TCONS_00073050 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00073050
Unique Name	TCONS_00073050
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2625

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_86:992051..1008079-
coding sequence from alignment at scaffold_86:992051..1008079-

transcript sequence

>TCONS_00073050 ID=TCONS_00073050|Name=TCONS_00073050|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2625bp
AATTGTCGAATTCAATAACACAGATAAGAGAGATTTCATCTGTtagaaaa
aacataaataaaatcgaCAACAACAAGAACAATAGTAACAACAACAGACA
ACTTCATGTACAACACTATGAATACCATGGTCGTGCAAGCCAAACCAGAA
ATGATGACACACATACCACACCCACACCATCAATTAAAACCAGGTGTTGG
TGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAACACCCTGGGTTGGTCGCACATCCAG
GATTAGTTGGATTGAATGGAGATAACCATGTTAAACGACCTATGAATGCT
TTTATGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGAGACAGATGGCCCAAGAACACCC
TCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAGCGGTTAGGTGCACAATGGAAAG
TCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTTTATTGATGAAGCCAAGCGCCTT
CGTGCCGTTCACATACAAGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACG
CCGGAAGCcgaaacaaatgaaaaaagacaTGTACCCAGCTTATAGCAACA
TGGCAGCCTCGACTACAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGA
ATGGCCTACCAACAATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGA
TTTATACGGAAAAATGAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCC
CCGGATACCCTGTGATGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACC
ACGGCACCAAGCGCCGGCTCAGGCAGCGGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTC
CAGTAATGGAACTAGAGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATG
GTTCGTCAACAGGCGCCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATAT
CGCCCAACTTCAACAGAATATATGACTTCTAAGAGCTATTACATTAATGG
TGGACAGTACAGCCCTCTCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTCACTCAC
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TCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGTAATTCAGATGCAGCAACCACCGGCTC
CATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAATGGAAGCGCAGAGGAACACAGCCCGT
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GCAGGCTCCTTTTATGAGAAGAAGATATTTTTTATTATGAGAGAGGGGAG
CCAAAAAATGGTGTAGAGAAAACAACCCACTTTTAACGACCAAAAAAGAT
TGGCGTCAAAATGTCTTCACACTTGCGTACGGGGGAGATGAGGCGTCAAA
TGATGGATaagaattagaaaattttgggcGAAAAAATGAAGGTTTTCGGA
TGTCACACCAGTGGTATGAAATATCGCACGAAATAGATATAGTTGTGttt
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ACAATAATTGCGTTCACTAAAAGGGACTGGGTCCCAACTAGAAGGTAGTC
AAACATTAGAGATAACAAACTCTTTCAAAGACTTATATAGGATAATCTCT
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CTGTGTTCCCTTTCGTGGGAGCAAAGTTATTTCTATAGCTCCGTAAAGCC
ATTTTTACTTtttgcaaaattgatttttgttttaacAATCGACCCATGGT
CGTCGTTACAATATTTGTTGAAAggttttgtttataattttttcgaCCTA
CACCGAATCATGAATCATCAAGCCATTAAGGCTACACATTCGGCTACACA
TTCCAAAAAaatcgatcaaagattttgtttggCCGAGGCGGGGCCGAGAT
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ACACAAactttttatgagaaaaaataGGTTTGATATATTATGCTATCATC
ATATATATTTCGAGTTTATCAATCGACTActtattatttttatcaaaata
ttgttttttgctgataatttataatatttGTTTATTAACGCTATATAATA
TAAAACGGCGATTGTTTGAAAAGCAATcctaatattttattttgaaagaa
aatgaaacaGCAAAATAATTCCAAC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of Sox10

>TCONS_00073050-protein ID=TCONS_00073050-protein|Name=Sox10|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=383bp
MYNTMNTMVVQAKPEMMTHIPHPHHQLKPGVGGPGSPAMQHPGLVAHPGL
VGLNGDNHVKRPMNAFMVWSRGKRRQMAQEHPRMHNSEISKRLGAQWKVL
TPEEKQPFIDEAKRLRAVHIQEHPDYKYKPKRRKPKQMKKDMYPAYSNMA
ASTTIIPGMDPKYGGMAYQQSMAYGISTMSPDLYGKMNAAYAYPAAISPG
YPVMYSNYPMTTMGTTAPSAGSGSGGAPSPTSSNGTRGYNTASLGSPNGS
STGATMADSNANTTYRPTSTEYMTSKSYYINGGQYSPLPAANATQGHSQQ
PQAARYPSPHDESRISQSVVSQSNSDAATTGSILMPKSVNGSAEEHSPSP
PTYPSTNTPVGRHWTPSGGSGAPTQDMTSGNFH

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_86:992051..1008079-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00073050 ID=TCONS_00073050|Name=TCONS_00073050|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16029bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:992051..1008079- (Clytia hemisphaerica)
