TCONS_00017932 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00017932
Unique NameTCONS_00017932
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3309

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00017932 ID=TCONS_00017932|Name=TCONS_00017932|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3309bp
CACAagtattttggtttaaatttacagaaaaattaCAAAGACGAACTAAA
TGAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGAT
TCAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATTGATAGTGAAGAAAAAGA
GCGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCAG
ATAAAAAGAAAGTTCAAATTCTTCCTTTGTTGGCACAGAGCTGTCTTTTA
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ttttgaattttctctcTACGACAGTAAAAGTATGAGAATTTTACTGTGGG
TAGGGTTGAATTTCTCTCCCGTTCAAGTCTCCAATAACAGGGATAGTGTA
AAAAAGGTCCTTGTTGTGAGACTTATATAGTGCTTTATTTTTAAAACCCA
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AGATTTACTGAATTTTATAAAGGAAAGCTATATAGACTTATCAAGTTACC
AAGGAGTTATACTAGGTATTAATCCTATCTCCCAACGAAAGATCCATCAA
TTCTCACCATAAATGGAGCCTCAACTATAATAGTCTTCACCCTCTCTTAG
TACAGGTTTTAGAAGGGTGTGACGGTTGGTGCGACGGTTGGGGCCAACCA
AAATAGACTTGGGAATAGCTTATACATTTTCTTATTCATGATCTATCAtg
tcataattttttttcctttgtGCTGCTTGTTTTGTTCTAATAAATGATGG
GAAAAAAGACTAGCAGACTAACAGGGCCATATTTTTAAGAGGTGCAAGAA
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AACTTGtttattttataaatctataaTTATTCTAAAATTGTAAATACATT
GAACTATAGTTTTAAATAAATAGCATGTAAATTTTGTAGCTTTCGAGCAC
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GCAAGATCAATCCCAGCTAATACCTCGAAAAATTGATCTAAAAGTTTATA
GTGGTTTCTCCAGCTTCTCAAATCAAGAATTAATAACTGGCCAACTTTAG
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TTTGAAGCATGTTTATACCAATAAACCCTACCCGAGATATATCGATTATG
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TATTGATGGTAGTTTTACTTGCATCCTTTGTGGAATGGTTACTGAGACGT
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tctTTTCCGAATCTGAATTAATTGTTATTGTTAATGATCGAGTGAATTTG
atttatataaaatataaaacagtTGAAGTTAAAGGAGTTGCCTGAACATT
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ATCTTTTAATCAAgatattctatcaaaatttcaaaatcttaaacgTTGTA
TAACCTATT
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00017932-protein

>TCONS_00017932-protein ID=TCONS_00017932-protein|Name=TCONS_00017932-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=321bp
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SVLTYISTSTIASAGIFGTVFPVFILSALEAKPHEECEYPLRLFSLVIWL
TNKLFLFRSPVKSKSSTETNK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000279:306998..314716+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00017932 ID=TCONS_00017932|Name=TCONS_00017932|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7719bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279:306998..314716+ (Clytia hemisphaerica)
CACAagtattttggtttaaatttacagaaaaattaCAAAGACGAACTAAA
TGAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGAT
TCAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATTGATAGTGAAGAAAAAGA
GCGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCAG
ATAAAAAGTAAGATGTTAATTCATAACATTATTTATTAAAACAAACGTTT
ATGAAAGATTTATCTGTTAATTTATAGAAGATATTTAGCCTTCATATAAT
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CTCTTTTGGTATGTCTAGAGTAAAATTCTATATTTTGAAGTAAATTGCAG
TtttgttatgactgtttttaaactttcaatCATGATAATATTATTGCCCT
gctttttgccagtagtggaaaatttaagctaaaaaaattagatgaaacag
aaattttttaaatagacaaaaaaaatcAGCTAAAAAAATCAGCCACGTCA
ATTGAATTGAataatttatttgaaatttcttttttttacttttaggtAAG
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TGTTTGTCTCATGTGAGTCTCATTGTTGAGTTATCGAGCAATTTAATAAG
AAACAGGATACCTTAAGTGAAAAAATCACCTCAACTTAAAGTCtatctgt
ctcaatataatttacagaggagacaaaaaaggctataaACTTTGATGAAA
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attttattgttttttgttaaTAAAAGTCATATTCAGTCATATTCAGTTCA
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TTTTCATTAGAGATAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATATNtttct
cgagctgtactttatattttttcatgaaattttgcacactgatgcaaaat
ggcaatacctaaaatatgacagagcctgattttcaataaacgtacttttc
cggccgaaaatgccggaaatatgccggaaaaacatNCTTTGGTCATATGT
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GtgtttattattgttttgaatttaaaaaaataagataGATTTGGAtaatc
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GACAAGGGCATCAAATTCTAAATTAAGTCTATAGCTTTTTTAACAACTTT
CAGACTGTTACAgtcttgtttaaaatttttgaaacttgtatttttttatt
ggacctaccccggtgggctgtaggtcctataaattaacctctgcNctatt
ccggctgaaaatgccggaaatatcccggaaatcgccgtttttgcagattt
tcatcggactttttccttatatttcgttgttttttcagacaaaaacatta
ttgatagcaatgcccaccatcaagcatgtttcaattttcaataaaattga
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cggaaagacagtgttacttgaatttctcgagctgtactttatattttttt
atgaaattttgcacactgacgcaatatgacaatacataaaatgtgacgga
gcctgattttcgaaaaacatttttttccggccgaaaatgccggaaatatg
ccggaaaaccgttNCAGTTTCACCAGAACTAGGCCTACTAGAAGGCAAAG
TAGGCCTTAAGAAATActaatttaaaacaaaacctttaaattcaaTCTTG
TTAAAATTGATCCTACAAAGATCAAACAATATTTTCTTCTCTTCTTCTTT
CAGCATTTTTCATTAGAGATAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATAT
GTAGAACCCGTCATGAAGTATACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTT
GTTTTGGTTAAGCAAAATTCTCAACTGTATATGGTTTGTTGTAAGTATTG
CGGtgtttattattgttttgaattaaaaaaaataagatagaTTTGGAtga
tcaagaacattttaatgtcATTTTTCACTTGACAGTTATTTGAAGTACAG
TTGAAAAGGGCATCAAATTCTAAATTAAGTCTATAGCTTTTTTAACAACT
TTCAGACTGTTACAgtcttgtttaaaatttttgaattttttttatttcct
tcaATTCAACGAGCTTCATGCGCAGATAAAAATCCTCAATAGTTAATTGC
ATTGATGAtccttctttttgattttttttatgttaAAATTGTTTTCCTCT
TTTTCAGGACACATTCTAAATAAGTTACCTTATTGTATTAATTTTGGTGG
ATTTAACTAAAATCCGCCAATGGTAATAATACACTTTAGGTAGAGGATGG
ACTGATGGTCTTACAAACtatttgatttttaaactttttattttcaggaa
