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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000004_pilon:1211837..1216330- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012463 ID=XLOC_012463|Name=XLOC_012463|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:1211837..1216330- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTACTAGAAGATGATGAAAAGACGCTGTTGAAACATGATGCATT
GCAAACCCAGGATGCATTGCAGGCAAGAGAAGCTGTATTAGATGTGAAGG
AGAAGTCCGCTCTCTTTTCTTCCATCGAACAATCAACGGAAAGCAATGGA
AATTGTTGTCAAAATAAAATGTGAGAGATTTATTTATCATTACCATTTGA
AATAACCAAGCTGATGATTCAAGTTAACTTATCGGCCAAAACTTAGTCGG
CCCTAAGTGACTACATTTTGACGAGCCGACTGAAATTAAGGCTGACTAAG
TTTTGGCCGATAAGGTATAGCAGCGCTGAAGCGGGTTTTTTTCGTCAACA
GGCGAAGACCTACGCTAGCTGCCGAATATCTGCAGATTTAATGCGTGATC
ATATTTCCAGTGGTCAAAGATCTTAACAGACCACCAAAAACCTGCAAAAC
TTACACATTTAAGAATCTAAATGCGAACAATTACCTTAGGTTTTTAAAAA
TCAAGTCAATTAAACTGTTTTTGTTATCAAACTATTGAAGGCCTTGTTTG
GTCTTCGTCTGTTGGTGGAAAAAAATCCGCAGCGCCGAGCTCACGCCACT
GTTTCGTGACAGTGGTAAAAAACGAAGAACTTTGAGTTTTGTGCCGAAAC
GAAGACAAAATTTTCCCGCTGTTTTCATTGAAATGAGACGCTTCTTTCAC
AGTCACCATTAGACTCGTGCTAGCATGCTATACAATGAAATAAAATCCCT
CTTATTATTTTATTTAAACTTAAATTTTACCCTTTTTACCATTGCTGCAC
TTGCAAACTTTGACCAATGCAACACTCACACTGAATTTAATTTGTCCTTT
TCAGGTTGCTTCTCAAAACGATAGTATCTGGACAAATCCTATCTTTAATG
TTGAGTGGTACGGGAACGGCCGCTACCGCATTAAGTGTTAAATACAAAGC
GGAAACACCCTCATTGAATGCTTTCTTCATGTATGTCATTCTCGCTTCGA
CTTTTGGTGTTTATGCTGCAACGAGAAAAGAATTTAAAACAATCGTTCGT
AAACATTGGTGGAAATACCTGATTGTAGCTATCCTTGATGTGGAAGCGAA
CTATTTGTTGACCAAGGCGTACACTTATACAACGCTAACAAGTGTGCAGG
TAAGGAGACTAATTGCATACAAATCCACGTACCACCTCTTTATTTCACTG
GCAGACACAATCGCAGTACAATCGCTATCAAAAATTCTGAAAAAGCGAAC
TTAGAGGTTGGGTATGAGCTTGGATTAATTGTTTCATCAAACTAAAGATA
CGATTTTCCTATGTATGGTATCTTAGTTTTACTGAGACGTTTTTTTTTTT
ACTGATAATGAGTTATTGTACTGGGTAATGGTTATCTGTTGATGCCAGGT
ACAAATTCTAGACCGCCATCCTATTGGTAATCTCTTTACTATCTGAGAGT
CTGAAATATCTTTTGTGAATATTATTTTTCCCAATATCATACTTAACTCT
TATCTCTCCAATAGCTATGTGACAGTTTCACCATTCCAACAACAATGGTT
ATCTCCTTTATATTTCTACGGATAAGATACAAAGTGATCCATTACATTGG
AGTGATTCTGTGTATTGGAGGCGCCGTTTGTTTGATTTTTACCGACGGAA
ATGACAAATCAAATAATGGTAAGAATATAATTTTGATAATTGAAATCTTA
