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gene from alignment at Sc0000007:2661575..2671757+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96878 ID=gene:BL96878|Name=gene:BL96878|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=10183bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000007:2661575..2671757+ (Branchiostoma lanceolatum) CCAGAACCGAAAAGTTTAATTGTTGAGGCCTAAAAAGTTTAAATGTCCCG
CCCAACTTGTGAGGCGAAGTCGTGCGCTGATTGGTCCAATGGCTGATCAC
CACGTGACCAGCCCCAGCTGACAGGATCAGACGACAACAAGGACGGCCTG
AGGTACGGCTGGACATGCGGGCTGTCCGGCACGGCCTAGTGGTCACTCAG
GCCCGGCCGGGGGGACGGGACCTCCTCGGACGGAGCCAAGCGATGCTCCT
GGGCCTCGGGATTCTTCAGACCGTCCTCGGTTGTGCCGTGGTGTCTCTCA
GCTTCGCCGCGCTGGCCATGACCACCTACAGCCGTGTCCGGAACGCGTGT
CCTTACTGGGCTGGTTTCGCCGTAAGTAGTGACCACACAAGATGACCACT
GGCCTCTTTACAATACTACGTAGTATAAAATACGTCTTTAATTGTCAAAA
TTGCCACAGAACTGATTTTTGAACCCCCATGTACTAGCTATTAACGTTGA
TACCAATTTTCCAGAATGTATTTTTCCAGAATTCATTCGTAGAAACTCTT
AATCGTTTCGGCCCTTAAACCGATTTCTCTTTATTTGGATTCACGCAGAT
CTGTTGTCGATCTGTGTCCCATTTGCGTCTCTTTATTTCACAGTTCTTGA
CCCTGAATAAGACGTTTTTGTGTTGAGATATTTCCCAGTAGCGACAGTGT
TATAGAACGAACACAATGGCTACCTTATGACTAATATATATGACTGATCC
TATGATTCTGATCCCGAGGGACTCCATCTATTTGCATTTTTATGGATCCT
ATGCTAATGCTGAGGAGGGTTTAGCTGATTCTCTGCAACTATTATGTGAA
TGCATAGCTGTAAAGCTATGGAGATAGTTAATTGTAGAATTACCATATCA
AGAGAATTAAGCTTTTAAAACCCATTTCTGAATGAGGGAAATTGTTAATC
TCCAAGCAGATGTTGGAAGGAGAGATTGGTCGTCCAGAGATAGGAGAGAA
GGCTTGCATCAATAAATATCCCCAATTTGGCCAAGTAAATCTGGTCACCT
CTGTGCTTTTCGGTTTTAGTGTGCTGGGTTCTTTAGAAAAAAGATACCAA
TATTTAGATTTGTACTAGAAAACAAAAGAGCAGAATATTGATATTGTTGA
ATTACTGTTTGGCTTATTTTCTGCAACTGTTGTGTAAATGCGTACCTGTA
AAACTATGGAGGTATTTTGTTGTAGAATTATTTAGCATATCAACAGGATT
AGCTTGTTTTATCCACTTTAATGAGTACAATTAAATATGAATGAGAAAAG
AGATGGACCAGAAAGGATGGTTCAGATTACCTTTTAGTTACTATTTGTGC
AAATTTTTTGTTTCAATTCTTCATGATCTTGTGTCTTTCTAGCATAAATG
GTGCATTAGTATTTGTCATATCATATAGATATGGATATTTTTTTATTAGA