atAGCAGATGGTGCGTACAGAAAGAAATACGGAAGACCAGTATCCTCTTT
GATTTCTTCAAAAGACaagtaatttaatttttttattaccaAAGGTTATT
GTCAGTATTTCTTTAAAAGAATAAAGGTTTCTAATAACTTTAGCCTCATA
GTggaggggggggtagaatctaccccGCGTTGATGTTCTTTTGTCTTTAT
TTcagagaaatatttttgaaacgaTTTGAAACTCTTTGACTTTTTATAAA
ATCTTAAGAGAAATTGTGCAGACTTTAGGGTCATGTAGGTAATCTAGATC
AGGTTTAAAGCCCACCACCCCCTTGTgctacaaaagtcaaaaaagcttga
gGTTAATAGGGTTTTTCTAAAAGCTATTGTTTTAACCAATTTAATGTTAC
AAACATTATGAGTGAAAAGAGACTCAATCAAAGCTTTAAATCTTGAATTT
GAATCTTGTATTGGTacaatgaaaaatgttttcccttGTTCAACTATTGA
CGTTGATGGTGTTCtatttacttttactttttacAGCATCTTCAAAGTGA
TCAGCAAGTCAATGGCAGACTTTTTGTTCAGTATTCTAGTAGAGATTTTC
TTCCTGATTCAAGTATGTATTCTTCTTCATCTAAAATGCCCAATCAGGGT
TGCTTTGCTTGACATTTGTGATTTTTGGTTTGGAGAAAGCAATTCAGGTC
AGACAATTTCCTGTCCTGTCTCTGATGAATTGTCATTCAATAAAAGCTTT
AAAGGAGGTATTTTTGTCTCAATTCAGCTAAATTCATTTAAGTATCAATA
TTTGGTCCAATTTGTTGTGTAAGCTTTGTTTCTTGTCCTGagaagaaaaa
gtaaaacaggagttgaatttgTTGGTAATTGgttgttaaagtcttttgat
ttagACTTTTTAGTATAACGCAAGATTGCTCTGAATATACTTACTACTAT
CAGTATcaaagatttctagccttctaatatacgaaaattgaatattacaa
tagcatacatctcctgtttctttatacctccatgcttaTTCTCTTCCACA
ATAAAGAGTAGGTCATTTTAAATGTATCTTAATGAattaagttaaaattt
tctcaatttctcTTTACTCTCTCCGTTTATTATGAAAAGAGAATTTACTT
TAGTGTGGTATCTAATTGGAATATTTTAAGGTGATCAGGGCTTGACTTTC
AATGAATTAGCAAACAAAAGCAAAGTTGCCAAACAAAATAGATCAAGCAC
TGATAGATCTTCATAAGTTATGACATCATTCACTAACCATGTTATGTTAA
CTtacttttaagttttttttttctaaatagtATTTATCATATTTTTAGGC
TCAATTGGTGGGGCTTATACCAGTGTTTGGCACCACTCTCTTATATGTTC
ACATGTCTCTCCTATACTCGCTATACGCATTTGAATACACTTGGTCAAAC
CTTGGGTGGACCGTTGTACGAAGAGTAGGTTTCATTGAAACTTATTGGCC
CTATTTCACTGGATTTGGTTTTCTCTTGTCTGTATTGACGTACATCTCAA
CATCAACAATAGCAAGGTAGTATTGGTTGGTATTCCGTATTGTTTGGTTT
AGTTTGTAACTGAAATGATTTGAAGTGACCTGCAGTTTTAACCCGcaaaa
aatcaagtttgaaGTGACCTGCAGTTTTAACCCACAAAAAATCAAGTATG
GTAGTGCCAATTTACCGTCTTCCTAAGTCAAACTTTCTCTttcgctgaaa
aacacaaatGCGTAAAACTGTCATTACATCGTTTGATAAGGCTAGTTTTA
GACAGTGTATAATTATCCTATTTTAAACTTTTCCTTTAGTGCTGNATTTG
ATAAGGCTAGTTTTAGACAGTGAATAATTATcctattttcaacttttcct
tTAGTGCTGGTATATTTGGTACTGTTTTCCCAGTATTTATTTTGAGTGCA
CTGGAAGCAAAGCCACACGAAGAATGGTAAAACATTATCACTCATgtata
ctttcaatttttttgcacaaGGTGTAAGAACTCTCCTGTTTATTAGGCTA
CAAAGCTTGCAAATGAAATAGATCTAAAACCTATACGTTAATCAGTCTat
catttcaacatttttctgtGTATCTAATAGCTGCACTATCTTCATTAATT
GCAGTTTTATATATTTACAGTGGGAACCTGATTCCGATTTAAACACACTA
AATTCTTTTCTCTTAGTTGGCTTAGTTCAGTATAAAAGAGCCAAGTTTTC
TCTGTTTCTCTCATTTTAGTGAATATCCACTGAGGTTGTTTTCATTGGTG
ATATGGCTGACAaacaaattgttcttattcagATCACCTGtcaaaagtaa
atcaagtaCTGAAACTAATAAATGACAACAATTGAAGAAGTGAATAACCC
AAGGgagtaattttgaattttctctcTACGACAGTAAAAGTATGAGAATT
TTACTGTGGGTAGGGTTGAATTTCTCTCCCGTTCAAGTCTCCAATAACAG
GGATAGTGTAAAAAAGGTCCTTGTTGTGAGACTTATATAGTGCTTTATTT
TTAAAACCCACCAAACAAATTGAAATTCGTGGtctatctttccaaaaaag
atgTTGCTCTAGATTTACTGAATTTTATAAAGGAAAGCTATATAGACTTA
