|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00073082 ID=TCONS_00073082|Name=TCONS_00073082|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1734bp
GAAAATGTATTTGTATTCAGTAAGCAACTAGTTTTCAATCCCCAAATAAT
TAAATAAGGAAGATGGAAGATTTGCTTTAAATAATTCATTATAAGTAAAC
GATGTTAAAACAGCAAATCTTGCCAaatatttcaaagatttcaTTTCTTC
TTTCCTTTCAATATTATTGCAAGCCATTTTAAAACATAACGGTCCAAGTC
TCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCATCCCAATTTCTTCA
TTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTTTCAGGAGAAATAAT
TTGGTGAACAACTTCTATAGTAGATAAATCAATTGCCATGTAAAATTCAG
GGTGAAATACATCCTTTGTGGCACAGTAAAGTGGCATAACAAGGCGATCG
AACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTGAAGTCCCTTCCTCTATATTCTAC
TGGTACCTTCACAGAGAGAATGaagttttttgtttcatttattGACAAAC
GAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAGCTCTTAATTCAAGGTCCTCTAATTCG
CCATAGCCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATGTTTAAGATCAACAAC
ATTAAACAACATCCACGATTCAATGTATTCCAAATCATACGAATATAAGA
AATTACCGGAATAATCACATTCAATGATCTTTAGGTTTATCATATCTTCA
CTATCTTCAATATaagaccttttaaagaaaaatattttgtccttAGTATA
TTCCCTTCTCGCAAATACTGATCCACCAGCGGTTTCGAAATCTATAACCA
ATCTTCTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCTTGATAAAATCCAGA
TAGTTGTATTTCTCGTCCTGGTTACTCTCATAATACTTAGTAAAATAACT
GCTTATAAGTAAAGTGGGATTCTCGTGGCCAAGAAATTCTGCATATTTAC
AAGTTATCGAGTTGAATAATTGATCATATGTCAAAGACAGATCTGGAGTG
GATGCTtcgtcatcaatttttgaatCATGATGCTGCAAATCTCTATTTAA
ATCAGCTTTAAGTGACTCTGGTGAACCATGTTCCCTGTTTAGATTTTGAC
TTTGTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAGGTCTACTAGATTCA
TCGTTCGAATCTTGATTGTACGAATCTTCAAAGATACTAGCCATAAAAGA
TAGATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGGATTATAAAATG
TTGGTGTTCTTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATTCAggaatttttaaA
TCTTTACCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAAGTATAAAG
ATCCATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGTTTGTATGATAT
GAACCAATACACCACTGGTtgaattgaaaacattttctcgGTGACATTCG
AGTTCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTGTGTACCCATTGGAA
TTCTTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACAATATTTTCTTCCTTGTCTT
CTTGTAGGATCAAATAATATTTGCCAGTGTGGAAGAACCCTTGCGCATGC
TCGTTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAATTACCCAATAACAA
AGGTGGGATATCTTTATGTTTGTATTCTGGTGGGATGAACCATGATTTCT
TAATGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_86:1389070..1397867- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00073082 ID=TCONS_00073082|Name=TCONS_00073082|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8798bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:1389070..1397867- (Clytia hemisphaerica)
GAAAATGTATTTGTATTCAGTAAGCAACTAGTTTTCAATCCCCAAATAAT
TAAATAAGGAAGATGGAAGATTTGCTTTAAATAATTCATTATAAGTAAAC
GATGTTAAAACAGCAAATCTTGCCAAATATTTCAAAGATTTCATTTCTTC
TTTCCTTTCAATATTATTGCAAGCCATTTTAAAACATAACGGTCCAAGTC
TCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAGTCATCCCAATTTCTTCA
TTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAATTTTCAGGAGAAATAAT
TTGGTGAACAACTTCTATAGTAGATAAATCAATTGCCATGTAAAATTCAG
GGTGAAATACATCCTTTGTGGCACAGTAAAGTGGCATAACAAGGCGATCG
AACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTGAAGTCCCTTCCTCTATATTCTAC
TGGTACCTTCACAGAGAGAATGAAGTTTTTTGTTTCATTTATTGACAAAC
GAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAGCTCTTAATTCAAGGTCCTCTAATTCG
CCATAGCCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAATGTTTAAGATCAACAAC
ATTAAACAACATCCACGATTCAATGTATTCCAAATCATACGAATATAAGA
