGACAAACCAAAAAACAAACCATCCAT
GTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGACAATTATCGCCTCGGATACGGAAT
GGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGATTCACATCACCCCACGGTGCACCTT
TAACACAGTTCGCACGCTCACGAATTCCAGCTGCTGAATCAACGAAAGAT
GTCACCGGTACCAAACGAAACATGGCTTTTTCTCAAGAACCATCATCTAC
AGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCACACACCCAGGGTTTACAACCATGG
GATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCTATCGAAGCACAAAAATCAAGGATC
CCaaagaaattgtaaatgaggcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCCCT
AGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGAGG
AAAGTCCCGATGCAACTCCAGAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAAC
ACTGAACAATCACCAGATGAAGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCA
ACCTTCTTCATCAGAGAAAGAAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAG
CTTCAGAATCTGAATCCACCAAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACT
ACTGAAGGTGCCAAGAAGACTGAAGTCCCTAATAagGACGCCGAAGCATC
TGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGGACAACACTGATGATG
CTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCACGGA
GACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCACGAACACGACAATCA
TCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAGAAT
GGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCATGGACACCACGAAGGA
GGACATCACGGTGAGCACGGACATCATCACGGTGGTCACCACGGTGGCGG
CGGCGGATACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactGCTA
CCCCTCAAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAGAAA
TGGTGGTTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTGGGG
ACACCCTCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACCATG
GCTTACACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGTGGT
TTGGGTGGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGGTGG
CGGCAACGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTGGCT
GCGGAGGAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAACGGC
CATGGTGGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCACTA
CAAGAGCAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCACCA
AGAGATGTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACACGGTCCAGCTGGTAAT
GGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATA
TGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAG
GATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAAT
GCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAA
CAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACA
ACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGA
TGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCA
TCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCG
GACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAA
AACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAA
CTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTC
ACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGGGT
CAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCACGC
AGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGAC
GAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCATCTTCAAGCTTATCAT
TGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGC
AACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTT
TCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTATGGGGATGG
GGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANGACTCGGTGGTGGATA
CGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGAT
TGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCT
GTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTT
CGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGAT
GGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGAT
CTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCCATCATCC
ATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCG
ATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGAT
ATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGG
CGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGT
GGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCTTGGGGAGAAGGTCAC
GGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTGGCCATCA
CGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGG
GACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCAAGCTTAC
CATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGA
TGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACG
GTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACGGGACTCTGGGGA
TGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGATCCAAActcaaaga
aaagaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCAAATCTACCAAGGATA
CTGCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCAAGACGACAAACCAAA
AAACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAGTGGCGACAATTATCG
CCTCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGGCTGGATTCACATCAC
CCCACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCACGAATTCCAGCTGCT
GAATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAACATGGCTTTTTCTCA
AGAACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATCCAGTCACACACCCAG
GGTTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGATTCATCTATCGAAGCA
CAAAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatgaggcTTAGGCTGCTAGT
ATTATTACTAGCCCTAGCTTTATGCTTGACAAATGCAAAACCACTGACGG
ATACCCAAACAGAGGAAAGTCCCGATGCAACTCCAGAGAAGAAAGACAAT
ACTCCTGAACCAAACACTGAACAATCACCAGATGAAGACCAAAAGTCAAC
AGAAGAGGTTGATCAACCTTCTTCATCAGAGAAAGAAACATCTACTGAAT
CACAACCAGAAGAAGCTTCAGAATCTGAATCCACCAAGGAGGTAGAAGAA
