TCONS_00073084 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00073084
Unique NameTCONS_00073084
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1581

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00073084 ID=TCONS_00073084|Name=TCONS_00073084|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1581bp
tttcttttcaatatcatTGCAAGCCATTTTAAAACATAACGGTCCAAGTC
TCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCATCCCAATTTCTTCA
TTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTTTCAGGAGAAATAAT
TTGGTGAACAACTTCTGTAGTAGATAAATCAATTGCCATGTAAAATTCAG
GGTGAAATACATCCCTTGTGGTACAGTAAAATGGCATAACAAGGCGATCG
AACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTCAAGTCCCTATCTCTATATTCTAC
TGGTACTTTCACGCAGGGAATGaagttttttgtttcatttattGACAAAA
GAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAACTCTTAATTCAAGGTCCTCCAATTCG
CCATAACCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATGTTTAAGATCAACAAC
ATTAAACATCCACGATTCAATGTATTCTAAATCATACGAATATAAAAAAT
TACCAGAATAATCACATTCAAGGATCTTTAAGTTTATCATATCTTCACTA
TCTTCAATATaagaccttttaaagaaaaatattttgtccttAGTATATTC
CCTTCTCGCAAATACTGATCCACCAGCGGTTTCGAAATCTATAACCAATC
TTCTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCTTGATAAAATCCAGATAG
TTGTATTTCTCGTCCTGGTTACTCTCATAATACTTAGTAAAATAACTGCT
TATAAGTAAAGTGGGATTCTCGTGGCCAAGAAATTCTGCATATTTACAAG
TTATCGAGTTGAATAATTGATCATATGTCAAAGACAGATCTGGAGTGGAT
GCTtcgtcatcaatttttgaatCATGATGCTGCAAATCTCTATTTAAATC
AGCTTTAAGTGACTCTGGTGAACCATGTTCCCTGTTTAGATTTTGACTTT
GTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAGGTCTACTAGATTCATCG
TTCGAATCTTGATTGTACGAATCTTCAAAGATACTAGCCATAAAAGATAG
ATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGGATTATAAAATGTTG
GTGTTCTTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATTCAggaatttttaaATCT
TTACCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAAGTATAAAGATC
CATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGTTTGTATGATATGAA
CCAATACACCACTGGTtgaattgaaaacattttctcgGTGACATTCGAGT
TCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTGTGTACCCATTGGAATTC
TTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACAATATTTTCTTCCTTGTCTTCTT
GTAGGATCAAATAATATTTGCCAGTGTGGAAGAACCCTTGCGCATGCTCG
TTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAATTACCCAATAACAAAGG
TGGGATATCTTTATGTTTGTATTCTGGTGGGATGAACCATGATTTCTTAA
TGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_86:1389070..1402364-

Legend: exon
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>TCONS_00073084 ID=TCONS_00073084|Name=TCONS_00073084|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13295bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1389070..1402364- (Clytia hemisphaerica)
TTTCTTTTCAATATCATTGCAAGCCATTTTAAAACATAACGGTCCAAGTC
TCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCATCCCAATTTCTTCA
TTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTTTCAGGAGAAATAAT
TTGGTGAACAACTTCTGTAGTAGATAAATCAATTGCCATGTAAAATTCAG
GGTGAAATACATCCCTTGTGGTACAGTAAAATGGCATAACAAGGCGATCG
AACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTCAAGTCCCTATCTCTATATTCTAC
TGGTACTTTCACGCAGGGAATGAAGTTTTTTGTTTCATTTATTGACAAAA
GAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAACTCTTAATTCAAGGTCCTCCAATTCG
CCATAACCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATGTTTAAGATCAACAAC
ATTAAACATCCACGATTCAATGTATTCTAAATCATACGAATATAAAAAAT