AATTGTCGAATTCAATAACACAGATAAGAGGTAATCCATTATTTCTTCTA
TCTTTTTTTATATACTTTCTTTGTTGCTAAGTTTTCTCTTAATGAAACAA
AGCGTAAAGTATTTGATGAAAATGAAAATAAAATAACGATGAAAATGATG
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AGAGATCAATAAACATGTATATGATTTTTAATAAGAACCATAATTCTTTT
TCTGAGATTCGGCTGTTTTCATTTTTTTACACTTTCAGGGTCCGTATTCG
GAGCACGCTCTTATTTTCAGTGAACGATTTCAGACTTTTACCACAGATCT
GTAAAGCCCGAAGGGCTAGATTTGCGGCCTTTATCGAAAAGTGAAGCAAG
TTTTGGTAGGATTTCCTACCAAAGAAATCACGTGACAACAAGCAATTTCA
CTGGTTTGAGAGATGCGAAATAGCGTTTGCCGCCTAATTTTTTTGATCTC
GCGCTCTAAAAACAATTAAAATGCTAGATCCTATCCATCGGCACGAAATT
TAAAAAGTCAAATTTTTGCTTCACTTTTTTTGCTGGAGAAAGCTTAAAGT
TGCCTATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATATCTGTGACTTTTACCCTTT
TTTTTAATACTTTTCATCTTCCAATTAGCTAAGACTCAGTCATTCCAGGT
CAGATATGGTAATCGCAGATAAATTTTACCGGGTGAAATTGAATTCCAAA
AGTCCAAGTAAATTACTTGGCATGGTTACTAAAGGTATATTCAACGGCAC
TTCACGGAGCAGAGTTATCGCTAAAACCATAAATAATTACTTTCAATATT
AAAACTAAACAATAGTTATGCTAAGAAACAAAAATAGTACAAAAGGCTTT
AACGACAAAACAATTTCTTGATGACGACGAAAAAAAAGAAATCAAGTCAA
AATTAATTATAACTTAATATCCCTAGGGGGTATGTATATTATAGAAAAAT
GTTACAATAAACATTTTTTAAGAAGTTTATTTACAAAGTTTCTCTCTTTG
ATATGTCATGAAAAGAAATCAAATAATAGCCAATCGCCTGATGAGCAACG
TGCTTCGCAAATCGCGTTAAAGTTTTTGAAGACACTGCAGGAACTGACAT
TTTTTGAACTTGTTATAAAAAAGAGCTATTATAATATTCTTGAATACTTA
TGGCTTGATTTGATTGTTGCGACGTGTTGGGTGAGGAGTTTGTGTGGATT
TTGAAAGTGTGCGTTTAGTGTCGCTTTGAGTGAAGATTTTGTATCTTTTG
TATTTTATGGGTAGTTTTCTCGCTGGGAAGTCATCGATTGGCCTATTTTG
CAGCGATTTGGATGGAGGGATAGTTCAACCAGGTATACCATGGGTTTTAT
CAAAGTCTTTGGCTTTATACACGATGTCCGAAAAAAACAACAGATTTTGT
ATCAATAGTGAAATCTCGTTGAAGTTTAGAAAAAATACAAAACGAAGCAA
TTTTCTTGTTAAATCAATGATATTCAGCTTCCATGGTAATTAGAACTCGA
TTANCATGGGTAGTTTTCTCGCTGGAAAGACATCGATTGGCCGATTTTGC
AGCGATTAGGATGGAGGGATAGTTCAACCAGGTATACAATGGGTTTTATC
AAAGTCTTTGGCTTTATACTTGATGTCCAAAGAAAAAAAAACAGATTTTG
TATCAAGTGAAATCTTGTTTAAGTTGAGAAAAAATACAAAAGCAATTTTC
TTATTAAATCAATGATATTCAGTTTGAAAGGTAATTAGAACTCGCTTAGA
ATGGGTATTTGAAAAATAGCTAGTAAATACTAAGGTACTGTACAATAGAT
TTTGACAAATTTTATAATACATTTATGGATTCTGTTCCGCTTCACCCCGG
ACACTATCTGCTTCAATCGAAATCAATTGTTGTTGAGTTCGAAATTCGCG
AAAAGCACAACATTCAACAAAGGCCATGCTGCAAAATCAATAAACTTTTT
TTATTAGAACATCGAAACTTTTTGAAATTTTTATGAGTACCTGTCCAATT
TCTTATGTTGCGTGTATGATGTAAATATAAACCTACTTTAAGACTCTACT
ATTGCTATCTCCGCAATCTTCATCAGACAAAATACCATCAAAATTTCTAC
AAACTTGTCAAGAGTCCCAAAGAAAAGGGGTTCAAAAAACGGGCGGCACA
TCCCCGCCCCCGGATCAAGGCGCTTAAAATTCTCACTATAAAATTGTATT
TAATAAGCCCTAGGTCCCTTTTAAACATAAACATGTTCTTTGAATCAATA
TGATCTTTTTTAATAAGATATGCTAAGGCCTTGACCAAATCACAAAAAAA
AACACATTGGCAAGTTAAGTAAAATAAACTTTAAAAAGTCAGTTTTCATC
CGGGTAAATTTCCGCTACAGACAAGTTGACTATCCGTCAGCAAACATTTT
AATGTCATGGTGTGCTTCATATTTTCCTTTCGTTTTCTTTTTAAAGCCCG
TCTTTTGACATTCAAATCCTTTTGTTAATGCTTTTGTGTCGTCAAAACGT
GTTAAAAAATGCAGGGAATTCTTTTTTATCTTGAACTTTAGTTTAATGTG
CCTGGAAGTGTACGTTTATGATAGGGGGAAGACGTTGAATTGAGGTAAAA
GCTTTTTTTTTTATTTTTGTGTTTTTGTTTGGGTTTTTTTATTAAAATAC
TATAATACTTTCTTTGTTTTTTTTTACCACAACAAAAGGTTTATTAACTA
ACAGTATAATTCAACATAATAATACAACAATTTAATACAACTCTTTTCTA
TTTTTCTTTTCATATTTATACATTAATTAATATATTCTTCATATTATCAC
TAATTATTTTTCTTTTAAATGATTTCAAAAAAAAATCGTAAATTTTGGCA
GCCATGTGCATTTTACATGTAGAAAAAGTCAGACAAACATTCTTTTCAAG
GGATGAGATTTTATCTTGATTTGATGCAAAGGAGATACTTAAAACCTTGG
ACAGCTATGTCTTCACACTGTTCGCTAGCGCCTCAAAGCTTGCAAGCGAC
TAAAAAGCCAGCGCTATCCTTTTTTTGGTTTATACCAGAAAAAACACTTT
AATAGCTTAGTACCCGTTTTTCGTAGTACTTTTCATTTTTGCTGAACATC
ATTTGTTTCGGGCCAAATTATTAGATTGATACTTTAGAGTCTTGAGTCAA
TCGAATGATGAAATCTAACGAAATATCGAAAAAATACCTTTCTGCTTGGG
CGTGTAGGTGGCGTTATCGTTATCAAATGACGTTATCCTACCTGATGACA
ATGATTTAACGATAAACGTACCGCTGTTTGTCGACAAAGAAAACATAGCC
TGAAAAAAGAAGATTGGATACTGTAGATTCAAAAAAATCTTTATACGGTT
TGTCCGGAAAAAAATCAATAAAAAATGGAAGCAATAGTCATATTGAATTT
CGCAGAAATTGCTATTTATTCCTACAGTACCTAGCCTGGGCTTTTTTGAG
GAATTAAAGTCCGGGGGGGGGGGCAAACAGCCCACCCCTCATAAAATTAT
CGAAAAGTCATAAAACTTGGTGATGCATTATCACGAGAAGGTTGTTTTGG
CACTCAAAATTTTTTTATTGTACATCTTTCGATGACAACAACAGTTTTTG
TAAGAACTTTTGCAAAAAATGCGAAAAATGACCTCACTTCAAACTGCTAT
GTTAGCTCTTGAAGTAGAAATGAATTTTCAATTCTGTTTCGATATTCTGA
AAGCCAATTAAATTCCTCACTAACGATTTCCAATATTTTCAGGTCTAAAG