TCGAATGATGATACTACTGAAGGTGCCAAGAAGACTGAAGTCCCTAATAa
gGACGCCGAAGCATCTGAAGAATCGTCAGACGATGTCGCAGATACTGAGG
ACAACACTGATGATGCTGCCAAGAGGGATTTCGGCGGTGGACATGAGGGT
GGTGGCCATCACGGAGACGAAGGTGGTCACGAAGGCCAACACGGTCATCA
CGAACACGACAATCATCATCACGGTCACCAACATCATGATCATGGTTATG
AATTCTATGAAGAATGGGGAGAGCATGGTGGTCATGAAGGTGAACATCAT
GGACACCACGAAGGAGGACATCACGGTGAGCACGGACATCATCACGGTGG
TCACCACGGTGGCGGCGGCGGATACAAACGTGAGAAAGTTGacaaaacca
aaaccaaaactGCTACCCCTCAAAAAGCTGAAGATGCCACTGACGGTGAA
GATGCTTCCAAGAAATGGTGGTTAGTTGGAGATCACTGGGGAGGTTGGGG
TCACTCCCACTGGGGACACCCTCACGCTATTGGTGATGGTGGTGGCTGGC
AATGGGGTCACCATGGCTTACACGGCGGTCACGGTGGTGGCTACGGTGGC
GGCTATGGCGGTGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGTTATGGCGGCGGTTT
GGGTGGATACGGTGGCGGCAACGGAGGCTACGGAGGAAATGGCGGTGGTT
GCGGTCATGGTGGCTGCGGAGGAGGATATGGTGGCTATGGAGGTCATGGA
TATGGCGGAAACGGCCATGGTGGATGTGGACACGGTGGTTGTGGTGGACA
CGTTGGTGGTCACTACAAGAGCAAAATCCCTGACTGTTGCAAATCCAAAG
ATCCAAAGGTCACCAAGAGATGTGGATGCCATTTGGGAACAACTGGACAC
GGTCCAGCTGGTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGGTGGTGGATACGGAGG
ACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTG
GTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGA
GGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCT
TGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAG
TACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCA
AGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGTCATCATCCATTGTA
CTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCA
GTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCT
ACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTT
CTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAG
ACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGAGAAGGTCACGGTTCG
GGTCACGGTCAGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGATGG
TTGCGGTAATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTGGAC
ACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCATGGCGCTCAT
CTTCAAGCTTATCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGCTGA
TGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGATACA
ATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGTACG
GGACTATGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGGANG
ACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTG
GTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTT
GGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGG
TTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTAT
ATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGT
CATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAG
TGTTCGCCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACG
TCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGT
TACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGG
TGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGT
CTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCATTCT
TGGGGAGAAGGTCACGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATGCGGTGGATGTGG
TGGTTGTGGCCATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGATGCTCAGGTTGTG
GACACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTCGGTCGTGGCGCT
CATCTTCAAGCTTACCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAAAGTGAATGGAGC
TGATGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCGTTCCCATTGGAT
ACAATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATATCCAGGAGTCGGT
ACGGGACTCTGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAATAAGGTCCCTGG
ATCCAAActcaaagaaaagaaagtgACATCCAAAGATAGCTCAGCATCCA
AATCTACCAAGGATACTGCTTCTAAAGATACAAAGAAGAGTGCTATCCCA
AGACGACAAACCAAAAAACAAACCATCCATGTTGGTTACGGATACGCAAG
TGGCGACAATTATCGCCTCGGATACGGAATGGGCGGCATGGGTGGCGTGG
CTGGATTCACATCACCCCACGGTGCACCTTTAACACAGTTCGCACGCTCA
CGAATTCCAGCTGCTGAATCAACGAAAGATGTCACCGGTACCAAACGAAA
CATGGCTTTTTCTCAAGAACCATCATCTACAGGATCAATGTTAGGACATC
CAGTCACACACCCAGGGTTTACAACCATGGGATTCCCAGGGCACGCTGAT
TCATCTATCGAAGCACAAAAATCAAGGATCCCaaagaaattgtaaatgag
gcTTAGGCTGCTAGTATTATTACTAGCCCTAGCTTTATGCTTGACAAATG
CAAAACCACTGACGGATACCCAAACAGAGGAAAGTCCCGATGCAACTCCA
GAGAAGAAAGACAATACTCCTGAACCAAACACTGAACAATCACCAGATGA
AGACCAAAAGTCAACAGAAGAGGTTGATCAACCTTCTTCATCAGAGAAAG
AAACATCTACTGAATCACAACCAGAAGAAGCTTCAGAATCTGAATCCACC
AAGGAGGTAGAAGAATCGAATGATGATACTACTGAAGGTGCCAAGAAGAC
TGAAGTCCCTAATAagGACGCCGAAGCATCTGAAGAATCGTCAGACGATG
TCGCAGATACTGAGGACAACACTGATGATGCTGCCAAGAGGGATTTCGGC
GGTGGACATGAGGGTGGTGGCCATCACGGAGACGAAGGTGGTCACGAAGG
CCAACACGGTCATCACGAACACGACAATCATCATCACGGTCACCAACATC
ATGATCATGGTTATGAATTCTATGAAGAATGGGGAGAGCATGGTGGTCAT
GAAGGTGAACATCATGGACACCACGAAGGAGGACATCACGGTGAGCACGG
ACATCATCACGGTGGTCACCACGGTGGCGGCGGCGGATACAAACGTGAGA
AAGTTGacaaaaccaaaaccaaaactGCTACCCCTCAAAAAGCTGAAGAT
GCCACTGACGGTGAAGATGCTTCCAAGAAATGGTGGTTAGTTGGAGATCA
CTGGGGAGGTTGGGGTCACTCCCACTGGGGACACCCTCACGCTATTGGTG
ATGGTGGTGGCTGGCAATGGGGTCACCATGGCTTACACGGCGGTCACGGT
GGTGGCTACGGTGGCGGCTATGGCGGTGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGG
TTATGGCGGCGGTTTGGGTGGATACGGTGGCGGCAACGGAGGCTACGGAG
GAAATGGCGGTGGTTGCGGTCATGGTGGCTGCGGAGGAGGATATGGTGGC
TATGGAGGTCATGGATATGGCGGAAACGGCCATGGTGGATGTGGACACGG
TGGTTGTGGTGGACACGTTGGTGGTCACTACAAGAGCAAAATCCCTGACT
GTTGCAAATCCAAAGATCCAAAGGTCACCAAGAGATGTGGATGCCATTTG
GGAACAACTGGACACGGTCCAGCTGGTAATGGTTTCTTCGGAGGACTCGG
TGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGATATGGTGGACTCGGTGGTGGAT
ACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCAGGATCTGGTGGGTTTGGCCTT
GGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAATGCCGGTGGTTGCGGTTGCGG
CCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGAACAATTACGGTGTATATGGAC
ATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGACAACTACCGTGTTTGTCATAAA
TGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACGATGTCTGTGCAAGAGTGTTCG
TCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTCATCGACCAGCTCACGTCTACA
TTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTCGGACACAACAGATGTTACGCC
AGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGAAAACACAGAGACTGGTGCAGC
CAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCAACTATGGTCCATGGTCTGCCT
ACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGTCACGGTCATCACGCTTTTGGA
GAAGGTCACGGTTCGGGTCACGGTCAGGGTCAGGGTCACGGTGGTGGATG
CGGTGGATGTGATGGTTGCGGTAATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTAGAT
GCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGCTTC
GGTCATGGCGCTCATCTTCAAGCTTATCATTGTAAAGATCAAGTTGAGAA
AGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCTGCG
TTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGATAT
CCAGGAGTCGGTACGGGACTATGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAAGAA
TAAGGTCCCTGGANGACTCGGTGGTGGATACGGAGGACTCGGTGGTGGAT
ATGGTGGACTCGGTGGTGGATACGGTGGATTGGGTGGTGGATATGGTGCA
GGATCTGGTGGGTTTGGCCTTGGTGGCGCTGTCGGAGGTTGTGGATGCAA
TGCCGGTGGTTGCGGTTGCGGCCCTGGTTTCGCTCTTGGTGGTGGCTTGA
ACAATTACGGTGTATATGGACATTCCGGATGGCCAGTACGCAAATTCGAC
AACTACCGTGTTTGTCATAAATGCCACGATCTACCAAGCGGTGGATCACG
ATGTCTGTGCAAGAGTGTTCGCCATCATCCATTGTACTTACCTGTTGTTC
ATCGACCAGCTCACGTCTACATTGATTGCGATACCAGTGCACACAAATTC
GGACACAACAGATGTTACGCCAGAGCTGATATTCCTACTCCTGAAGAAGA
AAACACAGAGACTGGTGCAGCCAAACAAGGCGTGTTCTATCCATATGCCA
ACTATGGTCCATGGTCTGCCTACCCATGGTGGGGAGACTGGTGGGGTGGT
CACGGTCATCATTCTTGGGGAGAAGGTCACGGTCAGGGTCACGGTGGTGG
ATGCGGTGGATGTGGTGGTTGTGGCCATCACGCAGGCGGTTGCCGAGGTA
GATGCTCAGGTTGTGGACACCACGGTATGGGACGAAATGTTGGATTTAGC
TTCGGTCGTGGCGCTCATCTTCAAGCTTACCATTGTAAAGATCAAGTTGA
GAAAGTGAATGGAGCTGATGACCACGAAGATGCAACCACCAAGCGATTCT
GCGTTCCCATTGGATACAATGGTGGATACGGTTTCCCATACTTTCACGGA
TATCCAGGAGTCGGTACGGGACTCTGGGGATGGGGATGGCCTTGGATCAA
GAATAAGGTCCCTGGATCCAAActcaaagaaaagaaagtgACATCCAAAG
ATAGCTCAGCATCCAAATCTACCAAGGATACTGCTTCTAAAGATACAAAG
AAGAGTGCTATCCCAAGACGACAAACCAAAAAACAAACCATCCATGTTGG
TTACGGATACGCAAGTGGCGACAATTATCGCCTCGGATACGGAATGGGCG
GCATGGGTGGCGTGGCTGGATTCACATCACCCCACGGTGCACCTTTAACA
CAGTTCGCACGCTCACGAATTCCAGCTGCTGAATCAACGAAAGATGTCAC
CGGTACCAAACGAAACATGGCTTTTTCTCAAGAACCATCATCTACAGGAT
CAATGTTAGGACATCCAGTCACACACCCAGGGTTTACAACCATGGGATTC
CCAGGGCACGCTGATTCATCTATCGAAGCACAAAAATCAAGGATCCCaaa
gaaattgtaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_030066XLOC_030066Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:57464..57877TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:57464..57877Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:57464..57877TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:57464..57877Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:57464..57877TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:57464..57877Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:58309..58532TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:58309..58532Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:58309..58532TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:58309..58532Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:58309..58532TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:58309..58532Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:61555..62404TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:61555..62404Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:61555..62404TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:61555..62404Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:61555..62404TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:61555..62404Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:63559..65876TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:63559..65876Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:63559..65876TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:63559..65876Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:63559..65876TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:63559..65876Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:66142..66662TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:66142..66662Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:66142..66662TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:66142..66662Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:66142..66662TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:66142..66662Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:66784..66929TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1491911889:66784..66929Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:66784..66929TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1510915933:66784..66929Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:66784..66929TCONS_00047160-exon-scaffold_123-1575043694:66784..66929Clytia hemisphaericaexon
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047160-proteinTCONS_00047160-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_123supercontigscaffold_123:57464..66929 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0820424 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00047160 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top