TGGCATCATGTGGCATTATACTTCTGGTGTTTAGCCAAGAGTTAAGGGTT
CAAACCCCCAACAGGCCCAGATGGTGTGCCCTAGGGAAAGGCACTTTTGA
TGAATTTCCCACTTGGGGTAGTAGGGTATGTTCCTGAGCAGCCTTTGTAA
CCCCTAGCCTCTACCAGGCCCCATCCTTTCGCTGGGAAAATAGTAGAAAT
CGGCCGAGGTAGTCCGCTATACAGGGTAGTCCGCTATACAGTGAAGCTCC
ATTATCGACTACCTCGGCCGATTTCTACTATTTTCCCAGCGAAAGGACGG
GGCCTGGTAGAGGCTATGTAACCCCTACCTCAGCCTGTGGTAGAATTATT
TTGTTATTTTCACACACAAAATGCTAGATTTGTGCTTCTATGCCACGATA
AGCAATTAAGTCATAGAATTAATACAGGTGTCTGTATTAATAATTTGTAT
TTTCCAAGAACCATAGTAGAATGGAACTCAATTCATCAAGTACTGTAGGA
GCATCTTCACTAAGTAGCTTTAAAGAACAGTTGCGGTCAGATATGCAAAG
ACTCTAGGTGTAACAGACCGTTCGGTGTAATATAACCAGCTGCTGCCATG
TCACGTACCTGCAAAGCTGGTGTGTTACGCCTAATGGCAGTTGTACCGGC
TATATAGATACAGATACAGAAGTCATAAAATCTGAGATGATGTACAAATT
TATTTTCTTGTTGTACAGGCCATGCTGTCAGGCGGGGTTGGGATGATAGC
CTGGAAGCAGCAGACTTCTCTGGCAGTAAGTACCTACATTCCTAGCCTCT
ACCAGGCTCCATCCTATCGTTGGGAAAATAGTAGAAATCAGCCAAGGTAC
TCCGCTATACAGGGTAGGTCCGCTATAAAGTAAAGTTCCATTTCGACCGT
CCATTGAAATGGAACTTTACTGTATAACGGACCCCAACGATTTTCCCAAC
GATAGAATGGAGCCTGGTAGAGGCTACAACATTCCCAGGACAGAAATCTT
TTGCCCTTCTATTCTAAAGACAATAAACAAAAGTCCCTATCAGACCTCAG
TAGAGAATTGAACTCTGGTCTCAATGTATGTGCACTGTGTGGCATAGTGA
TTACTAGTAGGGTGTTTTCCCCAGAAAACAGAGGTCCTGGGTTCGAATCC
CCTGATGTGCCATTGATGGCACATTGGAAAGGCACTTAACACGACTTTAC
CCACTCCACACAAGTGTAAAATTGGTACTCTCCAAGCAGAGGTTGGTGGG
GAAGATTGTGACCGTTTTATCATATGCCCCGTTTTTCGTCAGCTAAAACG
GGCATATGATAAAATGGTCACAATCTTCCCCACCAACCTCTGCTTGGAGA
GTATAAAAATGGGTACTTGACTTCGGTTGTGGAGTTTAAATGTGGTGGAA
GGAGAACTCTAATAAGTCATAACTTCCAATACCATGCCTTAGTGGATAAA
AAACACTTCCCCTATGGCCTTGAAAACGACTATGGGACTTCCTTTACCTT
TTTTCTACCTCGATGTACATAAAAAATCCTGGCAATTGTACCATGCAAGA
AAGACCATTTCAGAACAGGATCACAAAATATAAAATTCAAGCCATAATTT
TATTTTCTCCCCCCACCAGGTGAGTTTCTTTACGTTCCTGTCTGCTGTGT
GTGTGTTATTACACCTGGTGGCTGCTGTCCTGTCTGGGGAGAGTACATCT
CTGCTGACATCACTCAACTCCTGTCAGAACCTGGGCAAGGTCAGTACATA
ACAATGATATTGAGAAATATTACATGTTCATGTGTCTCAAGTGGTAGCGT