ACGGTACAGTGCGCCAAAATTGTTATAATTAGTTTTTTCTGAAATGGCAC
TCCATCATGGAAATATGATGTCATCGCATAAAATTTTTTTTCGATTTTTT
CCTTTCGTACCTCTATCCGTTGCAAAGATATCTAAGTTTATAATTTGTTA
GAAAATCCATACATTTTGCCTTAAAATTTGGATCAATTTCAAAAAATGCT
GACGTCGTCAAATTTTGGAAAGCAAGAAAAAAAGTTTTTTCTGGAAAGTA
AAGCTAAGTAAAATTTAGTAAGACTCATGAATTTTCAAGGCTATATCTAA
AGTCCCTGAACTTCCAGGAAAACAAGTTTGTCGAGGGAGGGGGAAGCTTT
GTCCCCCCCTGGGCTAGATAGGTCTTCCTGAAATTTTAAGACTATAAAGC
TTTAAAGGATTTTATAGGGATTTACTGGTCAGGCAATGCAATTTAAGTAT
TTTAGAGTCCATTCTGAAAAAAATTTATTTCATTTAGGTATTCAGATTTC
GTAATACATTATTTCTTTATAAGAACAAGCTGTTTTTGAATACTTTTTGA
CCCCTTGAAAAGATACTTGCAAATCACCAAATCCAGACTCTATATTGTTT
TTAAGTTGTAATTCTTTTTTAACGATTTCGAGCCTCATTATTAATACTAA
ATTATTCTTACAAAAAAGAGAGAAAAAAACATAAATTCAAAAATCAATTT
TCCTAAATAGTAACCCACGTGAAAAAATAATCTGGGAAATAACATATGTT
GCATAAGTGTTGTGTTGTACACAACATACGGAGGGCTTTTATGGGTAATT
GGCCTAATTGTTCGGAAAGCAAAACATGTGAAAACTAGTAATTAATTTAA
AATGAAGCCTATTAACACTTACTACAAAGGCCAAGTGTTTTATCCGTTAA
AATTGAAATCAAAACAAAGGAAAAGTGAAAATTGAATTTTTCGATGGATA
GAGGTCTCTCTTTTTCCGAATCCCTTTTAATTTTTACAGTCCCTTATTTC
AAAATTACACAATTTTTACAGTCCCTTATTTCAAAATTACACGCTTTTTT
TATAAGAATGATGTTTTTTTCAATTCATCATGAACATTCTTAACTTTTTG
AGGAAAATCGCCCTTAAATAATGTTAAAGTAATTTTAGGTTTGGGTCCAA
TTCCCAGCCAAAATCTAGCATGTAATAAAATTCCATGAACTAAACCAAAA
ATTTGGCATTGTTGTTGAAGCTTTTAGTATTGCTGGGTAATAATTGGCAA
TTTAATGGTAAATGCTCTAAAAATGGCATTCTTAGGTTCAGTTACCAAAT
TCCATGATGGCGGTATTTTTACCACATTTTTAATTTTTTTTGCCAATTTC
ATCATAAATATTCTTATCAAGTATATTCTTATAAAAAAAACGTGNTTTTT
AATTTTTTGGCCAATTTCATCATATGAAATTATATATTCTTATAAAAAAA
ACGTGTATTGCGAAACATCAGTCAAAATTCAACTGCTATCTTATCATTTC
AAGACTTTCACTTTCGGTTTCAATTCTTTAATTTGTTATCGACTTTTTAT
AACGTTTTCTGTTTTTCAAAGAAATTACCAAGAGGCGCATAATTTGGGGT
ATAAACAATTGCCTTTAACAAGAGTCATACATATTTTCAACCTCTCTCTT
TTAATCTTTGCTTAAGTTCTTAGGCTGAGCCCCGCTTAATCCTAAAGACT
TTGGCGCGTTAAGAGACAAAACAAGAGGCTTAAAGTCCCTTTCTATATAG
ATACGTGAGAAGCTGTCGTCAACTACAAAGAAAATCACAAACAAACGAAA
GACATATGATAAAATAAATAAAAGCATAACAAAATATTTAATTTAATTTT
AGCGGGTTTCGCGTAAATGTAGTATTCTTTTCTTCTTTACATTATTTTCA
TGATTTTTTTAAATTTTCATCATGAAGCATGGCTCTTGGATTGTTCTTGG
TCACTTTTTCTTCATGAAAATGAGGTAATCATTTAGCATGTAAGGAAGAT
TTTCTGTTTTCGTAAGCTACAGTAATTTTATGTCAGATTAATGAAACCTA
GAGATCTGAGTGTAAACAAGTGCTAGTTTATACACGAGACCTTCCAAGTA
GGCTCAAAATTTACGCCATTACGCTGACTCCTGGAGTGCTCCGTACATTC
CTCTGTATCTAATCTTACCGAAGACGGTTTAAATATAAAGTTTCTAATCT
CAGGTTCTAGCTAAAGTATGAGCCAAAAAATTTCCATCAATTTTTGACAA
CTAGTCGTTAAAATAAGAATATGAAAAAAANTTTTAAATTTTCATCATGA
AGCATGGCTCTTGGATTGTTCTTGGTCACTTTTTCTTCATGAAAATGAGG
TAATCATTTAGCATGTAAGGAAGATTTTCTGTTTTCGTAAGCTACAGTAA
TTTTATGTCAGATTAATGAAACCTAGAGATCTGAGTGCAAACAAGTGCTA
GTTTTTACACGAGACCTTCCAAGTAGGCTCAAAATTTACGCCATTACGCT
GACTCCTGGAGGGCTCCGTACATTCCTCTGTATCTAATCTTACCGTGTAA
TTGAGACTGAAGACGGTTTAAATATAAAGTTTCTAATCTCAGGTTCTAGC
TAAAGTATGAGCCAAAAAATTTCCATCAATTTTTGACAACTAGTCGTTAA
AATAAGAATATGAAAAAAAACTAATAAATTGCAAGTGTCTCTTAACAAGC
AAAGGTGCCAGTAATTACAGAGTACTAGGTCAGAATCCAACTTTGGGATG
ACATCTTTCTAACGTACATTTTACGTACTTTAGAGTACTTTACCGAGTCT
TTATAGAAATTATAGGAAATAGATGCTAACGAAAAAAAGTTTATTCAAAA
AATTACTGTTTACGCTCAAGGTCTTTTCAAATAAGAACCGCGCACACGCG
CAAATTATTGGGAGCCTGGCGCTAATTACTATTGCTATGGAAATAGTTTG
TTTTGAATGGAACTGAGAAATTTCGAGCTTATTGATTGGCGGACAGAAAT
TGAAGCATGTGTTAAAAGAAGTAAACATGTAAAAAAAAATATAATATATA
TTTTCTCTTTCTTTCGTTCAGAGAAGCATATATTGTTCTTTATATATATC
TTTTTTTTTAATTTCTTTATGGTTCACTCAATGTTCTTTTTTTCAAAGTT
GGGTGTTGAATGGTGGGGGTTACTAGTTGTAAAAAAATTGATACCTTATG
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CGATCTATTCATAGTGTTTACGCGCACTTGAAAAATTCGACAAATCTGAT
TGGTTGGTTTTTCTTCGTTCCTATTGTTTGTGAGGTGAGAACAATAAAAA
AGAATAAGAAAGAGAACATTTTTAAAAAGGTATCATTTTTTTTCATCATC
TTCAATGGATTAATTCTTTTCTTAATGATAGGTCGAAGAGAGGAGGGGGA
AGGCTTGAAAGAAGTTTTCTTTATGCTATTTACATTATAGATCTTTTGAT
TAAAAGATGAGTCGAGTGTAAAGGCTAGTATTATCACTTCTACATTTTTT
GTGATGAGTAGACTTGAATAAGTTTGTGATTTTTATAGATCTTTTGATAA
ATACTACTTTTTTTATACTTTATACATTCTTCTTTATTCTTTTGAGTACT
TGTTTTCAGCAGACTCCTTTTTATATAAAATTTCTTTCTTTTTTTTAAGT
ACCTATCAAATTCTAGGAATCTGTAATGAATGCTACTATATGTACATCTT
TTAAGGTGACTTTTAATAAGTTAAGAAGCTCTCCTCGCATTTGCTAGTAA
TTAATAGAACATTTTAAAGGGGAACTTAAAGCCAATATATCATTGCCCTT
