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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:1004382..1023398+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1025.6.p1 ID=MSTRG.1025.6.p1|Name=MSTRG.1025.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19017bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1004382..1023398+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAATATTgtcttattttatcctaaagattttttgaagaaaattcatcTTA
AGTTTCACTTAATTcacaagttttttttcttcaatttttcttcttttttg
cttcttttgctttagttttcaaaaattaagggATCCTTCTTAGGGGGACT
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tcattttgaatttgtttttcaaaattttgtaaattttttggcTTCTGTTT
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TCTTCATCGAACCGGTGCTACAGGTTAGCTTCGTCAGTATCGCCATCTGT
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TGTGGTATTGCATCATGGCATCGCACTTTTCCCCGTGGCATCGCATCGTG
GCATCGCACTTTTCCCTGTGGCATCGCATCGTGGCATCGCACATTTCCCC
GTGGCTTCGCATCGTGGCATCGCACATTTCCCCGTGGCATCGCATCGTGG
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TGACATCGCATCGTGGCGGATTCTGCCCGGAACTTAGAATCGGACCGGGT
GGTGGTGGCCGGAAACTATTACGGAGTTTAGTATCGTGGCGCGGCGTCGC
ACTTTTCGTCGGCACTCTGGTCACGCACACTTGAAAGGAGGACAGTTATT
ATTACATAGGGAGTGCGTCCATGTAAAAGCGCGCcataaatattttactt
ttttttaagggCCAGATACAAAATGTATAACgcataatgcaaaaagcgta
acataaaatgaaaatgcataacggaaaatgcataataggaaaaaCTTTAC
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ACTGTAAATCTTAAAAACTGCaggttttaaaggtttttttttaagaatcg
aGAATATGAGATAGGAAATTTATACTTAAAGTATGAAAACTCGTTACGCA
TTATATACATTATCCATTTTGTAGACCTTTGTACTTTgcctttgaacacc
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ttcatgaaaatttttaatcgacataTTTGACTTGGCGTcgcagttttgtt
tggttgatgtttggtatcatgatcattaaaagcaatgaaatgccacacag
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aaaaaacattttacgagaaattgttgatataatttatattgacttatttt
tacaattttgacggtgtgggttttgttggttgataatgtttacactgtgg
gatggttttcaaaaaactgttatattgattgctGTTTGTTGGAATTTATT
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atcgaaaaaaaccgtgtggatggttgaaaaacgaaagtgaaactgtgaaa
acgtccgcaaattcgggcccagtcctcttcctaAACGGAGGCTAAAATGT
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GCCATGATACGATGTTACAGGGAAAAGTGCGATGCCATGATACGATGTTA
CGGGGAAAAGTGCGATGCCACGATGCGATGCCACGGGGAAATGTGCGATG
CCACGATGCGATGCCACGGGGAAATGTGCGATGCCATGATACGGTTTTAC
GGGGAAAAGTGCGATGCCACGATACGATTTTACGGGGAAAAGTGCGATGC
AACGATGCGATGCGCCACGGGGAAAAGTGCGATGCCATGATGCAATGCCA
CGGGGAAAATTACGATGCCACGATGCGATGCCACTGGGTGATGTCATGGG
GGCGACGCCACGACGACATGCCACGGTGCCGTGGTGCGATGTTACGGTGC
GACGATTTCGACTACAATATAACTTTATAAATAACTCAATAATAACATTG