ATCTATATTTCAATTAAATTCCCCGATTAGCTCGGCTAACACCTATCTCA
CGCATGGTAATATCTACCAAAGTTTCACGTTTGCTTTTCCTGAGACGTGC
GGGGCATTAATAGTTCTCATAAAAAGGGTGTTTTAAGAGATTAAAGCAGT
AGAATGTAGCCAGCGCATTCCCACAAATCAAATTTTTAAACGCAGTAAAA
AAAGCGTTTCTTGTCTAACAGGCTAGGTAGAATGTGGTTGAAAGTGATTT
TTTCCCAATCCCGAAGAATCTTTTCTGCCGAACTAGTGGTGGGAACTGTT
AGATTACCAATTTAGAAAAAAAACAAAACTTTTATTCTATTTCAGCGCGT
AACGAAATTTTAGGAGACGTAATTGCATTAACAGCAGCTGTTTTATATGG
TATTTCGAATGTGGGTCAAGAATATTTAGTGAAAAAGTATTCTGCTCAAA
TGTATCTCGGTATTGTTGGTATCGTAGGGTTTGTCATTACTGGCTTGCAA
ACGTAAGCATATTTTACAAACTGGAGCCCAGTTCCTTATGACGAGTTTGG
TGTAAATTCGATTATAATCAATAGAACATGGTATGGAAGCTGATATTGAT
CACATGATCAAAATCCACAAAATAAAATTCAACCAAAGTGTCCAAGTGAT
ATTAATCCAATATATAAGAATCCGTCTGTCATAAATTTTGAGGATCTGGT
TTGATTGGGACGGGCTAAAATATTAGGTGCTTTGGGTCAATAAATTTACA
TAAAAAAACAACAACTTATTATAACCTTTTCAATAGTTTTTAATGAATAT
CTTTTGATATTTTAGAGCAATCATAGAACGGAACGATATAGCGTCCATTG
ATTTCAAATGGCAAGTTGGTAAGTGACATCACAAAGTCATCGATTTGTGC
TTAAATCCTTAAAAACGAAGCCGGTTAATTTTGTTTAATCTAAGCTTTTG
AAAACGACAATAACTGAAGGCAAAAATTATAAACCATCCCTCCAATAAAA
ATGCGAAATTACGAAAGAAACAATTTCCTCTAAGAACTAAAGCCAACTCG
GTGTCACGGATGAGAAAAGTCACGCTGTTATCTAGATTCCCTAAGCTACC
CCTGTCTCACAGCCCTGGTGAATAACTTCTTCCCTCATTAGGATGAAAAT
GTCTATCAGGATCCCAATGGGGATTGTTCTTAGGTCAAATTATCCAGTGG
GGATGGTTTTTGAGTGTATATTTTTCGTTAAATTTTAAATTGGGATGAAA
AGAAATACAATATTCCAGTAGGACTGAAATTGGAGGGTATTTTTCCCACC
GGGACAAAATTTTGACTAATTCTGTTCTATGCTTTAATGGGATAAATTTT
CGCGGGGATTAATTTTCGCGGATTTCGCGGATTTGGGTGTCATCCGCGAA
AATAAGTCCCATTGGAAATTTGAAAAAGGCCCATCCGCGAAAATTAGTTT
CCGCGAAAAATTTGAATTTTTGTTGCAATCCGCGAAATTTCTATTTTTAT
CGTTTTTTATTTTTTTCAACTTTTGATAGTTGTAATACATATCTCCTCGC
CCTGTTCCAAAACACCCTCTTATTACTTGAAAAAAAATTCTTAATTTTCC
TGGAAAAATTTTATTTCAATGTTTTGACCCTTTTCAAAAAATTTAATTTG
TACCCCAATCCGCGAAATAAAATCCCGCGAAAAATCAGGAAATCCCTCAT
CCGCGAAAATTAATCCCCGCGAAATCTTAAAATTTCGCGGATGAGCTCAA
CCGCGAAATTTAATCCCCGCGAAAATTTATCCCATTAAAGTAGACAAATG
AGAATTTTCATAATCCCAGCTCATCAGTCCAGTCTAACTATATATTTTGA
ATTTTAGGCATGTTATATTTTGCATTTGCAATTTGTCAGTATTTCTACTA
CACGATGATGCCTGTTGTGATGAAATTGAGCAGCGCCACAGTGATGAATC
TATCCTTACTCACCTCTGACCTGTACACGCTTCTCATTGGTCTACTCATC