AATTACCGGAATAATCACATTCAATGATCTTTAGGTTTATCATATCTTCA
CTATCTTCAATATAAGACCTTTTAAAGAAAAATATTTTGTCCTTAGTATA
TTCCCTTCTCGCAAATACTGATCCACCAGCGGTTTCGAAATCTATAACCA
ATCTTCTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCTTGATAAAATCCAGA
TAGTTGTATTTCTCGTCCTGGTTACTCTCATAATACTTAGTAAAATAACT
GCTTATAAGTAAAGTGGGATTCTCGTGGCCAAGAAATTCTGCATATTTAC
AAGTTATCGAGTTGAATAATTGATCATATGTCAAAGACAGATCTGGAGTG
GATGCTTCGTCATCAATTTTTGAATCATGATGCTGCAAATCTCTATTTAA
ATCAGCTTTAAGTGACTCTGGTGAACCATGTTCCCTGTTTAGATTTTGAC
TTTGTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAGGTCTACTAGATTCA
TCGTTCGAATCTTGATTGTACGAATCTTCAAAGATACTAGCCATAAAAGA
TAGATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTCAGGATTATAAAATG
TTGGTGTTCTTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATTCAGGAATTTTTAAA
TCTTTGCCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATGTTGTAATTATAAAG
ATCCATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTATGTTTGTATGATAT
GAACCAATACACCACTGGTTGAATTGAAAACATTTTCTCGGTGACCATCT
AGTTCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTGTGTACCCATTGGAA
TTCTTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACGATATTTTCTTCCTTTTCTT
CTTGTAGGATCAAATAATATTTACCAGTGTGGAAGAACCCTTGCGCATGC
TCGTTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAATTACCCAATAACAA
AGGTGGAATATCTCTATTTTCGTATTCACGTGGAATGAACCATGATTTCT
TAATGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTTACCTTAAAAATAGAGG
AAAGTGATATTGAATTCAATGTTCAGTGTCACAGTCAAAATAATACATCG
GTGAAAAAGCGAAAAAAAATAGGCAAAATTTGTACGTAAGGTGGAAAAGT
GAAAATTTACGTATTCACACTCAAAAAGATTTTTTAATTCGAAAAGTTAT
GACGAAGGTTTTATAAAAACCAACATAAGGATTCGCTATCACGTTTTTCT
ATCTGCGTGTCCTAGCTGTCTGACTTTCGTCCCTCGGACCCTTAGCAAAT
TCGCTTCCATCAATTGATGATAATTTAATGATGTAAAAACTTTCATTTTG
TTAAATTTTTCAAATTAACCTTCATGTAATCTTACGATTTTCACTTTTCA
TTCCCAAGCCAAATAGATATTCCTCATCGTTTAAAGAAATCATTATTGCA
ATTTCTTCGTTGTTCCAATTCAAGGAAACAGCTTGAATAAAATTCTGTAT
TTTTAATGAATTTAAAAGATGAAAAATTTCCTAATTTGAATTAAATTATT
ACTGACGGAATTTTGTATACCACTATGGAATCCGACCATATCTCCCCCTG
GAACGAAAATAAGCCACCTCAACAGGGACTATGAGGTTTTCCTGAAAAAG
TTCATACCGTCTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATAGTCA
AACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGA
TGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAATTTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTA
AACTTACAATTTTCATTTTTCAATTTCCAAATAGTCAAACAATATCGATG
GCAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTC
AATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTT
CATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCC
ATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATT
TTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCC
AAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATA
ATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATC
CTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAA
TATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCA
AAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTT
ACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAAT
CCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTG
TTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTT
CAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAAT
TGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAAT
AAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAG
TCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAG
CGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTT
GTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGA
TGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTT
TCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATT
TTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTT
CCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAA
TTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTC
CCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGA
TAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTA
TCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAAC
AATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGT
CAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAAC
TTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAA
ATCCGCTTCCATCAATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATT
TGTTAAAATTTTCAATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATT
TTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATATCGATGGTAAATCCGCTTCCATCA
ATTGATGATAATTGAGCGATGTCAAAACTTTCAATTTGTTAAAATTTTCA
ATAAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTCAATTCCCAAAT
AGTCAAACAATATCGATGGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTG
AACGATGTCAAAACTTTCAATTTGTCAAATTTTCAATAAATTATCCTTCT
TGTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATAGTCAAACAATGTT
GATGGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTCAACGATGTCAAAAC
AGCAAATCTTGCCAAATGTTTCAAAGATTTGNTTTGTCAAATTTTTCAAT
AAATTATCCTTCTTGTAAACTTACAATTTTCATTTTTCAATTCCCAAATA
GTCAAACAATATCGATGGCAAATTTGCTTCCATTAATTGATGATAATTGA
ACCATGTCAAAACTTTCAATTTGTCAAATTTTTCAATAAATTATCCTTCG
TGTAATCTTACGATTTTCATTTTTCTATGCCCAAATAGTCAAACAATGTT
GATGGCAAATTCGCTTCCATTAATTGATGATAATTGAACGATGTCAAAAC
AGCAAATCTTGCCAAATGTTTCAAAGATTTTACACTACCGTTCCCTTCAA
CAGTATCATTGCGTGCAATTTGAAATACGAATTCCTCATCGTTTAAAGAA
ATCATTGCAATTTCTTTGTTGTTCCAATTCAAGGAAACAGCCTGAATATC
GTCATCTTCAGTCATAATTTGTCTTTGAGACTTACGTGTAATTTTCATGT
TTGTTAAATCCAGAGTCATATATACCCCGTGGACATCGTCCCTTAATAAA
GCTGGTAATACAGTATGATTGAATCTTTTAATTGGATCATTTAATGCGAC
TGATTTGTACATAACTCCGTCCTCTTTCGGAAATATAATATTTTTAACTT
CTTTAACAATCTCAGCTTTACCTCTTTCCAATTTCATAACTCGTATTTCA
AGATCCTCAGGTTTAGTTTTTCTGGGGTAAAAATATAAAAATATTAAGTT
TGAATTTCTAATACATTCGAAATGCTTTACAAATGAATCGGAATAATCAA
TGGAATATGAATATAAAAATTTACCCGAGTAATCATATTCTAAGATTGTT
GACTTAATGGTATTGTGTTTGTTATCGATCCTTTCAAAATAGATCTTATG
CTTGGTAAAATATCGAAAAACAAAAGAATTTTCCAACGGTCTGTCTAATT
CTATTACCAGTCTTTTTTCTTGCTTTATTTGATGTAGCTCGATGTTTAAA
AAATCCAAACATAAACATCGATATGATACGAGTGAAGGGCCGTTAGCTTC
ATCAACTGTTCGTTGAGAAAATGCTGAAATGATAAGTTTTATATTGTTTC
CAATGATATTATGGTTGTGATAACTTAGAAATCTAAATTCACTGGCACAC
GTCAGACTTAAATCAGGAGAGGGTTTAAGATCCATACACAATTCAATGTT
GTTCCGGTTCTTTTCAAACCAATTAATAATGTGATAACCATAAAGGTCGA
TAGTAAAATATTCCCTGTCGCTAGAATAACGTTCGATTGTATGAAGAAGA
AAACCAACATCTGGATAAAAACAAAGCTGCTCGTAATTATAATATCCAAC
GCAGGAACGAAGTTTAACGGTCACAACGCGTTGAAGAAATTTAGAATAAC
TTTTATAGAATTCGATAATATGAATACGCACGGTATCGGTTTTTTTTGGA
TCTTCCTTAGCTAAAAAGTATTCACCAGTGTGGTAAAATCCCATCTCATC
TTTATCAAATGGCTCAAATCCGATGAATAGTGGTTGTATATCCTTGGCTT
TGAAGTCAGGTGGAATGAACCATGATTTCTTGTCGTCAATCATCGTAATT
CTTTTAATGTTTTTGGTTTTAATATTTTTTTGTACCTGTAAAAGAAGGAC
ATTAAATGTTATAATTCACAAGAAAGTACACGCAATTTTATCACGAGCAT
AAAGAAAAATGATGGAATTGCAGAAAATTGTAGTGTCCTTCAGATTCAAA
GCCAAAATACTGATTGCGCAATGATAATGGTGGCATATCCAGTTTGATTC
GTCTGTAGAAAGAAGTTATCATTTAAGCCTCCATTTTTTACAATAACTGC
TAGTCGAAAGCAATAAAATTAGACCATTATTATATCACAGCGAGATACAA
CATGTCACAAAACCTGGGGCCTGTTAAATAGGAAAATGACAGTTTATTGC
TAAAACGTACTAAAACATCTAGGAACAACCCGGGAGGGGGGGGTACAAGG
GCAAAATGGGTCAATCAGAAAAATCTGCCCCTCGTAAGGGTGCCTTTTTT