TTCAAAATGCTTTATGAAGCATGTTAAGAAATTTAAAATTGAACTTCTGG
TTAAAATCCTAAAGACAAATTGTGGTNTATAATATATATTTTCTCTTTCT
TTCGTTCAGGGAAGCATATATCGTTCTTTATATATATCTTTTTTTTTAAT
TTCTTTATGGTTCACTCAATGTTCTTTTTTTTCAAAGTTGGGTGTTGAAT
GGTGGGGGTTACTAGTTATAAAAAAATTGATACCTTATGTCAAAAAAAGG
AGTGAAAAAGAAATTGATAAGAGTTGTAGCCAATCAGAACGATCTATTCA
TAGTGTTTACGCGCACTTGAAAAATTCGACAAATCTGATTGGTTGGTTTT
TCTTCGTTCCTATTGTTTGTGAGGTGAGAACAATAAAAAAGAATAAGAAA
GAGAACATTTTTAAAAAGGTATCATTTTTTTTCATCATCTTCAATGGATT
AATTCTTTTCTTAATGATAGGTCGAAGAGAGGAGGGGGAAGGCTTGAAAG
AAGTTTTCTTTATGCTATTTACATTATAGATCTTTTGATTAAAAGATGAG
TCGAGTGTAAAGGCTAGTATTATCACTTCTACATTTTTTGTGATGAGTAG
ACTTGAATAAGTTTGTGATTTTTATAGATCTTTTGATAAATACTACTTTT
TTTATACTTTATACATTCTTCTTTATTCTTTTGAGTACTTGTTTTCAGCA
GACTCCTTTTTATATAAAATTTCTTTCTTTTTTTTAAGTACCTATCAAAT
TCTAGGAATCTGTAATGAATGCTACTATATGTACATCTTTTAAGGTGACT
TTTAATAAGTTAAGAAGCTCTCCTCGCATTTGCTAGTAATTAATAGAACA
TTTTAAAGGGGAACTTAAAGCCAATATATCATTGCCCTTTTCAAAATGCT
TTATGAAGCATGTTAAGAAATTTAAAATTGAACTTCTGGTTAAAATCCTA
AAGACAAATTGTGGTTCGTCATGCCCTTCTATATCAGCGAAGTATTGGGT
CCTCTTACAGTATTTGGAGTATGATTTCCAAAAGATATGTCAAACGCCAT
TCTCATCTCTTTAAAAATGTCGTCCAAATCAACATCGCGACATATGCCTA
TATTTTCTTGTGTCTGCGAAGTCCTCTTGCCGACAAAATCGGAGCCGCGG
TAATATACCGTAATATTCGCACGTTCGTCTAACTTACTTCGATCCGTCGC
GAATTGAAGTTAGTAGAGTTGTGCTGACTTTATATTCGAAACACGGAACT
GTTAAACATGTTCGCGCGCGAGTTATCTTTTTCTTTTTTTTGTAGTACTT
CTGTTTTTGTTGACCTTTAAGTCGTGTTGTTTCCCGTGAAACACAGTTGC
TACTACCGTTAGAACTCTCTAAAAAAACTTTTTTTGATATCACGATGGAA
TGCTGTGGTGTCACCTCGATGTGGTTGGGTTTTTGGATTAGCTTTAAAGT
AAAAATCGACTTTTGTGCGTTTAATTTATTGCTTTAAAAAGTTAGCTTTA
AAATTCTTGATTGCTGGACAAAAGGCTAGAGGCAATCTTTTATGTTGAGA
AAATCTAAATCACATAAGACATGCCAGATGGATTGAGTTTAGACTCGCAT
TTAGGGCTGGACTAGAAACTTTCGGATGGGAAATGAAGCTACTTAATTTA
TCATTCAGAACGCCCAGGCGTGGTTTAAACACAAACGTCGGATTGAAAGT
AAAATCTATCGCTAGATTTCAAAAAATGCAGTCCTCAAAAACAAAGGAAC
CGCTAGATACAATCCGTCGTCATGATTGCGGCGCGTTCTGGATGGGAAAT
AACTGGCTTCACTTTTTCTTGCCTGGGAAAGGTTAGAGATTCTACTCTAG
CCCTTCGGCTTTAAACTCAATCATCAGACGTACCCAACATCGGCTCTGCA
GCCGTTTTGTATTCTGAGAGAGATTTAAATATGGCAGAGCGACATTTATA
AAAGTTTAAAGATCTTTACTAGAATATTTTCACCCTCTAACAAAGGTTTA
GGTATCCAATTACTGATTACTTTGTTATTTGCTTATTCATCATGACGTAG
AGTTTTATGTTTTTGATAATTAAGTAATTTAATAAGAATTCCCAAAAGTC
ATCAAATAAAATAGTTCAAGGATTTCTTTGTCCTAGTCTAATTATCACAT
TTTGTAAAAGCCGCCAAATTTTGTATGTTGTTTTGTATGTTTCTTTGTCC
TCTCTTTTTATTATGACAAATGGATTTTATGTAAGGAGACTGTAATGAAG
GCGTTTAACAAAATTTACTGTGGTATGTTATGTTTTAAATTACTTTTAAG
CTCAGATTTATTAAGGGTGTCTTTTCGCAAAGGAAATTTATCTATTTTAG
CATTTTCTGACTCATCTAAAACTTCAGAAGCTTTAACTTTTCCTTGAAAG
AACCATAAGTGAAGCAACTAAATCTAAGATTGCCATTTTTAGAGCGATAA
AAATCCGGTATAAATACACTAAACTGTCGTAAAAATACCATTCTTTTGCT
TGAGGTATGTATTACTTGTTAAATTTGGGTTAAGTTTCTAAGATGCTAAT
CTAGGAATATTTTAAGATAAGAATATCCCTCATGAAATGGAAATAAAACG
CGTAAAAAAACATGTAAAGAACAGTACGGGAGGTTCAACTTGTAACTAAT
CAATGACTGAGCAAGCGGTCGATCATTAAGAGACTCAAGAGGGCAAGCTC
AGAAACGTTGTTCATATTATTACGATACATCTAAGGGGACAGTTATACGG
ATATAAGATTGTCATTCTTAACCGCATCATTGTTTCTAATATAAACAATT
TTGTTTGTTTAATGTGAGTGTTAGAGGAAGTAAATTGCTTCAAAGTGCTG
CGTTCTTAAGATTAGCCGCTTCCATTTGCTTTCAGGGAAATTAGTTTTTT
CTTGCCTTATTATCATCAGAACTTACAGAAAGTATCTGGTAAGACAGTAT
GGGACAACAAAAATCCAGCGAAATTTGCTTAAGGTAAAAAGTTACACTCA
AAGAATACAGTGCAAAAAGAATGCAAAGAAAATTAGGTAGGGTAAATGTA
TTTTTTAGGTGGTTTGAATAATTTTTTCTGTTCTTTAGAGATTTCATCTG
TTAGAAAAAACATAAATAAAATCGACAACAACAAGAACAATAGTAACAAC
AACAGACAACTTCATGTACAACACTATGAATACCATGGTCGTGCAAGCCA
AACCAGAAATGATGACACACATACCACACCCACACCATCAATTAAAACCA
GGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAACACCCTGGTAAGAACTT
TGTTTGAGTGGGCTCACGTCCAAACGGTAGCGAACATTTCTAAGCTCTTT
GCTAAAAGGGATTGGCATGGATACAAACTATATAAGAGCTGACTAAGGCT
TCGATAGCCTTTAGTATTAAAAACAAGTTAAGAACACCCAATTTCTTAGG
AAATTGCACAAAAATGCCCAAAAGATGGTGAAATTAGAACATTTTAGGAA
CATTTTTAGGCTGAAAACTGAAAAAGTTATAAACATTATGAACATTTTGG
ATGTTCTTATAAAGAACGTGTACATGTGCAATCTAAAACACCATTCGGGC
AACCATATAGATATTACCACAAATAGACTTACAACAACATTACCAATCAA
ATCCACCCTTGAGACCTAGTTTATTGTAAGTTACTTTCAATGAATTTTTG
TTCTTAATTTTTATCATTCAGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGA
TTGAATGGAGATAACCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGGTGAG
TGATTTGCAACTATCGGGCATTCCGTGTACATAGTATACATTTTTGAAAA
CACGAAGTGGAAGTTTGGCCTAAGCTGAGATCAACAATTTAAGCTTAAAA
GCGAACTCGGTAGCATCTGGTCTTGATCGATGTGCTTTAGAATTCTCCAA
AAACAGATAGTCAAGCCTCCAACTAAAATCTTTGCGTTCAAGCAAATTTA
GTACCCACATAGAAGAAATTTGTAGTGGGTTAATATAGTCATAACATCGA
AAACCCAAGGTTACACATCAATCCATGTATCCACTTCAAACTAGCTGACA
TCTATATTATATTCTTTGCCTTAGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGAGACA
GATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAGCGGT
TAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTTTATT
GGTAAGACCTTAATTATTGGTAGCCCAATAGATAAAGAGTCAATCCTTGG
GGTTAAAAATTAGATTTTGATTACAAAACAATAACTTTTTGGAACGAAGA
CAAAAAGCCATCCAATTTGAAATTGAACACTTAAAAATAGTGTANTGAAC
AAAGACAAAAAGCCATCCAATTTGAAATTGAACACTTAGAAATAGTGTAG
TATCCATAGCTGATAACTTGTTCGAGTTAAGATTCGAGATATTAGATATG
AAGAACCTACTGTGTAACATTTCATTGCGTGAAACCGGTTAACACTTTTG
GATTTGAGTCAAAATTCTCTCTGTAAAACATTAAGGAAGGAAATGGGATA
CAAGAACGGTCTAAGAACGTATGAAAAGGTGTGAAGCTAATTAGCCGGAC
GTCAAGATCTCTAATGGATTATGACCTATTTAAGGGGCTGTACTGAAAAG
CTTTGTTTTACTTAGACACGATTTCCTGTAAAGGAAATGCACTGGTTGTG
TTGAGGATTGACAGTGAGCTTACTTACTATATTTCGAAAAATTTTGCTTT
AATCAGACTTATGAATTTTGTAATCATGAGTCATCAACAGGGATATTTTA
CATTAGAATCGGCAAAATTAACCAAATAGAAACGACCAGGTTAAATGTTT
GAAGAATTTCTAAAAAGGAAGACTCTTCGAGGAAATTTCGTATTGGTATT
CTAGTAATTCTAACTTTTATGAAGTCCACAGTTTTTATATAATTACATGT
GTTTGTCGTGAAAGATGAAAGAAGTAACGCGTACAAAAAAAGTTAGTTAG
TATTTCAATATTGACTTAAAGATTTTAATATTGAACGGAATTCAAAAAGG
GTGTTTACTGCCTTCTAACCGGTTAATATTATGATTCAACGAAAAAAAGG
GGACTTTATTGACATAGTAATGTTGATTTGATTGCTTTCGTTTTTCTTTG
ATGTAGATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTTCACATACAAGAACACCCT
GATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCCGAAACAAATGAAAAAAGA
CATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCTCGACTACAATAATTCCGG
GTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCAACAATCAATGGCATAT
GGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAAAAATGAATGCTGCATA
TGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCTGTGATGTACTCTAACT
ACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCAAGCGCCGGCTCAGGCAGC
GGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGGAACTAGAGGCTATAATAC
AGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGGCGCCACGATGGCGG
ATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACTTCAACAGAATATATGACT
TCTAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAGTACAGCCCTCTCCCTGCAGC
AAACGCCACTCAAGGTAAAAATTAGCTTTCAATCAATGGGTTTGTTGATA
ATGGGTCTAAAAGATAGTTTGGGCTCAGAAACGACTTTTGAAAAATACCA
GGGACCAAACATGTTCACAAGAAAATCTCTTTTGGGCTGGGCTGGATTAT
TTTTAGGGTTCGGAGAAATTAAAGTAGAGCGGTGTCAAATAGAACTTCTA
TCATTCACATTTTCCTATGATTCGAACTTCGTTCATTTCGATTCAGTTCA
TACTTCGATTCTGAATTAGCAGAGTCAGAGGTTTTCCGACTCTGGTAAAA
AATGTCTGAGAACAGATACAGTACAAAAATGAAATACAACTAATAATTGA
TTTATATCAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATACCCTTCACC
TCATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGTAATTCAG
ATGCAGCAACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAATGGAAGC
GCAGAGGAACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAACTAATACACC
CGTAGGACGACATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGACTCAAN
CACACCCGTAGGACGACATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGA
CTCAAGATATGACTAGGTAAATAGTGAAAAGAATTCAAAGAATTGCTTTC
CAACTATCTTCCTTCAGGAGTGGGTAGTAGAGCAGGTGTATGCACTTCGT
CCTTATCGGGATATAGTTTTTGATTTACATAATTAAACGTATTTTTAGGG
AAGATTGCAGCTTTTCAGGGGGACGGGGAGAATAAAGAAGTATCTAAGGA
TATTTTACTACTCTAGTTTTTCCCTAAATTTGCAATATTTTCTACAAGTC
CCAGACCCCTTAAAATTTTACAAGGCGCCAGGATATGGAACCATTTCCTC
AATTGTGGAAGGCTCCCAGGATATACCATGTCTACCCAGTTGTGTAATTT
AGGTTTAAAATGAAAAATGGGAGGGACTGATATAATAATTTCCGTAAGGA
TTCAACCTCATACGTTAGGGGTCTTGGCACCAAATTATATAATACACATC
AATTATAGAATCTTGATTATTAAGCGTGTGGTGTTAGGGTGCAAATTATG
ACTCATTGCTCACTGAATGATGCAATCTGAATTGTGTCTCTTTAAAAAAA
AAACCTTTGTAACAAAACGTATCATTTTATGTTTCTTCATTTTAGTGGGA
ATTTTCATTAAAGATGGAGTCGCGTACAACAGAAAAACAAAAAAAAATAG
AAGAATAAAAAACAACACATAAAAAGATGATGTAAATTTTGTTATGTGAA
TACAAAGAGAAGGCGGACCTTTAGCGAAATGGAGGGATATTTAGTGAAGA
AAAGGCAGGCTCCTTTTATGAGAAGAAGATATTTTTTATTATGAGAGAGG