TACCAGAATAATCACATTCAAGGATCTTTAAGTTCATTATTTCTTCACTA
NATTCAATGTATTCCAGATTATACGAATATAAAAAATTACCAGAATAATC
ACATTCGAGGATCTTTAGGTTCATTATATCTTCACTGTCTTCAATATAAG
ACCTTTTAAAGAAAAATATTTTGTCTTTAGTATATTCCCTTCTCGCAATT
ACTGATCCACCAACCGTATCGAAATCTAAGACCAATCTTTTCTCGTGACA
AAGTTGATCTTTTTGTATCTTGATAAAATCCAGATAGTTGTATCTCTCAT
CCTGGTTACTCTCATAATACGGAGTAAAATAACTGCTTATAAGTAAAGTG
GCATTCTCGTGGCCAAGAAATTTTGCATATTTACAAGTTATAGAGTTAAA
TAACTGATCATATGCCAAAGACAGATCTGGAGTGGATGCTTCGTCGTCAA
TCTTTGAATCTTGATGATGCAAATCTCTATTTAAATCAGCTTTAAGTGAC
TCTGATGAACCATGTTCCATGTTTAGATTTTGATTTTGTGATTCTGAGGG
CAATTCAAAAAACGATGTAGGTCTACTAGATTCATCGTTTGAATCTTGAT
CGTACGAATCTTCAAAGATACTAGTCATAAAAGATAGATCTGGTGAATTT
TGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGGATTATAAAATGTCGGTTTTCTTGGTGG
TGATTCTGGTTCAGTTGATTCAGGAATTTTTACATCTTTACCATTAAGCT
CGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAATTATAAAGATCCATTACAGTTTCT
NTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAAGTATAAAGATCCATTACAGTTT
CATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGTTTGTATGATATGAACCAATACACCA
CTGGTTGAATTGAAAACATTTTCTCGGTGACATTCGAGTTCAGTTTCTGG
TAATCTGATAATAATTCGACTGTGCAACCATTGGAATTCTTCTATATCGA
ATTTGATCACGTGAACGATATTTTCTTCATTTTCTTCTTGTAGGAACAAA
TAATATTTACCAGTGTGGAAGAGNAATCAATGGAATATGAATATAAAAAT
TTACCCGAGTAATCATATTCTAAGATTGTTGACTTAATGGTATTGTGTTT
GTTATCGATCCTTTCAAAATAGATCTTATGCTTGGTAAAATATCGAAAAA
CAAAAGAATTTTCCAACGGTCTGTCTAATTCTATTACCAGTCTTTTTTCT
TGCTTTATTTGATGTAGCTCGATGTTTAAAAAATCCAAACATAAACTTCG
ATATGATACGAGTGAAGGGTCGTTAGCTTCATCAACTGTTCGTTGAGAAA
ATGCTGAAATGATAAGTTTTATATTGTTTCCAATGATATCNTTCAGTGTC
ACAGTCAAAATAATACATCGGTGAAAAAGCGAAAAAAAATAGGCAAAATT
TGTACGTAAGGTGGAAAAGTGAAAATTTACGTATTCACACTCAAAAAGAT
TTTTGAATTCGAAAAGTTATGACGAAGGTTTTATAAAAACCAACATAAGG
ATTCGCTATTACGTTTTTCTATCTGCGTGTCCTAGCTGTCTGACTTTCGT
CCCTCGGACCCTTAGCAAATTCGCTTCCATCAATTGATGNAACCATAAAG
GTCGATAGTAAAATATTCCCTGTCGCTAGAATAACGTTCGATTGTATGAA
GAAGAAAACCAACATCTGGATAAAAACAAAGCTGCTCGTAATTATAATAT
CCAACGCAGGAACGAAGTTTAACGGTCACAATGCGTTGAAGAAATTTAGA
AAAACTTTTACAGAATTCGATAATATGAATACGCACAGTATCGGATANTT
TTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTC
CCAAATAGTCAAACAATATCGATGGCAAATCCGCTTCCATTAATTGATGA
TAATTGAACGATGTCAAAACTTTCAATTTANGGTCACAACGCGTTGAAGA
AATTTAGAATAACTTTTATAGAATTCGATAATATGAATACGCACGGTATC
GGTTTTTTTTGGATCTTCCTTAGCTAAAAAGTATTCACCAGTGTGGTAAA
ATCCCATCTCATCTTTATCAAATGGCTCAAATCCGATGAATAGTGGTTGT
ATATCCTTGGCTTTGAAGTCAGGTGGAATGAACCATGATTTCTTGTCGTC
AATCATCGCAATTTTTTTAATGTTTTTGATTTTAATGTTTTTTTGTAACT
GTAAAAGAATGACAAAATGTTATAATTCACAAGAAAGTACATGCAATTTT
ATCACGAGCTAAAGAAAAATGGTGGAATTATAGAAACTTGTAGTGATTTT
AACCAGATATTTTAACCGATTTCCTCAACTTAATTGGCCTTACTTTATAC
TTTCAATGCAGAGATATCTAACAAGGGTACTCCTACGCTTGTGTTCCTGA
TACCCGTCCGATGTTTGATAGGTGTTTGATAGTAAACATTGCTCAAAGAT
CTAACAAAACTTCAAAAGAAACAAAATATTTTTGGTACAATAGATAAAAT
ATAAAACTTTTTTGGAAATGAAAAATTATTAGAATTTATATTGATCTATG
TAATAGATATTGAAAAAATCTTCAATCTCTTTGGTAAAAACTGATAAAGG
CTTCACTGAATCTTAAATTGTCCCCTTATTTTAAAAATTTCCATTAAAAA
AAGCATTGTAACCATAAAATGTTTAACTACGCCTCATTACTCTGGTCAAT
GACCAATTGAGTTCCATACCTATAAAGATATAACAGTATAATGGTAAAAT
ATTCAATCTTACTAATTATTTCAAAGATTTCATTTTCCCTGTATAATGCT
ACAATTTTCACTTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATGTCCTTTTTTTT
TACAATAACTGCTAAGTTGAAAGCAATAAAGTTAGACAATTATTATATCA
CGTCGAGATACAACATGTCACAAAAAGCCCCTGGGGCTTGAAATAGGAAA
ATGATAGTTTATTGCTGAAACGTACTATAAACATCTAAGAACAACCCTGG
