XLOC_043837 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043837
Unique NameXLOC_043837
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_55:5379..11112-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043837 ID=XLOC_043837|Name=XLOC_043837|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5734bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_55:5379..11112- (Clytia hemisphaerica)
AAGTAATTAAAAATGAGAATTGTTCGATTGAAAAGTTTTGTGGACTGGCT
ATTGCAAAGAAAAATGCAAGATAGACAGAGAGTCTTCTTAAAGGGCTCTC
TATCCTTATTTTTTAGGAATAGGAAATAGTAAAATTTTATTTCATTGTGG
ATGATTGGATTTCAACCGAAGAGAAGAAAAATGTTTTGGTGACAGGCTGT
GATTCTGGTTTTGGTTTTCAAACAGCTTTAGAATTAAGTGAATCTAATTG
TAAAGTTTTTGCTGGTTGTTTAACTCAAGATGGTGTCAAACGACTTGAGA
GCAATGCCAGGTTTCGAGGGATGGCTTTTATCATGGACGTGACTAAAGAC
GAGGATGTTCAGAAAGCAAAGGAGGTCATTGAAGAGAATGGAGGTATAAG
ACTTTTTTTTATTTAAGTGTTTCGTCAATGGCTACTTAACATACACTTAT
AGCTATCCGTCTGACTTTATGTCTCGTGTTTTATTATGTTATCAAAGATT
TGGGTATCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCAGTTGCTACGGCACTGTAACAT
CTGAATGTCTGTTGTTCTATCACTGTTGTATTTAATGACTATTTGTTGAT
CAAGAAATAAGTAATGTAGCATCTTTAATGGTAAATTTTATTGGTTGGTC
GTTAATACTTATTTGTCAGTGCGTTTTAGACATCAAGGATATGCCCTTGA
TAATACACTTGCATTACAAAATCATTGTGCAGGAAAGATTAACAATAAGA
AATTTAAACAAGCACAAAATGGCTGGGCTGAAAGAACTCAAAAATTAATA
AAGTGCCTCGAAATGCCTTCACAATATTTCAGTGAAATCTTTTTAGAAAT
CGATGAAATAGTATTCAAATTTATCATTCAAACTGACAGGAAAGTTGTCA
TCTTAAATACAGTTATATATACTTATAATTTTAATTTTGGCGAAAAACTA
TCAAAAATACCCCTAAAAGATATCCAAAATCAGTTCAAGTGTTTTATTGG
GTATTGTTAACCGGTTACTTTTTCAAAGCGGGCTACACGGCTTTTTGCGC
AATGCAATTGGTTCTTTTTCCATGAGGACGGGCCTACACTGTCCAGAGTT
GCCCGTCGTTAGGAAATTTCATTGTGACGTCACTTTTTCAATGGAAAATT
AACAATGCGCTAACATCGAGGTCCTGGAGTCACCGGAGACACTCACCTTT
CGTTAACACCACTGCTGACGCAGAAGTCACAAATTTCATTTGTAATATTT
AATTAAAGTTTTCAATAAGTTTTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTANNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATC
TAAAACAATGAATTAACTGGTTAGTGACAGTTAGTGAAAACTCTCTTTGT
GGGGAAAATTCTGTTGCGGTTCACAGAACTGTAATTTCAAACTTTTTAAG
CTGTAATAACCGACGTTATAACCGGAACACCTTGGCCAATATGAAGAATG
TTAACTCTTAAAATTTTGATTGTATTGAATATGGAATTAAACAATTGGAA
TCATTATCTTGAACTTGGTACTTGGAGATTTTCTTCCCCATGCATTTATA
ATGTGGAAAACTTTTTGTTCGTGGAGATTTTTTCCACTTGCGTTTTAAAC
GTGGAAACTTTTGTTGTGAATTTGGAGATTTTCTTCCCCGTGCATTTAAA
ACGTGGAAAACTTTGGTTGTGAATTTGTAGATTGTTTTCCATNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNAGGGTTTCAGTTTTCATGTTTGCCTTTTCTTTTTCCTCTTGGTCATTG
CTCACTGTTTTTCAGATTTTTCATCTTAAAATATATTTGATTTCTATTAT
ATGTATATCAAAATAAATTTGTGCTTTATCTTAAATGCGTTGACATCATT
TCTCTCATTTTTTATTTCTGACGTCAGAAATTATAACAATTTTTTATCTC
TTTTCGCTTGTTTTTTTTCGCTTTATTTCGCTATTTTTCCTTGATAAATA
AATCAATCGAAGCTGAAGGAAACGGTTAACAAATACAATAATGACCGGGT
TTTTCGGGCTGTACTGAAAATATTGACCTCGGGCAATATTTCTCAGTATA
GCCCTCACTAACCGGTCATTATTGTATTACAGATTCAAAGATATCTAGCA
ATAAAAAAGCTTTTTGTGAAGGAAAATAAAAGAAAAATTTCAAAACTATC
TACAAATAATAAACTGACAATCTTGATGTTCTTATAAAGCTCGGAGACAG
AGATAGAACAGCAATTAACTGAAAAGACAATGCGGTAGATATTCCAGCCG
CGGCTTTCTTATACTATGCTCTAAGCAATTTTTTCATGTGAAAGTTTTCA
TTTTTGTCTTGATTCGCGAAAGTCTATGCTCGCGAAATATATTTTCGTTG
AATTCGCGAAAGTAAATGTTGGAAATTTCGGAATTTTCCGACCTCGCAAA
GGTTTCTGCTCGGGAAAGTTTGCACGCCTAAAGTACCATGGATTGTAAAA
TCCACCCTACTGTAGCTAAATAAGAACAAGGTAAAGAACATTTTAAAGCT
TCGAGTAGTGCTGAAAAATGAGAACGGCCGAGCTTTAAACGATTATAATT
GTAGAACTTCAATTAGAATCCTGCCAAGATTGAGAGTTATACTGTGAATC
TTCCTTGATTTTCGTACAGCTTTGGACGGTATAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070381TCONS_00070381Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_55supercontigscaffold_55:5379..11112 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.79	0.18	0.64	0.87	0	0.38	0.23	1.93	1.05	1.12	2.19	1.84	4.88	4.67	6.1	7.66	4.38	4.75	10.45	11	7.38	8.91	7.99	11.67	15.61	16.55	3.73	3.66	28.59	17.28