TTTGATTATCAGGTATGTAATAACGCCATCTTTTTTAATCAGTAAGTAAG
ACGTGCTTCTCCACATGGTGACGATAATATTGTGTGTTTTCTGAGTATAG
CTTTTGGCATTGTGACGCTTAAACTGACTTTTCTAAATTTTTAAAAAGTA
CACCAAAACAAGGGTATTAAATTAAGCATTTTAGTATTTTTGATGGGATT
TTTTTTTATAATTCTTTAAATAACTGATGATGTTAGAAGTTATTTTATGA
AGGGAAGTATCTTGTTCAAAATAGAAATATCAATATAATTGACTAAATTC
AAAAAGCTGTACCTCAAAGTTTAAGTTAGACTATCCTCCTTCTAATAAAA
GCATTGAGATCAATTAAATATTACATTTGACCTGGTTTGATTATTAAACG
TCCAAAGTATTTTTGCGAGTCACCCAGCAGTGAGTTGTGACTCTGTAGTA
AATGATTCTTACTTACACTTTTTTATTTTCTTTAGTTTTCAAATATGTAT
TTTGTGGCATTTGCTGGTATCCTCACTGGACTCATAACATATAATGTCCG
CCCACCACCTGCCGCCCCGCCCAAACGAAAGAAAAACACCTCAATGAGAA
TTGAAAACGGCGTCGATAAACCGAAAAATTGGACCGAGTCCTCCTTCAAA
GCTCAGAATGGTAATACGTTGTTTTTCTACAAAAATGAAAATGGAATCAA
TAATCATAACCACATCGGTAACGGTAATTTAAATAGTACCTCCTCATTGG
TTAATAATAGGACTGGACCGAATAGAGATTACTCAGGCTTATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000004_pilon:1211837..1216330- >XLOC_012463 ID=XLOC_012463|Name=XLOC_012463|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2586bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:1211837..1216330- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTACTAGAAGATGATGAAAAGACGCTGTTGAAACATGATGCATT
GCAAACCCAGGATGCATTGCAGGCAAGAGAAGCTGTATTAGATGTGAAGG
AGAAGTCCGCTCTCTTTTCTTCCATCGAACAATCAACGGAAAGCAATGGA
AATTGTTGTCAAAATAAAATATGATGGTACTAGAAGATGATGAAAAGACG
CTGTTGAAACATGATGCATTGCAAACCCAGGATGCATTGCAGGCAAGAGA
AGCTGTATTAGATGTGAAGGAGAAGTCCGCTCTCTTTTCTTCCATCGAAC
AATCAACGGAAAGCAATGGAAATTGTTGTCAAAATAAAATGTTGCTTCTC
AAAACGATAGTATCTGGACAAATCCTATCTTTAATGTTGAGTGGTACGGG
AACGGCCGCTACCGCATTAAGTGTTAAATACAAAGCGGAAACACCCTCAT
TGAATGCTTTCTTCATGTATGTCATTCTCGCTTCGACTTTTGGTGTTTAT
GCTGCAACGAGAAAAGAATTTAAAACAATCGTTCGTAAACATTGGTGGAA
ATACCTGATTGTAGCTATCCTTGATGTGGAAGCGAACTATTTGTTGACCA
AGGCGTACACTTATACAACGCTAACAAGTGTGCAGGTTGCTTCTCAAAAC
GATAGTATCTGGACAAATCCTATCTTTAATGTTGAGTGGTACGGGAACGG
CCGCTACCGCATTAAGTGTTAAATACAAAGCGGAAACACCCTCATTGAAT
GCTTTCTTCATGTATGTCATTCTCGCTTCGACTTTTGGTGTTTATGCTGC
AACGAGAAAAGAATTTAAAACAATCGTTCGTAAACATTGGTGGAAATACC
TGATTGTAGCTATCCTTGATGTGGAAGCGAACTATTTGTTGACCAAGGCG
TACACTTATACAACGCTAACAAGTGTGCAGCTATGTGACAGTTTCACCAT