GGAGCCAAAAAATGGTGTAGAGAAAACAACCCACTTTTAACGACCAAAAA
AGATTGGCGTCAAAATGTCTTCACACTTGCGTACGGGGGAGATGAGGCGT
CAAATGATGGATAAGAATTAGAAAATTTTGGGCGAAAAAATGAAGGTTTT
CGGATGTCACACCAGTGGTATGAAATATCGCACGAAATAGATATAGTTGT
GTTTACTTCAAAATTTTTGGGTTGGTACTTGTTGTGGTTTCAACAATACA
GATTACAATAATTGCGTTCACTAAAAGGGACTGGGTCCCAACTAGAAGGT
AGTCAAACATTAGAGATAACAAACTCTTTCAAAGACTTATATAGGATAAT
CTCTTTCCCGCTTGGAATCGAGACTAATCATTTAGGATGTTTTTTAATCC
TCCACACACATTTAACGTGTTTTGGTATATATTTTATTTTTCATCTTCAT
TTAAGAGATTTATTTACTTCATTTTTTTTAAATAACAAAAAGATATGAAA
TTATTGTCACACATTATGTTTCACAGGATATGGATCCGATTCAGCAACAG
ATTCTATAAACAGTTCTAGAAACAATTTGCGTTAAATTTGCCCAAAATTA
AGAAATACTTAAATAATATTTTAGGAGTCTCAATTTTTTTCCGGTACCAC
AGCTCTGTGTTCCCTTTCGTGGGAGCAAAGTTATTTCTATAGCTCCGTAA
AGCCATTTTTACTTTTTGCAAAATTGATTTTTGTTTTAACAATCGACCCA
TGGTCGTCGTTACAATATTTGTTGAAAGGTTTTGTTTATAATTTTTTCGA
CCTACACCGAATCATGAATCATCAAGCCATTAAGGCTACACATTCGGCTA
CACATTCCAAAAAAATCGATCAAAGATTTTGTTTGGCCGAGGCGGGGCCG
AGATCAAGAAAGTGCTTTTCGGGTTTATATAAAACTGAAAGGCATTATGA
GTAGACACAAACTTTTTATGAGAAAAAATAGGTTTGATATATTATGCTAT
CATCATATATATTTCGAGTTTATCAATCGACTACTTATTATTTTTATCAA
AATATTGTTTTTTGCTGATAATTTATAATATTTGTTTATTAACGCTATAT
AATATAAAACGGCGATTGTTTGAAAAGCAATCCTAATATTTTATTTTGAA
AGAAAATGAAACAGCAAAATAATTCCAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_86:992051..1008079-

>TCONS_00073050 ID=TCONS_00073050|Name=TCONS_00073050|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8064bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:992051..1008079- (Clytia hemisphaerica)
TGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGAC
TCAAGATATGACTAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATACCCT
TCACCTCATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGTAA
TTCAGATGCAGCAACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAATG
GAAGCGCAGAGGAACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAACTAAT
ACACCCGTAGGACGACATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTTCACATACA
AGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCCGAAACAAA
TGAAAAAAGACATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCTCGACTACA
ATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCAACAATC
AATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAAAAATGA
ATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCTGTGATG
TACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCAAGCGCCGG
CTCAGGCAGCGGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGGAACTAGAG
GCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGGCGCC
ACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACTTCAACAGA
ATATATGACTTCTAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAGTACAGCCCTC
TCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGAGACA
GATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAGCGGT
TAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTTTATT
GGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAGATAACCATGT
TAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATGAATACCATGG
TCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACACCCACACCAT
CAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAACACCC
TGTGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCG
ACTCAAGATATGACTAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATACC
CTTCACCTCATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGT
AATTCAGATGCAGCAACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAA
TGGAAGCGCAGAGGAACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAACTA
ATACACCCGTAGGACGACATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTTCACATA
CAAGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCCGAAACA
AATGAAAAAAGACATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCTCGACTA
CAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCAACAA
TCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAAAAAT
GAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCTGTGA
TGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCAAGCGCC
GGCTCAGGCAGCGGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGGAACTAG
AGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGGCG
CCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACTTCAACA
GAATATATGACTTCTAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAGTACAGCCC
TCTCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGAGA
CAGATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAGCG
GTTAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTTTA
TTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAGATAACCAT
GTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATGAATACCAT
GGTCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACACCCACACC
ATCAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAACAC
CCTGTGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCAC
CGACTCAAGATATGACTAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATA
CCCTTCACCTCATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGA
GTAATTCAGATGCAGCAACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTA
AATGGAAGCGCAGAGGAACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAAC
TAATACACCCGTAGGACGACATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTTCACA
TACAAGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCCGAAA
CAAATGAAAAAAGACATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCTCGAC
TACAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCAAC
AATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAAAA
ATGAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCTGT
GATGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCAAGCG
CCGGCTCAGGCAGCGGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGGAACT
AGAGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGG
CGCCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACTTCAA
CAGAATATATGACTTCTAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAGTACAGC
CCTCTCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGA
GACAGATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAG
CGGTTAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTT
TATTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAGATAACC
ATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATGAATACC
ATGGTCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACACCCACA
CCATCAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAAC
ACCCTGTGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGC
ACCGACTCAAGATATGACTAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGA
TACCCTTCACCTCATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACA
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ACTACAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCA
ACAATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAA
AAATGAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCT
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CTAGAGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACA
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GAGACAGATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTA
AGCGGTTAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCG
TTTATTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAGATAA
CCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATGAATA
CCATGGTCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACACCCA
CACCATCAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCA
ACACCCTGTGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGG
GCACCGACTCAAGATATGACTAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCA
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CAACTAATACACCCGTAGGACGACATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTT
CACATACAAGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCC
GAAACAAATGAAAAAAGACATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCT
CGACTACAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTAC
CAACAATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGG
AAAAATGAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACC
CTGTGATGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCA
AGCGCCGGCTCAGGCAGCGGTGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGG
AACTAGAGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAA
CAGGCGCCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACT
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CAGCCCTCTCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTTTGGTCAAGAGGAAAG
AGGAGACAGATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTC
TAAGCGGTTAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGC
CGTTTATTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAGAT
AACCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATGAA
TACCATGGTCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACACC
CACACCATCAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATG
CAACACCCTGTGGGAATTTTCATTAAATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCG
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TTCACATACAAGAACACCCTGATTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAG
CCGAAACAAATGAAAAAAGACATGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGC
CTCGACTACAATAATTCCGGGTATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCT
ACCAACAATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTATAC
GGAAAAATGAATGCTGCATATGCCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATA
CCCTGTGATGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGCAC
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GGAACTAGAGGCTATAATACAGCTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTC
AACAGGCGCCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAA
CTTCAACAGAATATATGACTTCTAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAG
TACAGCCCTCTCCCTGCAGCAAACGCCACTCAAGGTTTGGTCAAGAGGAA
AGAGGAGACAGATGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATC
TCTAAGCGGTTAGGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACA
GCCGTTTATTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGGAG
ATAACCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTATG
AATACCATGGTCGTGCAAGCCAAACCAGAAATGATGACACACATACCACA
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CTACCAACAATCAATGGCATATGGTATCTCGACCATGTCACCCGATTTAT
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TACCCTGTGATGTACTCTAACTACCCTATGACAACTATGGGTACCACGGC
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TCAACAGGCGCCACGATGGCGGATTCAAACGCAAACACAACATATCGCCC
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CAGCCGTTTATTGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATTGAATGG
AGATAACCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGATGTACAACACTA
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CACCCACACCATCAATTAAAACCAGGTGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGC
TATGCAACACCCTG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_045293	XLOC_045293	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Sox10	TCONS_00073050-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_86	supercontig	scaffold_86:992051..1008079 -

Expression

Values :

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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR009071	HMG_box_dom

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00073050 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SOX21 (Transcription factor SOX-21 OS=Homo sapiens GN=SOX21 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 125.946 bits (315), Expect = 2.497e-31
Identity = 54/68 (79.41%), Postives = 65/68 (95.59%), Query Frame = 1

Query:  274 NHVKRPMNAFMVWSRGKRRQMAQEHPRMHNSEISKRLGAQWKVLTPEEKQPFIDEAKRLRAVHIQEHP 477
            +HVKRPMNAFMVWSR +RR+MAQE+P+MHNSEISKRLGA+WK+LT  EK+PFIDEAKRLRA+H++EHP
Sbjct:    6 DHVKRPMNAFMVWSRAQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLTESEKRPFIDEAKRLRAMHMKEHP 73

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00073050 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00073050 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SOX21	2.497e-31	79.41	Transcription factor SOX-21 OS=Homo sapiens GN=SOX...	[more]

You are here

TCONS_00073050 (transcript) - C. hemisphaerica