AACCCCGACGCTTGTCCATATTGATCAAATTTCTTGGATCGGTGGCCTGA
GTTCAATCCCATGGTCACCGTCAGCCCCAGCTTGGACATGTTAGGGATTG
CATTCATCATTTTAGATGGTGATGTAAAGCCAGCGGCCCCGTGTATGAGG
GAGCTTCAGGTGCCATGTAATATATTACATGTAACTTCTGCTTGTAAAGG
AACCCAACACACCTCAAGCCTCTGCATGTAAAAGAACTCAACACACTTAT
TCATTGAAATGAGTAGGGTCGGGGTGACCCAATGTGCTTGGCTAAAAACT
TGTGCTAGGCACTATCAGCTATTGAAAAAAGCATCACTCTTCATGTTCAT
TTTGATTTTGGCCACTTGACGGTAATTTACCGTAAAGTTAACTTTTTTTT
TCTTACCTTACATTACAAGACAATTGTATTTTTTTCTTCACGTTATTAAT
GTCTTGTAGAAGTGATAGCCAATAAGTACCAACTCAAAAAAGAACAAGGA
AGAATCATGATCATAACTACAAGAATCAGCCCAAAATCGTGTCATCAAGT
GCAGTGGAGGGCTTGAAATAGTTTAGGCATGACGAGCTGTTTTGTGTGAT
AAATATAAGCAACTGCTGTGTTCCCGTGAAACTGGTGGGTTAAAATCAAT
TTGAAAGCAGACTCTTGTTTGAAGAGTAGCGCTGGATTCACCATTCACCT
TGGAGTTTGTGTTCGTGTGTGTTTGCAGACATGTCAGTGTCTGCTAGGGG
GCACTGACATGACATGTTCGGGTATCCAGACCCTGCTGAAGGATCTGATG
TACGCCGTCTGTGGAACCAGCGTTGTGGCGTGTCTCGTCAGTGCGCTGTC
TGTAGCTGTAGGCTGTATGCACTTCATCAAGAGAGGGTCGCACCAGAGCG
TGAGTAGAACTTTCTCATAGCAATCTTGTCTTTTGTATTTAACACTCTCC
CTGCTGCCTAACCCTTCAACCAATAGCTATAGGGAACTAGAGTCAAGTTG
AGTTGCTACATATACTTCAGGTTTGCTATGTTAGTTTAGCGATTACGGGG
TCTTTTTATAAATATGAATTGGTATTGAATTTTTCTTTTCATTTGAGTTG
AATATGTAATGGTTGTGTGCCGATTTGTTAAAAATAGAGAGAATGCTAGC
GACCCCCCAAAACACCCCTCCCAATGAAATGGTATGGCTACACTGCGACG
TCACAAAATCAAGATGGCGGCCACCACACATGCCAACAGATTCAACAAAG
GTTTTGCTACGCAAACCTGTAATTGGGTGCCAAACGTAGATGTTAATCTA
ATCATTGATATTTTCTATGGTGCATTTATAGTCTTCTGTTATGTGGTACG
TTAACAAACAACCCACTACTGAGATGCCACCTTTTGAACACACAACTGCC
TTGATGGGGTGGGGGGGGTCTGGATCAGGGGTACCTGAGTATTCATACAA
ATTTTACGGGAGGTTAAAGACAGTGGAAAGAGAGGGTTGGGCCCTGCCTT
CCATTACCATGGCGTAGACACAGTGGATAACAACCCACTGCCCCTACAGC
CTCAAAAAGGCTATGAGACTACCTTTATCTTTTTTTAAATGTGCGAATCC
TTGCTCCAATTGACAGATGCTCTATGGACACAGCCTGGGGTCCCCAGTTC
TCCCCTCTGACTCATTGCGCACACCTCTGGAGGATGAGATGTTCCCAGTG
AACATGGTTCAGCCTGTTCCGCCCCCTCCTTACTCCCCTCCTGGCTGTTA
CATCTCACAACACGGAATTCTCAGGTCAGTTGTATCTTCAACTTACTGAA