GGGGGGGGATACTAGGGCAAAATGGGTTACGGGGATGCGCCGCTGGTTAG
GGTACCTTTTTTAACCTCCAAGAGTCCCAGGTAGGGTTGCTAAAACACCA
AAATAGAAAAATCAGTCCCTCTTTTGGGAAAACTTGGGGAAAAAGTAGAA
AATTTTAAAACTTTGGAGAAATTTTGGAACTCCAGTCCCATTCAGAGTCA
CTTTTTTCGCAAATTTCGGCAAAATTTTTTAAAAAACGAGTCCCACGTAG
GGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCGCCCTGTCAGTCGACAAGGGTAG
TACCCCGTCCCCTGGGGAACAACCGAAACTTACGATTACTGATTTTTGTA
AGAAAATCTGGTAATTTATTCATTGGGTTTGATAATATAAAAATTATAAA
TTTTGTAAAATATCTGTCTTAATATAGCGGGTATAAAATAGTTTGGTAGA
GCGAAAATAAAAAAATGCAGTGTTTCCAGAATGCGGGTGGAGGAACAAAA
CTCTCATGCGGCCGAACGGGAAAAATTTTGTTTTGCTTTTTTTGATAACT
ATAAAGATCATTGAAATAGAACTTTAAAGATAACTTTTATTTATAAACAG
TATGAAGTCTTGAACACCAATGCATCGACTACTAACGAACAAAACTTGAT
TTACAAGCGAAAATATCTAACCAAACAGCGTTTGATAGTTTGAACGGTCA
GATTGATTTTCTTTACGATGAACCATATAGATGAACCCATAGTCTGCGGC
CGGGTCAGAATTTTTTTTTTTTCACCCGGCCGGTTTCGTGAAACACTACA
TTTTTATATTTTTGCCTAGATATAAATTTTTTAACGGGAAGGATACAAAA
CTATCAATATTAATAATGTTCGCTTCATATTAGGTGATTTTGATGAATTT
CCTTATTGTTTTTCCTCCATTTTTCAAATGTTTTTCAAATATTAGTGGAA
AATGTATTTGTATTCAGTAAGCAACTAGTTTTCAATCCCCAAATAATTAA
ATAAGGAAGATGGAAGATTTGCTTTAAATAATTCATTATAAGTAAACGAT
GTTAAAACAGCAAATCTTGCCAAATATTTCAAAGATTTCATTTCTTCTTT
CCTTTCAATATTATTGCAAGCCATTTTAAAACATAACGGTCCAAGTCTCG
TAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCATCCCAATTTCTTCATTG
TTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTTTCAGGAGAAATAATTTG
GTGAACAACTTCTATAGTAGATAAATCAATTGCCATGTAAAATTCAGGGT
GAAATACATCCTTTGTGGCACAGTAAAGTGGCATAACAAGGCGATCGAAC
TTCTTGATAGGGGCACGCACTCTGAAGTCCCTTCCTCTATATTCTACTGG
TACCTTCACAGAGAGAATGAAGTTTTTTGTTTCATTTATTGACAAACGAA
CCCCATTCTCCAGTTTTAAAGCTCTTAATTCAAGGTCCTCTAATTCGCCA
TAGCCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATGTTTAAGATCAACAACATT
AAACAACATCCACGATTCAATGTATTCCAAATCATACGAATATAAGAAAT
TACCGGAATAATCACATTCAATGATCTTTAGGTTTATCATATCTTCACTA
TCTTCAATATAAGACCTTTTAAAGAAAAATATTTTGTCCTTAGTATATTC
CCTTCTCGCAAATACTGATCCACCAGCGGTTTCGAAATCTATAACCAATC
TTCTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCTTGATAAAATCCAGATAG
TTGTATTTCTCGTCCTGGTTACTCTCATAATACTTAGTAAAATAACTGCT
TATAAGTAAAGTGGGATTCTCGTGGCCAAGAAATTCTGCATATTTACAAG
TTATCGAGTTGAATAATTGATCATATGTCAAAGACAGATCTGGAGTGGAT
GCTTCGTCATCAATTTTTGAATCATGATGCTGCAAATCTCTATTTAAATC
AGCTTTAAGTGACTCTGGTGAACCATGTTCCCTGTTTAGATTTTGACTTT
GTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAGGTCTACTAGATTCATCG
TTCGAATCTTGATTGTACGAATCTTCAAAGATACTAGCCATAAAAGATAG
ATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGGATTATAAAATGTTG
GTGTTCTTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATTCAGGAATTTTTAAATCT
TTGCCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAATTATAAAGATC
CATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGTTTGTATGATATGAA
CCAATACACCACTGGTTGAATTGAAAACATTTTCTCGGTGACCATCTAGT
TCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTGTGTACCCATTGGAATTC
TTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACGATATTTTCTTCCTTTTCTTCTT
GTAGGATCAAATAATATTTACCAGTGTGGAAGAACCCTTGCGCATGCTCG
TTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAATTACCCAATAACAAAGG
TGGAATATCTCTATTTTCGTATTCACGTGGAATGAACCATGATTTCTTAA
TGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTTACCTTAAAAATAGAGGAAA
GTGATATTGAATTCAATGTTCAGTGTCACAGTCAAAATAATACATCGGTG
AAAAAGCGAAAAAAAATAGGCAAAATTTGTACGTAAGGTGGAAAAGTGAA
AATTTACGTATTCACACTCAAAAAGATTTTTTAATTCGAAAAGTTATGAC