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ctttgtttgttttgaaccTTAATAGGGTAGGCTGCTCTAATTCTATTTTC
CTTCTCTATTTTTCAGGTTATCGTTTCTTCCGTACTTCTTtgtttttcca
aacattttcacTGGTGTCCCTGCTCACTTATCTGCTTGTGTCCAGTCTCC
TGGACCGCTCAACTGTCCTCAATGCCATCATTTCTGTGGCCTCGGGTTTA
CTACTTGGCATTTTATCAATGTTTGTGACAACCATGGGGTTACTAATGAC
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ACATCTTCGAGactgtttcaaatgtttttgtgGCACCTTGTATATGTCTT
GTACTTTTCATCCTGTTATCTGTACCCTTGCTGAAATGGCAACGTGGATG
TGCTGTCATCTATATCTGCAGTTATGGTGCCATCTTAATGATGCTGGCTG
ttgattttttcattgatttgtCCATGTTACGGTTGATGGGTTACCAGAAT
ATTTTAGTGGTCAAACGAACAGTTCAACCATGCTGGTTTTCATGGTGTGT
CCTTGCATTGTGGCCCTTGATGTTGTTCGTAGGATGTATCGTACAGTTCT
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actTGTTTCAAGTCCAGggctcttaaaatactttccgtaattcgaacaaa
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attttgaaaggagTTTTTCTGAATGTGGTACCCGCATCGaaagcgctagg
tctacttcgCTGGCACAGTAGTGATGTAGCGTCGTTTGTCACGAGGCAAG
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ggaatgtaaagagatggaaaaacagcttcttgtaaacaatggaaaaacgg
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taggtttcttttgttgtcgctataaaaaatctgcataattagcgtgttgt
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atattttgggtacacctctcctatacgtaaaggtacctatatcttcttgc
tcagaatttcctagcgattctttTGATATAACCGCATTATGACCGCATCA
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ctcgaattctgacagttttacaagaaccaatttaatatcattgcgttaag
aatttcttttgctatacattagTAAAaatgctccttattcttaaaaattg
aactagtaatcggcaaaaaaggaaacacaaattttcatttttatcgtcaa
atcatgtagaaaccgtccgatttgtatggcgagccgtcttttctggactt
tcatttaatgacctaatcaacttttttacaatagaattttcaatagaagt
gatcgttgaactttgagtaatcagaaaaactgtttttccatctctttaca
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CATTGACCTATTATATACTCTGGACcgagctatatccgccatctttgatc
ggagtttttttgaaagtggcaCCCAAACCACGCCACGCCAAAGAAGCCAT
TACAttaaaaattaacatctaaCGGCGGCGCTACATAATCaaaaagtatt
cgaggaaaagtagtTCTAGTCTAGAGTTCTCGGTGCATTTACACCGTTAT
TGagtacgtttttttataagaacattcagactttttgagttttaacccta
aagattttcttaacatttcttattttcgccattttttgagtttcttgacc
attttcctaagaaatttggtgtttttggagtcagcaaagccttaaaatga
gcTTACCCAGCTGGTacataacgttgttttaacgttcaaacatgaacata
taaacgactggacatccatctcctttgtctttttgtagaaaaggctgcta
gcttcgttgccgcctcgttaaaagcataaaatgagaCAATagagattttg
atgatataccacttgggagtaccttgctaacaacatcaaaacttcgacaa
aactCTCTGTtattctactcttctcaagtcttttatctttatcataacaa
agataacagaggcaaaatcatcgtcagcttgtcaaaactccggctaatat
ttctaaattttgacttaaaagtgtctaataatctTAGAGTgtctttggca
agctatttttttcaagtcataaaataaattattggagtgacaaaaggaat