TTTATATAAGTTTCAAATACATGTACATTGTACTGTAAATCTTGAAATGT
TTGCGGTGGTAGTCCAGTGGTTAGTGATTTTGCCTCTGGAACTAGAAGCC
TCAAGTTCAATCCTGGCTGTGTCGCTCACCCGACATGCACGCTATCGGAA
AGGGTCGCAGTCCTTAGGAAGGGACGTTAAGCTGTGGTCCACTGTTCATT
GTGCTTGTCAAAAAGAGCTAGGGAAATTTCCCCGGTACAATGAACCTGTA
AATACTGTACATGGCGTCTGTCTTCTCTGTCACGACCAGTGGAAGATTAG
CTCATCTGTTCATTGAGTTCATTTGAGCTAAACTGGTTCGAGATCACTTT
CCTTTCCATTCTCAAGCTTTTGCTGTGACCGCTTTCATGCAAATTCTTGA
CACGGGGAATATGTGTTTCCAGTGCATAACTGTACTGCAGTATTATTTCA
ACCCTAAACATAAAACACATTGAAAACCTCCATAGACCATCTACCATAAG
ACTAAGTCACCACAAAAATAAATAGATAAATTTGCAGTACATCTATCATT
TAGAATTGGGTCAGTTTTCAGGTAATTAAGATATTACAGGAAATTCAGAA
ACAGTAATGTTAGCCATCCGCCAGTCAGGTTTTACATTGCTCAATGCATG
ACCCTTGACCTCGATACAACTTGTTTCCCCAGTGAGGACCCCCCTCCCTA
CTCAGCTGTGGATCCCCTTGCCAGGATTACAGAGATTGGTGCACAGTGGA
CAACTGAGGCACAGCGCTCGGTGGTAAGCTGACATCACATTTATGATACA
TTTTGTCTGTGTATAATGATTATAGATTAGTTTATGTATTCAAGAATATA
AGATCTAACATCCTTAATTGTGGCAGATGTTTTTAATCTCATCTCATCTC
GTGGAAGGAAACTGGTAGGAAAGACCATTTTCAGGCAGACCCTTATAATT
ACTAGTCTAACTACAATGTATTTGACCATTGGGGCACCATAGAAGATCTG
GCAACCAGTTTTCTCCACCCTTCTTGGTTTTCTGTTCTTACTGTTTCACT
TATTTTCATGCCTGTCCATTCTCTGATATTATCCTTCCATGTTTTCTGTC
GCATACCTCTCTTTCTTCTTCCCTGGACAGTTCCTTGCATGATAGTTTTG
GCTAGTCTTGATGAACATGGCATATGGCCGTACCACTTCAGTTTTCTTTT
CTTTGTCTGGCTCATTCCCCGTCTTCGAGGATTAATGGGAAGGGCAGGCC
CTCTGATGGCTGAACAGTCCTATCCTGGAGAGGCATGCTCGCCCGCATCG
CTCGCAGATGAACTGGGCCTGGGCTGGTAGATTCTGAGCAGCCGTCTTTC
TCCTCCTTCGGCTCTCCTCTGCATGCTCCCTTCTTCTTTCTTTCTTTTCT
TTACTGGGGTATTAAAGGAGGCCTTCGTACAGACCGATGTTTTGCTTGAC
AAATGTTTATCATCTATATGATGTCTAAAATGTTGTTTCTTCTTATCTCC
ATGAAAAAAGGCTTTTTCATGGAGATACTGTTTTGCGTGCGTTTGCTTGT
TTGTGTGTATGTTTGTGTCACCGGATGCTTAAAGTCAGCATAACTGTAGA
ACATGTAGATGGATTGTAATGATATTTGGTATGTGGGTAGGTGTTGGGAG
GAGAAAGGTCAAGGTCGATTTTGGGCCCCCTGGTATGGGTCACTGGAACT
GCAATGGCCTATTTGTAAAAATCTTCTAAGGAGAATAACTGAAGAAAAAA
AGAAAAAAGAAAAAAAATTAAGGAACGACAGATTGTCATGTTATTTTTTG