GAAGGTTTTATAAAAACCAACATAAGGATTCGCTATCACGTTTTTCTATC
TGCGTGTCCTAGCTGTCTGACTTTCGTCCCTCGGACCCTTAGCAAATTCG
CTTCCATCAATTGATGATAATTTAATGATGTAAAAACTTTCATTTTGTTA
AATTTTTCAAATTAACCTTCATGTAATCTTACGATTTTCACTTTTCATTC
CCAAGCCAAATAGATATTCCTCATCGTTTAAAGAAATCATTATTGCAATT
TCTTCGTTGTTCCAATTCAAGGAAACAGCTTGAATAAAATTCTGTATTTT
TAATGAATTTAAAAGATGAAAAATTTCCTAATTTGAATTAAATTATTACT
GACGGAATTTTGTATACCACTATGGAATCCGACCATATCTCCCCCTGGAA
CGAAAATAAGCCACCTCAACAGGGACTATGAGGTTTTCCTGAAAAAGTTC
ATACCGTCTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATAGTCAAAC
AATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGT
CAAAACTTTCAATTTGTTAAATTTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAAC
TTACAATTTTCATTTTTCAATTTCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGCA
AATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAAT
TTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCAT
TTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATC
AATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTC
AATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAA
TAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATT
GAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTT
CTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATAT
CGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAA
CTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACA
ATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCG
CTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTA
AAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAA
TTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGA
TGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAA
TTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCA
AACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGA
TGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTA
AACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGG
TAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCA
ATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTC
ATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCA
TCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTT
TCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCA
AATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAA
TTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCC
TTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAAT
ATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAA
AACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTA
CAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATC
CGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGT
TAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTC
AATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATT
GATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATA
AATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGT
CAAACAATATCGATGGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTGAAC
GATGTCAAAACTTTCAATTTGTCAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGT
AAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATGTTGAT
GGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTCAACGATGTCAAAACAGC
AAATCTTGCCAAATGTTTCAAAGATTTGNTTTGTCAAATTTTTCAATAAA
TTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATAGTC
AAACAATATCGATGGCAAATTTGCTTCCATTAATTGATGATAATTGAACC
ATGTCAAAACTTTCAATTTGTCAAATTTTTCAATAAATTATCCTTCGTGT
AATCTTACGATTTTCATTTTTCTATGCCCAAATAGTCAAACAATGTTGAT
GGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTGAACGATGTCAAAACAGC
AAATCTTGCCAAATGTTTCAAAGATTTTACACTACCGTTCCCTTCAACAG
TATCATTGCGTGCAATTTGAAATACGAATTCCTCATCGTTTAAAGAAATC
ATTGCAATTTCTTTGTTGTTCCAATTCAAGGAAACAGCCTGAATATCGTC
ATCTTCAGTCATAATTTGTCTTTGAGACTTACGTGTAATTTTCATGTTTG
TTAAATCCAGAGTCATATATACCCCGTGGACATCGTCCCTTAATAAAGCT
GGTAATACAGTATGATTGAATCTTTTAATTGGATCATTTAATGCGACTGA
TTTGTACATAACTCCGTCCTCTTTCGGAAATATAATATTTTTAACTTCTT
TAACAATCTCAGCTTTACCTCTTTCCAATTTCATAACTCGTATTTCAAGA
TCCTCAGGTTTAGTTTTTCTGGGGTAAAAATATAAAAATATTAAGTTTGA
ATTTCTAATACATTCGAAATGCTTTACAAATGAATCGGAATAATCAATGG
AATATGAATATAAAAATTTACCCGAGTAATCATATTCTAAGATTGTTGAC
TTAATGGTATTGTGTTTGTTATCGATCCTTTCAAAATAGATCTTATGCTT
GGTAAAATATCGAAAAACAAAAGAATTTTCCAACGGTCTGTCTAATTCTA
TTACCAGTCTTTTTTCTTGCTTTATTTGATGTAGCTCGATGTTTAAAAAA
TCCAAACATAAACATCGATATGATACGAGTGAAGGGCCGTTAGCTTCATC
AACTGTTCGTTGAGAAAATGCTGAAATGATAAGTTTTATATTGTTTCCAA
TGATATTATGGTTGTGATAACTTAGAAATCTAAATTCACTGGCACACGTC
AGACTTAAATCAGGAGAGGGTTTAAGATCCATACACAATTCAATGTTGTT
CCGGTTCTTTTCAAACCAATTAATAATGTGATAACCATAAAGGTCGATAG
TAAAATATTCCCTGTCGCTAGAATAACGTTCGATTGTATGAAGAAGAAAA
CCAACATCTGGATAAAAACAAAGCTGCTCGTAATTATAATATCCAACGCA
GGAACGAAGTTTAACGGTCACAACGCGTTGAAGAAATTTAGAATAACTTT
TATAGAATTCGATAATATGAATACGCACGGTATCGGTTTTTTTTGGATCT
TCCTTAGCTAAAAAGTATTCACCAGTGTGGTAAAATCCCATCTCATCTTT
ATCAAATGGCTCAAATCCGATGAATAGTGGTTGTATATCCTTGGCTTTGA
AGTCAGGTGGAATGAACCATGATTTCTTGTCGTCAATCATCGTAATTCTT
TTAATGTTTTTGGTTTTAATATTTTTTTGTACCTGTAAAAGAAGGACATT
AAATGTTATAATTCACAAGAAAGTACACGCAATTTTATCACGAGCATAAA
GAAAAATGATGGAATTGCAGAAAATTGTAGTGTCCTTCAGATTCAAAGCC
AAAATACTGATTGCGCAATGATAATGGTGGCATATCCAGTTTGATTCGTC
TGTAGAAAGAAGTTATCATTTAAGCCTCCATTTTTTACAATAACTGCTAG
TCGAAAGCAATAAAATTAGACCATTATTATATCACAGCGAGATACAACAT
GTCACAAAACCTGGGGCCTGTTAAATAGGAAAATGACAGTTTATTGCTAA
AACGTACTAAAACATCTAGGAACAACCCGGGAGGGGGGGGTACAAGGGCA
AAATGGGTCAATCAGAAAAATCTGCCCCTCGTAAGGGTGCCTTTTTTGGA
AAATTTGGGGAAAAAGTGAAAAATTTGAGAACATTTCTGAATTTCAGTCC
TATTTAGAGTCACTTTTTCGCAAATTTCGGCAAAATTAAAAAAAAAACGA
GTCCCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCACCCCCATCGGT
CAGCAAGGGTAGTACACCACCCGGGGAACAACCGAAACTTACAATCACTG
ATTTTTGTAAGATAATCTGGGAATTCATTCATTGAGTTTGATAAAATAAA
AAATTATAAATTCTGTAAAATAGTTATCCTAATTATAAATATATAATATA
GTATAAAAAAGTTTGATAGAATCTTATAAAATTTCGTAAAGGGAAGGATA
CAAAACTATCAATATTAATAATGTTCGCTTCATATTATTTCCAATGTTTT
TCAAATATTGGTGGAAAATGTATTCAGTAAGTAACTAGTTTTTNCGCTTC
ATATTAGGTGATTTTGATGAATTTCCTTTTTGTTTTCCTCCATTTTTCCA
ATGTTTTTCAAATATTGGTGGAAAATGTATTCAGTAAACAACTAGTTTTC
AATCCCCAAATAATTAAATAATGAAGATGGAAGATTTGCTTTAAATAATT
CATTATAAGTAAACGATGTCAAAACAGCAAATCTTGACAAATATTTCAAA
GATTTAATTTTTTCTTTCTTTTCAATATCATTGCAAGCCATTTTAAAACA
TAACGGTCCAAGTCTCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCA
TCCCAATTTCTTCATTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTT
TCAGGAGAAATAATTTGGTGAACAACTTCTGTAGTAGATAAATCAATTGC
CATGTAAAATTCAGGGTGAAATACATCCCTTGTGGTACAGTAAAATGGCA
TAACAAGACGATCGAACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTCAAGTCCCTA
TCTCTATATTCTACTGGTACTTTCACACAGGGAATGAAGTTTTTTGTTTC
ATTTATTGACAAAACAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAACTCGTAATTCAA
GGTCCTCCAATTCGCCATAACCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATAT
TTAAGATCAACAACATTAAACATCCACGATTCAATGTATTCCAGATTATA
CGAATATAAAAAATTACCAGAATAATCACATTCGAGGATCTTTAAGTTCA
TTATATATTCACTGTCTTCAATATAAGACCTTTTAAAGAAAAATATTTTG
TCTTTAGTATATTCCCTTCTCGCAATTACTGATCCACCAACCGTATCGAA
ATCTAAGACCAATCTTTTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCTTGA
TAAAATCCAGATAGTTGTATCTCTCATCCTGGTTACTCTCATAATACGGA
GTAAAATAACTGCTTATAAGTAAAGTGGCATTCTCGTGGCCAAGAAATTT
TGCATATTTACAAGTTATAGAGTTGAATAATTGATCATATGCCAAAGACA
GATCTGGAGTGGATGCTTCGTCGTCAATCTTTGAATCTAGATGATGCAAA
TCTCTATTTAAATCAGCTTTAAGTGACTCTGATGAACCATGTTCCATGTT
TAGATTTTGATTTTGTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAGGTC
TACTAGATTCATCGTTCGAATCTTGATCGTACGAATCTTCAAAGATACTA
GCCATAAAAGATAGATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGG
ATTATAAAATGTTGGTGTTTCTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATTCAG
GAATTTTTACATCTTTACCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTG
TAAGTATAAAGATCCATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGT
TTGTATGATATGAACCAATACACCACTGGTTGAATTGAAAACATTTTCTC
GGTGACATTCGAGTTCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTGTGT
ACCCATTGGAATTCTTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACAATATTTTC
TTCCTTGTCTTCTTGTAGGATCAAATAATATTTGCCAGTGTGGAAGAACC
CTTGCGCATGCTCGTTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAATTA
CCCAATAACAAAGGTGGGATATCTTTATGTTTGTATTCTGGTGGGATGAA
CCATGATTTCTTAATGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045303XLOC_045303Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1401834..1402364TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1401834..1402364Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1396569..1397183TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1396569..1397183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1389070..1389504TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1575043694:1389070..1389504Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1401834..1402364TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1401834..1402364Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1396569..1397183TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1396569..1397183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1389070..1389504TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1510915933:1389070..1389504Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1401834..1402364TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1401834..1402364Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1396569..1397183TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1396569..1397183Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1389070..1389504TCONS_00073084-exon-scaffold_86-1491911889:1389070..1389504Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_86supercontigscaffold_86:1389070..1402364 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.998646	1.71659	0.508674	0.412523	0.136768	0	1.73152	0.770342	0.370383	0	0.780891	0.680316	0.418738	0.380188	1.15385	0	0.54214	0.442189	0.614351	0.455135	0.71838	0.974533	0	0.963084	0	0.519663	0.828246	0.661072	0.576103	0.0370454
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00073084 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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