tcaaaagtatacacgcagttgaaattctgcattttagagttgaaaatgtt
gataaaatatataacaaacttgtgaaaaaattcgaaaataatttttttgt
acattaggagtaatgtttaAGCTCTATcgatccttttacctaaataattc
aaagaaataaaattatgacggaatattgtcggatttttcataccaatttt
gaaatacaggcggcaacgaagctcgcttcaaagagaccataaaagataga
tgtccagtcgtttatatgttcatggttcaaataacgttatgaatgtcaaa
tggacgttgtttctACGTTGTGTGCTGGCTGggtaacttgtttttaatat
tttggtcatcgaagccttatatagtttgttcttataaaaaaacgggTACT
ATTAGAGTACCActtaaaaaaactctgatcaagaTTTTGCTTGTCCGGAA
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AATCTCCGACGTTAAAATATTAATAAGGATTGAAAGTATGGTCTGTATTT
TTGATGGATCAAATATAATCATTTCTCATTGCTCATGCATGATAAGCAAA
CAGCCTCATAGAGGTATAGAttggttttaaacaaattaatcttttttctt
CGACTACTACATCGAAGATTGCCTCTAATATTTGGTAACTCTCGGGCGGG
AACTTTAGAAATTAGTTTCTCCctatatatcaaaacataaaagAGGGGAT
ACGTGCAGCCTAGGCTTAGCCTATATGGGAGCCCCCATCTCACTGTGACA
AACATTGTACATACTTTTGGTACTTCTATCAAGGGAGATAAGAAATAAAA
AGCaattatatttttgttgaaataccTTTCTCTGTACAATAATAACAAAA
TATCTCCACACACCATAAATCTTTACAAATTATTTCCAAAAAGATAAAAC
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GCTATATATAAATACCTCCTTCTCCTATATTATACCCTACAATACCAGTA
AAAATTCCCCCGCCATAATTTGTTCTCATCGCAAATTGCAACAGGTCTTT
CTTATAGCAGTTAGCTAAGACCAAAATTTAATGACAGGCGGAAACCACAA
TCTAACAGTCTtgtcaatttattttttcatactcGTAAATTTGTTtgtac
tttgaaatttttcgatGCCCTTTTACTATCATCAATAACAAAGAAGAGAG
TTCAACGATTTCAAATATCTTACAAAACGTTTGcatatataaataaataa
taaaaatatttgaatatttccaATCCCTCAAGCGGTCATTCTCATAACTT
TCATTTCTACCCATGCTTGAGTTCTGTAAAACAGCAAGGAAGACCAATCT
ACTTTGCTTGCCGCCTTTCCATTCTCACGTGTGTCGTAAAACCCGTTCAG
ATTGGATTCTGCGCATGCGTTATACCACCATGCTCCATGCAAGTCACGTG
CACAATTTTTGGTCGCATGGCGGTCATTATCTCGATCAAAGGTCGAGAAT
TCCATGTTGTCATGGTAACTCAACGAATCACCATTCCCAAAACTATATTT
AATGTGAAGTTTGTAGTTTGCCGCCTCGCTATCTATGGCAAAGTGTTTGT
AAAATGCCATATATTTCAAGTCCCAGGAATGTGGTGATTTCATAGTGATT
TTTAGTTCTGAGCCTTTTGGATATAACGCTTGTGTACTCAGTGCGTATAG
ATTCTCGTTGCCTATCCAAAATTCGCCTTGAAGTTTCCCGAAACCTTGCT
TGTACTGCTCCCATGAACGATAGAAATTGGTGCTTCCGTCCATACGTCGT
TGTATCACCGTCCAACCGTTGCCGTCGCAGAATACATTTGTGCTCCGTAA
GCCGTCCATTGTAACAGTGTAGATTCCGGCCACGTAGTTGCCCTTGAGGT
AGAATTCTTTACAATCTCGTTTCGGTGGTAAAGCACGACAATCACAATAG
TGCCGGTCAGGTATCGTCAAATCTTCCAAACATTGACATTTTCCGCATTT
ATTTTGAGCGCAATAACCTAAAGGTTTCTTTTCACGCTCTTTTAAGTCTG
TAATTTCTTTCTGAAGTTTTAACACCATCCTCTTAAGGTCATCGTTTGAA
ATAACAACTGCTGCAGTAGAAACCTGGGTAAATTGGAAGAGCAACCATGC
tccaaaatttattaaaatccaTGTTTGCATCATCCTTCCTACGTTTCCAA
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acaatttgaaaattttattagatACAGTGTGATACGCTCGACTTATATAG
TGATTGACACGTGAACACAATGACCCCCAAACTAAAGGCCGGGCTccact
tttttaaattatacAACGAATATATTATCTTAACTTATACAATAATAAAA