TATATGTTAGGATGATGCGACCGGACTGAGCCCCAGTGTAGAAGGAGCCT
GTGGAACGCAGGCTGTCTCACATTCCGTGTTGGCAGTGTCTCACTCGGGA
ACTCTCAACAACATGCTGGACAGTCTACAACTGGCCTCCAGCTTTAACAA
CGGCCAGGCTTCACCCAATGCTAAGGTCAGCGTTCATGTATGTTAAGTCA
AACCTGTCTATAGTGACCACTCATGGCACTTGAAAAAAATGTTTATTGTA
GACAGGTCAGACACTATAGACAGGATTCTTAACCTTCTCTGTGCTGAAAT
AGCCTTTTGGCATCAAATTTGCATCATTTACTAGGTTAGGCAGTAAGGAG
AAATGCTTTGGACATTGGGAAATGTAATCTAAGGCCACACCAATTTAATT
TCTTGGTTAACAAATTTTTTTGTAAAATTTTAGCCGGAGGACATCATTGA
AACAGAGGGCTGGGGTAAAACTGTGTGGACCAAAGTACAAACTTTCTTCT
GAGATTCTGTTTTCATGTTGAATTTCCAATATAGCATTTTTTTAAGAATT
CCATTAACCAAGAAATTGAATTGGTGTGGCCTAAGGGACTACCAAAATTC
ATTAATCAATTCATATCTACATGTATGTCTAAGGCCCCACCGATAACTTA
TAGAAAAGTTTCCTTGATTCTCAGACCTTTTACAGAAAAAAGGAAGCAAG
AGTTTAAGATTAGCTCGAAAGAAAACTCAAATTTGACTGCTGGGTATGCT
TACTCCCTGAAACGGAAGCTGTCTGGTCATTTGATTAATCTTTTTCCTCT
ATTTTCATAACAGTTGATCTTCCAGTTCAGATTTATGTTAAATATGAGAA
TCAATTCGCCAACAAACTCAATCAGTGTGACCCGACAAGGAATTGTAGTT
TGTTGAAAGTGTTAGATTAAATGTGATTGAACATTTTACAGGAAACAACG
ACTTGTGAATCGGCTGAACTGCAGCGTGCTGTAGATATGAGTCTGGAGAG
CGTACTCCAGGCCTTCCACGAACAGACTCAACAGATGGACGGGACAGAAA
CAACCGTCAGACAGGAACCAACCAGGAACTTCAGACATGTACCTCACTTT
AACCTTCCTGATGCAACGCCAAGTCCACAGGGAGCGGCCAGCTTAGTGAG
AGAGAGCTCAGACTCAAACGTGCCACGCCTTGCAAGCAGAGTCAGGCAGG
ACTCTAAAAATAAGACTCAAGAGACAAGAGTGAGAAGTGATCCCAGGCTG
GGCTTGCTCAGAAGGCATGAAGAACCCCTCACAGAAGTTTCATCACTCAA
TGGCATTCAGGAGGACATCCATCCACACTGCAATACTGGTAGGAAAAGTA
AGGCAGAAAGACCGAAAACACTCAATCTATCTGGGAATGCGAAGCTTAGG
AAACACACTCATAGAAGTCATAAAAAGAGGCCCAGATCCTTGGTTGATGC
TAAAGACCTTAAAGACACAAAAGTCCTGGTTGCTCAGTTTCTGGAGCAGC
CGGTAGGAAACCTTCCCCCGGCCGTGCAGATTGTTGTGGAAAACATCAAG
TCTGTCATCCAGTCTGATGAGCACCACCTAGCAGAAGTGATGCACAGTGC
AAGTGTCCTTCAGGAAGTGGAAGTACGCCACTCCACCTACAGGTACAGCC
TGAGCTCCACAAGCTCCAGCAGCCACGTGTCCTCATCGGGCTCCGTTTAC
AGGACGGTGGAGGTTTCCAGTTCCACTGTCTGTAGGACAGGGGAGGTTTC
TCCATCTAGTGCTGTTAGTAGGACAGCTGAGGCTCCAGGTGCTGTGCCCA