GGAAAATTTGGGGAAAAAGTGAAAAATTTGAGAACATTTCTGAATTTCAG
TCCTATTTAGAGTCACTTTTTCGCAAATTTCGGCAAAATTAAAAAAAAAA
CGAGTCCCACGTAGGGTCCATTTTTCGAACCTCAGCGGAGCACCCCCATC
GGTCAGCAAGGGTAGTACACCACCCGGGGAACAACCGAAACTTACAATCA
CTGATTTTTGTAAGATAATCTGGGAATTCATTCATTGAGTTTGATAAAAT
AAAAAATTATAAATTCTGTAAAATAGTTATCCTAATTATAAATATATAAT
ATAGTATAAAAAAGTTTGATAGAATCTTATAAAATTTCGTAAAGGGAAGG
ATACAAAACTATCAATATTAATAATGTTCGCTTCATATTATTTCCAATGT
TTTTCAAATATTGGTGGAAAATGTATTCAGTAAGTAACTAGTTTTTNCGC
TTCATATTAGGTGATTTTGATGAATTTCCTTTTTGTTTTCCTCCATTTTT
CCAATGTTTTTCAAATATTGGTGGAAAATGTATTCAGTAAACAACTAGTT
TTCAATCCCCAAATAATTAAATAATGAAGATGGAAGATTTGCTTTAAATA
ATTCATTATAAGTAAACGATGTCAAAACAGCAAATCTTGACAAATATTTC
AAAGATTTAATTTTTTCTTTCTTTTCAATATCATTGCAAGCCATTTTAAA
ACATAACGGTCCAAGTCTCGTAGCATTTTGAAGATTATCTTTACGAAAAG
TCATCCCAATTTCTTCATTGTTCCAATTTACAGAATAGCAAGGATGTGAA
TTTTCAGGAGAAATAATTTGGTGAACAACTTCTGTAGTAGATAAATCAAT
TGCCATGTAAAATTCAGGGTGAAATACATCCCTTGTGGTACAGTAAAATG
GCATAACAAGACGATCGAACTTCTTGATAGGGGCACGCACTCTCAAGTCC
CTATCTCTATATTCTACTGGTACTTTCACACAGGGAATGAAGTTTTTTGT
TTCATTTATTGACAAAACAACCCCATTCTCCAGTTTTAAAACTCGTAATT
CAAGGTCCTCCAATTCGCCATAACCATTATAAAGAAATATGTAATTTGAA
TATTTAAGATCAACAACATTAAACATCCACGATTCAATGTATTCCAGATT
ATACGAATATAAAAAATTACCAGAATAATCACATTCGAGGATCTTTAAGT
TCATTATATATTCACTGTCTTCAATATAAGACCTTTTAAAGAAAAATATT
TTGTCTTTAGTATATTCCCTTCTCGCAATTACTGATCCACCAACCGTATC
GAAATCTAAGACCAATCTTTTCTCGTGACAAAGTTGATCTTTTTGTATCT
TGATAAAATCCAGATAGTTGTATCTCTCATCCTGGTTACTCTCATAATAC
GGAGTAAAATAACTGCTTATAAGTAAAGTGGCATTCTCGTGGCCAAGAAA
TTTTGCATATTTACAAGTTATAGAGTTGAATAATTGATCATATGCCAAAG
ACAGATCTGGAGTGGATGCTTCGTCGTCAATCTTTGAATCTAGATGATGC
AAATCTCTATTTAAATCAGCTTTAAGTGACTCTGATGAACCATGTTCCAT
GTTTAGATTTTGATTTTGTGATTCTGAGGGCAATTCAAAAAACGATGTAG
GTCTACTAGATTCATCGTTCGAATCTTGATCGTACGAATCTTCAAAGATA
CTAGCCATAAAAGATAGATCTGGTGAATTTTGGGGTTCTGAAAAATCCTC
AGGATTATAAAATGTTGGTGTTTCTGGTGGTGATTCTGGTTCAGTTGATT
CAGGAATTTTTACATCTTTACCATTAAGCTCGTCAAAAAGATCAACAATG
TTGTAAGTATAAAGATCCATTACAGTTTCATGACGTTCGTTTGTTGGGTA
TGTTTGTATGATATGAACCAATACACCACTGGTTGAATTGAAAACATTTT
CTCGGTGACATTCGAGTTCAGTTTTTGGTAAGCTGATAATTATTCGACTG
TGTACCCATTGGAATTCTTCTATATCGAATTTGATCACGTGAACAATATT
TTCTTCCTTGTCTTCTTGTAGGATCAAATAATATTTGCCAGTGTGGAAGA
ACCCTTGCGCATGCTCGTTGGAGTAGCTTGAAGTGCTTGATACAGAAAAA
TTACCCAATAACAAAGGTGGGATATCTTTATGTTTGTATTCTGGTGGGAT
GAACCATGATTTCTTAATGCTGTTATACATTGTTATCTGTTTCTTTTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1575043694:1396569..1397867 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1575043694:1396569..1397867 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1575043694:1389070..1389504 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1575043694:1389070..1389504 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1510915933:1396569..1397867 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1510915933:1396569..1397867 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1510915933:1389070..1389504 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1510915933:1389070..1389504 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1491911889:1396569..1397867 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1491911889:1396569..1397867 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1491911889:1389070..1389504 | TCONS_00073082-exon-scaffold_86-1491911889:1389070..1389504 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_86 | supercontig | scaffold_86:1389070..1397867 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