GCGTGAGGCATTTAGTTAATTCCACGCTTTTCAGCAATCATTTGGCTGAG
TTTCTGATAAAATTTTCTACATTCGCGTCCTTTACCTCCATTTGAACAGA
ATACGAGGGGCGTAAAGCTCCTATGCTCATCTGAATCACACGCTCAATCA
CAATCACacggccggtctccacttgtgtgcgctgcgatcgcactttatCT
TTCAAAGCTTCcgcgctattggtcaaaagtaaaatgaagcaattccattg
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aacggtgcgatcgcagcgcgcgtaAGCGGAGGccttaacaaaaacaaaaa
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GTTATAAAAACTCTGACTTACTATAAACCATCTTCTCCAACAACAGCATT
TCTTAAAATTGGACTCGTTTAACACTTTTAAGGAGCGAATCTTGAAGTAT
GATGTTTGTTGTTTAAATGTCAATTTCTGACTCGTCAACAACAATCTGTa
aacaaaaacatatttttccttCCTCACTTTGTTATCTTCCGATACGTACa
cgcctttttttataagaaccagtaaattttagCTAAGGCTCGGGTGTTCT
TATTCTCTCGTGATATTACTTTTggtattgacattttttaaatcgaCTTT
TTCATCGCAATTGCTGAAGTCTGAGGCTTAGATTTTTCTCAATTTGCTCT
TTAGATTTTGGTTAGAAAAataagcctcgtgttcttatgaaattgttctt
gtaaaaaaagcgtttttcCTATTACTGTTACAAGTTACTTTCAAGAAGAC
CTCATTGTGTCACGTCTACTGTCAAATATATGCAAACCACTTTATAAGGA
GAATTGCTGAATGAAGCTCTCTCCTCCACAAACACTTTGATTTATCCCTC
GCTGTTCTAGTTCTTTACTGCACATTCTCTTCTGTAATTTGCtgcctcaa
cagggggggggtcatgcagttactcCGTGACACTATGATGAGTGAATgcc
attttggaaaatttcttgtCACACCACCACCATCATTACTTACTCCACTG
TGGAGTAACTGTTGCTAAGTAACTAGTGCTCAAAAAGGGGTGCACCACCC
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tggtcaatttttttttggatttttgtatttaaaaGAATTGTTCGAATAAG
TTTATATACTTGGTTTAAGTCACTATCAAAGCATTACAcgatttatattt
tcataaatatgacaaaaaatttattttcatggaaaaatttcagatatttt
tccaaaaacaattcatcttttcttcgaaaaatttcaaatttttgacaaaa
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TGGagtaactgttttaaattttttcggtTGTTACACCACCACGTACTAAG
TGTAATAGTGTTCACAtagtaactgcatgaccccctcTGGCCTCAAActc
acaagtaatattgtattCGCTGGTTCTTGTCGACATTAGGGAGCggttat
atacacgttttttttatgagaacacccacaatttttgaagccttcggacg
ttcttaactttttgagcttcaagtctaaaaatattcttaacatgctctta
atttcaccattttgtgagtgtttttggcaattttcctaagaaatcgggtg
ttttagagtccacaaagccttaaaatgttcttaagttgttcttaacattt
tggctatcgaagccttatgttggtatatagtttcttcttataaaataaac
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CAAACCAATaaaaaaaccgataaaaaaacgtgtaaggcttcgattgccaa
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cTCCTTTCATCGAGTCTAAGATTTCATTTGATATATACTTTAATCAAAAA
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AATCGAGGTCCATTTAGACTTCCAGTTTCCAACATTCAATTCCCTTTAAT
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TACTAATTGCACTTGTCACTTTCTGTCATATCATCCTAGTATCATTTTCG
CACGCGCTTGTGCAACTTAGACAACAATTCGAACTTTcttctcttttaaa
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TTTCCCCATTCCCCCAGGAACTATCGGCCTCCAAAGATTATTCATAAAGA
GAAATCTTTGGCAGAGATCCTAACCAATTACCGTCAAATGTTACCCCTGA