TCAAGTTACCAAGGAGTTATACTAGGTATTAATCCTATCTCCCAACGAAA
GATCCATCAATTCTCACCATAAATGGAGCCTCAACTATAATAGTCTTCAC
CCTCTCTTAGTACAGGTTTTAGAAGGGTGTGACGGTTGGTGCGACGGTTG
GGGCCAACCAAAATAGACTTGGGAATAGCTTATACATTTTCTTATTCATG
ATCTATCAtgtcataattttttttcctttgtGCTGCTTGTTTTGTTCTAA
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GGTGCAAGAATTTGGTACTAAATTTTATTGATATTGTTAGTTTCTTAAGA
ATTTTTTGTGAACTTGtttattttataaatctataaTTATTCTAAAATTG
TAAATACATTGAACTATAGTTTTAAATAAATAGCATGTAAATTTTGTAGC
TTTCGAGCACTAAGCAGTACCTATGAAGTGTCACAGCCTCCAGCTCTTGC
ATAAGTTAGTGCAAGATCAATCCCAGCTAATACCTCGAAAAATTGATCTA
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CCAACTTTAGATTTAATCAccaaattaaatcaaaaatggCATATCTGTCA
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ATTATTGAACTTTGAACCAGAGCTATCAGTAAGCTTGCAAGCAGTATTGT
GGTATTTCTCTGTTTACAAACATGGGAAGACAGTCGGTCAAAATATGCTT
GGTACCGAATTGGTTGGGGTGAATGGTAGAAAAATCAATAATATTCAATG
TTACGGGCTTTTATTTGCTATATTTATACAATGGTTTAAAAATAGAGAAA
GTTTATGGGTGAAGTTGATGGATAAAATGGATTTGAACGGTACATCACTG
ATGAGAATATTTAAATATATAGAATCTTGTTCCGAGATTATAGTTTATGT
GAATATGTTGTTATTTTTGACGAGTGGAAATCATGTATCAGTTATTGAGA
GATGTTTAAATTTGAAGCATGTTTATACCAATAAACCCTACCCGAGATAT
ATCGATTATGATTACATACGTAAAGAAATGGTTTGGGATACGACAACAAA
GACGATGTTATGTTTACTGCCCttaattaatttcaaaaaaatttcatacc
ATTTGAACAGATTTTTTAATTCcaagaaattgattttaaaagatgATAAT
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AAATCCATACCAAGTTGGCTGTCCACACTGGTATTGTTATTATTGTTTGA
TGGCCAACTTTATTGATGGTAGTTTTACTTGCATCCTTTGTGGAATGGTT
ACTGAGACGTTCAAGCCAGTAATTTTTCAGAAAcgctaattttttgaaat
atttttgtattctTTTCCGAATCTGAATTAATTGTTATTGTTAATGATCG
AGTGAATTTGatttatataaaatataaaacagtTGAAGTTAAAGGAGTTG
CCTGAACATTGTCAcaaaagtggcatgaaactgccagtatcagaataaaa
aagtttttgtttttttctttctgactttaaaatataaaataatttttttt
aacgtTGGAGAAACTCGGGGGAAGGGGGTTCATCATTTAATCATAATGCC
TGTATATTTTGATgtattattttaaaaatgaattgTAATTtattatgaat
atttttttgacaTTCTTTATTAGCTTCCAAATTATTCTAGCCTTAACTGA
AATTGCTAAGATCTTTTAATCAAgatattctatcaaaatttcaaaatctt
aaacgTTGTATAACCTATT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000279:306998..314716+

>TCONS_00017932 ID=TCONS_00017932|Name=TCONS_00017932|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000279:306998..314716+ (Clytia hemisphaerica)
ATGAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGA
TTCAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATTGATAGTGAAGAAAAAG
AGCGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCA
GATAAAAAGAAAGTTCAAATTCTTCCTTTGTTGGCACAGAGCTGTCTTTT
AAATGGAGGTGCTCTTTTGgtAAGTGTTCTGGTATTTGAAGGATATATCA
TTCCTGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTCATCATTTTTCATTAGA
GATAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATATGTAGAACCCGTCATGAA
GTATACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTTGTTTTGGTTAAGCAAAA
TTCTCAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGATGGTGCGTACAGAAAG
AAATACGGAAGACCAGTATCCTCTTTGATTTCTTCAAAAGACaaCATCTT
CAAAGTGATCAGCAAGTCAATGGCAGACTTTTTGTTCAGTATTCTAGTAG
AGATTTTCTTCCTGATTCAAGCTCAATTGGTGGGGCTTATACCAGTGTTT
GGCACCACTCTCTTATATGTTCACATGTCTCTCCTATACTCGCTATACGC
ATTTGAATACACTTGGTCAAACCTTGGGTGGACCGTTGTACGAAGAGTAG
GTTTCATTGAAACTTATTGGCCCTATTTCACTGGATTTGGTTTTCTCTTG
TCTGTATTGACGTACATCTCAACATCAACAATAGCAAGTGCTGGTATATT
TGGTACTGTTTTCCCAGTATTTATTTTGAGTGCACTGGAAGCAAAGCCAC
ACGAAGAATGTGAATATCCACTGAGGTTGTTTTCATTGGTGATATGGCTG
ACAaacaaattgttcttattcagATCACCTGtcaaaagtaaatcaagtaC
TGAAACTAATAAATGAATGAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTT
TACTTGGTTTAAAAGATTCAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATT
GATAGTGAAGAAAAAGAGCGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTAC
AAGGCAAAGACAACCAGATAAAAAGAAAGTTCAAATTCTTCCTTTGTTGG
CACAGAGCTGTCTTTTAAATGGAGGTGCTCTTTTGgtAAGTGTTCTGGTA
TTTGAAGGATATATCATTCCTGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTC
ATCATTTTTCATTAGAGATAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATATG
TAGAACCCGTCATGAAGTATACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTTG
TTTTGGTTAAGCAAAATTCTCAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGA
TGGTGCGTACAGAAAGAAATACGGAAGACCAGTATCCTCTTTGATTTCTT
CAAAAGACaaCATCTTCAAAGTGATCAGCAAGTCAATGGCAGACTTTTTG
TTCAGTATTCTAGTAGAGATTTTCTTCCTGATTCAAGCTCAATTGGTGGG
GCTTATACCAGTGTTTGGCACCACTCTCTTATATGTTCACATGTCTCTCC
TATACTCGCTATACGCATTTGAATACACTTGGTCAAACCTTGGGTGGACC
GTTGTACGAAGAGTAGGTTTCATTGAAACTTATTGGCCCTATTTCACTGG
ATTTGGTTTTCTCTTGTCTGTATTGACGTACATCTCAACATCAACAATAG
CAAGTGCTGGTATATTTGGTACTGTTTTCCCAGTATTTATTTTGAGTGCA
CTGGAAGCAAAGCCACACGAAGAATGTGAATATCCACTGAGGTTGTTTTC
ATTGGTGATATGGCTGACAaacaaattgttcttattcagATCACCTGtca
aaagtaaatcaagtaCTGAAACTAATAAATGAATGAACACTATAGCTGAA
TTGTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGATTCAATTCTTGGTTTGAT
TGTCTTGACAAAGATTGATAGTGAAGAAAAAGAGCGAGATGGTAGACCTC
CAAGTAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCAGATAAAAAGAAAGTTCAA
ATTCTTCCTTTGTTGGCACAGAGCTGTCTTTTAAATGGAGGTGCTCTTTT
GgtAAGTGTTCTGGTATTTGAAGGATATATCATTCCTGCTGTCCAATACA
TTATGGTGTTTGTCTCATCATTTTTCATTAGAGATAATGGCTTACAAAGT
TCCCTTTGGTCATATGTAGAACCCGTCATGAAGTATACCTTTCAATATTT
GTGGGTTATTCCTTTGTTTTGGTTAAGCAAAATTCTCAACTGTATATGGT
TTGTTgaaatAGCAGATGGTGCGTACAGAAAGAAATACGGAAGACCAGTA
TCCTCTTTGATTTCTTCAAAAGACaaCATCTTCAAAGTGATCAGCAAGTC
AATGGCAGACTTTTTGTTCAGTATTCTAGTAGAGATTTTCTTCCTGATTC
AAGCTCAATTGGTGGGGCTTATACCAGTGTTTGGCACCACTCTCTTATAT
GTTCACATGTCTCTCCTATACTCGCTATACGCATTTGAATACACTTGGTC
AAACCTTGGGTGGACCGTTGTACGAAGAGTAGGTTTCATTGAAACTTATT
GGCCCTATTTCACTGGATTTGGTTTTCTCTTGTCTGTATTGACGTACATC
TCAACATCAACAATAGCAAGTGCTGGTATATTTGGTACTGTTTTCCCAGT
ATTTATTTTGAGTGCACTGGAAGCAAAGCCACACGAAGAATGTGAATATC
