transcript:BL97377_cuf2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL97377_cuf2
Unique Nametranscript:BL97377_cuf2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL97377_cuf2

>transcript:BL97377_cuf2-protein ID=transcript:BL97377_cuf2-protein|Name=transcript:BL97377_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=377bp
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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at xpSc0039673:1..75070-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL97377_cuf2 ID=transcript:BL97377_cuf2|Name=transcript:BL97377_cuf2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=75070bp|location=Sequence derived from alignment at xpSc0039673:1..75070- (Branchiostoma lanceolatum)
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GTGTGGCCGGAAGATGGGAGACATCTTGGTGAAGGACACGACAGGCCAAC
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AGTCAAGTCACAAGGTTAGAATGGCTGAGTCAGGACGCCGTCACGGTTCT
CGCCTCGGCCCATCGCAGTGGCAGGGTGCACCTATGGCAGTACAAGGTTC
ACAACAGAGTTTCCAGCTTAGTTGAGATTGCATCAACAGAAGTCGTGTCA
ACTTACCCGACTGCACTGAAGTTCTCACCTGCTGGCAAGTATCTGGCCGT
AGGTTTCCATGACAGTAAGGTGTGTTTCTACACCCTGAATCTGCGGGCCG
TCTCTCAGGCCTCGTCCTCACAACCTGTCCTCAAGCCGGTCTGCACCTGT
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GGCAACCAGAAGAAGACTCAAAATTTCAAGGTGTTCCAACATGTTTGTGC
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GCCAGTTCCTGGTGTCGGCCGGCTGGGACAGCCAGGTCCTCTACTGGAGC
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CGAACCTCTCTGCGGCTTCGTGATCGGGAGGAAGAAGTCGGCCGTGGGAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL97377gene:BL97377Branchiostoma lanceolatumgene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
BL97377_cuf2-E1BL97377_cuf2-E1-1564476830-550342Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E2BL97377_cuf2-E2-1564476830-550340Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E3BL97377_cuf2-E3-1564476830-550338Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E4BL97377_cuf2-E4-1564476830-550336Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E5BL97377_cuf2-E5-1564476830-550334Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E6BL97377_cuf2-E6-1564476830-550332Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E7BL97377_cuf2-E7-1564476830-550329Branchiostoma lanceolatumexon
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BL97377_cuf2-E9BL97377_cuf2-E9-1564476830-550325Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E10BL97377_cuf2-E10-1564476830-550323Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E11BL97377_cuf2-E11-1564476830-550321Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E12BL97377_cuf2-E12-1564476830-550319Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E13BL97377_cuf2-E13-1564476830-550317Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E14BL97377_cuf2-E14-1564476830-550315Branchiostoma lanceolatumexon
BL97377_cuf2-E15BL97377_cuf2-E15-1564476830-550313Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL97377_cuf2transcript:BL97377_cuf2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
xpSc0039673genomexpSc0039673:1..75070 -
Properties
Property NameValue
Transcript idBL97377_cuf2
Biotypeprotein_coding