TGACGTCAAGAGTTGGCCGTCAAACTATATATCGCCGAATAACGTCATTG
TGTGCTGCTTCCTGGCATTGACTTGGTACACCGTTGAATTTTTCATAGTG
ATATATGACAAAGTTTAGATTACTTCATTTTTGACAAAAGTCGTCTTTCT
AAAATCAATGTTTTACCTTTTTGATGTCAAACTTCTTTAAATCAGTTTAA
AGctaaaatttcaactttgaCTGTAAGCTTTCTGCCAATATTTCCGTCGA
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CAAAATACACCAAACCATCCTGTTGATTCAGAAGAACGACTCGCTTTAAC
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AACGTaaatctaacgttcacaacgccCACACAACGTCCACatgacgttag
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TTTCAGATAACCTTTCACTTTTCACCTTTCACTCACCACCATTTTAGACA
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CTACCTCATTTCCTGGTTGAGAAACTATATGTCTGACTGATCACCTATCA
CCATAcacttttctttataagaacatcctaaatatttgaagccttcggct
gttcttaactttttaagttttaggcctgaaaatgtttttaacatgttctt
attttaaccattttgtgatattttgatcattttcctaagaaaaactAGGT
ATTTTCTAGCacatgaagccttaaaaatttgttaacttgttcttaacatt
ttggttatcgaagccttatgttcttattaaaaaaacgtgtatagcaAAGA
TCATGTTCTTTCTCATCTACTGACCGCTTTTGCCGCCGTAATGGCCGCAC
TTTTAGCGGTGTTTTTCAAGGGCTGTTATAAAAGCCCGAAGATAGGTTCT
TTGCTGATATGTTTTATACTGCCGGgatgattaaaatttcaaaacttttg
gtattcataaggttaaatttttttccaacacTCTATCTTTCGTTGCGTTT
TTATCCTCGCGCAGTGTTCTTAATTGGCGATCTGTGTATCATGCTATTCC
CCCTGACAATAGATATCAGGTAATTCAACTATTGTTTAATAAAAAtgacc
tgaaaaaaaatttccttgtgCATTTTCGACGGAGTAGGTCCATGTTCTTG
TTAAAAATCTTGTGAATCaatcataaaatatttcttataataAATGAATG
TATCAGTGTGTGggaaaatctaattaaaaactATCTATTTAAGAATGTAT
CCATGTGAATTAAAGGAAATATACCTCACTATACGAGAGTCGTGCTCAGT
TTCCTTGACAAACAGGGAGTAAGCATTGAAACCATACAGATGTTTAATAT
TgtcaattcaaaatttgaaaatacatCTAACTGTCCCaaaaaaaCTGTGA
TGGTTATTCAATCAACATTCTTTATTTCGCAATTTATCGCGcttaagaaa
aaaagttaaaaccctCAGGAGAAGATAGCCGCTGAAATGAGGACTATAAA
GTAATTATGAATTTTTTCTGCACACACCCGCACCTTAGTTTATACTTAAA
TATTTTGGGTAACTTTAACATAGATATCACTCTAATTTAGTCTTCTCGAG
ATGGGAttagttcttttttttaaatttcgattttgataTCAAATTCCATA
CAATGGTAACTAAGCACGACgactttttggtattttagtatcTACCACAA
GAAAGTTTGAATTATTTCGGTATTCctccttcccagctggcacacgaagt
tgtttcaacgtttatctaacgttcataacgttcatataacgttagatgaa
cgttgaaacaacgtcgtggtTTGTGTGATGAGGTCAGAGACTTTATTTCT
AACACCACCCTGGTCGGGGCGCTCGTTGCCTTAACGCCCCCGCGTTGAAT
GGAGGAAATATGGTACCATGATAATAATGTTTTTTCCCATTCGTTTTAGA
ACCGCAATGGTACAAAAGAAGGAGTAATTCTGAACCAGGAGTTCGACTTC
TGTCCAGCAAAAGTGACGTCATAGCACAAGTGAGTGAatttttccctctc
aagattttattttgttatttgaaacttttttgtttactgtatgatgttgt
tgtatgttaGCCATGCATTGACGTGATGTACCATGAGCCAAAGACGTGAC
AAAGAATTCTTTCCTGCCTCGTGAGGCTGagaaaatgttttccttttACT
ACTGTATGGTTGAACCTCTTCTAAATTGAGGATCGTTGCCATAATATATA
TTAATCCTTAACAGCGCGGTCGGCCTTTCAGAGGAGTGGTGACGAGCTTA
AATTGTAAAATACTATCCCTGTTACGGGTGATAACATTGTCTAGTTTTGA