CACTGAGGTTGTTTTCATTGGTGATATGGCTGACAaacaaattgttctta
ttcagATCACCTGtcaaaagtaaatcaagtaCTGAAACTAATAAATGAAT
GAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGATT
CAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATTGATAGTGAAGAAAAAGAG
CGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCAGA
TAAAAAGAAAGTTCAAATTCTTCCTTTGTTGGCACAGAGCTGTCTTTTAA
ATGGAGGTGCTCTTTTGgtAAGTGTTCTGGTATTTGAAGGATATATCATT
CCTGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTCATCATTTTTCATTAGAGA
TAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATATGTAGAACCCGTCATGAAGT
ATACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTTGTTTTGGTTAAGCAAAATT
CTCAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGATGGTGCGTACAGAAAGAA
ATACGGAAGACCAGTATCCTCTTTGATTTCTTCAAAAGACaaCATCTTCA
AAGTGATCAGCAAGTCAATGGCAGACTTTTTGTTCAGTATTCTAGTAGAG
ATTTTCTTCCTGATTCAAGCTCAATTGGTGGGGCTTATACCAGTGTTTGG
CACCACTCTCTTATATGTTCACATGTCTCTCCTATACTCGCTATACGCAT
TTGAATACACTTGGTCAAACCTTGGGTGGACCGTTGTACGAAGAGTAGGT
TTCATTGAAACTTATTGGCCCTATTTCACTGGATTTGGTTTTCTCTTGTC
TGTATTGACGTACATCTCAACATCAACAATAGCAAGTGCTGGTATATTTG
GTACTGTTTTCCCAGTATTTATTTTGAGTGCACTGGAAGCAAAGCCACAC
GAAGAATGTGAATATCCACTGAGGTTGTTTTCATTGGTGATATGGCTGAC
AaacaaattgttcttattcagATCACCTGtcaaaagtaaatcaagtaCTG
AAACTAATAAATGAATGAACACTATAGCTGAATTGTTTTTGGGATGTTTA
CTTGGTTTAAAAGATTCAATTCTTGGTTTGATTGTCTTGACAAAGATTGA
TAGTGAAGAAAAAGAGCGAGATGGTAGACCTCCAAGTAGAAGAAGTACAA
GGCAAAGACAACCAGATAAAAAGAAAGTTCAAATTCTTCCTTTGTTGGCA
CAGAGCTGTCTTTTAAATGGAGGTGCTCTTTTGgtAAGTGTTCTGGTATT
TGAAGGATATATCATTCCTGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTCAT
CATTTTTCATTAGAGATAATGGCTTACAAAGTTCCCTTTGGTCATATGTA
GAACCCGTCATGAAGTATACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTTGTT
TTGGTTAAGCAAAATTCTCAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGATG
GTGCGTACAGAAAGAAATACGGAAGACCAGTATCCTCTTTGATTTCTTCA
AAAGACaaCATCTTCAAAGTGATCAGCAAGTCAATGGCAGACTTTTTGTT
CAGTATTCTAGTAGAGATTTTCTTCCTGATTCAAGCTCAATTGGTGGGGC
TTATACCAGTGTTTGGCACCACTCTCTTATATGTTCACATGTCTCTCCTA
TACTCGCTATACGCATTTGAATACACTTGGTCAAACCTTGGGTGGACCGT
TGTACGAAGAGTAGGTTTCATTGAAACTTATTGGCCCTATTTCACTGGAT
TTGGTTTTCTCTTGTCTGTATTGACGTACATCTCAACATCAACAATAGCA
AGTGCTGGTATATTTGGTACTGTTTTCCCAGTATTTATTTTGAGTGCACT
GGAAGCAAAGCCACACGAAGAATGTGAATATCCACTGAGGTTGTTTTCAT
TGGTGATATGGCTGACAaacaaattgttcttattcagATCACCTGtcaaa
agtaaatcaagtaCTGAAACTAATAAATGAATGAACACTATAGCTGAATT
GTTTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGATTCAATTCTTGGTTTGATTG
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GGAGGTGCTCTTTTGgtAAGTGTTCTGGTATTTGAAGGATATATCATTCC
TGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTCATCATTTTTCATTAGAGATA
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ACCTTTCAATATTTGTGGGTTATTCCTTTGTTTTGGTTAAGCAAAATTCT
CAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGATGGTGCGTACAGAAAGAAAT
ACGGAAGACCAGTATCCTCTTTGATTTCTTCAAAAGACaaCATCTTCAAA
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TTTCTTCCTGATTCAAGCTCAATTGGTGGGGCTTATACCAGTGTTTGGCA
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acaaattgttcttattcagATCACCTGtcaaaagtaaatcaagtaCTGAA
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AAGGATATATCATTCCTGCTGTCCAATACATTATGGTGTTTGTCTCATCA
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GGTTAAGCAAAATTCTCAACTGTATATGGTTTGTTgaaatAGCAGATGGT
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ATACCAGTGTTTGGCACCACTCTCTTATATGTTCACATGTCTCTCCTATA
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TTTTGGGATGTTTACTTGGTTTAAAAGATTCAATTCTTGGTTTGATTGTC
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TAGAAGAAGTACAAGGCAAAGACAACCAGATAAAAAGAAAGTTCAAATTC
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CTATTTCACTGGATTTGGTTTTCTCTTGTCTGTATTGACGTACATCTCAA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017932-proteinTCONS_00017932-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000279supercontigsc0000279:306998..314716 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00017932 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: EI24 (Etoposide-induced protein 2.4 homolog OS=Homo sapiens GN=EI24 PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 184.496 bits (467), Expect = 1.359e-50
Identity = 122/321 (38.01%), Postives = 180/321 (56.07%), Query Frame = 2 
Query:   89 GLKDSILGLIVLTKIDSE---------EKERDGXXXXXXXXXXXXXDKKKVQILPLLAQSCLLNGGALLVSVLVFEGYIIPAVQYIMVFVSSFFIRDNGLQSSLWSYVEPVMKYTFQYLWVIPLFWLSKILNCIWFVEIADGAYRKKYGRPVSSLISSKDNIFKVISKSMADFLFSILVEIFFLIQAQLVGLIPVF--GTTLLYVHMSLLYSLYAFEYTWSNLGWTVVRRVGFIETYWPYFTGFGFLLSVLTYISTSTIASAGIFGTVFPVFILSALEAK-PHEECEYPLRLFSLVIWLTNKLF----LFRSPVKSKSSTE 1003
            G+KDSI G+  ++K+D+           +        RR+    +  + + +I+  + Q C  NGG    S+L+F    IP +Q     V++  I D  L   +WS++E  +   F  LWV+PLF LSK++N IWF +IAD A+    GR        K + F  +SK +AD LF++L++  FLIQ   V L P+   G  +  +HMSLLYSLY FEY W N G  + +R+  IE  WPY+ GFG  L+ LT + +S I S  +F  +FP+FI+SA EAK P +   + LRLFSLV++L+N+LF      +S + S +S E
Sbjct:   15 GIKDSIWGICTISKLDARIQQKREEQRRRRASSVLAQRRAQSIERKQESEPRIVSRIFQCCAWNGGVFWFSLLLFYRVFIPVLQS----VTARIIGDPSLHGDVWSWLEFFLTSIFSALWVLPLFVLSKVVNAIWFQDIADLAFEVS-GR--------KPHPFPSVSKIIADMLFNLLLQALFLIQGMFVSLFPIHLVGQLVSLLHMSLLYSLYCFEYRWFNKGIEMHQRLSNIERNWPYYFGFGLPLAFLTAMQSSYIISGCLFSILFPLFIISANEAKTPGKAYLFQLRLFSLVVFLSNRLFHKTVYLQSALSSSTSAE 322
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00017932 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
EI241.359e-5038.01Etoposide-induced protein 2.4 homolog OS=Homo sapi... [more]
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