GGACAGCTGAAGGGTTAGAGACAGCTGGAGATTGTTATAGGGAAACTGTG
CTGTAACGTGTACAGCAGATGTGTATCCATCTATAGCTAGTACAGTTTGT
AGGACAGCTGAGATTCCAGGTGCTATATGTCCGGGACAGCTGAAGGTCAA
TGTTGTATAGAGACAGCAGAAGACATTTACAGGGAGACTGCGCTGTGACA
GCAGATGTTTTTCCATCTAGTACTGTCTGTAGGACATCTAAGATTCCAGA
CGCTGTGCATAGGACAGCTGAAGGGCAGCATGTTTAGAGACAGCAGGACA
CATTTACAGGGAACTATGCTGTTACATTGACATTCAGGCTGACACGTCCC
CAAACCTTATCTATAGCAAACAAGCACATCTTCTGATCATTCCAGAAAAT
GGGGAAAGTACTTAACACAGAGTCAAGACTACATGCATGGTAAAAGATAT
ATGTAGTCATTATACTGGGACTGAAATATTTAACAATTAACCTCTTGCAT
CTGATGGTAGCTAAAGTAGCACGTGCTAGTGCAATTTATTATTGCAGCTC
AGTTACAGATTGCTCCTATGCTGTGCCTACTATCAGTATTATAGCTTTGT
TGCATTCATTGTAGCATTGTATCTATTCACTATTCCTATATTGTCATGAC
TTGTTATGCTATACCTGTCATTCTATAATCTACTGTATATATTACATATT
ACATTAATGAATTTGTCACTACTGTTAGCTGTCGGTGTAAATGGTGATGC
CATACGTTATATTATTGAACCATGAGAATTGATATCACTGAAACGCAATA
TACTATGTCATATATGTATAGTCATATTCTGTAAAACTATGTGAAAAAGC
CATATTCAACACTCTTCTGGGTTGATTTGTTGCAAGGATTTAATCTTATA
AGCCAGAGACTTTGCAATGGTAAAACATGCATCACTCATATTTTCATATG
CTAGGTAATACCTCAAAATCTTGGATTCAAAAGGAGTGGACTAGAAAAAA
TCAACTCATAGCTATGTGCATGTAATCTTATTAATGGGGATACATGAAAT
CTTGAACACATCTGTAGTTAAAAGACTTTTCAACGATTTATCTTGTATTA
GTACACTGAAGTGGTTACCCGTTTCATGACAGCAAAAGATACACATGTAT
ATATATCTACAGCAAACACAAGGAAACTGAAAAACAAACAAATTCCTCTT
CATGTAAACAACACAGAGGTGTTGAGATCAGGGACAACATCAGGGTTTAA
GGGTGAGTTTTGAGGTGTACGATGTGAATGTGATACCAGCCTTAATAATG
ATTCAGGCAAGAGAAAATGGACCAATGAAGAATGATCGATTGATGACAAT
AAAATTCTGGAACACAGAATTTGAAAGCTATGGTTTCGCATCTTTCAATG
TCTCTATGAAGTTTGGTATGATTGGTTAGTGGCCTTACTTCTCGCTCACT
GGGCGAAAACCCAAAGGTGACGGGTTCAAAACCCAAATTACTATCATTAA
CTTACTTGCTACTGGAAGGGCTTACTTGCCGTG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000007 | genome | Sc0000007:2661575..2671757 + |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | gff3_genes |
Gene id | BL96878 |
Biotype | protein_coding |
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