AATAAAGACATTCGAATCCGTATATACAGGGATACAGCAAAGGCATTATA
ATATTCTAGCCAGAAACAACAAGATGGGTAATTCCATTAGATTTCCCTAC
AGGGGATGGACGAaccttttgaagtcaaaaaatatttttttggaaatgtg
tagataatttgcaaaaaagcccttggaaaaattcattttaaaccTTTAAG
TTTAcgatggacgaactaaaatcagttttttacccactggaaattttgaa
ataattttttacctcctggaaaaatgaaaaaacactctAATTTTAGACTC
CCTGGAAATTTCACTcaaattaccccctggaaatgttcgtccacccctgt
ataaatataaaatggaatggcccaatctaATTCAAATGATGCAATAATGA
ATTTCAAGAGCTTTTGAACTGTATTTCAAGTATCTTGAGAGAGTTGTTTA
TCATCTCTTCAAAAATGTGGAGATATTGAAgtctttatcaaaataatttg
cgaCAGAGACAAGAAAGGCTCTCAAATTTGGATTAAATACCGGTTTTGTG
CTCATCGAAAAGATATTCATATGGGTACAATATTATCAAATATAGAAACT
TGAAAGATATACCCAACCAAAGCAACAAAAGACTCTCTAAGAGTTAACAa
gtcaaaaattgaaagaactttttaagggtagcttttccaaaaatgagttt
ttctGAGGATTGGGAGGTAACTAGTACCCATCGGGTTGCAAACCTAGGAC
AATCCTTCAAGAAGTCAATTCCtttcagtttttattttcattttcagttt
gatttgaaattgagTGACTCGTGCGGATATCTTCTAATTCTAACACTATC
AAAAACAGTTGCGTAGCGGCAGGAGGGTCAGGAGTGGCAAcccccccAGT
GGGCGATTTGGGGGAGCCGAAATACAATACCACCTCAAGCCTGATAAGTA
AATCTATCACAAAATAAGCGATTTTCATGATAGCGAGAATGGAGGTATTT
AGGGTGTATTTACCAAAAGGGCACCAAAATACGCTTGTCTCTAAAAAGCT
GAGACGCTTTCGTATAGAATTCCAAAGAACGAAACAAAGAACAAAGCAAT
TTGGATTCATTGATATCTGGCACTTGACCTTTCATCAACTACTTCATGGC
GATATCTTTTGAATATCAGCCAACtttgaattcaaaaataaaCTGGTGAa
caattttgttcaaaaagtattGCCAAGTGGTTTGTTTGTGTTTCTTTACC
CCTCCAAATGTATTCAATTAATCCTCACACAGTTACTCACTTTCGATAAC
CTCTAGAAATGTTTTCACTCAAATATTGggccattttatatccatattTC
CTAGGggtggtttttcatttttccaagggggtaaaagttattcttaaatt
tCCAGGGAGTTAAAGAATGATTTAAGTATGTCCACCCTCGCTTCAAGGTA
tggaaagaatttttccaagggtatttttgcaGATTTCGCCATTTACCGGG
GGGTATCCAcacttttttagtatttttttttgactttaaaaggctcgtcc
accccctgtatggttttttaatggaatagcccattccCTCCGTTATTCAA
TGATAATCCGTCCGTCAAAGGTTGGTTATAAGCGAGTTTATAAATTCGAA
TTAAATCGAGgggagacggtataaagcaaagttgacatgtctccaaaatc
accttccactttgctcgacgacggttaAAACagcaaaataccgtcgtctg
tttaggtgagcaaaggcgatatatagagccgtacatcgaTTATCGActtt
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AGCCATCAAGAATGGTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:1004382..1023398+ >MSTRG.1025.6.p1 ID=MSTRG.1025.6.p1|Name=MSTRG.1025.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3540bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1004382..1023398+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATCTGAACGCTCATTGGCCGATGGATATTGCGAACATTTTCGCTA
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TCACCAAGCACCTCCGACAAATATAATTACCAACATTCGGTCAACAATGA
AGATGAAGTCTTTCTTATGGAGGATACAACATCCGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:1004382..1023398 + |
|