TCCAACAACAATGGTTATCTCCTTTATATTTCTACGGATAAGATACAAAG
TGATCCATTACATTGGAGTGATTCTGTGTATTGGAGGCGCCGTTTGTTTG
ATTTTTACCGACGGAAATGACAAATCAAATAATGCTATGTGACAGTTTCA
CCATTCCAACAACAATGGTTATCTCCTTTATATTTCTACGGATAAGATAC
AAAGTGATCCATTACATTGGAGTGATTCTGTGTATTGGAGGCGCCGTTTG
TTTGATTTTTACCGACGGAAATGACAAATCAAATAATGCGCGTAACGAAA
TTTTAGGAGACGTAATTGCATTAACAGCAGCTGTTTTATATGGTATTTCG
AATGTGGGTCAAGAATATTTAGTGAAAAAGTATTCTGCTCAAATGTATCT
CGGTATTGTTGGTATCGTAGGGTTTGTCATTACTGGCTTGCAAACCGCGT
AACGAAATTTTAGGAGACGTAATTGCATTAACAGCAGCTGTTTTATATGG
TATTTCGAATGTGGGTCAAGAATATTTAGTGAAAAAGTATTCTGCTCAAA
TGTATCTCGGTATTGTTGGTATCGTAGGGTTTGTCATTACTGGCTTGCAA
ACAGCAATCATAGAACGGAACGATATAGCGTCCATTGATTTCAAATGGCA
AGTTGAGCAATCATAGAACGGAACGATATAGCGTCCATTGATTTCAAATG
GCAAGTTGGCATGTTATATTTTGCATTTGCAATTTGTCAGTATTTCTACT
ACACGATGATGCCTGTTGTGATGAAATTGAGCAGCGCCACAGTGATGAAT
CTATCCTTACTCACCTCTGACCTGTACACGCTTCTCATTGGTCTACTCAT
CTTTGATTATCAGGCATGTTATATTTTGCATTTGCAATTTGTCAGTATTT
CTACTACACGATGATGCCTGTTGTGATGAAATTGAGCAGCGCCACAGTGA
TGAATCTATCCTTACTCACCTCTGACCTGTACACGCTTCTCATTGGTCTA
CTCATCTTTGATTATCAGTTTTCAAATATGTATTTTGTGGCATTTGCTGG
TATCCTCACTGGACTCATAACATATAATGTCCGCCCACCACCTGCCGCCC
CGCCCAAACGAAAGAAAAACACCTCAATGAGAATTGAAAACGGCGTCGAT
AAACCGAAAAATTGGACCGAGTCCTCCTTCAAAGCTCAGAATGGTAATAC
GTTGTTTTTCTACAAAAATGAAAATGGAATCAATAATCATAACCACATCG
GTAACGGTAATTTAAATAGTACCTCCTCATTGGTTAATAATAGGACTGGA
CCGAATAGAGATTACTCAGGCTTATGATTTTCAAATATGTATTTTGTGGC
ATTTGCTGGTATCCTCACTGGACTCATAACATATAATGTCCGCCCACCAC
CTGCCGCCCCGCCCAAACGAAAGAAAAACACCTCAATGAGAATTGAAAAC
GGCGTCGATAAACCGAAAAATTGGACCGAGTCCTCCTTCAAAGCTCAGAA
TGGTAATACGTTGTTTTTCTACAAAAATGAAAATGGAATCAATAATCATA
ACCACATCGGTAACGGTAATTTAAATAGTACCTCCTCATTGGTTAATAAT
AGGACTGGACCGAATAGAGATTACTCAGGCTTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000004_pilon | genome | sc0000004_pilon:1211837..1216330 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 985-1293:310 |
| Aaloc | 832-984:936 |
| Aaloc | 778-828:1979 |
| Aaloc | 622-774:2448 |
| Aaloc | 466-618:2981 |
| Aaloc | 172-465:3640 |
| Aaloc | 1-168:4495 |
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